Protein–RNA interactions for Protein: Q3E814

YLL006W-A, Uncharacterized protein YLL006W-A, yeastyeast

Predictions only

Length 58 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (RIP-Chip)
Gene UniProt Accession Gene Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score Detected Interaction
YLL006W-AQ3E814 NSR1YGR159C 1245 nt13.95□□□□□ -0.18
YLL006W-AQ3E814 YML009W-BYML009W-B 477 nt13.64□□□□□ -0.23
YLL006W-AQ3E814 NOP1YDL014W 984 nt13.13□□□□□ -0.31
YLL006W-AQ3E814 MDJ1YFL016C 1536 nt12.73□□□□□ -0.37
YLL006W-AQ3E814 YJL027CYJL027C 417 nt11.74□□□□□ -0.53
YLL006W-AQ3E814 YKL036CYKL036C 393 nt11.72□□□□□ -0.53
YLL006W-AQ3E814 SRX1YKL086W 384 nt11.47□□□□□ -0.57
YLL006W-AQ3E814 Q0297Q0297 156 nt11.36□□□□□ -0.59
YLL006W-AQ3E814 DBP2YNL112W 1641 nt11.1□□□□□ -0.63
YLL006W-AQ3E814 YBR190WYBR190W 312 nt11.01□□□□□ -0.65
YLL006W-AQ3E814 YCR051WYCR051W 669 nt10.81□□□□□ -0.68
YLL006W-AQ3E814 RTC3YHR087W 336 nt10.69□□□□□ -0.7
YLL006W-AQ3E814 TRN1tP(UGG)A 72 nt10.61□□□□□ -0.71
YLL006W-AQ3E814 SUF9tP(UGG)F 72 nt10.61□□□□□ -0.71
YLL006W-AQ3E814 SUF8tP(UGG)H 72 nt10.61□□□□□ -0.71
YLL006W-AQ3E814 tP(UGG)LtP(UGG)L 72 nt10.61□□□□□ -0.71
YLL006W-AQ3E814 SUF7tP(UGG)M 72 nt10.61□□□□□ -0.71
YLL006W-AQ3E814 tP(UGG)N1tP(UGG)N1 72 nt10.61□□□□□ -0.71
YLL006W-AQ3E814 tP(UGG)N2tP(UGG)N2 72 nt10.61□□□□□ -0.71
YLL006W-AQ3E814 tP(UGG)O1tP(UGG)O1 72 nt10.61□□□□□ -0.71
YLL006W-AQ3E814 SUF11tP(UGG)O2 72 nt10.61□□□□□ -0.71
YLL006W-AQ3E814 SSA3YBL075C 1950 nt10.59□□□□□ -0.71
YLL006W-AQ3E814 SCS3YGL126W 1143 nt10.43□□□□□ -0.74
YLL006W-AQ3E814 CCC1YLR220W 969 nt10.43□□□□□ -0.74
YLL006W-AQ3E814 RVS167YDR388W 1449 nt10.39□□□□□ -0.75
YLL006W-AQ3E814 PUT4YOR348C 1884 nt10.28□□□□□ -0.76
YLL006W-AQ3E814 SCJ1YMR214W 1134 nt10.22□□□□□ -0.77
YLL006W-AQ3E814 RPP1BYDL130W 321 nt10.18□□□□□ -0.78
YLL006W-AQ3E814 YOL085CYOL085C 342 nt10.15□□□□□ -0.78
YLL006W-AQ3E814 PKP1YIL042C 1185 nt9.99□□□□□ -0.81
YLL006W-AQ3E814 ARE1YCR048W 1833 nt9.96□□□□□ -0.82
YLL006W-AQ3E814 SHR5YOL110W 714 nt9.93□□□□□ -0.82
YLL006W-AQ3E814 POA1YBR022W 534 nt9.9□□□□□ -0.82
YLL006W-AQ3E814 tP(UGG)O3tP(UGG)O3 72 nt9.89□□□□□ -0.83
YLL006W-AQ3E814 URN1YPR152C 1398 nt9.88□□□□□ -0.83
YLL006W-AQ3E814 YHR049C-AYHR049C-A 297 nt9.85□□□□□ -0.83
YLL006W-AQ3E814 SAH1YER043C 1350 nt9.85□□□□□ -0.83
YLL006W-AQ3E814 OPI9YLR338W 858 nt9.84□□□□□ -0.83
YLL006W-AQ3E814 BSC6YOL137W 1494 nt9.79□□□□□ -0.84
YLL006W-AQ3E814 PET122YER153C 765 nt9.75□□□□□ -0.85
YLL006W-AQ3E814 DEP1YAL013W 1218 nt9.71□□□□□ -0.86
YLL006W-AQ3E814 RPN10YHR200W 807 nt9.68□□□□□ -0.86
YLL006W-AQ3E814 SPT5YML010W 3192 nt9.63□□□□□ -0.87
YLL006W-AQ3E814 YDJ1YNL064C 1230 nt9.61□□□□□ -0.87
YLL006W-AQ3E814 YNL208WYNL208W 600 nt9.58□□□□□ -0.88
YLL006W-AQ3E814 PUN1YLR414C 792 nt9.57□□□□□ -0.88
YLL006W-AQ3E814 BUD23YCR047C 828 nt9.56□□□□□ -0.88
YLL006W-AQ3E814 SCR1SCR1 522 nt9.56□□□□□ -0.88
YLL006W-AQ3E814 SSA4YER103W 1929 nt9.5□□□□□ -0.89
YLL006W-AQ3E814 PTC2YER089C 1395 nt9.47□□□□□ -0.89
YLL006W-AQ3E814 NAB2YGL122C 1578 nt9.43□□□□□ -0.9
YLL006W-AQ3E814 RRN5YLR141W 1092 nt9.42□□□□□ -0.9
YLL006W-AQ3E814 GAR1YHR089C 618 nt9.4□□□□□ -0.9
YLL006W-AQ3E814 YJR018WYJR018W 363 nt9.4□□□□□ -0.9
YLL006W-AQ3E814 FIS1YIL065C 468 nt9.27□□□□□ -0.93
YLL006W-AQ3E814 MEP2YNL142W 1500 nt9.25□□□□□ -0.93
YLL006W-AQ3E814 YER088W-BYER088W-B 147 nt9.24□□□□□ -0.93
YLL006W-AQ3E814 DAL1YIR027C 1383 nt9.23□□□□□ -0.93
YLL006W-AQ3E814 ATS1YAL020C 1002 nt9.21□□□□□ -0.94
YLL006W-AQ3E814 YJR120WYJR120W 351 nt9.17□□□□□ -0.94
YLL006W-AQ3E814 BDF1YLR399C 2061 nt9.16□□□□□ -0.94
YLL006W-AQ3E814 FPR4YLR449W 1179 nt9.15□□□□□ -0.94
YLL006W-AQ3E814 INM2YDR287W 879 nt9.14□□□□□ -0.95
YLL006W-AQ3E814 PHO4YFR034C 939 nt9.14□□□□□ -0.95
YLL006W-AQ3E814 TIR1YER011W 765 nt9.12□□□□□ -0.95
YLL006W-AQ3E814 RPP2BYDR382W 333 nt9.11□□□□□ -0.95
YLL006W-AQ3E814 RSB1YOR049C 1065 nt9.11□□□□□ -0.95
YLL006W-AQ3E814 YPS1YLR120C 1710 nt9.11□□□□□ -0.95
YLL006W-AQ3E814 SSA1YAL005C 1929 nt9.07□□□□□ -0.96
YLL006W-AQ3E814 DCW1YKL046C 1350 nt9.06□□□□□ -0.96
YLL006W-AQ3E814 TAT1YBR069C 1860 nt9.06□□□□□ -0.96
YLL006W-AQ3E814 YHR165W-AYHR165W-A 312 nt9.02□□□□□ -0.97
YLL006W-AQ3E814 YDR095CYDR095C 411 nt9.01□□□□□ -0.97
YLL006W-AQ3E814 YBL100CYBL100C 315 nt8.96□□□□□ -0.98
YLL006W-AQ3E814 EMI2YDR516C 1503 nt8.95□□□□□ -0.98
YLL006W-AQ3E814 YMR090WYMR090W 684 nt8.95□□□□□ -0.98
YLL006W-AQ3E814 YBR220CYBR220C 1683 nt8.93□□□□□ -0.98
YLL006W-AQ3E814 YDL221WYDL221W 552 nt8.87□□□□□ -0.99
YLL006W-AQ3E814 BDH2YAL061W 1254 nt8.86□□□□□ -0.99
YLL006W-AQ3E814 FUN26YAL022C 1554 nt8.84□□□□□ -0.99
YLL006W-AQ3E814 SRB2YHR041C 633 nt8.83□□□□□ -1
YLL006W-AQ3E814 RPP2AYOL039W 321 nt8.83□□□□□ -1
YLL006W-AQ3E814 SDH1YKL148C 1923 nt8.83□□□□□ -1
YLL006W-AQ3E814 PTP1YDL230W 1008 nt8.82□□□□□ -1
YLL006W-AQ3E814 ALF1YNL148C 765 nt8.81□□□□□ -1
YLL006W-AQ3E814 CAC2YML102W 1407 nt8.8□□□□□ -1
YLL006W-AQ3E814 YJL225CYJL225C 5277 nt8.76□□□□□ -1.01
YLL006W-AQ3E814 TRM9YML014W 840 nt8.74□□□□□ -1.01
YLL006W-AQ3E814 PAC11YDR488C 1602 nt8.72□□□□□ -1.01
YLL006W-AQ3E814 SCC4YER147C 1875 nt8.71□□□□□ -1.01
YLL006W-AQ3E814 SEC11YIR022W 504 nt8.71□□□□□ -1.02
YLL006W-AQ3E814 CCT6YDR188W 1641 nt8.71□□□□□ -1.02
YLL006W-AQ3E814 LSM3YLR438C-A 270 nt8.69□□□□□ -1.02
YLL006W-AQ3E814 SIS1YNL007C 1059 nt8.69□□□□□ -1.02
YLL006W-AQ3E814 IRC15YPL017C 1500 nt8.69□□□□□ -1.02
YLL006W-AQ3E814 PCH2YBR186W 1695 nt8.69□□□□□ -1.02
YLL006W-AQ3E814 SUF2tP(AGG)C 72 nt8.67□□□□□ -1.02
YLL006W-AQ3E814 SUF10tP(AGG)N 72 nt8.67□□□□□ -1.02
YLL006W-AQ3E814 GUT2YIL155C 1950 nt8.65□□□□□ -1.02
YLL006W-AQ3E814 WWM1YFL010C 636 nt8.62□□□□□ -1.03
Retrieved 100 of 7,029 protein–RNA pairs in 15.5 ms