Protein–RNA interactions for Protein: Q01389

BCK1, Serine/threonine-protein kinase BCK1/SLK1/SSP31, yeastyeast

Predictions only

Length 1,478 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (RIP-Chip)
Gene UniProt Accession Gene Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score Detected Interaction
BCK1Q01389 YML009W-BYML009W-B 477 nt28.73■■■□□ 2.19
BCK1Q01389 NOP1YDL014W 984 nt27.83■■■□□ 2.04
BCK1Q01389 NSR1YGR159C 1245 nt27.74■■■□□ 2.03
BCK1Q01389 YKL036CYKL036C 393 nt26.32■■□□□ 1.8
BCK1Q01389 YJL027CYJL027C 417 nt24.69■■□□□ 1.54
BCK1Q01389 Q0297Q0297 156 nt24.58■■□□□ 1.52
BCK1Q01389 MDJ1YFL016C 1536 nt24.52■■□□□ 1.52
BCK1Q01389 SRX1YKL086W 384 nt24.44■■□□□ 1.5
BCK1Q01389 SCS3YGL126W 1143 nt24.34■■□□□ 1.49
BCK1Q01389 YCR051WYCR051W 669 nt23.33■■□□□ 1.33
BCK1Q01389 YOL085CYOL085C 342 nt22.73■■□□□ 1.23
BCK1Q01389 PKP1YIL042C 1185 nt22.54■■□□□ 1.2
BCK1Q01389 SCJ1YMR214W 1134 nt22.15■■□□□ 1.14
BCK1Q01389 RPP1BYDL130W 321 nt22.09■■□□□ 1.13
BCK1Q01389 TRN1tP(UGG)A 72 nt21.85■■□□□ 1.09
BCK1Q01389 SUF9tP(UGG)F 72 nt21.85■■□□□ 1.09
BCK1Q01389 SUF8tP(UGG)H 72 nt21.85■■□□□ 1.09
BCK1Q01389 tP(UGG)LtP(UGG)L 72 nt21.85■■□□□ 1.09
BCK1Q01389 SUF7tP(UGG)M 72 nt21.85■■□□□ 1.09
BCK1Q01389 tP(UGG)N1tP(UGG)N1 72 nt21.85■■□□□ 1.09
BCK1Q01389 tP(UGG)N2tP(UGG)N2 72 nt21.85■■□□□ 1.09
BCK1Q01389 tP(UGG)O1tP(UGG)O1 72 nt21.85■■□□□ 1.09
BCK1Q01389 SUF11tP(UGG)O2 72 nt21.85■■□□□ 1.09
BCK1Q01389 ATS1YAL020C 1002 nt21.77■■□□□ 1.07
BCK1Q01389 DBP2YNL112W 1641 nt21.76■■□□□ 1.07
BCK1Q01389 CCC1YLR220W 969 nt21.69■■□□□ 1.06
BCK1Q01389 PET122YER153C 765 nt21.2■□□□□ 0.98
BCK1Q01389 SCR1SCR1 522 nt20.98■□□□□ 0.95
BCK1Q01389 tP(UGG)O3tP(UGG)O3 72 nt20.81■□□□□ 0.92
BCK1Q01389 RRN5YLR141W 1092 nt20.52■□□□□ 0.88
BCK1Q01389 RVS167YDR388W 1449 nt20.51■□□□□ 0.87
BCK1Q01389 YBR190WYBR190W 312 nt20.5■□□□□ 0.87
BCK1Q01389 RSB1YOR049C 1065 nt20.37■□□□□ 0.85
BCK1Q01389 RTC3YHR087W 336 nt20.32■□□□□ 0.84
BCK1Q01389 YER088W-BYER088W-B 147 nt20.13■□□□□ 0.81
BCK1Q01389 PST2YDR032C 597 nt20.02■□□□□ 0.8
BCK1Q01389 YDJ1YNL064C 1230 nt20■□□□□ 0.79
BCK1Q01389 SHR5YOL110W 714 nt19.95■□□□□ 0.78
BCK1Q01389 GAR1YHR089C 618 nt19.64■□□□□ 0.73
BCK1Q01389 YKL097CYKL097C 411 nt19.64■□□□□ 0.73
BCK1Q01389 DEP1YAL013W 1218 nt19.39■□□□□ 0.69
BCK1Q01389 SHU1YHL006C 453 nt19.24■□□□□ 0.67
BCK1Q01389 URN1YPR152C 1398 nt19.15■□□□□ 0.66
BCK1Q01389 TIR1YER011W 765 nt18.91■□□□□ 0.62
BCK1Q01389 YNL208WYNL208W 600 nt18.91■□□□□ 0.62
BCK1Q01389 YAL037C-BYAL037C-B 975 nt18.88■□□□□ 0.61
BCK1Q01389 RPN10YHR200W 807 nt18.85■□□□□ 0.61
BCK1Q01389 YOR139CYOR139C 393 nt18.79■□□□□ 0.6
BCK1Q01389 OPI9YLR338W 858 nt18.63■□□□□ 0.57
BCK1Q01389 SSA1YAL005C 1929 nt18.61■□□□□ 0.57
BCK1Q01389 SRB2YHR041C 633 nt18.56■□□□□ 0.56
BCK1Q01389 SAH1YER043C 1350 nt18.54■□□□□ 0.56
BCK1Q01389 NPL3YDR432W 1245 nt18.5■□□□□ 0.55
BCK1Q01389 MNP1YGL068W 585 nt18.43■□□□□ 0.54
BCK1Q01389 PUT4YOR348C 1884 nt18.36■□□□□ 0.53
BCK1Q01389 WWM1YFL010C 636 nt18.26■□□□□ 0.51
BCK1Q01389 YJR018WYJR018W 363 nt18.22■□□□□ 0.51
BCK1Q01389 ARE1YCR048W 1833 nt18.22■□□□□ 0.51
BCK1Q01389 HOM6YJR139C 1080 nt18.21■□□□□ 0.51
BCK1Q01389 YGR021WYGR021W 873 nt18.19■□□□□ 0.5
BCK1Q01389 YJR120WYJR120W 351 nt18.19■□□□□ 0.5
BCK1Q01389 YHR049C-AYHR049C-A 297 nt18.12■□□□□ 0.49
BCK1Q01389 YOL037CYOL037C 354 nt18.11■□□□□ 0.49
BCK1Q01389 PUN1YLR414C 792 nt18.08■□□□□ 0.49
BCK1Q01389 RPP2BYDR382W 333 nt17.96■□□□□ 0.47
BCK1Q01389 RKM5YLR137W 1104 nt17.95■□□□□ 0.46
BCK1Q01389 tM(CAU)CtM(CAU)C 72 nt17.88■□□□□ 0.45
BCK1Q01389 IMT4tM(CAU)E 72 nt17.88■□□□□ 0.45
BCK1Q01389 IMT3tM(CAU)J3 72 nt17.88■□□□□ 0.45
BCK1Q01389 IMT1tM(CAU)O1 72 nt17.88■□□□□ 0.45
BCK1Q01389 IMT2tM(CAU)P 72 nt17.88■□□□□ 0.45
BCK1Q01389 POA1YBR022W 534 nt17.88■□□□□ 0.45
BCK1Q01389 PTC2YER089C 1395 nt17.85■□□□□ 0.45
BCK1Q01389 YFL021C-AYFL021C-A 855 nt17.83■□□□□ 0.45
BCK1Q01389 SSA3YBL075C 1950 nt17.75■□□□□ 0.43
BCK1Q01389 BDH2YAL061W 1254 nt17.72■□□□□ 0.43
BCK1Q01389 BUD23YCR047C 828 nt17.71■□□□□ 0.43
BCK1Q01389 PUS2YGL063W 1113 nt17.67■□□□□ 0.42
BCK1Q01389 BSC6YOL137W 1494 nt17.59■□□□□ 0.41
BCK1Q01389 YLR281CYLR281C 468 nt17.58■□□□□ 0.41
BCK1Q01389 MOT3YMR070W 1473 nt17.57■□□□□ 0.4
BCK1Q01389 FIS1YIL065C 468 nt17.5■□□□□ 0.39
BCK1Q01389 WHI5YOR083W 888 nt17.5■□□□□ 0.39
BCK1Q01389 FPR4YLR449W 1179 nt17.49■□□□□ 0.39
BCK1Q01389 YBL100CYBL100C 315 nt17.49■□□□□ 0.39
BCK1Q01389 NAB2YGL122C 1578 nt17.48■□□□□ 0.39
BCK1Q01389 LSM3YLR438C-A 270 nt17.42■□□□□ 0.38
BCK1Q01389 DAL1YIR027C 1383 nt17.37■□□□□ 0.37
BCK1Q01389 INM2YDR287W 879 nt17.34■□□□□ 0.37
BCK1Q01389 PHO4YFR034C 939 nt17.34■□□□□ 0.37
BCK1Q01389 FMP45YDL222C 930 nt17.31■□□□□ 0.36
BCK1Q01389 YLR236CYLR236C 324 nt17.31■□□□□ 0.36
BCK1Q01389 YPR011CYPR011C 981 nt17.24■□□□□ 0.35
BCK1Q01389 FUN26YAL022C 1554 nt17.23■□□□□ 0.35
BCK1Q01389 TRM9YML014W 840 nt17.22■□□□□ 0.35
BCK1Q01389 DSK2YMR276W 1122 nt17.22■□□□□ 0.35
BCK1Q01389 YLR154C-GYLR154C-G 150 nt17.14■□□□□ 0.33
BCK1Q01389 CCT6YDR188W 1641 nt17.05■□□□□ 0.32
BCK1Q01389 MRPL8YJL063C 717 nt17.03■□□□□ 0.32
BCK1Q01389 YCH1YGR203W 447 nt17.02■□□□□ 0.32
Retrieved 100 of 7,029 protein–RNA pairs in 13.5 ms