Protein–RNA interactions for Protein: Q12484

YOR343C, Uncharacterized protein YOR343C, yeastyeast

Predictions only

Length 108 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (RIP-Chip)
Gene UniProt Accession Gene Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score Detected Interaction
YOR343CQ12484 YML009W-BYML009W-B 477 nt18.32■□□□□ 0.52
YOR343CQ12484 NSR1YGR159C 1245 nt18.27■□□□□ 0.52
YOR343CQ12484 NOP1YDL014W 984 nt17.76■□□□□ 0.43
YOR343CQ12484 MDJ1YFL016C 1536 nt16.31■□□□□ 0.2
YOR343CQ12484 YKL036CYKL036C 393 nt16.31■□□□□ 0.2
YOR343CQ12484 Q0297Q0297 156 nt15.52■□□□□ 0.08
YOR343CQ12484 SRX1YKL086W 384 nt15.52■□□□□ 0.08
YOR343CQ12484 YJL027CYJL027C 417 nt15.21■□□□□ 0.03
YOR343CQ12484 SCS3YGL126W 1143 nt14.8□□□□□ -0.04
YOR343CQ12484 YCR051WYCR051W 669 nt14.73□□□□□ -0.05
YOR343CQ12484 DBP2YNL112W 1641 nt14.4□□□□□ -0.1
YOR343CQ12484 YOL085CYOL085C 342 nt14.14□□□□□ -0.15
YOR343CQ12484 TRN1tP(UGG)A 72 nt14.08□□□□□ -0.16
YOR343CQ12484 SUF9tP(UGG)F 72 nt14.08□□□□□ -0.16
YOR343CQ12484 SUF8tP(UGG)H 72 nt14.08□□□□□ -0.16
YOR343CQ12484 tP(UGG)LtP(UGG)L 72 nt14.08□□□□□ -0.16
YOR343CQ12484 SUF7tP(UGG)M 72 nt14.08□□□□□ -0.16
YOR343CQ12484 tP(UGG)N1tP(UGG)N1 72 nt14.08□□□□□ -0.16
YOR343CQ12484 tP(UGG)N2tP(UGG)N2 72 nt14.08□□□□□ -0.16
YOR343CQ12484 tP(UGG)O1tP(UGG)O1 72 nt14.08□□□□□ -0.16
YOR343CQ12484 SUF11tP(UGG)O2 72 nt14.08□□□□□ -0.16
YOR343CQ12484 CCC1YLR220W 969 nt13.96□□□□□ -0.17
YOR343CQ12484 PKP1YIL042C 1185 nt13.94□□□□□ -0.18
YOR343CQ12484 RPP1BYDL130W 321 nt13.93□□□□□ -0.18
YOR343CQ12484 YBR190WYBR190W 312 nt13.92□□□□□ -0.18
YOR343CQ12484 RTC3YHR087W 336 nt13.62□□□□□ -0.23
YOR343CQ12484 RVS167YDR388W 1449 nt13.51□□□□□ -0.25
YOR343CQ12484 SCJ1YMR214W 1134 nt13.43□□□□□ -0.26
YOR343CQ12484 PET122YER153C 765 nt13.33□□□□□ -0.28
YOR343CQ12484 tP(UGG)O3tP(UGG)O3 72 nt13.3□□□□□ -0.28
YOR343CQ12484 ATS1YAL020C 1002 nt13.21□□□□□ -0.29
YOR343CQ12484 SCR1SCR1 522 nt13.15□□□□□ -0.3
YOR343CQ12484 SHR5YOL110W 714 nt13.02□□□□□ -0.33
YOR343CQ12484 RRN5YLR141W 1092 nt12.94□□□□□ -0.34
YOR343CQ12484 YDJ1YNL064C 1230 nt12.86□□□□□ -0.35
YOR343CQ12484 URN1YPR152C 1398 nt12.72□□□□□ -0.37
YOR343CQ12484 PUT4YOR348C 1884 nt12.72□□□□□ -0.37
YOR343CQ12484 DEP1YAL013W 1218 nt12.7□□□□□ -0.38
YOR343CQ12484 YER088W-BYER088W-B 147 nt12.68□□□□□ -0.38
YOR343CQ12484 RSB1YOR049C 1065 nt12.64□□□□□ -0.39
YOR343CQ12484 GAR1YHR089C 618 nt12.61□□□□□ -0.39
YOR343CQ12484 OPI9YLR338W 858 nt12.54□□□□□ -0.4
YOR343CQ12484 SAH1YER043C 1350 nt12.5□□□□□ -0.41
YOR343CQ12484 RPN10YHR200W 807 nt12.49□□□□□ -0.41
YOR343CQ12484 YNL208WYNL208W 600 nt12.47□□□□□ -0.41
YOR343CQ12484 ARE1YCR048W 1833 nt12.46□□□□□ -0.41
YOR343CQ12484 POA1YBR022W 534 nt12.33□□□□□ -0.44
YOR343CQ12484 YHR049C-AYHR049C-A 297 nt12.3□□□□□ -0.44
YOR343CQ12484 PST2YDR032C 597 nt12.25□□□□□ -0.45
YOR343CQ12484 TIR1YER011W 765 nt12.18□□□□□ -0.46
YOR343CQ12484 PUN1YLR414C 792 nt12.18□□□□□ -0.46
YOR343CQ12484 YJR018WYJR018W 363 nt12.13□□□□□ -0.47
YOR343CQ12484 BSC6YOL137W 1494 nt12.07□□□□□ -0.48
YOR343CQ12484 PTC2YER089C 1395 nt12.05□□□□□ -0.48
YOR343CQ12484 SSA1YAL005C 1929 nt12.05□□□□□ -0.48
YOR343CQ12484 BUD23YCR047C 828 nt12.02□□□□□ -0.49
YOR343CQ12484 SSA3YBL075C 1950 nt12.01□□□□□ -0.49
YOR343CQ12484 YJR120WYJR120W 351 nt11.92□□□□□ -0.5
YOR343CQ12484 NAB2YGL122C 1578 nt11.9□□□□□ -0.5
YOR343CQ12484 RPP2BYDR382W 333 nt11.86□□□□□ -0.51
YOR343CQ12484 SRB2YHR041C 633 nt11.85□□□□□ -0.51
YOR343CQ12484 SHU1YHL006C 453 nt11.78□□□□□ -0.52
YOR343CQ12484 DAL1YIR027C 1383 nt11.73□□□□□ -0.53
YOR343CQ12484 FIS1YIL065C 468 nt11.72□□□□□ -0.53
YOR343CQ12484 YKL097CYKL097C 411 nt11.72□□□□□ -0.53
YOR343CQ12484 FPR4YLR449W 1179 nt11.72□□□□□ -0.53
YOR343CQ12484 INM2YDR287W 879 nt11.7□□□□□ -0.54
YOR343CQ12484 YAL037C-BYAL037C-B 975 nt11.65□□□□□ -0.54
YOR343CQ12484 WWM1YFL010C 636 nt11.64□□□□□ -0.55
YOR343CQ12484 PHO4YFR034C 939 nt11.62□□□□□ -0.55
YOR343CQ12484 BDH2YAL061W 1254 nt11.6□□□□□ -0.55
YOR343CQ12484 YBL100CYBL100C 315 nt11.58□□□□□ -0.56
YOR343CQ12484 SPT5YML010W 3192 nt11.53□□□□□ -0.56
YOR343CQ12484 YGR021WYGR021W 873 nt11.52□□□□□ -0.57
YOR343CQ12484 HOM6YJR139C 1080 nt11.48□□□□□ -0.57
YOR343CQ12484 FUN26YAL022C 1554 nt11.44□□□□□ -0.58
YOR343CQ12484 YFL021C-AYFL021C-A 855 nt11.43□□□□□ -0.58
YOR343CQ12484 MNP1YGL068W 585 nt11.43□□□□□ -0.58
YOR343CQ12484 LSM3YLR438C-A 270 nt11.43□□□□□ -0.58
YOR343CQ12484 YPS1YLR120C 1710 nt11.42□□□□□ -0.58
YOR343CQ12484 TRM9YML014W 840 nt11.41□□□□□ -0.58
YOR343CQ12484 YDR095CYDR095C 411 nt11.34□□□□□ -0.59
YOR343CQ12484 MEP2YNL142W 1500 nt11.33□□□□□ -0.6
YOR343CQ12484 RKM5YLR137W 1104 nt11.32□□□□□ -0.6
YOR343CQ12484 YHR165W-AYHR165W-A 312 nt11.31□□□□□ -0.6
YOR343CQ12484 ALF1YNL148C 765 nt11.3□□□□□ -0.6
YOR343CQ12484 CCT6YDR188W 1641 nt11.28□□□□□ -0.6
YOR343CQ12484 YOR139CYOR139C 393 nt11.27□□□□□ -0.61
YOR343CQ12484 NPL3YDR432W 1245 nt11.19□□□□□ -0.62
YOR343CQ12484 SUF2tP(AGG)C 72 nt11.19□□□□□ -0.62
YOR343CQ12484 SUF10tP(AGG)N 72 nt11.19□□□□□ -0.62
YOR343CQ12484 YOL037CYOL037C 354 nt11.19□□□□□ -0.62
YOR343CQ12484 DCW1YKL046C 1350 nt11.16□□□□□ -0.62
YOR343CQ12484 SSA4YER103W 1929 nt11.15□□□□□ -0.62
YOR343CQ12484 SIS1YNL007C 1059 nt11.12□□□□□ -0.63
YOR343CQ12484 RPP2AYOL039W 321 nt11.12□□□□□ -0.63
YOR343CQ12484 PTP1YDL230W 1008 nt11.1□□□□□ -0.63
YOR343CQ12484 CAC2YML102W 1407 nt11.02□□□□□ -0.64
YOR343CQ12484 EMI2YDR516C 1503 nt11.01□□□□□ -0.65
YOR343CQ12484 ART5YGR068C 1761 nt10.97□□□□□ -0.65
Retrieved 100 of 7,029 protein–RNA pairs in 14.2 ms