RNA–Protein interactions for RNA: YMR139W

RIM11, Transcript of Protein kinase, yeast

Gene RIM11, Length 1,113 nt, Biotype protein coding.

RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (RIP-Chip)
Gene	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	Detected Interaction
RIM11	YMR139W	YPR117W	Q06116	2489 aa		3	□□□□□ -1.93
RIM11	YMR139W	YER190C-B	P0CX94	160 aa		3	□□□□□ -1.93
RIM11	YMR139W	YEL077W-A	P0CX95	160 aa		3	□□□□□ -1.93
RIM11	YMR139W	YGR296C-B	P0CX96	160 aa		3	□□□□□ -1.93
RIM11	YMR139W	YPL283W-B	P0CX97	160 aa		3	□□□□□ -1.93
RIM11	YMR139W	YPR204C-A	P0CX98	160 aa		3	□□□□□ -1.93
RIM11	YMR139W	BGL2	P15703	313 aa	Known RBP	3	□□□□□ -1.93
RIM11	YMR139W	QCR9	P22289	66 aa		3	□□□□□ -1.93
RIM11	YMR139W	ALK2	P32789	676 aa	Predicted RBP	3	□□□□□ -1.93
RIM11	YMR139W	MIA40	P36046	403 aa		3	□□□□□ -1.93
RIM11	YMR139W	AVT5	P38176	459 aa		3	□□□□□ -1.93
RIM11	YMR139W	SUR2	P38992	349 aa		3	□□□□□ -1.93
RIM11	YMR139W	YGR269W	P40326	108 aa		3	□□□□□ -1.93
RIM11	YMR139W	XPT1	P47165	209 aa		3	□□□□□ -1.93
RIM11	YMR139W	RIB4	P50861	169 aa	Predicted RBP	3	□□□□□ -1.93
RIM11	YMR139W	YGL260W	P53056	76 aa		3	□□□□□ -1.93
RIM11	YMR139W	YIP5	P53108	310 aa		3	□□□□□ -1.93
RIM11	YMR139W	ARL3	Q02804	198 aa		3	□□□□□ -1.93
RIM11	YMR139W	YPL108W	Q02872	168 aa	Predicted RBP	3	□□□□□ -1.93
RIM11	YMR139W	YDC1	Q02896	317 aa		3	□□□□□ -1.93
RIM11	YMR139W	PML1	Q07930	204 aa	Predicted RBP	3	□□□□□ -1.93
RIM11	YMR139W	RRS1	Q08746	203 aa	Known RBP	3	□□□□□ -1.93
RIM11	YMR139W	FIT3	Q08907	204 aa		3	□□□□□ -1.93
RIM11	YMR139W	RDL1	Q12305	139 aa	Known RBP	3	□□□□□ -1.93
RIM11	YMR139W	RAX2	Q12465	1220 aa		3	□□□□□ -1.93
RIM11	YMR139W	BOL1	Q3E793	110 aa		3	□□□□□ -1.93
RIM11	YMR139W	PAU19	P0CE85	124 aa		2.99	□□□□□ -1.93
RIM11	YMR139W	PAU21	P0CE86	164 aa		2.99	□□□□□ -1.93
RIM11	YMR139W	PAU22	P0CE87	164 aa		2.99	□□□□□ -1.93
RIM11	YMR139W	FCY2	P17064	533 aa		2.99	□□□□□ -1.93
RIM11	YMR139W	ROX3	P25046	220 aa		2.99	□□□□□ -1.93
RIM11	YMR139W	PAU3	P25610	124 aa		2.99	□□□□□ -1.93
RIM11	YMR139W	MRPL28	P36527	147 aa		2.99	□□□□□ -1.93
RIM11	YMR139W	YPT10	P38146	199 aa		2.99	□□□□□ -1.93
RIM11	YMR139W	HSP10	P38910	106 aa		2.99	□□□□□ -1.93
RIM11	YMR139W	UME6	P39001	836 aa		2.99	□□□□□ -1.93
RIM11	YMR139W	PAU5	P43575	122 aa		2.99	□□□□□ -1.93
RIM11	YMR139W	WSC2	P53832	503 aa		2.99	□□□□□ -1.93
RIM11	YMR139W	HCH1	P53834	153 aa		2.99	□□□□□ -1.93
RIM11	YMR139W	HSK3	P69852	69 aa		2.99	□□□□□ -1.93
RIM11	YMR139W	CYT2	Q00873	224 aa		2.99	□□□□□ -1.93
RIM11	YMR139W	YPL067C	Q02754	198 aa		2.99	□□□□□ -1.93
RIM11	YMR139W	YMR007W	Q03675	126 aa		2.99	□□□□□ -1.93
RIM11	YMR139W	SEN15	Q04675	128 aa		2.99	□□□□□ -1.93
RIM11	YMR139W	RAF1	Q06891	181 aa		2.99	□□□□□ -1.93
RIM11	YMR139W	HRD1	Q08109	551 aa		2.99	□□□□□ -1.93
RIM11	YMR139W	ERV2	Q12284	196 aa		2.99	□□□□□ -1.93
RIM11	YMR139W	YOP1	Q12402	180 aa		2.99	□□□□□ -1.93
RIM11	YMR139W	SEN1	Q00416	2231 aa	Known RBP	2.99	□□□□□ -1.93
RIM11	YMR139W	PET494	P07390	489 aa	Predicted RBP	2.98	□□□□□ -1.93
RIM11	YMR139W	RIP1	P08067	215 aa		2.98	□□□□□ -1.93
RIM11	YMR139W	RPS25B	P0C0T4	108 aa	Known RBP	2.98	□□□□□ -1.93
RIM11	YMR139W	NHP6A	P11632	93 aa	Known RBP	2.98	□□□□□ -1.93
RIM11	YMR139W	URA5	P13298	226 aa	Known RBP	2.98	□□□□□ -1.93
RIM11	YMR139W	LDB16	P25587	256 aa		2.98	□□□□□ -1.93
RIM11	YMR139W	COQ3	P27680	312 aa		2.98	□□□□□ -1.93
RIM11	YMR139W	RPS0A	P32905	252 aa	Known RBP	2.98	□□□□□ -1.93
RIM11	YMR139W	YBL059W	P34224	193 aa		2.98	□□□□□ -1.93
RIM11	YMR139W	QDR3	P38227	689 aa		2.98	□□□□□ -1.93
RIM11	YMR139W	CUE1	P38428	203 aa		2.98	□□□□□ -1.93
RIM11	YMR139W	YHR138C	P38841	114 aa	Predicted RBP	2.98	□□□□□ -1.93
RIM11	YMR139W	LSM4	P40070	187 aa	Known RBP	2.98	□□□□□ -1.93
RIM11	YMR139W	DFG10	P40526	253 aa		2.98	□□□□□ -1.93
RIM11	YMR139W	YFL015C	P43578	164 aa		2.98	□□□□□ -1.93
RIM11	YMR139W	LOC1	P43586	204 aa	Predicted RBP	2.98	□□□□□ -1.93
RIM11	YMR139W	GON7	P46984	123 aa		2.98	□□□□□ -1.93
RIM11	YMR139W	ATG27	P46989	271 aa		2.98	□□□□□ -1.93
RIM11	YMR139W	ARP3	P47117	449 aa	Known RBP	2.98	□□□□□ -1.93
RIM11	YMR139W	SIP18	P50263	79 aa		2.98	□□□□□ -1.93
RIM11	YMR139W	LST7	P53237	242 aa		2.98	□□□□□ -1.93
RIM11	YMR139W	OCA2	P53949	197 aa		2.98	□□□□□ -1.93
RIM11	YMR139W	YPL077C	Q02831	240 aa		2.98	□□□□□ -1.93
RIM11	YMR139W	CUE4	Q04201	117 aa	Predicted RBP	2.98	□□□□□ -1.93
RIM11	YMR139W	YDR114C	Q04597	100 aa		2.98	□□□□□ -1.93
RIM11	YMR139W	POC4	Q12245	148 aa	Predicted RBP	2.98	□□□□□ -1.93
RIM11	YMR139W	RPS25A	Q3E792	108 aa	Predicted RBP	2.98	□□□□□ -1.93
RIM11	YMR139W	RPS22A	P0C0W1	130 aa	Known RBP	2.97	□□□□□ -1.93
RIM11	YMR139W	YMR31	P19955	123 aa		2.97	□□□□□ -1.93
RIM11	YMR139W	SCM4	P32564	187 aa		2.97	□□□□□ -1.93
RIM11	YMR139W	YOX1	P34161	385 aa		2.97	□□□□□ -1.93
RIM11	YMR139W	YMR262W	P38430	313 aa		2.97	□□□□□ -1.93
RIM11	YMR139W	RTC3	P38804	111 aa	Predicted RBP	2.97	□□□□□ -1.93
RIM11	YMR139W	PSD1	P39006	500 aa		2.97	□□□□□ -1.93
RIM11	YMR139W	YEL057C	P39983	233 aa		2.97	□□□□□ -1.93
RIM11	YMR139W	NSA2	P40078	261 aa	Known RBP	2.97	□□□□□ -1.93
RIM11	YMR139W	HIT1	P46973	164 aa		2.97	□□□□□ -1.93
RIM11	YMR139W	UBC13	P52490	153 aa		2.97	□□□□□ -1.93
RIM11	YMR139W	ERV14	P53173	138 aa		2.97	□□□□□ -1.93
RIM11	YMR139W	APS2	Q00381	147 aa		2.97	□□□□□ -1.93
RIM11	YMR139W	ECM18	Q04623	453 aa		2.97	□□□□□ -1.93
RIM11	YMR139W	LIP2	Q06005	328 aa		2.97	□□□□□ -1.93
RIM11	YMR139W	FRQ1	Q06389	190 aa		2.97	□□□□□ -1.93
RIM11	YMR139W	YPS3	Q12303	508 aa		2.97	□□□□□ -1.93
RIM11	YMR139W	RNH203	Q12338	110 aa		2.97	□□□□□ -1.93
RIM11	YMR139W	FOL3	Q12676	427 aa	Predicted RBP	2.97	□□□□□ -1.93
RIM11	YMR139W	FMP27	Q06179	2628 aa		2.97	□□□□□ -1.93
RIM11	YMR139W	IRA2	P19158	3079 aa		2.96	□□□□□ -1.94
RIM11	YMR139W	VPS63	O13549	108 aa		2.96	□□□□□ -1.94
RIM11	YMR139W	RPL9A	P05738	191 aa	Known RBP	2.96	□□□□□ -1.94
RIM11	YMR139W	HEM4	P06174	275 aa		2.96	□□□□□ -1.94

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