Protein–RNA interactions for Protein: P08067

RIP1, Cytochrome b-c1 complex subunit Rieske, mitochondrial, yeastyeast

Predictions only

Length 215 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (RIP-Chip)
Gene UniProt Accession Gene Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score Detected Interaction
RIP1P08067 YML009W-BYML009W-B 477 nt19.26■□□□□ 0.67
RIP1P08067 NOP1YDL014W 984 nt18.88■□□□□ 0.61
RIP1P08067 NSR1YGR159C 1245 nt18.6■□□□□ 0.57
RIP1P08067 YKL036CYKL036C 393 nt17.93■□□□□ 0.46
RIP1P08067 YJL027CYJL027C 417 nt16.85■□□□□ 0.29
RIP1P08067 Q0297Q0297 156 nt16.68■□□□□ 0.26
RIP1P08067 SCS3YGL126W 1143 nt16.59■□□□□ 0.25
RIP1P08067 SRX1YKL086W 384 nt16.5■□□□□ 0.23
RIP1P08067 MDJ1YFL016C 1536 nt16.09■□□□□ 0.17
RIP1P08067 YCR051WYCR051W 669 nt15.75■□□□□ 0.11
RIP1P08067 YOL085CYOL085C 342 nt15.5■□□□□ 0.07
RIP1P08067 SCJ1YMR214W 1134 nt15.29■□□□□ 0.04
RIP1P08067 PKP1YIL042C 1185 nt15.26■□□□□ 0.03
RIP1P08067 RPP1BYDL130W 321 nt14.98□□□□□ -0.01
RIP1P08067 ATS1YAL020C 1002 nt14.96□□□□□ -0.01
RIP1P08067 TRN1tP(UGG)A 72 nt14.61□□□□□ -0.07
RIP1P08067 SUF9tP(UGG)F 72 nt14.61□□□□□ -0.07
RIP1P08067 SUF8tP(UGG)H 72 nt14.61□□□□□ -0.07
RIP1P08067 tP(UGG)LtP(UGG)L 72 nt14.61□□□□□ -0.07
RIP1P08067 SUF7tP(UGG)M 72 nt14.61□□□□□ -0.07
RIP1P08067 tP(UGG)N1tP(UGG)N1 72 nt14.61□□□□□ -0.07
RIP1P08067 tP(UGG)N2tP(UGG)N2 72 nt14.61□□□□□ -0.07
RIP1P08067 tP(UGG)O1tP(UGG)O1 72 nt14.61□□□□□ -0.07
RIP1P08067 SUF11tP(UGG)O2 72 nt14.61□□□□□ -0.07
RIP1P08067 CCC1YLR220W 969 nt14.53□□□□□ -0.08
RIP1P08067 DBP2YNL112W 1641 nt14.39□□□□□ -0.11
RIP1P08067 PET122YER153C 765 nt14.28□□□□□ -0.12
RIP1P08067 SCR1SCR1 522 nt14.27□□□□□ -0.13
RIP1P08067 tP(UGG)O3tP(UGG)O3 72 nt14.01□□□□□ -0.17
RIP1P08067 RTC3YHR087W 336 nt13.98□□□□□ -0.17
RIP1P08067 RRN5YLR141W 1092 nt13.92□□□□□ -0.18
RIP1P08067 RSB1YOR049C 1065 nt13.82□□□□□ -0.2
RIP1P08067 PST2YDR032C 597 nt13.74□□□□□ -0.21
RIP1P08067 RVS167YDR388W 1449 nt13.7□□□□□ -0.22
RIP1P08067 YER088W-BYER088W-B 147 nt13.63□□□□□ -0.23
RIP1P08067 YKL097CYKL097C 411 nt13.53□□□□□ -0.24
RIP1P08067 YBR190WYBR190W 312 nt13.53□□□□□ -0.24
RIP1P08067 YDJ1YNL064C 1230 nt13.51□□□□□ -0.25
RIP1P08067 SHR5YOL110W 714 nt13.32□□□□□ -0.28
RIP1P08067 GAR1YHR089C 618 nt13.19□□□□□ -0.3
RIP1P08067 SHU1YHL006C 453 nt13.1□□□□□ -0.31
RIP1P08067 SSA3YBL075C 1950 nt13.09□□□□□ -0.31
RIP1P08067 YOR139CYOR139C 393 nt12.87□□□□□ -0.35
RIP1P08067 DEP1YAL013W 1218 nt12.83□□□□□ -0.36
RIP1P08067 YAL037C-BYAL037C-B 975 nt12.78□□□□□ -0.36
RIP1P08067 TIR1YER011W 765 nt12.7□□□□□ -0.38
RIP1P08067 NPL3YDR432W 1245 nt12.68□□□□□ -0.38
RIP1P08067 URN1YPR152C 1398 nt12.65□□□□□ -0.38
RIP1P08067 YNL208WYNL208W 600 nt12.63□□□□□ -0.39
RIP1P08067 RPN10YHR200W 807 nt12.58□□□□□ -0.4
RIP1P08067 SSA1YAL005C 1929 nt12.43□□□□□ -0.42
RIP1P08067 MNP1YGL068W 585 nt12.36□□□□□ -0.43
RIP1P08067 SRB2YHR041C 633 nt12.33□□□□□ -0.44
RIP1P08067 tM(CAU)CtM(CAU)C 72 nt12.32□□□□□ -0.44
RIP1P08067 IMT4tM(CAU)E 72 nt12.32□□□□□ -0.44
RIP1P08067 IMT3tM(CAU)J3 72 nt12.32□□□□□ -0.44
RIP1P08067 IMT1tM(CAU)O1 72 nt12.32□□□□□ -0.44
RIP1P08067 IMT2tM(CAU)P 72 nt12.32□□□□□ -0.44
RIP1P08067 OPI9YLR338W 858 nt12.32□□□□□ -0.44
RIP1P08067 YOL037CYOL037C 354 nt12.32□□□□□ -0.44
RIP1P08067 YGR021WYGR021W 873 nt12.31□□□□□ -0.44
RIP1P08067 HOM6YJR139C 1080 nt12.29□□□□□ -0.44
RIP1P08067 WWM1YFL010C 636 nt12.25□□□□□ -0.45
RIP1P08067 SAH1YER043C 1350 nt12.13□□□□□ -0.47
RIP1P08067 RKM5YLR137W 1104 nt12.12□□□□□ -0.47
RIP1P08067 YJR018WYJR018W 363 nt12.09□□□□□ -0.47
RIP1P08067 MOT3YMR070W 1473 nt12.08□□□□□ -0.48
RIP1P08067 PUS2YGL063W 1113 nt12.07□□□□□ -0.48
RIP1P08067 BSC6YOL137W 1494 nt12.05□□□□□ -0.48
RIP1P08067 RPP2BYDR382W 333 nt12.01□□□□□ -0.49
RIP1P08067 YFL021C-AYFL021C-A 855 nt12.01□□□□□ -0.49
RIP1P08067 YJR120WYJR120W 351 nt11.99□□□□□ -0.49
RIP1P08067 PUN1YLR414C 792 nt11.99□□□□□ -0.49
RIP1P08067 PUT4YOR348C 1884 nt11.97□□□□□ -0.49
RIP1P08067 YLR281CYLR281C 468 nt11.97□□□□□ -0.49
RIP1P08067 WHI5YOR083W 888 nt11.89□□□□□ -0.51
RIP1P08067 BDH2YAL061W 1254 nt11.83□□□□□ -0.52
RIP1P08067 ARE1YCR048W 1833 nt11.82□□□□□ -0.52
RIP1P08067 FMP45YDL222C 930 nt11.79□□□□□ -0.52
RIP1P08067 PTC2YER089C 1395 nt11.76□□□□□ -0.53
RIP1P08067 LSM3YLR438C-A 270 nt11.75□□□□□ -0.53
RIP1P08067 MRPL8YJL063C 717 nt11.74□□□□□ -0.53
RIP1P08067 YHR049C-AYHR049C-A 297 nt11.72□□□□□ -0.53
RIP1P08067 DSK2YMR276W 1122 nt11.69□□□□□ -0.54
RIP1P08067 YPR011CYPR011C 981 nt11.69□□□□□ -0.54
RIP1P08067 YCH1YGR203W 447 nt11.67□□□□□ -0.54
RIP1P08067 YLR236CYLR236C 324 nt11.65□□□□□ -0.54
RIP1P08067 IMP2'YIL154C 1041 nt11.59□□□□□ -0.55
RIP1P08067 POA1YBR022W 534 nt11.59□□□□□ -0.55
RIP1P08067 SPT5YML010W 3192 nt11.58□□□□□ -0.56
RIP1P08067 UBX6YJL048C 1191 nt11.58□□□□□ -0.56
RIP1P08067 YBL100CYBL100C 315 nt11.58□□□□□ -0.56
RIP1P08067 Q0182Q0182 405 nt11.57□□□□□ -0.56
RIP1P08067 ADO1YJR105W 1023 nt11.57□□□□□ -0.56
RIP1P08067 INM2YDR287W 879 nt11.56□□□□□ -0.56
RIP1P08067 BUD23YCR047C 828 nt11.53□□□□□ -0.56
RIP1P08067 FPR4YLR449W 1179 nt11.53□□□□□ -0.56
RIP1P08067 TRM9YML014W 840 nt11.53□□□□□ -0.56
RIP1P08067 NAB2YGL122C 1578 nt11.51□□□□□ -0.57
RIP1P08067 YLR154C-GYLR154C-G 150 nt11.51□□□□□ -0.57
Retrieved 100 of 7,029 protein–RNA pairs in 8.3 ms