Protein–RNA interactions for Protein: P0C0W1

RPS22A, 40S ribosomal protein S22-A, yeastyeast

Known RBP Predictions only

Length 130 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (RIP-Chip)
Gene UniProt Accession Gene Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score Detected Interaction
RPS22AP0C0W1 NSR1YGR159C 1245 nt15.99■□□□□ 0.15
RPS22AP0C0W1 YML009W-BYML009W-B 477 nt15.63■□□□□ 0.09
RPS22AP0C0W1 NOP1YDL014W 984 nt15.03■□□□□ -0
RPS22AP0C0W1 MDJ1YFL016C 1536 nt14.66□□□□□ -0.06
RPS22AP0C0W1 YJL027CYJL027C 417 nt13.53□□□□□ -0.24
RPS22AP0C0W1 YKL036CYKL036C 393 nt13.34□□□□□ -0.27
RPS22AP0C0W1 SRX1YKL086W 384 nt13.09□□□□□ -0.31
RPS22AP0C0W1 Q0297Q0297 156 nt12.93□□□□□ -0.34
RPS22AP0C0W1 DBP2YNL112W 1641 nt12.71□□□□□ -0.37
RPS22AP0C0W1 YBR190WYBR190W 312 nt12.67□□□□□ -0.38
RPS22AP0C0W1 YCR051WYCR051W 669 nt12.38□□□□□ -0.43
RPS22AP0C0W1 RTC3YHR087W 336 nt12.38□□□□□ -0.43
RPS22AP0C0W1 SSA3YBL075C 1950 nt12.34□□□□□ -0.43
RPS22AP0C0W1 TRN1tP(UGG)A 72 nt12.13□□□□□ -0.47
RPS22AP0C0W1 SUF9tP(UGG)F 72 nt12.13□□□□□ -0.47
RPS22AP0C0W1 SUF8tP(UGG)H 72 nt12.13□□□□□ -0.47
RPS22AP0C0W1 tP(UGG)LtP(UGG)L 72 nt12.13□□□□□ -0.47
RPS22AP0C0W1 SUF7tP(UGG)M 72 nt12.13□□□□□ -0.47
RPS22AP0C0W1 tP(UGG)N1tP(UGG)N1 72 nt12.13□□□□□ -0.47
RPS22AP0C0W1 tP(UGG)N2tP(UGG)N2 72 nt12.13□□□□□ -0.47
RPS22AP0C0W1 tP(UGG)O1tP(UGG)O1 72 nt12.13□□□□□ -0.47
RPS22AP0C0W1 SUF11tP(UGG)O2 72 nt12.13□□□□□ -0.47
RPS22AP0C0W1 CCC1YLR220W 969 nt12.01□□□□□ -0.49
RPS22AP0C0W1 RVS167YDR388W 1449 nt11.96□□□□□ -0.49
RPS22AP0C0W1 PUT4YOR348C 1884 nt11.86□□□□□ -0.51
RPS22AP0C0W1 SCS3YGL126W 1143 nt11.83□□□□□ -0.52
RPS22AP0C0W1 SCJ1YMR214W 1134 nt11.68□□□□□ -0.54
RPS22AP0C0W1 RPP1BYDL130W 321 nt11.61□□□□□ -0.55
RPS22AP0C0W1 YOL085CYOL085C 342 nt11.53□□□□□ -0.56
RPS22AP0C0W1 ARE1YCR048W 1833 nt11.48□□□□□ -0.57
RPS22AP0C0W1 POA1YBR022W 534 nt11.46□□□□□ -0.57
RPS22AP0C0W1 PKP1YIL042C 1185 nt11.41□□□□□ -0.58
RPS22AP0C0W1 YHR049C-AYHR049C-A 297 nt11.38□□□□□ -0.59
RPS22AP0C0W1 SHR5YOL110W 714 nt11.38□□□□□ -0.59
RPS22AP0C0W1 URN1YPR152C 1398 nt11.38□□□□□ -0.59
RPS22AP0C0W1 SAH1YER043C 1350 nt11.36□□□□□ -0.59
RPS22AP0C0W1 BSC6YOL137W 1494 nt11.32□□□□□ -0.6
RPS22AP0C0W1 OPI9YLR338W 858 nt11.31□□□□□ -0.6
RPS22AP0C0W1 tP(UGG)O3tP(UGG)O3 72 nt11.3□□□□□ -0.6
RPS22AP0C0W1 DEP1YAL013W 1218 nt11.2□□□□□ -0.62
RPS22AP0C0W1 RPN10YHR200W 807 nt11.15□□□□□ -0.62
RPS22AP0C0W1 PET122YER153C 765 nt11.13□□□□□ -0.63
RPS22AP0C0W1 SPT5YML010W 3192 nt11.09□□□□□ -0.63
RPS22AP0C0W1 BUD23YCR047C 828 nt11.09□□□□□ -0.63
RPS22AP0C0W1 SSA4YER103W 1929 nt11.03□□□□□ -0.64
RPS22AP0C0W1 PUN1YLR414C 792 nt11.01□□□□□ -0.65
RPS22AP0C0W1 YNL208WYNL208W 600 nt11.01□□□□□ -0.65
RPS22AP0C0W1 YDJ1YNL064C 1230 nt10.96□□□□□ -0.65
RPS22AP0C0W1 SCR1SCR1 522 nt10.94□□□□□ -0.66
RPS22AP0C0W1 PTC2YER089C 1395 nt10.93□□□□□ -0.66
RPS22AP0C0W1 NAB2YGL122C 1578 nt10.89□□□□□ -0.67
RPS22AP0C0W1 YJR018WYJR018W 363 nt10.82□□□□□ -0.68
RPS22AP0C0W1 GAR1YHR089C 618 nt10.77□□□□□ -0.69
RPS22AP0C0W1 RRN5YLR141W 1092 nt10.76□□□□□ -0.69
RPS22AP0C0W1 MEP2YNL142W 1500 nt10.68□□□□□ -0.7
RPS22AP0C0W1 FIS1YIL065C 468 nt10.64□□□□□ -0.71
RPS22AP0C0W1 DAL1YIR027C 1383 nt10.64□□□□□ -0.71
RPS22AP0C0W1 FPR4YLR449W 1179 nt10.61□□□□□ -0.71
RPS22AP0C0W1 BDF1YLR399C 2061 nt10.61□□□□□ -0.71
RPS22AP0C0W1 INM2YDR287W 879 nt10.53□□□□□ -0.72
RPS22AP0C0W1 YER088W-BYER088W-B 147 nt10.53□□□□□ -0.72
RPS22AP0C0W1 PHO4YFR034C 939 nt10.53□□□□□ -0.72
RPS22AP0C0W1 RPP2BYDR382W 333 nt10.52□□□□□ -0.73
RPS22AP0C0W1 YPS1YLR120C 1710 nt10.5□□□□□ -0.73
RPS22AP0C0W1 TAT1YBR069C 1860 nt10.49□□□□□ -0.73
RPS22AP0C0W1 YJR120WYJR120W 351 nt10.47□□□□□ -0.73
RPS22AP0C0W1 DCW1YKL046C 1350 nt10.47□□□□□ -0.73
RPS22AP0C0W1 YHR165W-AYHR165W-A 312 nt10.45□□□□□ -0.74
RPS22AP0C0W1 TIR1YER011W 765 nt10.44□□□□□ -0.74
RPS22AP0C0W1 ATS1YAL020C 1002 nt10.43□□□□□ -0.74
RPS22AP0C0W1 RSB1YOR049C 1065 nt10.41□□□□□ -0.74
RPS22AP0C0W1 YMR090WYMR090W 684 nt10.4□□□□□ -0.74
RPS22AP0C0W1 SSA1YAL005C 1929 nt10.39□□□□□ -0.75
RPS22AP0C0W1 YDR095CYDR095C 411 nt10.36□□□□□ -0.75
RPS22AP0C0W1 EMI2YDR516C 1503 nt10.36□□□□□ -0.75
RPS22AP0C0W1 YBL100CYBL100C 315 nt10.33□□□□□ -0.76
RPS22AP0C0W1 YBR220CYBR220C 1683 nt10.32□□□□□ -0.76
RPS22AP0C0W1 YDL221WYDL221W 552 nt10.24□□□□□ -0.77
RPS22AP0C0W1 PAC11YDR488C 1602 nt10.21□□□□□ -0.78
RPS22AP0C0W1 SDH1YKL148C 1923 nt10.21□□□□□ -0.78
RPS22AP0C0W1 ALF1YNL148C 765 nt10.19□□□□□ -0.78
RPS22AP0C0W1 FUN26YAL022C 1554 nt10.18□□□□□ -0.78
RPS22AP0C0W1 BDH2YAL061W 1254 nt10.17□□□□□ -0.78
RPS22AP0C0W1 RPP2AYOL039W 321 nt10.17□□□□□ -0.78
RPS22AP0C0W1 CAC2YML102W 1407 nt10.13□□□□□ -0.79
RPS22AP0C0W1 PTP1YDL230W 1008 nt10.12□□□□□ -0.79
RPS22AP0C0W1 SEC11YIR022W 504 nt10.09□□□□□ -0.79
RPS22AP0C0W1 TRM9YML014W 840 nt10.08□□□□□ -0.8
RPS22AP0C0W1 SCC4YER147C 1875 nt10.08□□□□□ -0.8
RPS22AP0C0W1 PCH2YBR186W 1695 nt10.07□□□□□ -0.8
RPS22AP0C0W1 SRB2YHR041C 633 nt10.05□□□□□ -0.8
RPS22AP0C0W1 GUT2YIL155C 1950 nt10.02□□□□□ -0.81
RPS22AP0C0W1 IRC15YPL017C 1500 nt9.99□□□□□ -0.81
RPS22AP0C0W1 SUF2tP(AGG)C 72 nt9.99□□□□□ -0.81
RPS22AP0C0W1 SUF10tP(AGG)N 72 nt9.99□□□□□ -0.81
RPS22AP0C0W1 CCT6YDR188W 1641 nt9.99□□□□□ -0.81
RPS22AP0C0W1 SIS1YNL007C 1059 nt9.98□□□□□ -0.81
RPS22AP0C0W1 LSM3YLR438C-A 270 nt9.95□□□□□ -0.82
RPS22AP0C0W1 GIS3YLR094C 1509 nt9.95□□□□□ -0.82
RPS22AP0C0W1 YSC84YHR016C 1407 nt9.89□□□□□ -0.83
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