Protein–RNA interactions for Protein: P36527

MRPL28, 54S ribosomal protein L28, mitochondrial, yeastyeast

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Length 147 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (RIP-Chip)
Gene UniProt Accession Gene Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score Detected Interaction
MRPL28P36527 NSR1YGR159C 1245 nt15.28■□□□□ 0.04
MRPL28P36527 YML009W-BYML009W-B 477 nt14.9□□□□□ -0.02
MRPL28P36527 NOP1YDL014W 984 nt14.47□□□□□ -0.09
MRPL28P36527 MDJ1YFL016C 1536 nt14.34□□□□□ -0.11
MRPL28P36527 SSA3YBL075C 1950 nt13.34□□□□□ -0.27
MRPL28P36527 YJL027CYJL027C 417 nt13.14□□□□□ -0.31
MRPL28P36527 YKL036CYKL036C 393 nt13.12□□□□□ -0.31
MRPL28P36527 SRX1YKL086W 384 nt12.61□□□□□ -0.39
MRPL28P36527 Q0297Q0297 156 nt12.57□□□□□ -0.4
MRPL28P36527 YBR190WYBR190W 312 nt12.47□□□□□ -0.41
MRPL28P36527 DBP2YNL112W 1641 nt12.37□□□□□ -0.43
MRPL28P36527 RTC3YHR087W 336 nt12.11□□□□□ -0.47
MRPL28P36527 PUT4YOR348C 1884 nt11.99□□□□□ -0.49
MRPL28P36527 YCR051WYCR051W 669 nt11.92□□□□□ -0.5
MRPL28P36527 SCS3YGL126W 1143 nt11.79□□□□□ -0.52
MRPL28P36527 SPT5YML010W 3192 nt11.63□□□□□ -0.55
MRPL28P36527 SSA4YER103W 1929 nt11.6□□□□□ -0.55
MRPL28P36527 POA1YBR022W 534 nt11.52□□□□□ -0.57
MRPL28P36527 ARE1YCR048W 1833 nt11.51□□□□□ -0.57
MRPL28P36527 TRN1tP(UGG)A 72 nt11.5□□□□□ -0.57
MRPL28P36527 SUF9tP(UGG)F 72 nt11.5□□□□□ -0.57
MRPL28P36527 SUF8tP(UGG)H 72 nt11.5□□□□□ -0.57
MRPL28P36527 tP(UGG)LtP(UGG)L 72 nt11.5□□□□□ -0.57
MRPL28P36527 SUF7tP(UGG)M 72 nt11.5□□□□□ -0.57
MRPL28P36527 tP(UGG)N1tP(UGG)N1 72 nt11.5□□□□□ -0.57
MRPL28P36527 tP(UGG)N2tP(UGG)N2 72 nt11.5□□□□□ -0.57
MRPL28P36527 tP(UGG)O1tP(UGG)O1 72 nt11.5□□□□□ -0.57
MRPL28P36527 SUF11tP(UGG)O2 72 nt11.5□□□□□ -0.57
MRPL28P36527 BSC6YOL137W 1494 nt11.44□□□□□ -0.58
MRPL28P36527 RVS167YDR388W 1449 nt11.4□□□□□ -0.58
MRPL28P36527 CCC1YLR220W 969 nt11.35□□□□□ -0.59
MRPL28P36527 YOL085CYOL085C 342 nt11.34□□□□□ -0.59
MRPL28P36527 YHR049C-AYHR049C-A 297 nt11.33□□□□□ -0.6
MRPL28P36527 BDF1YLR399C 2061 nt11.28□□□□□ -0.6
MRPL28P36527 RPP1BYDL130W 321 nt11.27□□□□□ -0.61
MRPL28P36527 SAH1YER043C 1350 nt11.21□□□□□ -0.61
MRPL28P36527 SCJ1YMR214W 1134 nt11.18□□□□□ -0.62
MRPL28P36527 PAC11YDR488C 1602 nt11.14□□□□□ -0.63
MRPL28P36527 PKP1YIL042C 1185 nt11.14□□□□□ -0.63
MRPL28P36527 TAT1YBR069C 1860 nt11.09□□□□□ -0.63
MRPL28P36527 URN1YPR152C 1398 nt11.09□□□□□ -0.63
MRPL28P36527 OPI9YLR338W 858 nt11.07□□□□□ -0.64
MRPL28P36527 BUD23YCR047C 828 nt10.99□□□□□ -0.65
MRPL28P36527 NVJ2YPR091C 2313 nt10.92□□□□□ -0.66
MRPL28P36527 MEP2YNL142W 1500 nt10.84□□□□□ -0.67
MRPL28P36527 SHR5YOL110W 714 nt10.82□□□□□ -0.68
MRPL28P36527 tP(UGG)O3tP(UGG)O3 72 nt10.81□□□□□ -0.68
MRPL28P36527 DEP1YAL013W 1218 nt10.78□□□□□ -0.68
MRPL28P36527 PET122YER153C 765 nt10.75□□□□□ -0.69
MRPL28P36527 PTC2YER089C 1395 nt10.75□□□□□ -0.69
MRPL28P36527 NAB2YGL122C 1578 nt10.73□□□□□ -0.69
MRPL28P36527 PUN1YLR414C 792 nt10.72□□□□□ -0.69
MRPL28P36527 RPN10YHR200W 807 nt10.66□□□□□ -0.7
MRPL28P36527 SCR1SCR1 522 nt10.65□□□□□ -0.7
MRPL28P36527 DCW1YKL046C 1350 nt10.65□□□□□ -0.71
MRPL28P36527 YBR220CYBR220C 1683 nt10.6□□□□□ -0.71
MRPL28P36527 YNL208WYNL208W 600 nt10.53□□□□□ -0.72
MRPL28P36527 YDJ1YNL064C 1230 nt10.5□□□□□ -0.73
MRPL28P36527 FIS1YIL065C 468 nt10.49□□□□□ -0.73
MRPL28P36527 ATS1YAL020C 1002 nt10.49□□□□□ -0.73
MRPL28P36527 YJR018WYJR018W 363 nt10.48□□□□□ -0.73
MRPL28P36527 EMI2YDR516C 1503 nt10.47□□□□□ -0.73
MRPL28P36527 YMR090WYMR090W 684 nt10.46□□□□□ -0.73
MRPL28P36527 YPS1YLR120C 1710 nt10.44□□□□□ -0.74
MRPL28P36527 PCH2YBR186W 1695 nt10.43□□□□□ -0.74
MRPL28P36527 DAL1YIR027C 1383 nt10.42□□□□□ -0.74
MRPL28P36527 RRN5YLR141W 1092 nt10.42□□□□□ -0.74
MRPL28P36527 GUT2YIL155C 1950 nt10.41□□□□□ -0.74
MRPL28P36527 FPS1YLL043W 2010 nt10.4□□□□□ -0.75
MRPL28P36527 SDH1YKL148C 1923 nt10.37□□□□□ -0.75
MRPL28P36527 YHR165W-AYHR165W-A 312 nt10.35□□□□□ -0.75
MRPL28P36527 FPR4YLR449W 1179 nt10.34□□□□□ -0.75
MRPL28P36527 SEC11YIR022W 504 nt10.33□□□□□ -0.76
MRPL28P36527 YDL221WYDL221W 552 nt10.32□□□□□ -0.76
MRPL28P36527 PHO4YFR034C 939 nt10.32□□□□□ -0.76
MRPL28P36527 PIB2YGL023C 1908 nt10.25□□□□□ -0.77
MRPL28P36527 GAR1YHR089C 618 nt10.24□□□□□ -0.77
MRPL28P36527 YDR095CYDR095C 411 nt10.23□□□□□ -0.77
MRPL28P36527 INM2YDR287W 879 nt10.22□□□□□ -0.77
MRPL28P36527 YER088W-BYER088W-B 147 nt10.22□□□□□ -0.77
MRPL28P36527 CAC2YML102W 1407 nt10.19□□□□□ -0.78
MRPL28P36527 SCC4YER147C 1875 nt10.17□□□□□ -0.78
MRPL28P36527 YJR120WYJR120W 351 nt10.17□□□□□ -0.78
MRPL28P36527 RSB1YOR049C 1065 nt10.16□□□□□ -0.78
MRPL28P36527 UME6YDR207C 2511 nt10.14□□□□□ -0.79
MRPL28P36527 PTP1YDL230W 1008 nt10.12□□□□□ -0.79
MRPL28P36527 RTF1YGL244W 1677 nt10.08□□□□□ -0.8
MRPL28P36527 Q0182Q0182 405 nt10.06□□□□□ -0.8
MRPL28P36527 IRC15YPL017C 1500 nt10.04□□□□□ -0.8
MRPL28P36527 RPP2AYOL039W 321 nt10.04□□□□□ -0.8
MRPL28P36527 YSC84YHR016C 1407 nt10.04□□□□□ -0.8
MRPL28P36527 RPP2BYDR382W 333 nt10.02□□□□□ -0.81
MRPL28P36527 SSA1YAL005C 1929 nt10.01□□□□□ -0.81
MRPL28P36527 BOR1YNL275W 1731 nt9.99□□□□□ -0.81
MRPL28P36527 GIS3YLR094C 1509 nt9.98□□□□□ -0.81
MRPL28P36527 YHL050CYHL050C 2094 nt9.98□□□□□ -0.81
MRPL28P36527 YBL100CYBL100C 315 nt9.97□□□□□ -0.81
MRPL28P36527 PTK1YKL198C 1989 nt9.97□□□□□ -0.81
MRPL28P36527 TIR1YER011W 765 nt9.93□□□□□ -0.82
MRPL28P36527 BOP3YNL042W 1191 nt9.93□□□□□ -0.82
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