Protein–RNA interactions for Protein: P38841

YHR138C, Uncharacterized protein YHR138C, yeastyeast

Predicted RBP Predictions only

Length 114 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (RIP-Chip)
Gene UniProt Accession Gene Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score Detected Interaction
YHR138CP38841 NSR1YGR159C 1245 nt16.85■□□□□ 0.29
YHR138CP38841 YML009W-BYML009W-B 477 nt16.67■□□□□ 0.26
YHR138CP38841 NOP1YDL014W 984 nt16.2■□□□□ 0.18
YHR138CP38841 MDJ1YFL016C 1536 nt15.08■□□□□ 0.01
YHR138CP38841 YKL036CYKL036C 393 nt14.66□□□□□ -0.06
YHR138CP38841 SRX1YKL086W 384 nt14.1□□□□□ -0.15
YHR138CP38841 Q0297Q0297 156 nt14.04□□□□□ -0.16
YHR138CP38841 YJL027CYJL027C 417 nt13.99□□□□□ -0.17
YHR138CP38841 YCR051WYCR051W 669 nt13.34□□□□□ -0.27
YHR138CP38841 DBP2YNL112W 1641 nt13.23□□□□□ -0.29
YHR138CP38841 SCS3YGL126W 1143 nt13.15□□□□□ -0.3
YHR138CP38841 YBR190WYBR190W 312 nt13.01□□□□□ -0.33
YHR138CP38841 TRN1tP(UGG)A 72 nt12.86□□□□□ -0.35
YHR138CP38841 SUF9tP(UGG)F 72 nt12.86□□□□□ -0.35
YHR138CP38841 SUF8tP(UGG)H 72 nt12.86□□□□□ -0.35
YHR138CP38841 tP(UGG)LtP(UGG)L 72 nt12.86□□□□□ -0.35
YHR138CP38841 SUF7tP(UGG)M 72 nt12.86□□□□□ -0.35
YHR138CP38841 tP(UGG)N1tP(UGG)N1 72 nt12.86□□□□□ -0.35
YHR138CP38841 tP(UGG)N2tP(UGG)N2 72 nt12.86□□□□□ -0.35
YHR138CP38841 tP(UGG)O1tP(UGG)O1 72 nt12.86□□□□□ -0.35
YHR138CP38841 SUF11tP(UGG)O2 72 nt12.86□□□□□ -0.35
YHR138CP38841 CCC1YLR220W 969 nt12.72□□□□□ -0.37
YHR138CP38841 RTC3YHR087W 336 nt12.7□□□□□ -0.38
YHR138CP38841 YOL085CYOL085C 342 nt12.66□□□□□ -0.38
YHR138CP38841 RPP1BYDL130W 321 nt12.6□□□□□ -0.39
YHR138CP38841 RVS167YDR388W 1449 nt12.54□□□□□ -0.4
YHR138CP38841 PKP1YIL042C 1185 nt12.45□□□□□ -0.42
YHR138CP38841 SSA3YBL075C 1950 nt12.34□□□□□ -0.43
YHR138CP38841 SCJ1YMR214W 1134 nt12.25□□□□□ -0.45
YHR138CP38841 tP(UGG)O3tP(UGG)O3 72 nt12.09□□□□□ -0.47
YHR138CP38841 PET122YER153C 765 nt12.01□□□□□ -0.49
YHR138CP38841 SHR5YOL110W 714 nt11.98□□□□□ -0.49
YHR138CP38841 PUT4YOR348C 1884 nt11.94□□□□□ -0.5
YHR138CP38841 SCR1SCR1 522 nt11.92□□□□□ -0.5
YHR138CP38841 URN1YPR152C 1398 nt11.78□□□□□ -0.52
YHR138CP38841 YDJ1YNL064C 1230 nt11.74□□□□□ -0.53
YHR138CP38841 ATS1YAL020C 1002 nt11.71□□□□□ -0.53
YHR138CP38841 OPI9YLR338W 858 nt11.68□□□□□ -0.54
YHR138CP38841 DEP1YAL013W 1218 nt11.65□□□□□ -0.54
YHR138CP38841 RRN5YLR141W 1092 nt11.65□□□□□ -0.54
YHR138CP38841 RPN10YHR200W 807 nt11.64□□□□□ -0.55
YHR138CP38841 ARE1YCR048W 1833 nt11.64□□□□□ -0.55
YHR138CP38841 SAH1YER043C 1350 nt11.62□□□□□ -0.55
YHR138CP38841 POA1YBR022W 534 nt11.55□□□□□ -0.56
YHR138CP38841 YNL208WYNL208W 600 nt11.53□□□□□ -0.56
YHR138CP38841 YHR049C-AYHR049C-A 297 nt11.51□□□□□ -0.57
YHR138CP38841 GAR1YHR089C 618 nt11.47□□□□□ -0.57
YHR138CP38841 YER088W-BYER088W-B 147 nt11.41□□□□□ -0.58
YHR138CP38841 PUN1YLR414C 792 nt11.37□□□□□ -0.59
YHR138CP38841 RSB1YOR049C 1065 nt11.36□□□□□ -0.59
YHR138CP38841 BSC6YOL137W 1494 nt11.34□□□□□ -0.59
YHR138CP38841 BUD23YCR047C 828 nt11.24□□□□□ -0.61
YHR138CP38841 YJR018WYJR018W 363 nt11.24□□□□□ -0.61
YHR138CP38841 PTC2YER089C 1395 nt11.22□□□□□ -0.61
YHR138CP38841 NAB2YGL122C 1578 nt11.15□□□□□ -0.62
YHR138CP38841 TIR1YER011W 765 nt11.11□□□□□ -0.63
YHR138CP38841 RPP2BYDR382W 333 nt11□□□□□ -0.65
YHR138CP38841 SSA1YAL005C 1929 nt10.98□□□□□ -0.65
YHR138CP38841 DAL1YIR027C 1383 nt10.94□□□□□ -0.66
YHR138CP38841 SPT5YML010W 3192 nt10.94□□□□□ -0.66
YHR138CP38841 INM2YDR287W 879 nt10.92□□□□□ -0.66
YHR138CP38841 YJR120WYJR120W 351 nt10.9□□□□□ -0.66
YHR138CP38841 FIS1YIL065C 468 nt10.89□□□□□ -0.67
YHR138CP38841 FPR4YLR449W 1179 nt10.89□□□□□ -0.67
YHR138CP38841 PST2YDR032C 597 nt10.88□□□□□ -0.67
YHR138CP38841 PHO4YFR034C 939 nt10.81□□□□□ -0.68
YHR138CP38841 YBL100CYBL100C 315 nt10.72□□□□□ -0.69
YHR138CP38841 SSA4YER103W 1929 nt10.7□□□□□ -0.7
YHR138CP38841 BDH2YAL061W 1254 nt10.7□□□□□ -0.7
YHR138CP38841 YPS1YLR120C 1710 nt10.7□□□□□ -0.7
YHR138CP38841 MEP2YNL142W 1500 nt10.69□□□□□ -0.7
YHR138CP38841 SRB2YHR041C 633 nt10.65□□□□□ -0.7
YHR138CP38841 YHR165W-AYHR165W-A 312 nt10.61□□□□□ -0.71
YHR138CP38841 YDR095CYDR095C 411 nt10.59□□□□□ -0.71
YHR138CP38841 FUN26YAL022C 1554 nt10.58□□□□□ -0.72
YHR138CP38841 TRM9YML014W 840 nt10.56□□□□□ -0.72
YHR138CP38841 WWM1YFL010C 636 nt10.54□□□□□ -0.72
YHR138CP38841 LSM3YLR438C-A 270 nt10.54□□□□□ -0.72
YHR138CP38841 ALF1YNL148C 765 nt10.53□□□□□ -0.72
YHR138CP38841 YGR021WYGR021W 873 nt10.5□□□□□ -0.73
YHR138CP38841 SHU1YHL006C 453 nt10.47□□□□□ -0.73
YHR138CP38841 DCW1YKL046C 1350 nt10.46□□□□□ -0.74
YHR138CP38841 YFL021C-AYFL021C-A 855 nt10.45□□□□□ -0.74
YHR138CP38841 CCT6YDR188W 1641 nt10.44□□□□□ -0.74
YHR138CP38841 SUF2tP(AGG)C 72 nt10.44□□□□□ -0.74
YHR138CP38841 SUF10tP(AGG)N 72 nt10.44□□□□□ -0.74
YHR138CP38841 YMR090WYMR090W 684 nt10.43□□□□□ -0.74
YHR138CP38841 RPP2AYOL039W 321 nt10.41□□□□□ -0.74
YHR138CP38841 PAC11YDR488C 1602 nt10.4□□□□□ -0.75
YHR138CP38841 HOM6YJR139C 1080 nt10.38□□□□□ -0.75
YHR138CP38841 EMI2YDR516C 1503 nt10.38□□□□□ -0.75
YHR138CP38841 YAL037C-BYAL037C-B 975 nt10.35□□□□□ -0.75
YHR138CP38841 YKL097CYKL097C 411 nt10.35□□□□□ -0.75
YHR138CP38841 SIS1YNL007C 1059 nt10.33□□□□□ -0.76
YHR138CP38841 BDF1YLR399C 2061 nt10.31□□□□□ -0.76
YHR138CP38841 PTP1YDL230W 1008 nt10.31□□□□□ -0.76
YHR138CP38841 YDL221WYDL221W 552 nt10.29□□□□□ -0.76
YHR138CP38841 CAC2YML102W 1407 nt10.26□□□□□ -0.77
YHR138CP38841 MNP1YGL068W 585 nt10.24□□□□□ -0.77
YHR138CP38841 RKM5YLR137W 1104 nt10.24□□□□□ -0.77
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