Protein–RNA interactions for Protein: P38176

AVT5, Vacuolar amino acid transporter 5, yeastyeast

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Length 459 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (RIP-Chip)
Gene UniProt Accession Gene Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score Detected Interaction
AVT5P38176 NSR1YGR159C 1245 nt16.24■□□□□ 0.19
AVT5P38176 YML009W-BYML009W-B 477 nt16.07■□□□□ 0.16
AVT5P38176 NOP1YDL014W 984 nt15.6■□□□□ 0.09
AVT5P38176 MDJ1YFL016C 1536 nt14.56□□□□□ -0.08
AVT5P38176 YKL036CYKL036C 393 nt14.12□□□□□ -0.15
AVT5P38176 SSA3YBL075C 1950 nt13.6□□□□□ -0.23
AVT5P38176 SRX1YKL086W 384 nt13.59□□□□□ -0.23
AVT5P38176 Q0297Q0297 156 nt13.54□□□□□ -0.24
AVT5P38176 YJL027CYJL027C 417 nt13.48□□□□□ -0.25
AVT5P38176 YCR051WYCR051W 669 nt12.85□□□□□ -0.35
AVT5P38176 DBP2YNL112W 1641 nt12.8□□□□□ -0.36
AVT5P38176 SCS3YGL126W 1143 nt12.68□□□□□ -0.38
AVT5P38176 YBR190WYBR190W 312 nt12.56□□□□□ -0.4
AVT5P38176 TRN1tP(UGG)A 72 nt12.42□□□□□ -0.42
AVT5P38176 SUF9tP(UGG)F 72 nt12.42□□□□□ -0.42
AVT5P38176 SUF8tP(UGG)H 72 nt12.42□□□□□ -0.42
AVT5P38176 tP(UGG)LtP(UGG)L 72 nt12.42□□□□□ -0.42
AVT5P38176 SUF7tP(UGG)M 72 nt12.42□□□□□ -0.42
AVT5P38176 tP(UGG)N1tP(UGG)N1 72 nt12.42□□□□□ -0.42
AVT5P38176 tP(UGG)N2tP(UGG)N2 72 nt12.42□□□□□ -0.42
AVT5P38176 tP(UGG)O1tP(UGG)O1 72 nt12.42□□□□□ -0.42
AVT5P38176 SUF11tP(UGG)O2 72 nt12.42□□□□□ -0.42
AVT5P38176 CCC1YLR220W 969 nt12.27□□□□□ -0.45
AVT5P38176 RTC3YHR087W 336 nt12.24□□□□□ -0.45
AVT5P38176 YOL085CYOL085C 342 nt12.21□□□□□ -0.45
AVT5P38176 RPP1BYDL130W 321 nt12.14□□□□□ -0.47
AVT5P38176 RVS167YDR388W 1449 nt12.06□□□□□ -0.48
AVT5P38176 PKP1YIL042C 1185 nt12.01□□□□□ -0.49
AVT5P38176 PUT4YOR348C 1884 nt11.99□□□□□ -0.49
AVT5P38176 SCJ1YMR214W 1134 nt11.84□□□□□ -0.51
AVT5P38176 SSA4YER103W 1929 nt11.75□□□□□ -0.53
AVT5P38176 tP(UGG)O3tP(UGG)O3 72 nt11.66□□□□□ -0.54
AVT5P38176 SPT5YML010W 3192 nt11.61□□□□□ -0.55
AVT5P38176 PET122YER153C 765 nt11.59□□□□□ -0.55
AVT5P38176 POA1YBR022W 534 nt11.57□□□□□ -0.56
AVT5P38176 SHR5YOL110W 714 nt11.56□□□□□ -0.56
AVT5P38176 BSC6YOL137W 1494 nt11.5□□□□□ -0.57
AVT5P38176 SCR1SCR1 522 nt11.48□□□□□ -0.57
AVT5P38176 ARE1YCR048W 1833 nt11.48□□□□□ -0.57
AVT5P38176 PAC11YDR488C 1602 nt11.46□□□□□ -0.57
AVT5P38176 BDF1YLR399C 2061 nt11.37□□□□□ -0.59
AVT5P38176 YHR049C-AYHR049C-A 297 nt11.37□□□□□ -0.59
AVT5P38176 URN1YPR152C 1398 nt11.36□□□□□ -0.59
AVT5P38176 YDJ1YNL064C 1230 nt11.31□□□□□ -0.6
AVT5P38176 ATS1YAL020C 1002 nt11.29□□□□□ -0.6
AVT5P38176 OPI9YLR338W 858 nt11.27□□□□□ -0.61
AVT5P38176 DEP1YAL013W 1218 nt11.24□□□□□ -0.61
AVT5P38176 RRN5YLR141W 1092 nt11.24□□□□□ -0.61
AVT5P38176 SAH1YER043C 1350 nt11.22□□□□□ -0.61
AVT5P38176 RPN10YHR200W 807 nt11.2□□□□□ -0.62
AVT5P38176 TAT1YBR069C 1860 nt11.19□□□□□ -0.62
AVT5P38176 NVJ2YPR091C 2313 nt11.18□□□□□ -0.62
AVT5P38176 YNL208WYNL208W 600 nt11.11□□□□□ -0.63
AVT5P38176 BUD23YCR047C 828 nt11.06□□□□□ -0.64
AVT5P38176 GAR1YHR089C 618 nt11.06□□□□□ -0.64
AVT5P38176 YER088W-BYER088W-B 147 nt11.02□□□□□ -0.65
AVT5P38176 PUN1YLR414C 792 nt10.96□□□□□ -0.65
AVT5P38176 RSB1YOR049C 1065 nt10.94□□□□□ -0.66
AVT5P38176 MEP2YNL142W 1500 nt10.88□□□□□ -0.67
AVT5P38176 YJR018WYJR018W 363 nt10.84□□□□□ -0.67
AVT5P38176 PTC2YER089C 1395 nt10.83□□□□□ -0.68
AVT5P38176 NAB2YGL122C 1578 nt10.76□□□□□ -0.69
AVT5P38176 FPS1YLL043W 2010 nt10.74□□□□□ -0.69
AVT5P38176 TIR1YER011W 765 nt10.72□□□□□ -0.69
AVT5P38176 DCW1YKL046C 1350 nt10.7□□□□□ -0.7
AVT5P38176 YBR220CYBR220C 1683 nt10.65□□□□□ -0.7
AVT5P38176 SSA1YAL005C 1929 nt10.61□□□□□ -0.71
AVT5P38176 RPP2BYDR382W 333 nt10.59□□□□□ -0.71
AVT5P38176 DAL1YIR027C 1383 nt10.55□□□□□ -0.72
AVT5P38176 YJR120WYJR120W 351 nt10.54□□□□□ -0.72
AVT5P38176 YMR090WYMR090W 684 nt10.54□□□□□ -0.72
AVT5P38176 INM2YDR287W 879 nt10.52□□□□□ -0.73
AVT5P38176 FIS1YIL065C 468 nt10.52□□□□□ -0.73
AVT5P38176 PCH2YBR186W 1695 nt10.52□□□□□ -0.73
AVT5P38176 EMI2YDR516C 1503 nt10.52□□□□□ -0.73
AVT5P38176 PST2YDR032C 597 nt10.5□□□□□ -0.73
AVT5P38176 GUT2YIL155C 1950 nt10.49□□□□□ -0.73
AVT5P38176 FPR4YLR449W 1179 nt10.49□□□□□ -0.73
AVT5P38176 PHO4YFR034C 939 nt10.43□□□□□ -0.74
AVT5P38176 SDH1YKL148C 1923 nt10.41□□□□□ -0.74
AVT5P38176 SEC11YIR022W 504 nt10.4□□□□□ -0.74
AVT5P38176 YPS1YLR120C 1710 nt10.4□□□□□ -0.74
AVT5P38176 Q0182Q0182 405 nt10.39□□□□□ -0.75
AVT5P38176 YHR165W-AYHR165W-A 312 nt10.39□□□□□ -0.75
AVT5P38176 YDL221WYDL221W 552 nt10.35□□□□□ -0.75
AVT5P38176 UME6YDR207C 2511 nt10.34□□□□□ -0.75
AVT5P38176 YBL100CYBL100C 315 nt10.34□□□□□ -0.75
AVT5P38176 SRB2YHR041C 633 nt10.32□□□□□ -0.76
AVT5P38176 BDH2YAL061W 1254 nt10.32□□□□□ -0.76
AVT5P38176 PIB2YGL023C 1908 nt10.27□□□□□ -0.77
AVT5P38176 BOR1YNL275W 1731 nt10.23□□□□□ -0.77
AVT5P38176 YDR095CYDR095C 411 nt10.22□□□□□ -0.77
AVT5P38176 FUN26YAL022C 1554 nt10.21□□□□□ -0.78
AVT5P38176 SCC4YER147C 1875 nt10.2□□□□□ -0.78
AVT5P38176 TRM9YML014W 840 nt10.18□□□□□ -0.78
AVT5P38176 WWM1YFL010C 636 nt10.17□□□□□ -0.78
AVT5P38176 LSM3YLR438C-A 270 nt10.17□□□□□ -0.78
AVT5P38176 CAC2YML102W 1407 nt10.16□□□□□ -0.78
AVT5P38176 RTF1YGL244W 1677 nt10.16□□□□□ -0.78
AVT5P38176 ALF1YNL148C 765 nt10.13□□□□□ -0.79
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