Protein–RNA interactions for Protein: Q12303

YPS3, Aspartic proteinase yapsin-3, yeastyeast

Predictions only

Length 508 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (RIP-Chip)
Gene UniProt Accession Gene Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score Detected Interaction
YPS3Q12303 NSR1YGR159C 1245 nt16.53■□□□□ 0.24
YPS3Q12303 YML009W-BYML009W-B 477 nt16.39■□□□□ 0.21
YPS3Q12303 NOP1YDL014W 984 nt15.82■□□□□ 0.12
YPS3Q12303 MDJ1YFL016C 1536 nt14.97□□□□□ -0.01
YPS3Q12303 YKL036CYKL036C 393 nt14.26□□□□□ -0.13
YPS3Q12303 YJL027CYJL027C 417 nt13.83□□□□□ -0.2
YPS3Q12303 SRX1YKL086W 384 nt13.76□□□□□ -0.21
YPS3Q12303 Q0297Q0297 156 nt13.67□□□□□ -0.22
YPS3Q12303 YCR051WYCR051W 669 nt13.09□□□□□ -0.31
YPS3Q12303 DBP2YNL112W 1641 nt13.06□□□□□ -0.32
YPS3Q12303 YBR190WYBR190W 312 nt12.86□□□□□ -0.35
YPS3Q12303 SCS3YGL126W 1143 nt12.78□□□□□ -0.36
YPS3Q12303 RTC3YHR087W 336 nt12.63□□□□□ -0.39
YPS3Q12303 TRN1tP(UGG)A 72 nt12.61□□□□□ -0.39
YPS3Q12303 SUF9tP(UGG)F 72 nt12.61□□□□□ -0.39
YPS3Q12303 SUF8tP(UGG)H 72 nt12.61□□□□□ -0.39
YPS3Q12303 tP(UGG)LtP(UGG)L 72 nt12.61□□□□□ -0.39
YPS3Q12303 SUF7tP(UGG)M 72 nt12.61□□□□□ -0.39
YPS3Q12303 tP(UGG)N1tP(UGG)N1 72 nt12.61□□□□□ -0.39
YPS3Q12303 tP(UGG)N2tP(UGG)N2 72 nt12.61□□□□□ -0.39
YPS3Q12303 tP(UGG)O1tP(UGG)O1 72 nt12.61□□□□□ -0.39
YPS3Q12303 SUF11tP(UGG)O2 72 nt12.61□□□□□ -0.39
YPS3Q12303 CCC1YLR220W 969 nt12.57□□□□□ -0.4
YPS3Q12303 YOL085CYOL085C 342 nt12.33□□□□□ -0.44
YPS3Q12303 RVS167YDR388W 1449 nt12.33□□□□□ -0.44
YPS3Q12303 RPP1BYDL130W 321 nt12.29□□□□□ -0.44
YPS3Q12303 PKP1YIL042C 1185 nt12.21□□□□□ -0.45
YPS3Q12303 SCJ1YMR214W 1134 nt12.09□□□□□ -0.47
YPS3Q12303 PUT4YOR348C 1884 nt11.87□□□□□ -0.51
YPS3Q12303 tP(UGG)O3tP(UGG)O3 72 nt11.85□□□□□ -0.51
YPS3Q12303 SSA3YBL075C 1950 nt11.83□□□□□ -0.52
YPS3Q12303 SHR5YOL110W 714 nt11.77□□□□□ -0.53
YPS3Q12303 PET122YER153C 765 nt11.76□□□□□ -0.53
YPS3Q12303 URN1YPR152C 1398 nt11.66□□□□□ -0.54
YPS3Q12303 SCR1SCR1 522 nt11.62□□□□□ -0.55
YPS3Q12303 DEP1YAL013W 1218 nt11.57□□□□□ -0.56
YPS3Q12303 ARE1YCR048W 1833 nt11.57□□□□□ -0.56
YPS3Q12303 SAH1YER043C 1350 nt11.54□□□□□ -0.56
YPS3Q12303 OPI9YLR338W 858 nt11.53□□□□□ -0.56
YPS3Q12303 POA1YBR022W 534 nt11.53□□□□□ -0.56
YPS3Q12303 YHR049C-AYHR049C-A 297 nt11.47□□□□□ -0.57
YPS3Q12303 RPN10YHR200W 807 nt11.45□□□□□ -0.58
YPS3Q12303 YDJ1YNL064C 1230 nt11.45□□□□□ -0.58
YPS3Q12303 RRN5YLR141W 1092 nt11.4□□□□□ -0.58
YPS3Q12303 ATS1YAL020C 1002 nt11.34□□□□□ -0.59
YPS3Q12303 YNL208WYNL208W 600 nt11.34□□□□□ -0.59
YPS3Q12303 BSC6YOL137W 1494 nt11.32□□□□□ -0.6
YPS3Q12303 GAR1YHR089C 618 nt11.29□□□□□ -0.6
YPS3Q12303 BUD23YCR047C 828 nt11.23□□□□□ -0.61
YPS3Q12303 PUN1YLR414C 792 nt11.22□□□□□ -0.61
YPS3Q12303 YER088W-BYER088W-B 147 nt11.16□□□□□ -0.62
YPS3Q12303 PTC2YER089C 1395 nt11.14□□□□□ -0.63
YPS3Q12303 RSB1YOR049C 1065 nt11.11□□□□□ -0.63
YPS3Q12303 YJR018WYJR018W 363 nt11.1□□□□□ -0.63
YPS3Q12303 NAB2YGL122C 1578 nt11.03□□□□□ -0.64
YPS3Q12303 TIR1YER011W 765 nt10.91□□□□□ -0.66
YPS3Q12303 SPT5YML010W 3192 nt10.9□□□□□ -0.66
YPS3Q12303 FPR4YLR449W 1179 nt10.85□□□□□ -0.67
YPS3Q12303 RPP2BYDR382W 333 nt10.84□□□□□ -0.67
YPS3Q12303 DAL1YIR027C 1383 nt10.82□□□□□ -0.68
YPS3Q12303 SSA1YAL005C 1929 nt10.81□□□□□ -0.68
YPS3Q12303 FIS1YIL065C 468 nt10.79□□□□□ -0.68
YPS3Q12303 YJR120WYJR120W 351 nt10.76□□□□□ -0.69
YPS3Q12303 SSA4YER103W 1929 nt10.76□□□□□ -0.69
YPS3Q12303 INM2YDR287W 879 nt10.75□□□□□ -0.69
YPS3Q12303 PHO4YFR034C 939 nt10.71□□□□□ -0.69
YPS3Q12303 MEP2YNL142W 1500 nt10.65□□□□□ -0.7
YPS3Q12303 YBL100CYBL100C 315 nt10.6□□□□□ -0.71
YPS3Q12303 YPS1YLR120C 1710 nt10.6□□□□□ -0.71
YPS3Q12303 YHR165W-AYHR165W-A 312 nt10.57□□□□□ -0.72
YPS3Q12303 PST2YDR032C 597 nt10.53□□□□□ -0.72
YPS3Q12303 SRB2YHR041C 633 nt10.51□□□□□ -0.73
YPS3Q12303 BDH2YAL061W 1254 nt10.51□□□□□ -0.73
YPS3Q12303 YDR095CYDR095C 411 nt10.47□□□□□ -0.73
YPS3Q12303 DCW1YKL046C 1350 nt10.47□□□□□ -0.73
YPS3Q12303 FUN26YAL022C 1554 nt10.44□□□□□ -0.74
YPS3Q12303 ALF1YNL148C 765 nt10.42□□□□□ -0.74
YPS3Q12303 TRM9YML014W 840 nt10.41□□□□□ -0.74
YPS3Q12303 WWM1YFL010C 636 nt10.37□□□□□ -0.75
YPS3Q12303 YMR090WYMR090W 684 nt10.37□□□□□ -0.75
YPS3Q12303 EMI2YDR516C 1503 nt10.35□□□□□ -0.75
YPS3Q12303 BDF1YLR399C 2061 nt10.31□□□□□ -0.76
YPS3Q12303 LSM3YLR438C-A 270 nt10.31□□□□□ -0.76
YPS3Q12303 RPP2AYOL039W 321 nt10.3□□□□□ -0.76
YPS3Q12303 CCT6YDR188W 1641 nt10.26□□□□□ -0.77
YPS3Q12303 SUF2tP(AGG)C 72 nt10.26□□□□□ -0.77
YPS3Q12303 SUF10tP(AGG)N 72 nt10.26□□□□□ -0.77
YPS3Q12303 YDL221WYDL221W 552 nt10.24□□□□□ -0.77
YPS3Q12303 YBR220CYBR220C 1683 nt10.23□□□□□ -0.77
YPS3Q12303 PTP1YDL230W 1008 nt10.23□□□□□ -0.77
YPS3Q12303 YGR021WYGR021W 873 nt10.23□□□□□ -0.77
YPS3Q12303 CAC2YML102W 1407 nt10.22□□□□□ -0.77
YPS3Q12303 YFL021C-AYFL021C-A 855 nt10.2□□□□□ -0.78
YPS3Q12303 SHU1YHL006C 453 nt10.19□□□□□ -0.78
YPS3Q12303 SIS1YNL007C 1059 nt10.18□□□□□ -0.78
YPS3Q12303 TAT1YBR069C 1860 nt10.18□□□□□ -0.78
YPS3Q12303 SDH1YKL148C 1923 nt10.17□□□□□ -0.78
YPS3Q12303 YAL037C-BYAL037C-B 975 nt10.16□□□□□ -0.78
YPS3Q12303 HOM6YJR139C 1080 nt10.13□□□□□ -0.79
YPS3Q12303 SCC4YER147C 1875 nt10.08□□□□□ -0.8
Retrieved 100 of 7,029 protein–RNA pairs in 13.1 ms