Protein–RNA interactions for Protein: P34161

YOX1, Homeobox protein YOX1, yeastyeast

Predictions only

Length 385 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (RIP-Chip)
Gene UniProt Accession Gene Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score Detected Interaction
YOX1P34161 YML009W-BYML009W-B 477 nt17.35■□□□□ 0.37
YOX1P34161 NSR1YGR159C 1245 nt17.24■□□□□ 0.35
YOX1P34161 NOP1YDL014W 984 nt16.83■□□□□ 0.28
YOX1P34161 YKL036CYKL036C 393 nt15.48■□□□□ 0.07
YOX1P34161 MDJ1YFL016C 1536 nt15.38■□□□□ 0.05
YOX1P34161 Q0297Q0297 156 nt14.68□□□□□ -0.06
YOX1P34161 SRX1YKL086W 384 nt14.68□□□□□ -0.06
YOX1P34161 YJL027CYJL027C 417 nt14.46□□□□□ -0.09
YOX1P34161 SCS3YGL126W 1143 nt14.04□□□□□ -0.16
YOX1P34161 YCR051WYCR051W 669 nt13.98□□□□□ -0.17
YOX1P34161 DBP2YNL112W 1641 nt13.54□□□□□ -0.24
YOX1P34161 YOL085CYOL085C 342 nt13.4□□□□□ -0.26
YOX1P34161 TRN1tP(UGG)A 72 nt13.29□□□□□ -0.28
YOX1P34161 SUF9tP(UGG)F 72 nt13.29□□□□□ -0.28
YOX1P34161 SUF8tP(UGG)H 72 nt13.29□□□□□ -0.28
YOX1P34161 tP(UGG)LtP(UGG)L 72 nt13.29□□□□□ -0.28
YOX1P34161 SUF7tP(UGG)M 72 nt13.29□□□□□ -0.28
YOX1P34161 tP(UGG)N1tP(UGG)N1 72 nt13.29□□□□□ -0.28
YOX1P34161 tP(UGG)N2tP(UGG)N2 72 nt13.29□□□□□ -0.28
YOX1P34161 tP(UGG)O1tP(UGG)O1 72 nt13.29□□□□□ -0.28
YOX1P34161 SUF11tP(UGG)O2 72 nt13.29□□□□□ -0.28
YOX1P34161 PKP1YIL042C 1185 nt13.25□□□□□ -0.29
YOX1P34161 CCC1YLR220W 969 nt13.24□□□□□ -0.29
YOX1P34161 RPP1BYDL130W 321 nt13.19□□□□□ -0.3
YOX1P34161 YBR190WYBR190W 312 nt13.1□□□□□ -0.31
YOX1P34161 RTC3YHR087W 336 nt12.89□□□□□ -0.35
YOX1P34161 RVS167YDR388W 1449 nt12.78□□□□□ -0.36
YOX1P34161 SCJ1YMR214W 1134 nt12.67□□□□□ -0.38
YOX1P34161 PET122YER153C 765 nt12.61□□□□□ -0.39
YOX1P34161 tP(UGG)O3tP(UGG)O3 72 nt12.58□□□□□ -0.4
YOX1P34161 ATS1YAL020C 1002 nt12.55□□□□□ -0.4
YOX1P34161 SCR1SCR1 522 nt12.49□□□□□ -0.41
YOX1P34161 SSA3YBL075C 1950 nt12.32□□□□□ -0.44
YOX1P34161 SHR5YOL110W 714 nt12.3□□□□□ -0.44
YOX1P34161 RRN5YLR141W 1092 nt12.27□□□□□ -0.45
YOX1P34161 YDJ1YNL064C 1230 nt12.15□□□□□ -0.46
YOX1P34161 YER088W-BYER088W-B 147 nt12.01□□□□□ -0.49
YOX1P34161 DEP1YAL013W 1218 nt12.01□□□□□ -0.49
YOX1P34161 RSB1YOR049C 1065 nt12.01□□□□□ -0.49
YOX1P34161 URN1YPR152C 1398 nt12□□□□□ -0.49
YOX1P34161 GAR1YHR089C 618 nt11.94□□□□□ -0.5
YOX1P34161 PUT4YOR348C 1884 nt11.91□□□□□ -0.5
YOX1P34161 RPN10YHR200W 807 nt11.81□□□□□ -0.52
YOX1P34161 OPI9YLR338W 858 nt11.81□□□□□ -0.52
YOX1P34161 YNL208WYNL208W 600 nt11.79□□□□□ -0.52
YOX1P34161 SAH1YER043C 1350 nt11.78□□□□□ -0.52
YOX1P34161 ARE1YCR048W 1833 nt11.7□□□□□ -0.54
YOX1P34161 PST2YDR032C 597 nt11.62□□□□□ -0.55
YOX1P34161 POA1YBR022W 534 nt11.6□□□□□ -0.55
YOX1P34161 YHR049C-AYHR049C-A 297 nt11.57□□□□□ -0.56
YOX1P34161 TIR1YER011W 765 nt11.52□□□□□ -0.57
YOX1P34161 PUN1YLR414C 792 nt11.48□□□□□ -0.57
YOX1P34161 YJR018WYJR018W 363 nt11.44□□□□□ -0.58
YOX1P34161 SSA1YAL005C 1929 nt11.38□□□□□ -0.59
YOX1P34161 PTC2YER089C 1395 nt11.38□□□□□ -0.59
YOX1P34161 BUD23YCR047C 828 nt11.34□□□□□ -0.59
YOX1P34161 BSC6YOL137W 1494 nt11.32□□□□□ -0.6
YOX1P34161 RPP2BYDR382W 333 nt11.22□□□□□ -0.61
YOX1P34161 YJR120WYJR120W 351 nt11.21□□□□□ -0.61
YOX1P34161 NAB2YGL122C 1578 nt11.2□□□□□ -0.62
YOX1P34161 SHU1YHL006C 453 nt11.17□□□□□ -0.62
YOX1P34161 SRB2YHR041C 633 nt11.17□□□□□ -0.62
YOX1P34161 YKL097CYKL097C 411 nt11.16□□□□□ -0.62
YOX1P34161 FPR4YLR449W 1179 nt11.1□□□□□ -0.63
YOX1P34161 YAL037C-BYAL037C-B 975 nt11.06□□□□□ -0.64
YOX1P34161 DAL1YIR027C 1383 nt11.05□□□□□ -0.64
YOX1P34161 INM2YDR287W 879 nt11.04□□□□□ -0.64
YOX1P34161 WWM1YFL010C 636 nt11.01□□□□□ -0.65
YOX1P34161 FIS1YIL065C 468 nt11.01□□□□□ -0.65
YOX1P34161 FPS1YLL043W 2010 nt10.99□□□□□ -0.65
YOX1P34161 BDH2YAL061W 1254 nt10.95□□□□□ -0.66
YOX1P34161 PHO4YFR034C 939 nt10.94□□□□□ -0.66
YOX1P34161 YBL100CYBL100C 315 nt10.93□□□□□ -0.66
YOX1P34161 YGR021WYGR021W 873 nt10.91□□□□□ -0.66
YOX1P34161 HOM6YJR139C 1080 nt10.86□□□□□ -0.67
YOX1P34161 NVJ2YPR091C 2313 nt10.83□□□□□ -0.68
YOX1P34161 MNP1YGL068W 585 nt10.82□□□□□ -0.68
YOX1P34161 YFL021C-AYFL021C-A 855 nt10.81□□□□□ -0.68
YOX1P34161 LSM3YLR438C-A 270 nt10.8□□□□□ -0.68
YOX1P34161 FUN26YAL022C 1554 nt10.8□□□□□ -0.68
YOX1P34161 TRM9YML014W 840 nt10.79□□□□□ -0.68
YOX1P34161 PAC11YDR488C 1602 nt10.74□□□□□ -0.69
YOX1P34161 YPS1YLR120C 1710 nt10.73□□□□□ -0.69
YOX1P34161 SPT5YML010W 3192 nt10.73□□□□□ -0.69
YOX1P34161 RKM5YLR137W 1104 nt10.71□□□□□ -0.69
YOX1P34161 YOR139CYOR139C 393 nt10.7□□□□□ -0.7
YOX1P34161 ALF1YNL148C 765 nt10.68□□□□□ -0.7
YOX1P34161 YHR165W-AYHR165W-A 312 nt10.67□□□□□ -0.7
YOX1P34161 NPL3YDR432W 1245 nt10.66□□□□□ -0.7
YOX1P34161 YDR095CYDR095C 411 nt10.65□□□□□ -0.7
YOX1P34161 CCT6YDR188W 1641 nt10.63□□□□□ -0.71
YOX1P34161 MEP2YNL142W 1500 nt10.62□□□□□ -0.71
YOX1P34161 YOL037CYOL037C 354 nt10.6□□□□□ -0.71
YOX1P34161 SUF2tP(AGG)C 72 nt10.57□□□□□ -0.72
YOX1P34161 SUF10tP(AGG)N 72 nt10.57□□□□□ -0.72
YOX1P34161 RPP2AYOL039W 321 nt10.48□□□□□ -0.73
YOX1P34161 SIS1YNL007C 1059 nt10.47□□□□□ -0.73
YOX1P34161 DCW1YKL046C 1350 nt10.47□□□□□ -0.73
YOX1P34161 PTP1YDL230W 1008 nt10.41□□□□□ -0.74
YOX1P34161 SSA4YER103W 1929 nt10.4□□□□□ -0.74
Retrieved 100 of 7,029 protein–RNA pairs in 16.2 ms