Protein–RNA interactions for Protein: P46989

ATG27, Autophagy-related protein 27, yeastyeast

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Length 271 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (RIP-Chip)
Gene UniProt Accession Gene Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score Detected Interaction
ATG27P46989 NSR1YGR159C 1245 nt16.16■□□□□ 0.18
ATG27P46989 YML009W-BYML009W-B 477 nt15.94■□□□□ 0.14
ATG27P46989 NOP1YDL014W 984 nt15.4■□□□□ 0.06
ATG27P46989 MDJ1YFL016C 1536 nt14.61□□□□□ -0.07
ATG27P46989 YKL036CYKL036C 393 nt13.91□□□□□ -0.18
ATG27P46989 YJL027CYJL027C 417 nt13.47□□□□□ -0.25
ATG27P46989 SRX1YKL086W 384 nt13.46□□□□□ -0.25
ATG27P46989 Q0297Q0297 156 nt13.4□□□□□ -0.26
ATG27P46989 DBP2YNL112W 1641 nt12.84□□□□□ -0.35
ATG27P46989 SSA3YBL075C 1950 nt12.81□□□□□ -0.36
ATG27P46989 YCR051WYCR051W 669 nt12.7□□□□□ -0.38
ATG27P46989 YBR190WYBR190W 312 nt12.6□□□□□ -0.39
ATG27P46989 SCS3YGL126W 1143 nt12.49□□□□□ -0.41
ATG27P46989 TRN1tP(UGG)A 72 nt12.37□□□□□ -0.43
ATG27P46989 SUF9tP(UGG)F 72 nt12.37□□□□□ -0.43
ATG27P46989 SUF8tP(UGG)H 72 nt12.37□□□□□ -0.43
ATG27P46989 tP(UGG)LtP(UGG)L 72 nt12.37□□□□□ -0.43
ATG27P46989 SUF7tP(UGG)M 72 nt12.37□□□□□ -0.43
ATG27P46989 tP(UGG)N1tP(UGG)N1 72 nt12.37□□□□□ -0.43
ATG27P46989 tP(UGG)N2tP(UGG)N2 72 nt12.37□□□□□ -0.43
ATG27P46989 tP(UGG)O1tP(UGG)O1 72 nt12.37□□□□□ -0.43
ATG27P46989 SUF11tP(UGG)O2 72 nt12.37□□□□□ -0.43
ATG27P46989 RTC3YHR087W 336 nt12.28□□□□□ -0.44
ATG27P46989 CCC1YLR220W 969 nt12.17□□□□□ -0.46
ATG27P46989 YOL085CYOL085C 342 nt12.05□□□□□ -0.48
ATG27P46989 RPP1BYDL130W 321 nt12.01□□□□□ -0.49
ATG27P46989 RVS167YDR388W 1449 nt11.98□□□□□ -0.49
ATG27P46989 PUT4YOR348C 1884 nt11.94□□□□□ -0.5
ATG27P46989 SCJ1YMR214W 1134 nt11.87□□□□□ -0.51
ATG27P46989 PKP1YIL042C 1185 nt11.86□□□□□ -0.51
ATG27P46989 Q0182Q0182 405 nt11.63□□□□□ -0.55
ATG27P46989 tP(UGG)O3tP(UGG)O3 72 nt11.57□□□□□ -0.56
ATG27P46989 ARE1YCR048W 1833 nt11.52□□□□□ -0.57
ATG27P46989 POA1YBR022W 534 nt11.52□□□□□ -0.57
ATG27P46989 PET122YER153C 765 nt11.5□□□□□ -0.57
ATG27P46989 SHR5YOL110W 714 nt11.5□□□□□ -0.57
ATG27P46989 BSC6YOL137W 1494 nt11.39□□□□□ -0.59
ATG27P46989 YHR049C-AYHR049C-A 297 nt11.37□□□□□ -0.59
ATG27P46989 SPT5YML010W 3192 nt11.37□□□□□ -0.59
ATG27P46989 URN1YPR152C 1398 nt11.36□□□□□ -0.59
ATG27P46989 SAH1YER043C 1350 nt11.31□□□□□ -0.6
ATG27P46989 SSA4YER103W 1929 nt11.3□□□□□ -0.6
ATG27P46989 OPI9YLR338W 858 nt11.29□□□□□ -0.6
ATG27P46989 SCR1SCR1 522 nt11.28□□□□□ -0.6
ATG27P46989 DEP1YAL013W 1218 nt11.23□□□□□ -0.61
ATG27P46989 YDJ1YNL064C 1230 nt11.23□□□□□ -0.61
ATG27P46989 RPN10YHR200W 807 nt11.13□□□□□ -0.63
ATG27P46989 RRN5YLR141W 1092 nt11.11□□□□□ -0.63
ATG27P46989 MOT3YMR070W 1473 nt11.09□□□□□ -0.63
ATG27P46989 ATS1YAL020C 1002 nt11.08□□□□□ -0.64
ATG27P46989 BUD23YCR047C 828 nt11.06□□□□□ -0.64
ATG27P46989 YNL208WYNL208W 600 nt11.06□□□□□ -0.64
ATG27P46989 GAR1YHR089C 618 nt10.97□□□□□ -0.65
ATG27P46989 PUN1YLR414C 792 nt10.95□□□□□ -0.66
ATG27P46989 BDF1YLR399C 2061 nt10.93□□□□□ -0.66
ATG27P46989 YER088W-BYER088W-B 147 nt10.91□□□□□ -0.66
ATG27P46989 PTC2YER089C 1395 nt10.87□□□□□ -0.67
ATG27P46989 NAB2YGL122C 1578 nt10.82□□□□□ -0.68
ATG27P46989 YJR018WYJR018W 363 nt10.81□□□□□ -0.68
ATG27P46989 RSB1YOR049C 1065 nt10.78□□□□□ -0.68
ATG27P46989 MEP2YNL142W 1500 nt10.78□□□□□ -0.68
ATG27P46989 TAT1YBR069C 1860 nt10.77□□□□□ -0.69
ATG27P46989 TIR1YER011W 765 nt10.64□□□□□ -0.71
ATG27P46989 PAC11YDR488C 1602 nt10.63□□□□□ -0.71
ATG27P46989 FIS1YIL065C 468 nt10.62□□□□□ -0.71
ATG27P46989 YJR120WYJR120W 351 nt10.62□□□□□ -0.71
ATG27P46989 SSA1YAL005C 1929 nt10.58□□□□□ -0.72
ATG27P46989 DCW1YKL046C 1350 nt10.58□□□□□ -0.72
ATG27P46989 DAL1YIR027C 1383 nt10.57□□□□□ -0.72
ATG27P46989 RPP2BYDR382W 333 nt10.51□□□□□ -0.73
ATG27P46989 FPR4YLR449W 1179 nt10.51□□□□□ -0.73
ATG27P46989 YPS1YLR120C 1710 nt10.48□□□□□ -0.73
ATG27P46989 INM2YDR287W 879 nt10.48□□□□□ -0.73
ATG27P46989 PHO4YFR034C 939 nt10.47□□□□□ -0.73
ATG27P46989 YBR220CYBR220C 1683 nt10.47□□□□□ -0.73
ATG27P46989 EMI2YDR516C 1503 nt10.43□□□□□ -0.74
ATG27P46989 YMR090WYMR090W 684 nt10.42□□□□□ -0.74
ATG27P46989 YHR165W-AYHR165W-A 312 nt10.41□□□□□ -0.74
ATG27P46989 SRB2YHR041C 633 nt10.35□□□□□ -0.75
ATG27P46989 NVJ2YPR091C 2313 nt10.34□□□□□ -0.75
ATG27P46989 PST2YDR032C 597 nt10.33□□□□□ -0.76
ATG27P46989 YBL100CYBL100C 315 nt10.32□□□□□ -0.76
ATG27P46989 YDR095CYDR095C 411 nt10.3□□□□□ -0.76
ATG27P46989 SDH1YKL148C 1923 nt10.29□□□□□ -0.76
ATG27P46989 YDL221WYDL221W 552 nt10.29□□□□□ -0.76
ATG27P46989 BDH2YAL061W 1254 nt10.27□□□□□ -0.77
ATG27P46989 PCH2YBR186W 1695 nt10.25□□□□□ -0.77
ATG27P46989 GUT2YIL155C 1950 nt10.21□□□□□ -0.77
ATG27P46989 CAC2YML102W 1407 nt10.2□□□□□ -0.78
ATG27P46989 FUN26YAL022C 1554 nt10.19□□□□□ -0.78
ATG27P46989 SEC11YIR022W 504 nt10.19□□□□□ -0.78
ATG27P46989 PTP1YDL230W 1008 nt10.16□□□□□ -0.78
ATG27P46989 SCC4YER147C 1875 nt10.13□□□□□ -0.79
ATG27P46989 RPP2AYOL039W 321 nt10.13□□□□□ -0.79
ATG27P46989 YJL225CYJL225C 5277 nt10.12□□□□□ -0.79
ATG27P46989 WWM1YFL010C 636 nt10.11□□□□□ -0.79
ATG27P46989 TRM9YML014W 840 nt10.1□□□□□ -0.79
ATG27P46989 ALF1YNL148C 765 nt10.09□□□□□ -0.79
ATG27P46989 LSM3YLR438C-A 270 nt10.08□□□□□ -0.8
ATG27P46989 CCT6YDR188W 1641 nt10.07□□□□□ -0.8
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