Protein–RNA interactions for Protein: P19955

YMR31, 37S ribosomal protein YMR-31, mitochondrial, yeastyeast

Predictions only

Length 123 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (RIP-Chip)
Gene UniProt Accession Gene Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score Detected Interaction
YMR31P19955 NSR1YGR159C 1245 nt16.81■□□□□ 0.28
YMR31P19955 YML009W-BYML009W-B 477 nt16.72■□□□□ 0.27
YMR31P19955 NOP1YDL014W 984 nt16.2■□□□□ 0.18
YMR31P19955 MDJ1YFL016C 1536 nt15.12■□□□□ 0.01
YMR31P19955 YKL036CYKL036C 393 nt14.7□□□□□ -0.06
YMR31P19955 SRX1YKL086W 384 nt14.11□□□□□ -0.15
YMR31P19955 Q0297Q0297 156 nt14.05□□□□□ -0.16
YMR31P19955 YJL027CYJL027C 417 nt13.98□□□□□ -0.17
YMR31P19955 YCR051WYCR051W 669 nt13.4□□□□□ -0.26
YMR31P19955 DBP2YNL112W 1641 nt13.23□□□□□ -0.29
YMR31P19955 SCS3YGL126W 1143 nt13.22□□□□□ -0.29
YMR31P19955 YBR190WYBR190W 312 nt12.97□□□□□ -0.33
YMR31P19955 TRN1tP(UGG)A 72 nt12.87□□□□□ -0.35
YMR31P19955 SUF9tP(UGG)F 72 nt12.87□□□□□ -0.35
YMR31P19955 SUF8tP(UGG)H 72 nt12.87□□□□□ -0.35
YMR31P19955 tP(UGG)LtP(UGG)L 72 nt12.87□□□□□ -0.35
YMR31P19955 SUF7tP(UGG)M 72 nt12.87□□□□□ -0.35
YMR31P19955 tP(UGG)N1tP(UGG)N1 72 nt12.87□□□□□ -0.35
YMR31P19955 tP(UGG)N2tP(UGG)N2 72 nt12.87□□□□□ -0.35
YMR31P19955 tP(UGG)O1tP(UGG)O1 72 nt12.87□□□□□ -0.35
YMR31P19955 SUF11tP(UGG)O2 72 nt12.87□□□□□ -0.35
YMR31P19955 CCC1YLR220W 969 nt12.79□□□□□ -0.36
YMR31P19955 RTC3YHR087W 336 nt12.71□□□□□ -0.37
YMR31P19955 YOL085CYOL085C 342 nt12.71□□□□□ -0.37
YMR31P19955 RPP1BYDL130W 321 nt12.62□□□□□ -0.39
YMR31P19955 PKP1YIL042C 1185 nt12.56□□□□□ -0.4
YMR31P19955 RVS167YDR388W 1449 nt12.51□□□□□ -0.41
YMR31P19955 SCJ1YMR214W 1134 nt12.3□□□□□ -0.44
YMR31P19955 tP(UGG)O3tP(UGG)O3 72 nt12.12□□□□□ -0.47
YMR31P19955 PET122YER153C 765 nt12.06□□□□□ -0.48
YMR31P19955 SHR5YOL110W 714 nt11.98□□□□□ -0.49
YMR31P19955 SCR1SCR1 522 nt11.94□□□□□ -0.5
YMR31P19955 PUT4YOR348C 1884 nt11.89□□□□□ -0.51
YMR31P19955 URN1YPR152C 1398 nt11.79□□□□□ -0.52
YMR31P19955 ATS1YAL020C 1002 nt11.77□□□□□ -0.53
YMR31P19955 YDJ1YNL064C 1230 nt11.73□□□□□ -0.53
YMR31P19955 DEP1YAL013W 1218 nt11.71□□□□□ -0.53
YMR31P19955 RRN5YLR141W 1092 nt11.71□□□□□ -0.53
YMR31P19955 OPI9YLR338W 858 nt11.65□□□□□ -0.54
YMR31P19955 SAH1YER043C 1350 nt11.62□□□□□ -0.55
YMR31P19955 RPN10YHR200W 807 nt11.61□□□□□ -0.55
YMR31P19955 ARE1YCR048W 1833 nt11.6□□□□□ -0.55
YMR31P19955 SSA3YBL075C 1950 nt11.59□□□□□ -0.55
YMR31P19955 POA1YBR022W 534 nt11.55□□□□□ -0.56
YMR31P19955 GAR1YHR089C 618 nt11.52□□□□□ -0.57
YMR31P19955 YNL208WYNL208W 600 nt11.52□□□□□ -0.57
YMR31P19955 YHR049C-AYHR049C-A 297 nt11.51□□□□□ -0.57
YMR31P19955 YER088W-BYER088W-B 147 nt11.46□□□□□ -0.57
YMR31P19955 RSB1YOR049C 1065 nt11.43□□□□□ -0.58
YMR31P19955 BSC6YOL137W 1494 nt11.33□□□□□ -0.6
YMR31P19955 PUN1YLR414C 792 nt11.33□□□□□ -0.6
YMR31P19955 BUD23YCR047C 828 nt11.26□□□□□ -0.61
YMR31P19955 YJR018WYJR018W 363 nt11.23□□□□□ -0.61
YMR31P19955 PTC2YER089C 1395 nt11.21□□□□□ -0.61
YMR31P19955 TIR1YER011W 765 nt11.13□□□□□ -0.63
YMR31P19955 NAB2YGL122C 1578 nt11.11□□□□□ -0.63
YMR31P19955 SSA1YAL005C 1929 nt11.01□□□□□ -0.65
YMR31P19955 RPP2BYDR382W 333 nt10.99□□□□□ -0.65
YMR31P19955 FPR4YLR449W 1179 nt10.93□□□□□ -0.66
YMR31P19955 PST2YDR032C 597 nt10.92□□□□□ -0.66
YMR31P19955 YJR120WYJR120W 351 nt10.92□□□□□ -0.66
YMR31P19955 DAL1YIR027C 1383 nt10.91□□□□□ -0.66
YMR31P19955 INM2YDR287W 879 nt10.88□□□□□ -0.67
YMR31P19955 FIS1YIL065C 468 nt10.88□□□□□ -0.67
YMR31P19955 SPT5YML010W 3192 nt10.82□□□□□ -0.68
YMR31P19955 PHO4YFR034C 939 nt10.8□□□□□ -0.68
YMR31P19955 YBL100CYBL100C 315 nt10.73□□□□□ -0.69
YMR31P19955 SRB2YHR041C 633 nt10.72□□□□□ -0.69
YMR31P19955 Q0182Q0182 405 nt10.71□□□□□ -0.69
YMR31P19955 BDH2YAL061W 1254 nt10.68□□□□□ -0.7
YMR31P19955 MEP2YNL142W 1500 nt10.65□□□□□ -0.7
YMR31P19955 YPS1YLR120C 1710 nt10.64□□□□□ -0.71
YMR31P19955 SSA4YER103W 1929 nt10.62□□□□□ -0.71
YMR31P19955 YHR165W-AYHR165W-A 312 nt10.61□□□□□ -0.71
YMR31P19955 WWM1YFL010C 636 nt10.59□□□□□ -0.71
YMR31P19955 FUN26YAL022C 1554 nt10.57□□□□□ -0.72
YMR31P19955 YDR095CYDR095C 411 nt10.56□□□□□ -0.72
YMR31P19955 TRM9YML014W 840 nt10.55□□□□□ -0.72
YMR31P19955 SHU1YHL006C 453 nt10.53□□□□□ -0.72
YMR31P19955 ALF1YNL148C 765 nt10.53□□□□□ -0.72
YMR31P19955 LSM3YLR438C-A 270 nt10.51□□□□□ -0.73
YMR31P19955 YGR021WYGR021W 873 nt10.5□□□□□ -0.73
YMR31P19955 DCW1YKL046C 1350 nt10.46□□□□□ -0.74
YMR31P19955 YFL021C-AYFL021C-A 855 nt10.45□□□□□ -0.74
YMR31P19955 YAL037C-BYAL037C-B 975 nt10.45□□□□□ -0.74
YMR31P19955 YKL097CYKL097C 411 nt10.42□□□□□ -0.74
YMR31P19955 CCT6YDR188W 1641 nt10.4□□□□□ -0.74
YMR31P19955 HOM6YJR139C 1080 nt10.4□□□□□ -0.74
YMR31P19955 SUF2tP(AGG)C 72 nt10.39□□□□□ -0.75
YMR31P19955 SUF10tP(AGG)N 72 nt10.39□□□□□ -0.75
YMR31P19955 RPP2AYOL039W 321 nt10.38□□□□□ -0.75
YMR31P19955 YMR090WYMR090W 684 nt10.37□□□□□ -0.75
YMR31P19955 EMI2YDR516C 1503 nt10.36□□□□□ -0.75
YMR31P19955 MNP1YGL068W 585 nt10.31□□□□□ -0.76
YMR31P19955 PTP1YDL230W 1008 nt10.3□□□□□ -0.76
YMR31P19955 SIS1YNL007C 1059 nt10.3□□□□□ -0.76
YMR31P19955 CAC2YML102W 1407 nt10.26□□□□□ -0.77
YMR31P19955 YDL221WYDL221W 552 nt10.26□□□□□ -0.77
YMR31P19955 RKM5YLR137W 1104 nt10.26□□□□□ -0.77
YMR31P19955 YBR220CYBR220C 1683 nt10.19□□□□□ -0.78
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