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Protein–RNA interactions for Protein: Q12402
YOP1, Protein YOP1, yeast
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180 aa
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Protein
RNA
Prediction (catRAPID)
Interaction (RIP-Chip)
Gene
UniProt Accession
Gene
Ensembl Transcript ID
Length
Transcript Status
Prediction Score
Prediction z-Score
Detected Interaction
YOP1
Q12402
NSR1
YGR159C
1245 nt
15.72
■□□□□ 0.11
YOP1
Q12402
YML009W-B
YML009W-B
477 nt
15.26
■□□□□ 0.03
YOP1
Q12402
MDJ1
YFL016C
1536 nt
14.59
□□□□□ -0.07
YOP1
Q12402
NOP1
YDL014W
984 nt
14.58
□□□□□ -0.08
YOP1
Q12402
YJL027C
YJL027C
417 nt
13.42
□□□□□ -0.26
YOP1
Q12402
SSA3
YBL075C
1950 nt
13.05
□□□□□ -0.32
YOP1
Q12402
YKL036C
YKL036C
393 nt
12.81
□□□□□ -0.36
YOP1
Q12402
SRX1
YKL086W
384 nt
12.7
□□□□□ -0.38
YOP1
Q12402
YBR190W
YBR190W
312 nt
12.62
□□□□□ -0.39
YOP1
Q12402
DBP2
YNL112W
1641 nt
12.59
□□□□□ -0.39
YOP1
Q12402
Q0297
Q0297
156 nt
12.5
□□□□□ -0.41
YOP1
Q12402
RTC3
YHR087W
336 nt
12.34
□□□□□ -0.43
YOP1
Q12402
YCR051W
YCR051W
669 nt
12.03
□□□□□ -0.48
YOP1
Q12402
PUT4
YOR348C
1884 nt
11.94
□□□□□ -0.5
YOP1
Q12402
TRN1
tP(UGG)A
72 nt
11.87
□□□□□ -0.51
YOP1
Q12402
SUF9
tP(UGG)F
72 nt
11.87
□□□□□ -0.51
YOP1
Q12402
SUF8
tP(UGG)H
72 nt
11.87
□□□□□ -0.51
YOP1
Q12402
tP(UGG)L
tP(UGG)L
72 nt
11.87
□□□□□ -0.51
YOP1
Q12402
SUF7
tP(UGG)M
72 nt
11.87
□□□□□ -0.51
YOP1
Q12402
tP(UGG)N1
tP(UGG)N1
72 nt
11.87
□□□□□ -0.51
YOP1
Q12402
tP(UGG)N2
tP(UGG)N2
72 nt
11.87
□□□□□ -0.51
YOP1
Q12402
tP(UGG)O1
tP(UGG)O1
72 nt
11.87
□□□□□ -0.51
YOP1
Q12402
SUF11
tP(UGG)O2
72 nt
11.87
□□□□□ -0.51
YOP1
Q12402
CCC1
YLR220W
969 nt
11.78
□□□□□ -0.52
YOP1
Q12402
RVS167
YDR388W
1449 nt
11.77
□□□□□ -0.52
YOP1
Q12402
POA1
YBR022W
534 nt
11.54
□□□□□ -0.56
YOP1
Q12402
ARE1
YCR048W
1833 nt
11.52
□□□□□ -0.57
YOP1
Q12402
SCJ1
YMR214W
1134 nt
11.51
□□□□□ -0.57
YOP1
Q12402
BSC6
YOL137W
1494 nt
11.42
□□□□□ -0.58
YOP1
Q12402
YHR049C-A
YHR049C-A
297 nt
11.41
□□□□□ -0.58
YOP1
Q12402
SAH1
YER043C
1350 nt
11.34
□□□□□ -0.59
YOP1
Q12402
SPT5
YML010W
3192 nt
11.3
□□□□□ -0.6
YOP1
Q12402
SSA4
YER103W
1929 nt
11.29
□□□□□ -0.6
YOP1
Q12402
SCS3
YGL126W
1143 nt
11.29
□□□□□ -0.6
YOP1
Q12402
URN1
YPR152C
1398 nt
11.28
□□□□□ -0.6
YOP1
Q12402
OPI9
YLR338W
858 nt
11.24
□□□□□ -0.61
YOP1
Q12402
RPP1B
YDL130W
321 nt
11.23
□□□□□ -0.61
YOP1
Q12402
PAC11
YDR488C
1602 nt
11.2
□□□□□ -0.62
YOP1
Q12402
SHR5
YOL110W
714 nt
11.17
□□□□□ -0.62
YOP1
Q12402
BUD23
YCR047C
828 nt
11.12
□□□□□ -0.63
YOP1
Q12402
NVJ2
YPR091C
2313 nt
11.1
□□□□□ -0.63
YOP1
Q12402
DEP1
YAL013W
1218 nt
11.09
□□□□□ -0.63
YOP1
Q12402
YOL085C
YOL085C
342 nt
11.09
□□□□□ -0.63
YOP1
Q12402
tP(UGG)O3
tP(UGG)O3
72 nt
11.02
□□□□□ -0.65
YOP1
Q12402
PKP1
YIL042C
1185 nt
11.02
□□□□□ -0.65
YOP1
Q12402
RPN10
YHR200W
807 nt
11
□□□□□ -0.65
YOP1
Q12402
FPS1
YLL043W
2010 nt
10.99
□□□□□ -0.65
YOP1
Q12402
PUN1
YLR414C
792 nt
10.93
□□□□□ -0.66
YOP1
Q12402
PTC2
YER089C
1395 nt
10.9
□□□□□ -0.66
YOP1
Q12402
BDF1
YLR399C
2061 nt
10.89
□□□□□ -0.67
YOP1
Q12402
Q0182
Q0182
405 nt
10.88
□□□□□ -0.67
YOP1
Q12402
NAB2
YGL122C
1578 nt
10.86
□□□□□ -0.67
YOP1
Q12402
YNL208W
YNL208W
600 nt
10.85
□□□□□ -0.67
YOP1
Q12402
PET122
YER153C
765 nt
10.8
□□□□□ -0.68
YOP1
Q12402
MEP2
YNL142W
1500 nt
10.78
□□□□□ -0.68
YOP1
Q12402
SSA1
YAL005C
1929 nt
10.77
□□□□□ -0.69
YOP1
Q12402
TAT1
YBR069C
1860 nt
10.74
□□□□□ -0.69
YOP1
Q12402
YJR018W
YJR018W
363 nt
10.72
□□□□□ -0.69
YOP1
Q12402
YDJ1
YNL064C
1230 nt
10.66
□□□□□ -0.7
YOP1
Q12402
FIS1
YIL065C
468 nt
10.61
□□□□□ -0.71
YOP1
Q12402
DCW1
YKL046C
1350 nt
10.59
□□□□□ -0.71
YOP1
Q12402
DAL1
YIR027C
1383 nt
10.58
□□□□□ -0.72
YOP1
Q12402
FPR4
YLR449W
1179 nt
10.57
□□□□□ -0.72
YOP1
Q12402
GAR1
YHR089C
618 nt
10.54
□□□□□ -0.72
YOP1
Q12402
SCR1
SCR1
522 nt
10.54
□□□□□ -0.72
YOP1
Q12402
YPS1
YLR120C
1710 nt
10.5
□□□□□ -0.73
YOP1
Q12402
PHO4
YFR034C
939 nt
10.48
□□□□□ -0.73
YOP1
Q12402
YHR165W-A
YHR165W-A
312 nt
10.47
□□□□□ -0.73
YOP1
Q12402
YMR090W
YMR090W
684 nt
10.47
□□□□□ -0.73
YOP1
Q12402
YBR220C
YBR220C
1683 nt
10.45
□□□□□ -0.74
YOP1
Q12402
EMI2
YDR516C
1503 nt
10.44
□□□□□ -0.74
YOP1
Q12402
INM2
YDR287W
879 nt
10.42
□□□□□ -0.74
YOP1
Q12402
RRN5
YLR141W
1092 nt
10.42
□□□□□ -0.74
YOP1
Q12402
RPP2B
YDR382W
333 nt
10.35
□□□□□ -0.75
YOP1
Q12402
YJR120W
YJR120W
351 nt
10.35
□□□□□ -0.75
YOP1
Q12402
YDR095C
YDR095C
411 nt
10.32
□□□□□ -0.76
YOP1
Q12402
YDL221W
YDL221W
552 nt
10.3
□□□□□ -0.76
YOP1
Q12402
SDH1
YKL148C
1923 nt
10.3
□□□□□ -0.76
YOP1
Q12402
MOT3
YMR070W
1473 nt
10.28
□□□□□ -0.76
YOP1
Q12402
PCH2
YBR186W
1695 nt
10.25
□□□□□ -0.77
YOP1
Q12402
YBL100C
YBL100C
315 nt
10.23
□□□□□ -0.77
YOP1
Q12402
TIR1
YER011W
765 nt
10.22
□□□□□ -0.77
YOP1
Q12402
SEC11
YIR022W
504 nt
10.21
□□□□□ -0.77
YOP1
Q12402
UME6
YDR207C
2511 nt
10.21
□□□□□ -0.78
YOP1
Q12402
YER088W-B
YER088W-B
147 nt
10.2
□□□□□ -0.78
YOP1
Q12402
GUT2
YIL155C
1950 nt
10.2
□□□□□ -0.78
YOP1
Q12402
CAC2
YML102W
1407 nt
10.19
□□□□□ -0.78
YOP1
Q12402
RPP2A
YOL039W
321 nt
10.15
□□□□□ -0.78
YOP1
Q12402
SCC4
YER147C
1875 nt
10.15
□□□□□ -0.79
YOP1
Q12402
PTP1
YDL230W
1008 nt
10.13
□□□□□ -0.79
YOP1
Q12402
ALF1
YNL148C
765 nt
10.1
□□□□□ -0.79
YOP1
Q12402
FUN26
YAL022C
1554 nt
10.06
□□□□□ -0.8
YOP1
Q12402
IRC15
YPL017C
1500 nt
10.03
□□□□□ -0.8
YOP1
Q12402
RSB1
YOR049C
1065 nt
10.03
□□□□□ -0.8
YOP1
Q12402
BDH2
YAL061W
1254 nt
10
□□□□□ -0.81
YOP1
Q12402
GIS3
YLR094C
1509 nt
10
□□□□□ -0.81
YOP1
Q12402
YSC84
YHR016C
1407 nt
9.99
□□□□□ -0.81
YOP1
Q12402
PIB2
YGL023C
1908 nt
9.97
□□□□□ -0.81
YOP1
Q12402
RTF1
YGL244W
1677 nt
9.94
□□□□□ -0.82
YOP1
Q12402
TRM9
YML014W
840 nt
9.94
□□□□□ -0.82
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