Protein–RNA interactions for Protein: Q06116

YPR117W, Uncharacterized protein YPR117W, yeastyeast

Predictions only

Length 2,489 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (RIP-Chip)
Gene UniProt Accession Gene Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score Detected Interaction
YPR117WQ06116 YML009W-BYML009W-B 477 nt21.8■■□□□ 1.08
YPR117WQ06116 NOP1YDL014W 984 nt21.27■■□□□ 1
YPR117WQ06116 YKL036CYKL036C 393 nt20.76■□□□□ 0.91
YPR117WQ06116 NSR1YGR159C 1245 nt20.46■□□□□ 0.87
YPR117WQ06116 YJL027CYJL027C 417 nt19.63■□□□□ 0.73
YPR117WQ06116 SCS3YGL126W 1143 nt19.51■□□□□ 0.71
YPR117WQ06116 Q0297Q0297 156 nt19.07■□□□□ 0.64
YPR117WQ06116 SRX1YKL086W 384 nt18.89■□□□□ 0.61
YPR117WQ06116 SCJ1YMR214W 1134 nt18.34■□□□□ 0.53
YPR117WQ06116 YOL085CYOL085C 342 nt17.95■□□□□ 0.46
YPR117WQ06116 YCR051WYCR051W 669 nt17.87■□□□□ 0.45
YPR117WQ06116 PKP1YIL042C 1185 nt17.74■□□□□ 0.43
YPR117WQ06116 ATS1YAL020C 1002 nt17.71■□□□□ 0.43
YPR117WQ06116 MDJ1YFL016C 1536 nt17.38■□□□□ 0.37
YPR117WQ06116 RPP1BYDL130W 321 nt17.03■□□□□ 0.32
YPR117WQ06116 RTC3YHR087W 336 nt16.84■□□□□ 0.29
YPR117WQ06116 TRN1tP(UGG)A 72 nt16.5■□□□□ 0.23
YPR117WQ06116 SUF9tP(UGG)F 72 nt16.5■□□□□ 0.23
YPR117WQ06116 SUF8tP(UGG)H 72 nt16.5■□□□□ 0.23
YPR117WQ06116 tP(UGG)LtP(UGG)L 72 nt16.5■□□□□ 0.23
YPR117WQ06116 SUF7tP(UGG)M 72 nt16.5■□□□□ 0.23
YPR117WQ06116 tP(UGG)N1tP(UGG)N1 72 nt16.5■□□□□ 0.23
YPR117WQ06116 tP(UGG)N2tP(UGG)N2 72 nt16.5■□□□□ 0.23
YPR117WQ06116 tP(UGG)O1tP(UGG)O1 72 nt16.5■□□□□ 0.23
YPR117WQ06116 SUF11tP(UGG)O2 72 nt16.5■□□□□ 0.23
YPR117WQ06116 SCR1SCR1 522 nt16.41■□□□□ 0.22
YPR117WQ06116 PET122YER153C 765 nt16.3■□□□□ 0.2
YPR117WQ06116 CCC1YLR220W 969 nt16.29■□□□□ 0.2
YPR117WQ06116 YKL097CYKL097C 411 nt16.14■□□□□ 0.17
YPR117WQ06116 PST2YDR032C 597 nt16.12■□□□□ 0.17
YPR117WQ06116 RRN5YLR141W 1092 nt16.1■□□□□ 0.17
YPR117WQ06116 RSB1YOR049C 1065 nt16.01■□□□□ 0.15
YPR117WQ06116 DBP2YNL112W 1641 nt15.89■□□□□ 0.13
YPR117WQ06116 tP(UGG)O3tP(UGG)O3 72 nt15.86■□□□□ 0.13
YPR117WQ06116 YER088W-BYER088W-B 147 nt15.78■□□□□ 0.12
YPR117WQ06116 YOR139CYOR139C 393 nt15.43■□□□□ 0.06
YPR117WQ06116 SHU1YHL006C 453 nt15.26■□□□□ 0.03
YPR117WQ06116 RVS167YDR388W 1449 nt15.18■□□□□ 0.02
YPR117WQ06116 YDJ1YNL064C 1230 nt15.14■□□□□ 0.01
YPR117WQ06116 NPL3YDR432W 1245 nt15.01□□□□□ -0.01
YPR117WQ06116 GAR1YHR089C 618 nt15□□□□□ -0.01
YPR117WQ06116 SHR5YOL110W 714 nt14.82□□□□□ -0.04
YPR117WQ06116 BSC6YOL137W 1494 nt14.7□□□□□ -0.06
YPR117WQ06116 YAL037C-BYAL037C-B 975 nt14.7□□□□□ -0.06
YPR117WQ06116 tM(CAU)CtM(CAU)C 72 nt14.59□□□□□ -0.07
YPR117WQ06116 IMT4tM(CAU)E 72 nt14.59□□□□□ -0.07
YPR117WQ06116 IMT3tM(CAU)J3 72 nt14.59□□□□□ -0.07
YPR117WQ06116 IMT1tM(CAU)O1 72 nt14.59□□□□□ -0.07
YPR117WQ06116 IMT2tM(CAU)P 72 nt14.59□□□□□ -0.07
YPR117WQ06116 MOT3YMR070W 1473 nt14.49□□□□□ -0.09
YPR117WQ06116 YBR190WYBR190W 312 nt14.35□□□□□ -0.11
YPR117WQ06116 YOL037CYOL037C 354 nt14.28□□□□□ -0.12
YPR117WQ06116 UBX6YJL048C 1191 nt14.26□□□□□ -0.13
YPR117WQ06116 RPN10YHR200W 807 nt14.26□□□□□ -0.13
YPR117WQ06116 MNP1YGL068W 585 nt14.23□□□□□ -0.13
YPR117WQ06116 MRPL8YJL063C 717 nt14.22□□□□□ -0.13
YPR117WQ06116 TIR1YER011W 765 nt14.16□□□□□ -0.14
YPR117WQ06116 DEP1YAL013W 1218 nt14.13□□□□□ -0.15
YPR117WQ06116 PUS2YGL063W 1113 nt14.13□□□□□ -0.15
YPR117WQ06116 HOM6YJR139C 1080 nt14.08□□□□□ -0.15
YPR117WQ06116 YGR021WYGR021W 873 nt14.06□□□□□ -0.16
YPR117WQ06116 SSA1YAL005C 1929 nt14.03□□□□□ -0.16
YPR117WQ06116 YFL015W-AYFL015W-A 318 nt13.95□□□□□ -0.18
YPR117WQ06116 SRB2YHR041C 633 nt13.95□□□□□ -0.18
YPR117WQ06116 YEL076C-AYEL076C-A 651 nt13.94□□□□□ -0.18
YPR117WQ06116 YEL076CYEL076C 651 nt13.94□□□□□ -0.18
YPR117WQ06116 YLR464WYLR464W 651 nt13.94□□□□□ -0.18
YPR117WQ06116 FMP45YDL222C 930 nt13.92□□□□□ -0.18
YPR117WQ06116 WWM1YFL010C 636 nt13.92□□□□□ -0.18
YPR117WQ06116 URN1YPR152C 1398 nt13.91□□□□□ -0.18
YPR117WQ06116 YLR281CYLR281C 468 nt13.9□□□□□ -0.18
YPR117WQ06116 ADO1YJR105W 1023 nt13.89□□□□□ -0.19
YPR117WQ06116 YPR011CYPR011C 981 nt13.85□□□□□ -0.19
YPR117WQ06116 YNL208WYNL208W 600 nt13.84□□□□□ -0.19
YPR117WQ06116 WHI5YOR083W 888 nt13.78□□□□□ -0.2
YPR117WQ06116 YLR236CYLR236C 324 nt13.76□□□□□ -0.21
YPR117WQ06116 DSK2YMR276W 1122 nt13.73□□□□□ -0.21
YPR117WQ06116 RKM5YLR137W 1104 nt13.72□□□□□ -0.21
YPR117WQ06116 SIS1YNL007C 1059 nt13.65□□□□□ -0.22
YPR117WQ06116 SBA1YKL117W 651 nt13.63□□□□□ -0.23
YPR117WQ06116 YDR094WYDR094W 336 nt13.61□□□□□ -0.23
YPR117WQ06116 YCH1YGR203W 447 nt13.58□□□□□ -0.23
YPR117WQ06116 SSA3YBL075C 1950 nt13.58□□□□□ -0.24
YPR117WQ06116 YJR018WYJR018W 363 nt13.57□□□□□ -0.24
YPR117WQ06116 YFL021C-AYFL021C-A 855 nt13.57□□□□□ -0.24
YPR117WQ06116 RTG1YOL067C 534 nt13.55□□□□□ -0.24
YPR117WQ06116 SPP1YPL138C 1062 nt13.46□□□□□ -0.26
YPR117WQ06116 HUA1YGR268C 597 nt13.34□□□□□ -0.27
YPR117WQ06116 LPX1YOR084W 1164 nt13.26□□□□□ -0.29
YPR117WQ06116 OPI9YLR338W 858 nt13.25□□□□□ -0.29
YPR117WQ06116 IMP2'YIL154C 1041 nt13.21□□□□□ -0.29
YPR117WQ06116 RPP2BYDR382W 333 nt13.19□□□□□ -0.3
YPR117WQ06116 YJR120WYJR120W 351 nt13.17□□□□□ -0.3
YPR117WQ06116 PAU16YKL224C 372 nt13.16□□□□□ -0.3
YPR117WQ06116 ERV46YAL042W 1248 nt13.12□□□□□ -0.31
YPR117WQ06116 LSM3YLR438C-A 270 nt13.03□□□□□ -0.32
YPR117WQ06116 BDH2YAL061W 1254 nt13.01□□□□□ -0.33
YPR117WQ06116 SAH1YER043C 1350 nt12.98□□□□□ -0.33
YPR117WQ06116 PUN1YLR414C 792 nt12.98□□□□□ -0.33
YPR117WQ06116 YLR154C-GYLR154C-G 150 nt12.96□□□□□ -0.33
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