RNA–Protein interactions for RNA: YHR100C

GEP4, Transcript of Mitochondrial phosphatidylglycerophosphatase (PGP phosphatase), yeast

Gene GEP4, Length 558 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Mitochondria .

RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (RIP-Chip)
Gene	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	Detected Interaction
GEP4	YHR100C	SAC3	P46674	1301 aa		4.27	□□□□□ -1.73
GEP4	YHR100C	PWP2	P25635	923 aa	Known RBP	4.27	□□□□□ -1.73
GEP4	YHR100C	CLB5	P30283	435 aa		4.27	□□□□□ -1.73
GEP4	YHR100C	LTV1	P34078	463 aa		4.27	□□□□□ -1.73
GEP4	YHR100C	RRP14	P36080	434 aa	Known RBP	4.27	□□□□□ -1.73
GEP4	YHR100C	MUM2	P38236	366 aa		4.27	□□□□□ -1.73
GEP4	YHR100C	PMC1	P38929	1173 aa	Predicted RBP	4.27	□□□□□ -1.73
GEP4	YHR100C	ERP4	Q12450	207 aa		4.27	□□□□□ -1.73
GEP4	YHR100C	PIM1	P36775	1133 aa		4.26	□□□□□ -1.73
GEP4	YHR100C	AIM20	P40451	204 aa		4.26	□□□□□ -1.73
GEP4	YHR100C	AIR1	P40507	360 aa	Known RBP	4.26	□□□□□ -1.73
GEP4	YHR100C	LEM3	P42838	414 aa		4.26	□□□□□ -1.73
GEP4	YHR100C	BDP1	P46678	594 aa		4.26	□□□□□ -1.73
GEP4	YHR100C	CLA4	P48562	842 aa		4.26	□□□□□ -1.73
GEP4	YHR100C	VID30	P53076	958 aa		4.26	□□□□□ -1.73
GEP4	YHR100C	YPL062W	Q02781	134 aa		4.26	□□□□□ -1.73
GEP4	YHR100C	HEL2	Q05580	639 aa	Known RBP	4.26	□□□□□ -1.73
GEP4	YHR100C	KIN1	P13185	1064 aa		4.25	□□□□□ -1.73
GEP4	YHR100C	MSM1	P22438	575 aa		4.25	□□□□□ -1.73
GEP4	YHR100C	RRN6	P32786	894 aa		4.25	□□□□□ -1.73
GEP4	YHR100C	SAP190	P36123	1033 aa		4.25	□□□□□ -1.73
GEP4	YHR100C	FAF1	P40546	346 aa	Predicted RBP	4.25	□□□□□ -1.73
GEP4	YHR100C	BNI5	P53890	448 aa	Known RBP	4.25	□□□□□ -1.73
GEP4	YHR100C	RIA1	P53893	1110 aa		4.25	□□□□□ -1.73
GEP4	YHR100C	COG4	Q06096	861 aa		4.25	□□□□□ -1.73
GEP4	YHR100C	VPS5	Q92331	675 aa		4.25	□□□□□ -1.73
GEP4	YHR100C	PRP43	P53131	767 aa	Known RBP	4.24	□□□□□ -1.73
GEP4	YHR100C	ATF2	P53296	535 aa		4.24	□□□□□ -1.73
GEP4	YHR100C	TUB4	P53378	473 aa		4.24	□□□□□ -1.73
GEP4	YHR100C	YNL115C	P53925	644 aa		4.24	□□□□□ -1.73
GEP4	YHR100C	NIS1	P53939	407 aa		4.24	□□□□□ -1.73
GEP4	YHR100C	PRP3	Q03338	469 aa	Predicted RBP	4.24	□□□□□ -1.73
GEP4	YHR100C	ENT2	Q05785	613 aa		4.24	□□□□□ -1.73
GEP4	YHR100C	RPN7	Q06103	429 aa	Known RBP	4.24	□□□□□ -1.73
GEP4	YHR100C	JIP5	Q06214	492 aa	Predicted RBP	4.24	□□□□□ -1.73
GEP4	YHR100C	YPR172W	Q06608	200 aa		4.24	□□□□□ -1.73
GEP4	YHR100C	SGT2	Q12118	346 aa	Known RBP	4.24	□□□□□ -1.73
GEP4	YHR100C	SLY41	P22215	453 aa		4.23	□□□□□ -1.73
GEP4	YHR100C	RPL5	P26321	297 aa	Known RBP	4.23	□□□□□ -1.73
GEP4	YHR100C	DEP1	P31385	405 aa		4.23	□□□□□ -1.73
GEP4	YHR100C	STE5	P32917	917 aa		4.23	□□□□□ -1.73
GEP4	YHR100C	PAC1	P39946	494 aa	Known RBP	4.23	□□□□□ -1.73
GEP4	YHR100C	ALD4	P46367	519 aa	Known RBP	4.23	□□□□□ -1.73
GEP4	YHR100C	HUL5	P53119	910 aa		4.23	□□□□□ -1.73
GEP4	YHR100C	ECM16	Q04217	1267 aa	Known RBP	4.23	□□□□□ -1.73
GEP4	YHR100C	GGA1	Q06336	557 aa		4.23	□□□□□ -1.73
GEP4	YHR100C	RSC2	Q06488	889 aa		4.23	□□□□□ -1.73
GEP4	YHR100C	YVC1	Q12324	675 aa		4.23	□□□□□ -1.73
GEP4	YHR100C	CEX1	Q12453	761 aa		4.23	□□□□□ -1.73
GEP4	YHR100C	NKP1	Q12493	238 aa		4.23	□□□□□ -1.73
GEP4	YHR100C	KAR1	P11927	433 aa		4.22	□□□□□ -1.73
GEP4	YHR100C	HEM3	P28789	327 aa		4.22	□□□□□ -1.73
GEP4	YHR100C	NFU1	P32860	256 aa		4.22	□□□□□ -1.73
GEP4	YHR100C	RSC8	P43609	557 aa	Known RBP	4.22	□□□□□ -1.73
GEP4	YHR100C	BFA1	P47113	574 aa		4.22	□□□□□ -1.73
GEP4	YHR100C	NNF1	P47149	201 aa		4.22	□□□□□ -1.73
GEP4	YHR100C	YNL247W	P53852	767 aa	Known RBP	4.22	□□□□□ -1.73
GEP4	YHR100C	ALD3	P54114	506 aa		4.22	□□□□□ -1.73
GEP4	YHR100C	CTF4	Q01454	927 aa		4.22	□□□□□ -1.73
GEP4	YHR100C	VTC3	Q02725	835 aa		4.22	□□□□□ -1.73
GEP4	YHR100C	COG8	Q04632	607 aa		4.22	□□□□□ -1.73
GEP4	YHR100C	PUS5	Q06244	254 aa		4.22	□□□□□ -1.73
GEP4	YHR100C	RRP15	Q06511	250 aa	Predicted RBP	4.22	□□□□□ -1.73
GEP4	YHR100C	APC5	Q08683	685 aa		4.22	□□□□□ -1.73
GEP4	YHR100C	TSR4	P25040	408 aa		4.21	□□□□□ -1.74
GEP4	YHR100C	BRF1	P29056	596 aa		4.21	□□□□□ -1.74
GEP4	YHR100C	RPN12	P32496	274 aa		4.21	□□□□□ -1.74
GEP4	YHR100C	SWI3	P32591	825 aa		4.21	□□□□□ -1.74
GEP4	YHR100C	TFC3	P34111	1160 aa		4.21	□□□□□ -1.74
GEP4	YHR100C	SAS3	P34218	831 aa		4.21	□□□□□ -1.74
GEP4	YHR100C	BYE1	P36106	594 aa		4.21	□□□□□ -1.74
GEP4	YHR100C	RPC37	P36121	282 aa		4.21	□□□□□ -1.74
GEP4	YHR100C	MET1	P36150	593 aa		4.21	□□□□□ -1.74
GEP4	YHR100C	MAL31	P38156	614 aa		4.21	□□□□□ -1.74
GEP4	YHR100C	KEL2	P50090	882 aa		4.21	□□□□□ -1.74
GEP4	YHR100C	YNR021W	P53723	404 aa	Known RBP	4.21	□□□□□ -1.74
GEP4	YHR100C	FPK1	P53739	893 aa		4.21	□□□□□ -1.74
GEP4	YHR100C	MDM1	Q01846	1127 aa		4.21	□□□□□ -1.74
GEP4	YHR100C	SUB2	Q07478	446 aa	Known RBP	4.21	□□□□□ -1.74
GEP4	YHR100C	SSF2	Q12153	453 aa	Predicted RBP	4.21	□□□□□ -1.74
GEP4	YHR100C	GLE1	Q12315	538 aa		4.21	□□□□□ -1.74
GEP4	YHR100C	SNU66	Q12420	587 aa	Predicted RBP	4.21	□□□□□ -1.74
GEP4	YHR100C	TCB1	Q12466	1186 aa		4.21	□□□□□ -1.74
GEP4	YHR100C	CHD1	P32657	1468 aa		4.2	□□□□□ -1.74
GEP4	YHR100C	SSB1	P11484	613 aa	Known RBP	4.2	□□□□□ -1.74
GEP4	YHR100C	CLC1	P17891	233 aa		4.2	□□□□□ -1.74
GEP4	YHR100C	SCJ1	P25303	377 aa		4.2	□□□□□ -1.74
GEP4	YHR100C	DPB3	P27344	201 aa		4.2	□□□□□ -1.74
GEP4	YHR100C	PPH3	P32345	308 aa		4.2	□□□□□ -1.74
GEP4	YHR100C	PEX5	P35056	612 aa		4.2	□□□□□ -1.74
GEP4	YHR100C	SSB2	P40150	613 aa	Known RBP	4.2	□□□□□ -1.74
GEP4	YHR100C	GPI8	P49018	411 aa		4.2	□□□□□ -1.74
GEP4	YHR100C	RTF1	P53064	558 aa		4.2	□□□□□ -1.74
GEP4	YHR100C	SRP1	Q02821	542 aa	Known RBP	4.2	□□□□□ -1.74
GEP4	YHR100C	YOL057W	Q08225	711 aa		4.2	□□□□□ -1.74
GEP4	YHR100C	SUP35	P05453	685 aa	Known RBP	4.19	□□□□□ -1.74
GEP4	YHR100C	CDC31	P06704	161 aa	Known RBP	4.19	□□□□□ -1.74
GEP4	YHR100C	MAK16	P10962	306 aa	Predicted RBP	4.19	□□□□□ -1.74
GEP4	YHR100C	SIT4	P20604	311 aa		4.19	□□□□□ -1.74
GEP4	YHR100C	MSH3	P25336	1018 aa		4.19	□□□□□ -1.74

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