Protein–RNA interactions for Protein: Q05580

HEL2, E3 ubiquitin-protein ligase HEL2, yeastyeast

Known RBP Predictions only

Length 639 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (RIP-Chip)
Gene UniProt Accession Gene Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score Detected Interaction
HEL2Q05580 YML009W-BYML009W-B 477 nt20.31■□□□□ 0.84
HEL2Q05580 NSR1YGR159C 1245 nt19.92■□□□□ 0.78
HEL2Q05580 NOP1YDL014W 984 nt19.87■□□□□ 0.77
HEL2Q05580 YKL036CYKL036C 393 nt18.77■□□□□ 0.6
HEL2Q05580 MDJ1YFL016C 1536 nt17.97■□□□□ 0.47
HEL2Q05580 YJL027CYJL027C 417 nt17.6■□□□□ 0.41
HEL2Q05580 Q0297Q0297 156 nt17.59■□□□□ 0.41
HEL2Q05580 SRX1YKL086W 384 nt17.42■□□□□ 0.38
HEL2Q05580 SCS3YGL126W 1143 nt17.34■□□□□ 0.37
HEL2Q05580 YCR051WYCR051W 669 nt16.54■□□□□ 0.24
HEL2Q05580 YOL085CYOL085C 342 nt16.28■□□□□ 0.2
HEL2Q05580 PKP1YIL042C 1185 nt15.99■□□□□ 0.15
HEL2Q05580 SCJ1YMR214W 1134 nt15.85■□□□□ 0.13
HEL2Q05580 RPP1BYDL130W 321 nt15.78■□□□□ 0.12
HEL2Q05580 DBP2YNL112W 1641 nt15.71■□□□□ 0.11
HEL2Q05580 ATS1YAL020C 1002 nt15.63■□□□□ 0.09
HEL2Q05580 TRN1tP(UGG)A 72 nt15.51■□□□□ 0.07
HEL2Q05580 SUF9tP(UGG)F 72 nt15.51■□□□□ 0.07
HEL2Q05580 SUF8tP(UGG)H 72 nt15.51■□□□□ 0.07
HEL2Q05580 tP(UGG)LtP(UGG)L 72 nt15.51■□□□□ 0.07
HEL2Q05580 SUF7tP(UGG)M 72 nt15.51■□□□□ 0.07
HEL2Q05580 tP(UGG)N1tP(UGG)N1 72 nt15.51■□□□□ 0.07
HEL2Q05580 tP(UGG)N2tP(UGG)N2 72 nt15.51■□□□□ 0.07
HEL2Q05580 tP(UGG)O1tP(UGG)O1 72 nt15.51■□□□□ 0.07
HEL2Q05580 SUF11tP(UGG)O2 72 nt15.51■□□□□ 0.07
HEL2Q05580 CCC1YLR220W 969 nt15.35■□□□□ 0.05
HEL2Q05580 YBR190WYBR190W 312 nt15.33■□□□□ 0.04
HEL2Q05580 RTC3YHR087W 336 nt15.11■□□□□ 0.01
HEL2Q05580 PET122YER153C 765 nt15.05■□□□□ -0
HEL2Q05580 SCR1SCR1 522 nt14.93□□□□□ -0.02
HEL2Q05580 RVS167YDR388W 1449 nt14.82□□□□□ -0.04
HEL2Q05580 tP(UGG)O3tP(UGG)O3 72 nt14.81□□□□□ -0.04
HEL2Q05580 RRN5YLR141W 1092 nt14.66□□□□□ -0.06
HEL2Q05580 SSA3YBL075C 1950 nt14.5□□□□□ -0.09
HEL2Q05580 RSB1YOR049C 1065 nt14.45□□□□□ -0.1
HEL2Q05580 PST2YDR032C 597 nt14.42□□□□□ -0.1
HEL2Q05580 YER088W-BYER088W-B 147 nt14.38□□□□□ -0.11
HEL2Q05580 YDJ1YNL064C 1230 nt14.31□□□□□ -0.12
HEL2Q05580 SHR5YOL110W 714 nt14.2□□□□□ -0.14
HEL2Q05580 PUT4YOR348C 1884 nt14.06□□□□□ -0.16
HEL2Q05580 YKL097CYKL097C 411 nt14.02□□□□□ -0.17
HEL2Q05580 URN1YPR152C 1398 nt13.99□□□□□ -0.17
HEL2Q05580 DEP1YAL013W 1218 nt13.98□□□□□ -0.17
HEL2Q05580 GAR1YHR089C 618 nt13.93□□□□□ -0.18
HEL2Q05580 SAH1YER043C 1350 nt13.82□□□□□ -0.2
HEL2Q05580 OPI9YLR338W 858 nt13.79□□□□□ -0.2
HEL2Q05580 ARE1YCR048W 1833 nt13.75□□□□□ -0.21
HEL2Q05580 SHU1YHL006C 453 nt13.74□□□□□ -0.21
HEL2Q05580 RPN10YHR200W 807 nt13.73□□□□□ -0.21
HEL2Q05580 POA1YBR022W 534 nt13.71□□□□□ -0.21
HEL2Q05580 YNL208WYNL208W 600 nt13.66□□□□□ -0.22
HEL2Q05580 YHR049C-AYHR049C-A 297 nt13.64□□□□□ -0.23
HEL2Q05580 TIR1YER011W 765 nt13.45□□□□□ -0.26
HEL2Q05580 YOR139CYOR139C 393 nt13.45□□□□□ -0.26
HEL2Q05580 BSC6YOL137W 1494 nt13.41□□□□□ -0.26
HEL2Q05580 YAL037C-BYAL037C-B 975 nt13.4□□□□□ -0.26
HEL2Q05580 PUN1YLR414C 792 nt13.4□□□□□ -0.26
HEL2Q05580 SSA1YAL005C 1929 nt13.4□□□□□ -0.26
HEL2Q05580 BUD23YCR047C 828 nt13.39□□□□□ -0.27
HEL2Q05580 YJR018WYJR018W 363 nt13.33□□□□□ -0.28
HEL2Q05580 PTC2YER089C 1395 nt13.31□□□□□ -0.28
HEL2Q05580 NPL3YDR432W 1245 nt13.17□□□□□ -0.3
HEL2Q05580 FPS1YLL043W 2010 nt13.15□□□□□ -0.3
HEL2Q05580 SRB2YHR041C 633 nt13.15□□□□□ -0.3
HEL2Q05580 NAB2YGL122C 1578 nt13.14□□□□□ -0.31
HEL2Q05580 RPP2BYDR382W 333 nt13.02□□□□□ -0.33
HEL2Q05580 FPR4YLR449W 1179 nt13.02□□□□□ -0.33
HEL2Q05580 MNP1YGL068W 585 nt12.99□□□□□ -0.33
HEL2Q05580 HOM6YJR139C 1080 nt12.98□□□□□ -0.33
HEL2Q05580 YJR120WYJR120W 351 nt12.97□□□□□ -0.33
HEL2Q05580 WWM1YFL010C 636 nt12.95□□□□□ -0.34
HEL2Q05580 YGR021WYGR021W 873 nt12.94□□□□□ -0.34
HEL2Q05580 DAL1YIR027C 1383 nt12.92□□□□□ -0.34
HEL2Q05580 tM(CAU)CtM(CAU)C 72 nt12.89□□□□□ -0.35
HEL2Q05580 IMT4tM(CAU)E 72 nt12.89□□□□□ -0.35
HEL2Q05580 IMT3tM(CAU)J3 72 nt12.89□□□□□ -0.35
HEL2Q05580 IMT1tM(CAU)O1 72 nt12.89□□□□□ -0.35
HEL2Q05580 IMT2tM(CAU)P 72 nt12.89□□□□□ -0.35
HEL2Q05580 YOL037CYOL037C 354 nt12.88□□□□□ -0.35
HEL2Q05580 INM2YDR287W 879 nt12.87□□□□□ -0.35
HEL2Q05580 FIS1YIL065C 468 nt12.87□□□□□ -0.35
HEL2Q05580 NVJ2YPR091C 2313 nt12.83□□□□□ -0.36
HEL2Q05580 PHO4YFR034C 939 nt12.79□□□□□ -0.36
HEL2Q05580 RKM5YLR137W 1104 nt12.78□□□□□ -0.36
HEL2Q05580 SPT5YML010W 3192 nt12.75□□□□□ -0.37
HEL2Q05580 YBL100CYBL100C 315 nt12.72□□□□□ -0.37
HEL2Q05580 YFL021C-AYFL021C-A 855 nt12.69□□□□□ -0.38
HEL2Q05580 BDH2YAL061W 1254 nt12.67□□□□□ -0.38
HEL2Q05580 PAC11YDR488C 1602 nt12.66□□□□□ -0.38
HEL2Q05580 PUS2YGL063W 1113 nt12.61□□□□□ -0.39
HEL2Q05580 YPS1YLR120C 1710 nt12.6□□□□□ -0.39
HEL2Q05580 YLR281CYLR281C 468 nt12.6□□□□□ -0.39
HEL2Q05580 MEP2YNL142W 1500 nt12.58□□□□□ -0.4
HEL2Q05580 Q0182Q0182 405 nt12.57□□□□□ -0.4
HEL2Q05580 YHR165W-AYHR165W-A 312 nt12.57□□□□□ -0.4
HEL2Q05580 FUN26YAL022C 1554 nt12.56□□□□□ -0.4
HEL2Q05580 MOT3YMR070W 1473 nt12.53□□□□□ -0.4
HEL2Q05580 TRM9YML014W 840 nt12.52□□□□□ -0.41
HEL2Q05580 SSA4YER103W 1929 nt12.52□□□□□ -0.41
HEL2Q05580 LSM3YLR438C-A 270 nt12.49□□□□□ -0.41
Retrieved 100 of 7,029 protein–RNA pairs in 13 ms