Protein–RNA interactions for Protein: Q12153

SSF2, Ribosome biogenesis protein SSF2, yeastyeast

Predicted RBP Predictions only

Length 453 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (RIP-Chip)
Gene UniProt Accession Gene Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score Detected Interaction
SSF2Q12153 YML009W-BYML009W-B 477 nt23.99■■□□□ 1.43
SSF2Q12153 NSR1YGR159C 1245 nt23.77■■□□□ 1.4
SSF2Q12153 NOP1YDL014W 984 nt23.32■■□□□ 1.32
SSF2Q12153 YKL036CYKL036C 393 nt21.54■■□□□ 1.04
SSF2Q12153 MDJ1YFL016C 1536 nt21.09■□□□□ 0.97
SSF2Q12153 Q0297Q0297 156 nt20.38■□□□□ 0.85
SSF2Q12153 SRX1YKL086W 384 nt20.35■□□□□ 0.85
SSF2Q12153 YJL027CYJL027C 417 nt20.13■□□□□ 0.81
SSF2Q12153 SCS3YGL126W 1143 nt19.6■□□□□ 0.73
SSF2Q12153 YCR051WYCR051W 669 nt19.36■□□□□ 0.69
SSF2Q12153 YOL085CYOL085C 342 nt18.64■□□□□ 0.57
SSF2Q12153 DBP2YNL112W 1641 nt18.63■□□□□ 0.57
SSF2Q12153 PKP1YIL042C 1185 nt18.39■□□□□ 0.53
SSF2Q12153 TRN1tP(UGG)A 72 nt18.38■□□□□ 0.53
SSF2Q12153 SUF9tP(UGG)F 72 nt18.38■□□□□ 0.53
SSF2Q12153 SUF8tP(UGG)H 72 nt18.38■□□□□ 0.53
SSF2Q12153 tP(UGG)LtP(UGG)L 72 nt18.38■□□□□ 0.53
SSF2Q12153 SUF7tP(UGG)M 72 nt18.38■□□□□ 0.53
SSF2Q12153 tP(UGG)N1tP(UGG)N1 72 nt18.38■□□□□ 0.53
SSF2Q12153 tP(UGG)N2tP(UGG)N2 72 nt18.38■□□□□ 0.53
SSF2Q12153 tP(UGG)O1tP(UGG)O1 72 nt18.38■□□□□ 0.53
SSF2Q12153 SUF11tP(UGG)O2 72 nt18.38■□□□□ 0.53
SSF2Q12153 RPP1BYDL130W 321 nt18.31■□□□□ 0.52
SSF2Q12153 CCC1YLR220W 969 nt18.25■□□□□ 0.51
SSF2Q12153 YBR190WYBR190W 312 nt17.96■□□□□ 0.47
SSF2Q12153 RTC3YHR087W 336 nt17.63■□□□□ 0.41
SSF2Q12153 RVS167YDR388W 1449 nt17.6■□□□□ 0.41
SSF2Q12153 ATS1YAL020C 1002 nt17.54■□□□□ 0.4
SSF2Q12153 PET122YER153C 765 nt17.49■□□□□ 0.39
SSF2Q12153 SCJ1YMR214W 1134 nt17.47■□□□□ 0.39
SSF2Q12153 tP(UGG)O3tP(UGG)O3 72 nt17.41■□□□□ 0.38
SSF2Q12153 SCR1SCR1 522 nt17.35■□□□□ 0.37
SSF2Q12153 RRN5YLR141W 1092 nt17■□□□□ 0.31
SSF2Q12153 SHR5YOL110W 714 nt16.96■□□□□ 0.31
SSF2Q12153 YDJ1YNL064C 1230 nt16.82■□□□□ 0.28
SSF2Q12153 RSB1YOR049C 1065 nt16.69■□□□□ 0.26
SSF2Q12153 YER088W-BYER088W-B 147 nt16.65■□□□□ 0.26
SSF2Q12153 DEP1YAL013W 1218 nt16.5■□□□□ 0.23
SSF2Q12153 GAR1YHR089C 618 nt16.49■□□□□ 0.23
SSF2Q12153 URN1YPR152C 1398 nt16.48■□□□□ 0.23
SSF2Q12153 RPN10YHR200W 807 nt16.27■□□□□ 0.2
SSF2Q12153 PUT4YOR348C 1884 nt16.25■□□□□ 0.19
SSF2Q12153 YNL208WYNL208W 600 nt16.22■□□□□ 0.19
SSF2Q12153 PST2YDR032C 597 nt16.21■□□□□ 0.19
SSF2Q12153 OPI9YLR338W 858 nt16.21■□□□□ 0.19
SSF2Q12153 SAH1YER043C 1350 nt16.12■□□□□ 0.17
SSF2Q12153 ARE1YCR048W 1833 nt15.98■□□□□ 0.15
SSF2Q12153 TIR1YER011W 765 nt15.92■□□□□ 0.14
SSF2Q12153 YHR049C-AYHR049C-A 297 nt15.82■□□□□ 0.12
SSF2Q12153 POA1YBR022W 534 nt15.8■□□□□ 0.12
SSF2Q12153 PUN1YLR414C 792 nt15.77■□□□□ 0.12
SSF2Q12153 YJR018WYJR018W 363 nt15.72■□□□□ 0.11
SSF2Q12153 SSA1YAL005C 1929 nt15.69■□□□□ 0.1
SSF2Q12153 YKL097CYKL097C 411 nt15.64■□□□□ 0.09
SSF2Q12153 SHU1YHL006C 453 nt15.57■□□□□ 0.08
SSF2Q12153 PTC2YER089C 1395 nt15.57■□□□□ 0.08
SSF2Q12153 BUD23YCR047C 828 nt15.49■□□□□ 0.07
SSF2Q12153 RPP2BYDR382W 333 nt15.45■□□□□ 0.06
SSF2Q12153 YJR120WYJR120W 351 nt15.43■□□□□ 0.06
SSF2Q12153 BSC6YOL137W 1494 nt15.43■□□□□ 0.06
SSF2Q12153 SRB2YHR041C 633 nt15.42■□□□□ 0.06
SSF2Q12153 YAL037C-BYAL037C-B 975 nt15.35■□□□□ 0.05
SSF2Q12153 NAB2YGL122C 1578 nt15.34■□□□□ 0.05
SSF2Q12153 Q0182Q0182 405 nt15.3■□□□□ 0.04
SSF2Q12153 WWM1YFL010C 636 nt15.22■□□□□ 0.03
SSF2Q12153 FPR4YLR449W 1179 nt15.18■□□□□ 0.02
SSF2Q12153 INM2YDR287W 879 nt15.16■□□□□ 0.02
SSF2Q12153 DAL1YIR027C 1383 nt15.15■□□□□ 0.02
SSF2Q12153 YGR021WYGR021W 873 nt15.15■□□□□ 0.02
SSF2Q12153 FIS1YIL065C 468 nt15.11■□□□□ 0.01
SSF2Q12153 BDH2YAL061W 1254 nt15.1■□□□□ 0.01
SSF2Q12153 HOM6YJR139C 1080 nt15.07■□□□□ 0
SSF2Q12153 MNP1YGL068W 585 nt15.03■□□□□ -0
SSF2Q12153 YBL100CYBL100C 315 nt15.03■□□□□ -0
SSF2Q12153 PHO4YFR034C 939 nt15.01□□□□□ -0.01
SSF2Q12153 SSA3YBL075C 1950 nt14.97□□□□□ -0.01
SSF2Q12153 YFL021C-AYFL021C-A 855 nt14.97□□□□□ -0.01
SSF2Q12153 YOR139CYOR139C 393 nt14.96□□□□□ -0.01
SSF2Q12153 LSM3YLR438C-A 270 nt14.9□□□□□ -0.02
SSF2Q12153 NPL3YDR432W 1245 nt14.89□□□□□ -0.03
SSF2Q12153 MOT3YMR070W 1473 nt14.87□□□□□ -0.03
SSF2Q12153 RKM5YLR137W 1104 nt14.86□□□□□ -0.03
SSF2Q12153 TRM9YML014W 840 nt14.84□□□□□ -0.03
SSF2Q12153 FUN26YAL022C 1554 nt14.84□□□□□ -0.03
SSF2Q12153 YOL037CYOL037C 354 nt14.79□□□□□ -0.04
SSF2Q12153 YPS1YLR120C 1710 nt14.68□□□□□ -0.06
SSF2Q12153 ALF1YNL148C 765 nt14.67□□□□□ -0.06
SSF2Q12153 CCT6YDR188W 1641 nt14.64□□□□□ -0.07
SSF2Q12153 YDR095CYDR095C 411 nt14.6□□□□□ -0.07
SSF2Q12153 YHR165W-AYHR165W-A 312 nt14.57□□□□□ -0.08
SSF2Q12153 SUF2tP(AGG)C 72 nt14.56□□□□□ -0.08
SSF2Q12153 SUF10tP(AGG)N 72 nt14.56□□□□□ -0.08
SSF2Q12153 SPT5YML010W 3192 nt14.54□□□□□ -0.08
SSF2Q12153 MEP2YNL142W 1500 nt14.46□□□□□ -0.09
SSF2Q12153 YLR281CYLR281C 468 nt14.42□□□□□ -0.1
SSF2Q12153 WHI5YOR083W 888 nt14.4□□□□□ -0.1
SSF2Q12153 tM(CAU)CtM(CAU)C 72 nt14.39□□□□□ -0.11
SSF2Q12153 IMT4tM(CAU)E 72 nt14.39□□□□□ -0.11
SSF2Q12153 IMT3tM(CAU)J3 72 nt14.39□□□□□ -0.11
SSF2Q12153 IMT1tM(CAU)O1 72 nt14.39□□□□□ -0.11
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