Protein–RNA interactions for Protein: Q12315

GLE1, Nucleoporin GLE1, yeastyeast

Predictions only

Length 538 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (RIP-Chip)
Gene UniProt Accession Gene Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score Detected Interaction
GLE1Q12315 YML009W-BYML009W-B 477 nt19.17■□□□□ 0.66
GLE1Q12315 NSR1YGR159C 1245 nt18.9■□□□□ 0.62
GLE1Q12315 NOP1YDL014W 984 nt18.81■□□□□ 0.6
GLE1Q12315 YKL036CYKL036C 393 nt17.72■□□□□ 0.43
GLE1Q12315 MDJ1YFL016C 1536 nt17.09■□□□□ 0.33
GLE1Q12315 Q0297Q0297 156 nt16.62■□□□□ 0.25
GLE1Q12315 YJL027CYJL027C 417 nt16.58■□□□□ 0.24
GLE1Q12315 SRX1YKL086W 384 nt16.46■□□□□ 0.23
GLE1Q12315 SCS3YGL126W 1143 nt16.3■□□□□ 0.2
GLE1Q12315 YCR051WYCR051W 669 nt15.61■□□□□ 0.09
GLE1Q12315 SSA3YBL075C 1950 nt15.56■□□□□ 0.08
GLE1Q12315 YOL085CYOL085C 342 nt15.35■□□□□ 0.05
GLE1Q12315 PKP1YIL042C 1185 nt15.04■□□□□ -0
GLE1Q12315 DBP2YNL112W 1641 nt14.99□□□□□ -0.01
GLE1Q12315 SCJ1YMR214W 1134 nt14.95□□□□□ -0.02
GLE1Q12315 RPP1BYDL130W 321 nt14.9□□□□□ -0.02
GLE1Q12315 YBR190WYBR190W 312 nt14.77□□□□□ -0.05
GLE1Q12315 ATS1YAL020C 1002 nt14.7□□□□□ -0.06
GLE1Q12315 TRN1tP(UGG)A 72 nt14.66□□□□□ -0.06
GLE1Q12315 SUF9tP(UGG)F 72 nt14.66□□□□□ -0.06
GLE1Q12315 SUF8tP(UGG)H 72 nt14.66□□□□□ -0.06
GLE1Q12315 tP(UGG)LtP(UGG)L 72 nt14.66□□□□□ -0.06
GLE1Q12315 SUF7tP(UGG)M 72 nt14.66□□□□□ -0.06
GLE1Q12315 tP(UGG)N1tP(UGG)N1 72 nt14.66□□□□□ -0.06
GLE1Q12315 tP(UGG)N2tP(UGG)N2 72 nt14.66□□□□□ -0.06
GLE1Q12315 tP(UGG)O1tP(UGG)O1 72 nt14.66□□□□□ -0.06
GLE1Q12315 SUF11tP(UGG)O2 72 nt14.66□□□□□ -0.06
GLE1Q12315 CCC1YLR220W 969 nt14.48□□□□□ -0.09
GLE1Q12315 RTC3YHR087W 336 nt14.32□□□□□ -0.12
GLE1Q12315 PET122YER153C 765 nt14.18□□□□□ -0.14
GLE1Q12315 SCR1SCR1 522 nt14.12□□□□□ -0.15
GLE1Q12315 RVS167YDR388W 1449 nt14.01□□□□□ -0.17
GLE1Q12315 tP(UGG)O3tP(UGG)O3 72 nt13.99□□□□□ -0.17
GLE1Q12315 RRN5YLR141W 1092 nt13.83□□□□□ -0.2
GLE1Q12315 PUT4YOR348C 1884 nt13.71□□□□□ -0.21
GLE1Q12315 RSB1YOR049C 1065 nt13.62□□□□□ -0.23
GLE1Q12315 PST2YDR032C 597 nt13.58□□□□□ -0.24
GLE1Q12315 YER088W-BYER088W-B 147 nt13.55□□□□□ -0.24
GLE1Q12315 YDJ1YNL064C 1230 nt13.55□□□□□ -0.24
GLE1Q12315 SHR5YOL110W 714 nt13.44□□□□□ -0.26
GLE1Q12315 PAC11YDR488C 1602 nt13.32□□□□□ -0.28
GLE1Q12315 ARE1YCR048W 1833 nt13.32□□□□□ -0.28
GLE1Q12315 NVJ2YPR091C 2313 nt13.29□□□□□ -0.28
GLE1Q12315 URN1YPR152C 1398 nt13.28□□□□□ -0.28
GLE1Q12315 OPI9YLR338W 858 nt13.23□□□□□ -0.29
GLE1Q12315 YKL097CYKL097C 411 nt13.19□□□□□ -0.3
GLE1Q12315 POA1YBR022W 534 nt13.19□□□□□ -0.3
GLE1Q12315 SAH1YER043C 1350 nt13.19□□□□□ -0.3
GLE1Q12315 GAR1YHR089C 618 nt13.15□□□□□ -0.3
GLE1Q12315 FPS1YLL043W 2010 nt13.14□□□□□ -0.31
GLE1Q12315 YHR049C-AYHR049C-A 297 nt13.14□□□□□ -0.31
GLE1Q12315 DEP1YAL013W 1218 nt13.09□□□□□ -0.31
GLE1Q12315 RPN10YHR200W 807 nt13.04□□□□□ -0.32
GLE1Q12315 BSC6YOL137W 1494 nt13.03□□□□□ -0.32
GLE1Q12315 SSA4YER103W 1929 nt13□□□□□ -0.33
GLE1Q12315 YNL208WYNL208W 600 nt12.94□□□□□ -0.34
GLE1Q12315 SHU1YHL006C 453 nt12.92□□□□□ -0.34
GLE1Q12315 SSA1YAL005C 1929 nt12.9□□□□□ -0.35
GLE1Q12315 PUN1YLR414C 792 nt12.85□□□□□ -0.35
GLE1Q12315 SPT5YML010W 3192 nt12.79□□□□□ -0.36
GLE1Q12315 BUD23YCR047C 828 nt12.75□□□□□ -0.37
GLE1Q12315 TIR1YER011W 765 nt12.71□□□□□ -0.37
GLE1Q12315 PTC2YER089C 1395 nt12.7□□□□□ -0.38
GLE1Q12315 BDF1YLR399C 2061 nt12.7□□□□□ -0.38
GLE1Q12315 YJL225CYJL225C 5277 nt12.67□□□□□ -0.38
GLE1Q12315 YJR018WYJR018W 363 nt12.66□□□□□ -0.38
GLE1Q12315 NAB2YGL122C 1578 nt12.64□□□□□ -0.39
GLE1Q12315 YOR139CYOR139C 393 nt12.62□□□□□ -0.39
GLE1Q12315 YAL037C-BYAL037C-B 975 nt12.59□□□□□ -0.39
GLE1Q12315 RDN37-1RDN37-1 5354 nt12.51□□□□□ -0.41
GLE1Q12315 RDN37-2RDN37-2 5354 nt12.51□□□□□ -0.41
GLE1Q12315 TAT1YBR069C 1860 nt12.5□□□□□ -0.41
GLE1Q12315 FIS1YIL065C 468 nt12.43□□□□□ -0.42
GLE1Q12315 NPL3YDR432W 1245 nt12.4□□□□□ -0.42
GLE1Q12315 YJR120WYJR120W 351 nt12.39□□□□□ -0.43
GLE1Q12315 DAL1YIR027C 1383 nt12.39□□□□□ -0.43
GLE1Q12315 SRB2YHR041C 633 nt12.35□□□□□ -0.43
GLE1Q12315 INM2YDR287W 879 nt12.3□□□□□ -0.44
GLE1Q12315 RPP2BYDR382W 333 nt12.3□□□□□ -0.44
GLE1Q12315 MEP2YNL142W 1500 nt12.29□□□□□ -0.44
GLE1Q12315 PHO4YFR034C 939 nt12.26□□□□□ -0.45
GLE1Q12315 FPR4YLR449W 1179 nt12.25□□□□□ -0.45
GLE1Q12315 YGR021WYGR021W 873 nt12.24□□□□□ -0.45
GLE1Q12315 HOM6YJR139C 1080 nt12.24□□□□□ -0.45
GLE1Q12315 WWM1YFL010C 636 nt12.21□□□□□ -0.45
GLE1Q12315 UME6YDR207C 2511 nt12.2□□□□□ -0.46
GLE1Q12315 MNP1YGL068W 585 nt12.2□□□□□ -0.46
GLE1Q12315 YPS1YLR120C 1710 nt12.19□□□□□ -0.46
GLE1Q12315 YOL037CYOL037C 354 nt12.16□□□□□ -0.46
GLE1Q12315 tM(CAU)CtM(CAU)C 72 nt12.12□□□□□ -0.47
GLE1Q12315 IMT4tM(CAU)E 72 nt12.12□□□□□ -0.47
GLE1Q12315 IMT3tM(CAU)J3 72 nt12.12□□□□□ -0.47
GLE1Q12315 IMT1tM(CAU)O1 72 nt12.12□□□□□ -0.47
GLE1Q12315 IMT2tM(CAU)P 72 nt12.12□□□□□ -0.47
GLE1Q12315 YBL100CYBL100C 315 nt12.08□□□□□ -0.48
GLE1Q12315 YDR095CYDR095C 411 nt12.07□□□□□ -0.48
GLE1Q12315 RKM5YLR137W 1104 nt12.05□□□□□ -0.48
GLE1Q12315 YHR165W-AYHR165W-A 312 nt12.04□□□□□ -0.48
GLE1Q12315 DCW1YKL046C 1350 nt12.04□□□□□ -0.48
GLE1Q12315 YFL021C-AYFL021C-A 855 nt12.01□□□□□ -0.49
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