Protein–RNA interactions for Protein: Q07478

SUB2, ATP-dependent RNA helicase SUB2, yeastyeast

Known RBP Predictions only

Length 446 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (RIP-Chip)
Gene UniProt Accession Gene Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score Detected Interaction
SUB2Q07478 YML009W-BYML009W-B 477 nt23.67■■□□□ 1.38
SUB2Q07478 NOP1YDL014W 984 nt23.22■■□□□ 1.31
SUB2Q07478 NSR1YGR159C 1245 nt23.15■■□□□ 1.3
SUB2Q07478 YKL036CYKL036C 393 nt21.76■■□□□ 1.07
SUB2Q07478 YJL027CYJL027C 417 nt20.42■□□□□ 0.86
SUB2Q07478 Q0297Q0297 156 nt20.37■□□□□ 0.85
SUB2Q07478 SRX1YKL086W 384 nt20.23■□□□□ 0.83
SUB2Q07478 MDJ1YFL016C 1536 nt20.12■□□□□ 0.81
SUB2Q07478 SCS3YGL126W 1143 nt19.97■□□□□ 0.79
SUB2Q07478 YCR051WYCR051W 669 nt19.28■□□□□ 0.68
SUB2Q07478 YOL085CYOL085C 342 nt18.81■□□□□ 0.6
SUB2Q07478 PKP1YIL042C 1185 nt18.5■□□□□ 0.55
SUB2Q07478 RPP1BYDL130W 321 nt18.31■□□□□ 0.52
SUB2Q07478 SCJ1YMR214W 1134 nt18.24■□□□□ 0.51
SUB2Q07478 TRN1tP(UGG)A 72 nt18.01■□□□□ 0.47
SUB2Q07478 SUF9tP(UGG)F 72 nt18.01■□□□□ 0.47
SUB2Q07478 SUF8tP(UGG)H 72 nt18.01■□□□□ 0.47
SUB2Q07478 tP(UGG)LtP(UGG)L 72 nt18.01■□□□□ 0.47
SUB2Q07478 SUF7tP(UGG)M 72 nt18.01■□□□□ 0.47
SUB2Q07478 tP(UGG)N1tP(UGG)N1 72 nt18.01■□□□□ 0.47
SUB2Q07478 tP(UGG)N2tP(UGG)N2 72 nt18.01■□□□□ 0.47
SUB2Q07478 tP(UGG)O1tP(UGG)O1 72 nt18.01■□□□□ 0.47
SUB2Q07478 SUF11tP(UGG)O2 72 nt18.01■□□□□ 0.47
SUB2Q07478 ATS1YAL020C 1002 nt18■□□□□ 0.47
SUB2Q07478 DBP2YNL112W 1641 nt17.92■□□□□ 0.46
SUB2Q07478 CCC1YLR220W 969 nt17.92■□□□□ 0.46
SUB2Q07478 SCR1SCR1 522 nt17.44■□□□□ 0.38
SUB2Q07478 PET122YER153C 765 nt17.41■□□□□ 0.38
SUB2Q07478 tP(UGG)O3tP(UGG)O3 72 nt17.21■□□□□ 0.35
SUB2Q07478 Q0182Q0182 405 nt17.18■□□□□ 0.34
SUB2Q07478 RVS167YDR388W 1449 nt17.1■□□□□ 0.33
SUB2Q07478 YBR190WYBR190W 312 nt17.07■□□□□ 0.32
SUB2Q07478 RRN5YLR141W 1092 nt16.99■□□□□ 0.31
SUB2Q07478 MOT3YMR070W 1473 nt16.83■□□□□ 0.28
SUB2Q07478 RSB1YOR049C 1065 nt16.8■□□□□ 0.28
SUB2Q07478 RTC3YHR087W 336 nt16.79■□□□□ 0.28
SUB2Q07478 YER088W-BYER088W-B 147 nt16.64■□□□□ 0.25
SUB2Q07478 YDJ1YNL064C 1230 nt16.63■□□□□ 0.25
SUB2Q07478 PST2YDR032C 597 nt16.57■□□□□ 0.24
SUB2Q07478 SHR5YOL110W 714 nt16.53■□□□□ 0.24
SUB2Q07478 GAR1YHR089C 618 nt16.24■□□□□ 0.19
SUB2Q07478 YKL097CYKL097C 411 nt16.2■□□□□ 0.18
SUB2Q07478 DEP1YAL013W 1218 nt15.94■□□□□ 0.14
SUB2Q07478 URN1YPR152C 1398 nt15.82■□□□□ 0.12
SUB2Q07478 SHU1YHL006C 453 nt15.8■□□□□ 0.12
SUB2Q07478 YNL208WYNL208W 600 nt15.75■□□□□ 0.11
SUB2Q07478 RPN10YHR200W 807 nt15.74■□□□□ 0.11
SUB2Q07478 TIR1YER011W 765 nt15.65■□□□□ 0.1
SUB2Q07478 OPI9YLR338W 858 nt15.48■□□□□ 0.07
SUB2Q07478 YAL037C-BYAL037C-B 975 nt15.45■□□□□ 0.06
SUB2Q07478 YOR139CYOR139C 393 nt15.38■□□□□ 0.05
SUB2Q07478 SSA1YAL005C 1929 nt15.35■□□□□ 0.05
SUB2Q07478 NPL3YDR432W 1245 nt15.28■□□□□ 0.04
SUB2Q07478 SAH1YER043C 1350 nt15.27■□□□□ 0.04
SUB2Q07478 PUT4YOR348C 1884 nt15.13■□□□□ 0.01
SUB2Q07478 YJR018WYJR018W 363 nt15.12■□□□□ 0.01
SUB2Q07478 YGR021WYGR021W 873 nt15.1■□□□□ 0.01
SUB2Q07478 SRB2YHR041C 633 nt15.08■□□□□ 0
SUB2Q07478 PUN1YLR414C 792 nt15.07■□□□□ 0
SUB2Q07478 WWM1YFL010C 636 nt15.02■□□□□ -0
SUB2Q07478 HOM6YJR139C 1080 nt15.01□□□□□ -0.01
SUB2Q07478 RPP2BYDR382W 333 nt15□□□□□ -0.01
SUB2Q07478 ARE1YCR048W 1833 nt14.99□□□□□ -0.01
SUB2Q07478 MNP1YGL068W 585 nt14.99□□□□□ -0.01
SUB2Q07478 YOL037CYOL037C 354 nt14.95□□□□□ -0.02
SUB2Q07478 YJR120WYJR120W 351 nt14.84□□□□□ -0.03
SUB2Q07478 YHR049C-AYHR049C-A 297 nt14.82□□□□□ -0.04
SUB2Q07478 RKM5YLR137W 1104 nt14.81□□□□□ -0.04
SUB2Q07478 PTC2YER089C 1395 nt14.81□□□□□ -0.04
SUB2Q07478 tM(CAU)CtM(CAU)C 72 nt14.79□□□□□ -0.04
SUB2Q07478 IMT4tM(CAU)E 72 nt14.79□□□□□ -0.04
SUB2Q07478 IMT3tM(CAU)J3 72 nt14.79□□□□□ -0.04
SUB2Q07478 IMT1tM(CAU)O1 72 nt14.79□□□□□ -0.04
SUB2Q07478 IMT2tM(CAU)P 72 nt14.79□□□□□ -0.04
SUB2Q07478 YFL021C-AYFL021C-A 855 nt14.78□□□□□ -0.04
SUB2Q07478 POA1YBR022W 534 nt14.75□□□□□ -0.05
SUB2Q07478 BDH2YAL061W 1254 nt14.7□□□□□ -0.06
SUB2Q07478 LSM3YLR438C-A 270 nt14.6□□□□□ -0.07
SUB2Q07478 PUS2YGL063W 1113 nt14.59□□□□□ -0.07
SUB2Q07478 BUD23YCR047C 828 nt14.58□□□□□ -0.08
SUB2Q07478 NAB2YGL122C 1578 nt14.56□□□□□ -0.08
SUB2Q07478 INM2YDR287W 879 nt14.56□□□□□ -0.08
SUB2Q07478 YLR281CYLR281C 468 nt14.55□□□□□ -0.08
SUB2Q07478 SSA3YBL075C 1950 nt14.54□□□□□ -0.08
SUB2Q07478 FPR4YLR449W 1179 nt14.49□□□□□ -0.09
SUB2Q07478 YBL100CYBL100C 315 nt14.46□□□□□ -0.09
SUB2Q07478 WHI5YOR083W 888 nt14.46□□□□□ -0.09
SUB2Q07478 DAL1YIR027C 1383 nt14.45□□□□□ -0.1
SUB2Q07478 TRM9YML014W 840 nt14.41□□□□□ -0.1
SUB2Q07478 BSC6YOL137W 1494 nt14.31□□□□□ -0.12
SUB2Q07478 FIS1YIL065C 468 nt14.3□□□□□ -0.12
SUB2Q07478 FUN26YAL022C 1554 nt14.3□□□□□ -0.12
SUB2Q07478 PHO4YFR034C 939 nt14.27□□□□□ -0.13
SUB2Q07478 DSK2YMR276W 1122 nt14.21□□□□□ -0.13
SUB2Q07478 FMP45YDL222C 930 nt14.2□□□□□ -0.14
SUB2Q07478 IMP2'YIL154C 1041 nt14.18□□□□□ -0.14
SUB2Q07478 CCT6YDR188W 1641 nt14.17□□□□□ -0.14
SUB2Q07478 YLR154C-GYLR154C-G 150 nt14.15□□□□□ -0.14
SUB2Q07478 YPR011CYPR011C 981 nt14.1□□□□□ -0.15
SUB2Q07478 SUF2tP(AGG)C 72 nt14.09□□□□□ -0.15
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