Protein–RNA interactions for Protein: Q12420

SNU66, 66 kDa U4/U6.U5 small nuclear ribonucleoprotein component, yeastyeast

Predicted RBP Predictions only

Length 587 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (RIP-Chip)
Gene UniProt Accession Gene Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score Detected Interaction
SNU66Q12420 YML009W-BYML009W-B 477 nt24.91■■□□□ 1.58
SNU66Q12420 NSR1YGR159C 1245 nt24.59■■□□□ 1.53
SNU66Q12420 NOP1YDL014W 984 nt24.33■■□□□ 1.49
SNU66Q12420 YKL036CYKL036C 393 nt22.66■■□□□ 1.22
SNU66Q12420 MDJ1YFL016C 1536 nt21.57■■□□□ 1.04
SNU66Q12420 Q0297Q0297 156 nt21.38■■□□□ 1.01
SNU66Q12420 SRX1YKL086W 384 nt21.26■□□□□ 0.99
SNU66Q12420 YJL027CYJL027C 417 nt21.18■□□□□ 0.98
SNU66Q12420 SCS3YGL126W 1143 nt20.7■□□□□ 0.9
SNU66Q12420 YCR051WYCR051W 669 nt20.18■□□□□ 0.82
SNU66Q12420 YOL085CYOL085C 342 nt19.62■□□□□ 0.73
SNU66Q12420 PKP1YIL042C 1185 nt19.28■□□□□ 0.68
SNU66Q12420 DBP2YNL112W 1641 nt19.19■□□□□ 0.66
SNU66Q12420 RPP1BYDL130W 321 nt19.18■□□□□ 0.66
SNU66Q12420 TRN1tP(UGG)A 72 nt19.07■□□□□ 0.64
SNU66Q12420 SUF9tP(UGG)F 72 nt19.07■□□□□ 0.64
SNU66Q12420 SUF8tP(UGG)H 72 nt19.07■□□□□ 0.64
SNU66Q12420 tP(UGG)LtP(UGG)L 72 nt19.07■□□□□ 0.64
SNU66Q12420 SUF7tP(UGG)M 72 nt19.07■□□□□ 0.64
SNU66Q12420 tP(UGG)N1tP(UGG)N1 72 nt19.07■□□□□ 0.64
SNU66Q12420 tP(UGG)N2tP(UGG)N2 72 nt19.07■□□□□ 0.64
SNU66Q12420 tP(UGG)O1tP(UGG)O1 72 nt19.07■□□□□ 0.64
SNU66Q12420 SUF11tP(UGG)O2 72 nt19.07■□□□□ 0.64
SNU66Q12420 CCC1YLR220W 969 nt18.88■□□□□ 0.61
SNU66Q12420 SCJ1YMR214W 1134 nt18.66■□□□□ 0.58
SNU66Q12420 ATS1YAL020C 1002 nt18.61■□□□□ 0.57
SNU66Q12420 YBR190WYBR190W 312 nt18.37■□□□□ 0.53
SNU66Q12420 PET122YER153C 765 nt18.28■□□□□ 0.52
SNU66Q12420 SCR1SCR1 522 nt18.16■□□□□ 0.5
SNU66Q12420 tP(UGG)O3tP(UGG)O3 72 nt18.13■□□□□ 0.49
SNU66Q12420 RVS167YDR388W 1449 nt18.1■□□□□ 0.49
SNU66Q12420 RTC3YHR087W 336 nt17.96■□□□□ 0.47
SNU66Q12420 RRN5YLR141W 1092 nt17.8■□□□□ 0.44
SNU66Q12420 YDJ1YNL064C 1230 nt17.55■□□□□ 0.4
SNU66Q12420 SHR5YOL110W 714 nt17.53■□□□□ 0.4
SNU66Q12420 RSB1YOR049C 1065 nt17.48■□□□□ 0.39
SNU66Q12420 YER088W-BYER088W-B 147 nt17.44■□□□□ 0.38
SNU66Q12420 PST2YDR032C 597 nt17.2■□□□□ 0.34
SNU66Q12420 GAR1YHR089C 618 nt17.1■□□□□ 0.33
SNU66Q12420 DEP1YAL013W 1218 nt16.95■□□□□ 0.3
SNU66Q12420 URN1YPR152C 1398 nt16.89■□□□□ 0.3
SNU66Q12420 YNL208WYNL208W 600 nt16.73■□□□□ 0.27
SNU66Q12420 RPN10YHR200W 807 nt16.72■□□□□ 0.27
SNU66Q12420 YKL097CYKL097C 411 nt16.63■□□□□ 0.25
SNU66Q12420 OPI9YLR338W 858 nt16.62■□□□□ 0.25
SNU66Q12420 TIR1YER011W 765 nt16.53■□□□□ 0.24
SNU66Q12420 PUT4YOR348C 1884 nt16.48■□□□□ 0.23
SNU66Q12420 SAH1YER043C 1350 nt16.44■□□□□ 0.22
SNU66Q12420 SHU1YHL006C 453 nt16.43■□□□□ 0.22
SNU66Q12420 SSA1YAL005C 1929 nt16.26■□□□□ 0.19
SNU66Q12420 ARE1YCR048W 1833 nt16.25■□□□□ 0.19
SNU66Q12420 YJR018WYJR018W 363 nt16.15■□□□□ 0.18
SNU66Q12420 PUN1YLR414C 792 nt16.14■□□□□ 0.17
SNU66Q12420 YAL037C-BYAL037C-B 975 nt16.11■□□□□ 0.17
SNU66Q12420 YHR049C-AYHR049C-A 297 nt16.03■□□□□ 0.16
SNU66Q12420 SRB2YHR041C 633 nt16.02■□□□□ 0.16
SNU66Q12420 POA1YBR022W 534 nt16■□□□□ 0.15
SNU66Q12420 YJR120WYJR120W 351 nt15.92■□□□□ 0.14
SNU66Q12420 YOR139CYOR139C 393 nt15.91■□□□□ 0.14
SNU66Q12420 PTC2YER089C 1395 nt15.89■□□□□ 0.13
SNU66Q12420 RPP2BYDR382W 333 nt15.89■□□□□ 0.13
SNU66Q12420 WWM1YFL010C 636 nt15.83■□□□□ 0.12
SNU66Q12420 YGR021WYGR021W 873 nt15.82■□□□□ 0.12
SNU66Q12420 HOM6YJR139C 1080 nt15.77■□□□□ 0.12
SNU66Q12420 NPL3YDR432W 1245 nt15.74■□□□□ 0.11
SNU66Q12420 BUD23YCR047C 828 nt15.7■□□□□ 0.1
SNU66Q12420 MNP1YGL068W 585 nt15.7■□□□□ 0.1
SNU66Q12420 NAB2YGL122C 1578 nt15.66■□□□□ 0.1
SNU66Q12420 BDH2YAL061W 1254 nt15.61■□□□□ 0.09
SNU66Q12420 BSC6YOL137W 1494 nt15.59■□□□□ 0.09
SNU66Q12420 YFL021C-AYFL021C-A 855 nt15.58■□□□□ 0.08
SNU66Q12420 INM2YDR287W 879 nt15.56■□□□□ 0.08
SNU66Q12420 YOL037CYOL037C 354 nt15.55■□□□□ 0.08
SNU66Q12420 SSA3YBL075C 1950 nt15.55■□□□□ 0.08
SNU66Q12420 RKM5YLR137W 1104 nt15.53■□□□□ 0.08
SNU66Q12420 DAL1YIR027C 1383 nt15.49■□□□□ 0.07
SNU66Q12420 LSM3YLR438C-A 270 nt15.47■□□□□ 0.07
SNU66Q12420 FPR4YLR449W 1179 nt15.46■□□□□ 0.07
SNU66Q12420 FIS1YIL065C 468 nt15.42■□□□□ 0.06
SNU66Q12420 YBL100CYBL100C 315 nt15.42■□□□□ 0.06
SNU66Q12420 PHO4YFR034C 939 nt15.34■□□□□ 0.05
SNU66Q12420 tM(CAU)CtM(CAU)C 72 nt15.3■□□□□ 0.04
SNU66Q12420 IMT4tM(CAU)E 72 nt15.3■□□□□ 0.04
SNU66Q12420 IMT3tM(CAU)J3 72 nt15.3■□□□□ 0.04
SNU66Q12420 IMT1tM(CAU)O1 72 nt15.3■□□□□ 0.04
SNU66Q12420 IMT2tM(CAU)P 72 nt15.3■□□□□ 0.04
SNU66Q12420 TRM9YML014W 840 nt15.29■□□□□ 0.04
SNU66Q12420 FUN26YAL022C 1554 nt15.25■□□□□ 0.03
SNU66Q12420 YLR281CYLR281C 468 nt15.19■□□□□ 0.02
SNU66Q12420 PUS2YGL063W 1113 nt15.11■□□□□ 0.01
SNU66Q12420 WHI5YOR083W 888 nt15.11■□□□□ 0.01
SNU66Q12420 CCT6YDR188W 1641 nt15.1■□□□□ 0.01
SNU66Q12420 ALF1YNL148C 765 nt14.99□□□□□ -0.01
SNU66Q12420 SUF2tP(AGG)C 72 nt14.97□□□□□ -0.01
SNU66Q12420 SUF10tP(AGG)N 72 nt14.97□□□□□ -0.01
SNU66Q12420 YPS1YLR120C 1710 nt14.95□□□□□ -0.02
SNU66Q12420 YDR095CYDR095C 411 nt14.91□□□□□ -0.02
SNU66Q12420 YLR154C-GYLR154C-G 150 nt14.91□□□□□ -0.02
SNU66Q12420 DSK2YMR276W 1122 nt14.8□□□□□ -0.04
SNU66Q12420 IMP2'YIL154C 1041 nt14.79□□□□□ -0.04
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