Protein–RNA interactions for Protein: Q12493

NKP1, Inner kinetochore subunit NKP1, yeastyeast

Predictions only

Length 238 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (RIP-Chip)
Gene UniProt Accession Gene Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score Detected Interaction
NKP1Q12493 NSR1YGR159C 1245 nt18.81■□□□□ 0.6
NKP1Q12493 YML009W-BYML009W-B 477 nt18.09■□□□□ 0.49
NKP1Q12493 MDJ1YFL016C 1536 nt17.44■□□□□ 0.38
NKP1Q12493 NOP1YDL014W 984 nt17.27■□□□□ 0.36
NKP1Q12493 YJL027CYJL027C 417 nt15.99■□□□□ 0.15
NKP1Q12493 SSA3YBL075C 1950 nt15.62■□□□□ 0.09
NKP1Q12493 DBP2YNL112W 1641 nt15.18■□□□□ 0.02
NKP1Q12493 YKL036CYKL036C 393 nt15.16■□□□□ 0.02
NKP1Q12493 SRX1YKL086W 384 nt15.14■□□□□ 0.01
NKP1Q12493 YBR190WYBR190W 312 nt15.14■□□□□ 0.01
NKP1Q12493 Q0297Q0297 156 nt14.92□□□□□ -0.02
NKP1Q12493 Q0182Q0182 405 nt14.76□□□□□ -0.05
NKP1Q12493 RTC3YHR087W 336 nt14.63□□□□□ -0.07
NKP1Q12493 PUT4YOR348C 1884 nt14.44□□□□□ -0.1
NKP1Q12493 TRN1tP(UGG)A 72 nt14.21□□□□□ -0.13
NKP1Q12493 SUF9tP(UGG)F 72 nt14.21□□□□□ -0.13
NKP1Q12493 SUF8tP(UGG)H 72 nt14.21□□□□□ -0.13
NKP1Q12493 tP(UGG)LtP(UGG)L 72 nt14.21□□□□□ -0.13
NKP1Q12493 SUF7tP(UGG)M 72 nt14.21□□□□□ -0.13
NKP1Q12493 tP(UGG)N1tP(UGG)N1 72 nt14.21□□□□□ -0.13
NKP1Q12493 tP(UGG)N2tP(UGG)N2 72 nt14.21□□□□□ -0.13
NKP1Q12493 tP(UGG)O1tP(UGG)O1 72 nt14.21□□□□□ -0.13
NKP1Q12493 SUF11tP(UGG)O2 72 nt14.21□□□□□ -0.13
NKP1Q12493 YCR051WYCR051W 669 nt14.19□□□□□ -0.14
NKP1Q12493 RVS167YDR388W 1449 nt13.96□□□□□ -0.18
NKP1Q12493 MOT3YMR070W 1473 nt13.94□□□□□ -0.18
NKP1Q12493 SPT5YML010W 3192 nt13.92□□□□□ -0.18
NKP1Q12493 CCC1YLR220W 969 nt13.92□□□□□ -0.18
NKP1Q12493 ARE1YCR048W 1833 nt13.9□□□□□ -0.18
NKP1Q12493 POA1YBR022W 534 nt13.84□□□□□ -0.19
NKP1Q12493 SCJ1YMR214W 1134 nt13.8□□□□□ -0.2
NKP1Q12493 BSC6YOL137W 1494 nt13.74□□□□□ -0.21
NKP1Q12493 SSA4YER103W 1929 nt13.73□□□□□ -0.21
NKP1Q12493 YHR049C-AYHR049C-A 297 nt13.66□□□□□ -0.22
NKP1Q12493 SAH1YER043C 1350 nt13.58□□□□□ -0.24
NKP1Q12493 OPI9YLR338W 858 nt13.48□□□□□ -0.25
NKP1Q12493 URN1YPR152C 1398 nt13.45□□□□□ -0.26
NKP1Q12493 SCS3YGL126W 1143 nt13.38□□□□□ -0.27
NKP1Q12493 BDF1YLR399C 2061 nt13.36□□□□□ -0.27
NKP1Q12493 RPP1BYDL130W 321 nt13.35□□□□□ -0.27
NKP1Q12493 SHR5YOL110W 714 nt13.34□□□□□ -0.27
NKP1Q12493 PAC11YDR488C 1602 nt13.24□□□□□ -0.29
NKP1Q12493 SSA1YAL005C 1929 nt13.21□□□□□ -0.29
NKP1Q12493 BUD23YCR047C 828 nt13.2□□□□□ -0.3
NKP1Q12493 YOL085CYOL085C 342 nt13.19□□□□□ -0.3
NKP1Q12493 DEP1YAL013W 1218 nt13.16□□□□□ -0.3
NKP1Q12493 TAT1YBR069C 1860 nt13.16□□□□□ -0.3
NKP1Q12493 tP(UGG)O3tP(UGG)O3 72 nt13.13□□□□□ -0.31
NKP1Q12493 NVJ2YPR091C 2313 nt13.1□□□□□ -0.31
NKP1Q12493 PUN1YLR414C 792 nt13.06□□□□□ -0.32
NKP1Q12493 RPN10YHR200W 807 nt13.04□□□□□ -0.32
NKP1Q12493 PTC2YER089C 1395 nt13.03□□□□□ -0.32
NKP1Q12493 PKP1YIL042C 1185 nt13.02□□□□□ -0.33
NKP1Q12493 MEP2YNL142W 1500 nt13.01□□□□□ -0.33
NKP1Q12493 NAB2YGL122C 1578 nt12.99□□□□□ -0.33
NKP1Q12493 YNL208WYNL208W 600 nt12.92□□□□□ -0.34
NKP1Q12493 PET122YER153C 765 nt12.85□□□□□ -0.35
NKP1Q12493 YJR018WYJR018W 363 nt12.79□□□□□ -0.36
NKP1Q12493 FIS1YIL065C 468 nt12.78□□□□□ -0.36
NKP1Q12493 FPS1YLL043W 2010 nt12.78□□□□□ -0.36
NKP1Q12493 DCW1YKL046C 1350 nt12.76□□□□□ -0.37
NKP1Q12493 YDJ1YNL064C 1230 nt12.75□□□□□ -0.37
NKP1Q12493 YBR220CYBR220C 1683 nt12.67□□□□□ -0.38
NKP1Q12493 DAL1YIR027C 1383 nt12.66□□□□□ -0.38
NKP1Q12493 YPS1YLR120C 1710 nt12.64□□□□□ -0.39
NKP1Q12493 EMI2YDR516C 1503 nt12.57□□□□□ -0.4
NKP1Q12493 PHO4YFR034C 939 nt12.55□□□□□ -0.4
NKP1Q12493 YJR120WYJR120W 351 nt12.52□□□□□ -0.41
NKP1Q12493 GAR1YHR089C 618 nt12.51□□□□□ -0.41
NKP1Q12493 FPR4YLR449W 1179 nt12.5□□□□□ -0.41
NKP1Q12493 YMR090WYMR090W 684 nt12.49□□□□□ -0.41
NKP1Q12493 INM2YDR287W 879 nt12.46□□□□□ -0.41
NKP1Q12493 YHR165W-AYHR165W-A 312 nt12.46□□□□□ -0.41
NKP1Q12493 YDR095CYDR095C 411 nt12.44□□□□□ -0.42
NKP1Q12493 SDH1YKL148C 1923 nt12.44□□□□□ -0.42
NKP1Q12493 YDL221WYDL221W 552 nt12.42□□□□□ -0.42
NKP1Q12493 SCR1SCR1 522 nt12.42□□□□□ -0.42
NKP1Q12493 PCH2YBR186W 1695 nt12.42□□□□□ -0.42
NKP1Q12493 GUT2YIL155C 1950 nt12.39□□□□□ -0.43
NKP1Q12493 RRN5YLR141W 1092 nt12.38□□□□□ -0.43
NKP1Q12493 SEC11YIR022W 504 nt12.32□□□□□ -0.44
NKP1Q12493 CAC2YML102W 1407 nt12.29□□□□□ -0.44
NKP1Q12493 PTP1YDL230W 1008 nt12.28□□□□□ -0.44
NKP1Q12493 RPP2BYDR382W 333 nt12.26□□□□□ -0.45
NKP1Q12493 PIB2YGL023C 1908 nt12.26□□□□□ -0.45
NKP1Q12493 SCC4YER147C 1875 nt12.21□□□□□ -0.45
NKP1Q12493 YJL225CYJL225C 5277 nt12.2□□□□□ -0.46
NKP1Q12493 YBL100CYBL100C 315 nt12.18□□□□□ -0.46
NKP1Q12493 TIR1YER011W 765 nt12.16□□□□□ -0.46
NKP1Q12493 RPP2AYOL039W 321 nt12.16□□□□□ -0.46
NKP1Q12493 YER088W-BYER088W-B 147 nt12.15□□□□□ -0.46
NKP1Q12493 IRC15YPL017C 1500 nt12.14□□□□□ -0.47
NKP1Q12493 UME6YDR207C 2511 nt12.09□□□□□ -0.47
NKP1Q12493 GIS3YLR094C 1509 nt12.05□□□□□ -0.48
NKP1Q12493 FUN26YAL022C 1554 nt12.02□□□□□ -0.49
NKP1Q12493 YSC84YHR016C 1407 nt12.02□□□□□ -0.49
NKP1Q12493 RTF1YGL244W 1677 nt12.01□□□□□ -0.49
NKP1Q12493 YHL050CYHL050C 2094 nt11.99□□□□□ -0.49
NKP1Q12493 ALF1YNL148C 765 nt11.96□□□□□ -0.49
NKP1Q12493 BDH2YAL061W 1254 nt11.94□□□□□ -0.5
Retrieved 100 of 7,029 protein–RNA pairs in 23.6 ms