RNA–Protein interactions for RNA: ENSMUST00000001226.9

Sh3bp1-201, Transcript of SH3 domain-binding protein 1, mousemouse

TSL 5 BASIC

Gene Sh3bp1, Length 2,510 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytoplasm .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Sh3bp1-201ENSMUST00000001226 Slc4a1apE9PX68 744 aa22.6■■□□□ 1.21
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Sh3bp1-201ENSMUST00000001226 Myo5cE9Q1F5 1742 aa22.6■■□□□ 1.21
Sh3bp1-201ENSMUST00000001226 Ccdc27Q3V036 639 aa22.59■■□□□ 1.21
Sh3bp1-201ENSMUST00000001226 Uggt2E9Q4X2 1504 aa22.59■■□□□ 1.21
Sh3bp1-201ENSMUST00000001226 Ttc41Q692V3 1318 aa22.58■■□□□ 1.21
Sh3bp1-201ENSMUST00000001226 Atp10dQ8K2X1 1416 aa22.58■■□□□ 1.21
Sh3bp1-201ENSMUST00000001226 Itsn2Q9Z0R6 1659 aa22.58■■□□□ 1.2
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Sh3bp1-201ENSMUST00000001226 Znf608Q56A10 1511 aa22.55■■□□□ 1.2
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Sh3bp1-201ENSMUST00000001226 AnkarA2RT91 1465 aa22.53■■□□□ 1.2
Sh3bp1-201ENSMUST00000001226 Fam184bQ0KK56 942 aa22.53■■□□□ 1.2
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Sh3bp1-201ENSMUST00000001226 Kdm5aQ3UXZ9 1690 aa22.49■■□□□ 1.19
Sh3bp1-201ENSMUST00000001226 Atf7ipQ7TT18 1306 aa22.49■■□□□ 1.19
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Sh3bp1-201ENSMUST00000001226 Hdac5Q9Z2V6 1113 aa22.45■■□□□ 1.18
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Sh3bp1-201ENSMUST00000001226 Usp19Q3UJD6 1360 aa22.44■■□□□ 1.18
Sh3bp1-201ENSMUST00000001226 Plekhh1Q80TI1 1356 aa22.44■■□□□ 1.18
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Sh3bp1-201ENSMUST00000001226 Abca6Q8K441 1624 aa22.43■■□□□ 1.18
Sh3bp1-201ENSMUST00000001226 Zfyve16Q80U44 1528 aa22.43■■□□□ 1.18
Sh3bp1-201ENSMUST00000001226 Iqgap3F8VQ29 1632 aa22.43■■□□□ 1.18
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Sh3bp1-201ENSMUST00000001226 Iqcf3Q9D498 203 aa22.42■■□□□ 1.18
Sh3bp1-201ENSMUST00000001226 Myom1Q62234 1667 aaKnown RBP22.42■■□□□ 1.18
Sh3bp1-201ENSMUST00000001226 Myo3aQ8K3H5 1613 aa22.41■■□□□ 1.18
Sh3bp1-201ENSMUST00000001226 Kif7B7ZNG0 1348 aa22.4■■□□□ 1.18
Sh3bp1-201ENSMUST00000001226 Abca8aQ8K442 1620 aa22.4■■□□□ 1.18
Sh3bp1-201ENSMUST00000001226 Rwdd1Q9CQK7 243 aa22.39■■□□□ 1.18
Sh3bp1-201ENSMUST00000001226 Abca9Q8K449 1623 aa22.39■■□□□ 1.18
Sh3bp1-201ENSMUST00000001226 Nos1Q9Z0J4 1429 aa22.38■■□□□ 1.17
Sh3bp1-201ENSMUST00000001226 Gm20521D3Z5F7 333 aa22.37■■□□□ 1.17
Sh3bp1-201ENSMUST00000001226 Kif3bQ61771 747 aa22.37■■□□□ 1.17
Sh3bp1-201ENSMUST00000001226 Os9Q8K2C7 672 aa22.36■■□□□ 1.17
Sh3bp1-201ENSMUST00000001226 Speer4f1Q9D5Q6 258 aa22.36■■□□□ 1.17
Sh3bp1-201ENSMUST00000001226 Apbb1Q9QXJ1 710 aa22.36■■□□□ 1.17
Sh3bp1-201ENSMUST00000001226 Ttc21bQ0HA38 1315 aa22.36■■□□□ 1.17
Sh3bp1-201ENSMUST00000001226 Nkx1-2P42580 305 aa22.35■■□□□ 1.17
Sh3bp1-201ENSMUST00000001226 Gtf2e1Q9D0D5 440 aa22.34■■□□□ 1.17
Sh3bp1-201ENSMUST00000001226 Sipa1l1Q8C0T5 1782 aa22.34■■□□□ 1.17
Sh3bp1-201ENSMUST00000001226 Rims1Q99NE5 1463 aa22.34■■□□□ 1.17
Sh3bp1-201ENSMUST00000001226 Dbr1Q923B1 550 aa22.34■■□□□ 1.17
Sh3bp1-201ENSMUST00000001226 ErbinQ80TH2 1402 aa22.34■■□□□ 1.17
Sh3bp1-201ENSMUST00000001226 Ccdc30Q8BVF4 654 aa22.33■■□□□ 1.17
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Sh3bp1-201ENSMUST00000001226 Usp40Q8BWR4 1235 aa22.33■■□□□ 1.17
Sh3bp1-201ENSMUST00000001226 Dcaf11Q91VU6 549 aa22.32■■□□□ 1.16
Sh3bp1-201ENSMUST00000001226 Stk24Q99KH8 431 aa22.32■■□□□ 1.16
Sh3bp1-201ENSMUST00000001226 Ehbp1l1Q99MS7 1716 aa22.32■■□□□ 1.16
Sh3bp1-201ENSMUST00000001226 Nphp4P59240 1425 aa22.32■■□□□ 1.16
Sh3bp1-201ENSMUST00000001226 Neurod2Q62414 383 aa22.32■■□□□ 1.16
Sh3bp1-201ENSMUST00000001226 Prex1Q69ZK0 1650 aa22.32■■□□□ 1.16
Sh3bp1-201ENSMUST00000001226 Kiaa1107Q80TK0 1369 aa22.31■■□□□ 1.16
Sh3bp1-201ENSMUST00000001226 Fan1Q69ZT1 1020 aa22.31■■□□□ 1.16
Sh3bp1-201ENSMUST00000001226 Trpm1Q2TV84 1622 aa22.31■■□□□ 1.16
Sh3bp1-201ENSMUST00000001226 Znf518aB2RRF6 1478 aaKnown RBP22.3■■□□□ 1.16
Sh3bp1-201ENSMUST00000001226 DnmbpQ6TXD4 1580 aa22.29■■□□□ 1.16
Sh3bp1-201ENSMUST00000001226 PrkcshO08795 521 aa22.29■■□□□ 1.16
Sh3bp1-201ENSMUST00000001226 Nlrp6Q91WS2 869 aa22.29■■□□□ 1.16
Sh3bp1-201ENSMUST00000001226 EspnQ9ET47 871 aa22.29■■□□□ 1.16
Sh3bp1-201ENSMUST00000001226 AatkQ80YE4 1365 aa22.29■■□□□ 1.16
Sh3bp1-201ENSMUST00000001226 Talpid3E9PV87 1520 aa22.29■■□□□ 1.16
Sh3bp1-201ENSMUST00000001226 Zmym3Q9JLM4 1370 aa22.28■■□□□ 1.16
Sh3bp1-201ENSMUST00000001226 Adgrb3Q80ZF8 1522 aa22.27■■□□□ 1.16
Sh3bp1-201ENSMUST00000001226 Igf1rQ60751 1373 aa22.27■■□□□ 1.16
Sh3bp1-201ENSMUST00000001226 Hsp90aa1P07901 733 aaKnown RBP22.27■■□□□ 1.16
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Sh3bp1-201ENSMUST00000001226 Smc5Q8CG46 1101 aaKnown RBP22.26■■□□□ 1.15
Sh3bp1-201ENSMUST00000001226 Chmp5Q9D7S9 219 aa22.25■■□□□ 1.15
Sh3bp1-201ENSMUST00000001226 Gprasp1Q5U4C1 1347 aa22.24■■□□□ 1.15
Sh3bp1-201ENSMUST00000001226 Golga2Q921M4 999 aa22.23■■□□□ 1.15
Sh3bp1-201ENSMUST00000001226 CanxP35564 591 aaKnown RBP22.23■■□□□ 1.15
Sh3bp1-201ENSMUST00000001226 Tspyl2Q7TQI8 677 aa22.23■■□□□ 1.15
Sh3bp1-201ENSMUST00000001226 Stard8Q8K031 1019 aa22.23■■□□□ 1.15
Sh3bp1-201ENSMUST00000001226 Efcab6Q6P1E8 1516 aa22.22■■□□□ 1.15
Sh3bp1-201ENSMUST00000001226 Topbp1Q6ZQF0 1515 aa22.22■■□□□ 1.15
Sh3bp1-201ENSMUST00000001226 Uspl1Q3ULM6 1089 aa22.22■■□□□ 1.15
Sh3bp1-201ENSMUST00000001226 Prdm10Q3UTQ7 1184 aa22.22■■□□□ 1.15
Sh3bp1-201ENSMUST00000001226 NudcO35685 332 aaKnown RBP22.21■■□□□ 1.15
Sh3bp1-201ENSMUST00000001226 Myom2Q14BI5 1463 aa22.21■■□□□ 1.15
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Sh3bp1-201ENSMUST00000001226 Ythdc2B2RR83 1445 aaKnown RBP22.2■■□□□ 1.14
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