RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000629983.2

CAPNS1-217, Transcript of calpain small subunit 1, humanhuman

TSL 5 BASIC

Gene CAPNS1, Length 799 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytosol, Ribosome .

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CAPNS1-217ENST00000629983 FBXO31Q5XUX0 539 aaPredicted RBP43.9■■■■■ 4.62
CAPNS1-217ENST00000629983 DNMT1P26358 1616 aaKnown RBP43.89■■■■■ 4.62
CAPNS1-217ENST00000629983 CCDC141Q6ZP82 1450 aa43.89■■■■■ 4.62
CAPNS1-217ENST00000629983 SCAF1Q9H7N4 1312 aaKnown RBP43.88■■■■■ 4.61
CAPNS1-217ENST00000629983 WASHC2CQ9Y4E1 1318 aa43.84■■■■■ 4.61
CAPNS1-217ENST00000629983 KDM5DQ9BY66 1539 aa43.83■■■■■ 4.61
CAPNS1-217ENST00000629983 CAMSAP2Q08AD1 1489 aa43.83■■■■■ 4.61
CAPNS1-217ENST00000629983 PZPP20742 1482 aa43.81■■■■■ 4.6
CAPNS1-217ENST00000629983 NCOA2Q15596 1464 aa43.8■■■■■ 4.6
CAPNS1-217ENST00000629983 PIP4K2BP78356 416 aa43.78■■■■■ 4.6
CAPNS1-217ENST00000629983 RSPH4AQ5TD94 716 aa43.78■■■■■ 4.6
CAPNS1-217ENST00000629983 FAM135AQ9P2D6 1515 aa43.74■■■■■ 4.59
CAPNS1-217ENST00000629983 ANKLE2Q86XL3 938 aa43.74■■■■■ 4.59
CAPNS1-217ENST00000629983 DROSHAQ9NRR4 1374 aaKnown RBP eCLIP43.72■■■■■ 4.59
CAPNS1-217ENST00000629983 NEURL4Q96JN8 1562 aa43.71■■■■■ 4.59
CAPNS1-217ENST00000629983 TOM1O60784 492 aa43.71■■■■■ 4.59
CAPNS1-217ENST00000629983 TSPY4P0CV99 314 aa43.71■■■■■ 4.59
CAPNS1-217ENST00000629983 TSPY10P0CW01 314 aa43.71■■■■■ 4.59
CAPNS1-217ENST00000629983 CPS1P31327 1500 aa43.71■■■■■ 4.59
CAPNS1-217ENST00000629983 POLR1AO95602 1720 aaPredicted RBP43.7■■■■■ 4.59
CAPNS1-217ENST00000629983 SHANK2Q9UPX8 1470 aa43.7■■■■■ 4.59
CAPNS1-217ENST00000629983 THEMISQ8N1K5 641 aaPredicted RBP43.69■■■■■ 4.58
CAPNS1-217ENST00000629983 MIA2Q96PC5 1412 aa43.68■■■■■ 4.58
CAPNS1-217ENST00000629983 HSPA1LP34931 641 aa43.68■■■■■ 4.58
CAPNS1-217ENST00000629983 NLRP1Q9C000 1473 aa43.64■■■■■ 4.58
CAPNS1-217ENST00000629983 UGGT1Q9NYU2 1555 aa43.62■■■■■ 4.57
CAPNS1-217ENST00000629983 ARHGEF5Q12774 1597 aa43.59■■■■■ 4.57
CAPNS1-217ENST00000629983 NPHP4O75161 1426 aaPredicted RBP43.59■■■■■ 4.57
CAPNS1-217ENST00000629983 VWDEQ8N2E2 1590 aa43.52■■■■■ 4.56
CAPNS1-217ENST00000629983 MED14O60244 1454 aa43.49■■■■■ 4.55
CAPNS1-217ENST00000629983 MED1Q15648 1581 aaPredicted RBP43.49■■■■■ 4.55
CAPNS1-217ENST00000629983 DEPDC5O75140 1603 aa43.46■■■■■ 4.55
CAPNS1-217ENST00000629983 ABCC3O15438 1527 aa43.45■■■■■ 4.55
CAPNS1-217ENST00000629983 LRRC9Q6ZRR7 1453 aa43.43■■■■■ 4.54
CAPNS1-217ENST00000629983 RNF17Q9BXT8 1623 aaKnown RBP43.42■■■■■ 4.54
CAPNS1-217ENST00000629983 SENP3Q9H4L4 574 aaPredicted RBP43.39■■■■■ 4.54
CAPNS1-217ENST00000629983 IQGAP1P46940 1657 aa43.39■■■■■ 4.54
CAPNS1-217ENST00000629983 ERVK-7P63135 1459 aa43.38■■■■■ 4.54
CAPNS1-217ENST00000629983 MAST1Q9Y2H9 1570 aa43.37■■■■■ 4.53
CAPNS1-217ENST00000629983 ZC3H13Q5T200 1668 aaKnown RBP43.37■■■■■ 4.53
CAPNS1-217ENST00000629983 PHF23Q9BUL5 403 aaPredicted RBP43.37■■■■■ 4.53
CAPNS1-217ENST00000629983 VPS8Q8N3P4 1428 aa43.37■■■■■ 4.53
CAPNS1-217ENST00000629983 EIF2AK4Q9P2K8 1649 aaKnown RBP43.31■■■■■ 4.52
CAPNS1-217ENST00000629983 LRRC7Q96NW7 1537 aa43.27■■■■■ 4.52
CAPNS1-217ENST00000629983 ALKQ9UM73 1620 aa43.27■■■■■ 4.52
CAPNS1-217ENST00000629983 KANK4Q5T7N3 995 aaPredicted RBP43.27■■■■■ 4.52
CAPNS1-217ENST00000629983 MYOM3Q5VTT5 1437 aa43.26■■■■■ 4.52
CAPNS1-217ENST00000629983 MROH1Q8NDA8 1641 aa43.25■■■■■ 4.51
CAPNS1-217ENST00000629983 DUOX2Q9NRD8 1548 aa43.22■■■■■ 4.51
CAPNS1-217ENST00000629983 CEP152O94986 1710 aa43.21■■■■■ 4.51
CAPNS1-217ENST00000629983 SYNMO15061 1565 aa43.2■■■■■ 4.51
CAPNS1-217ENST00000629983 SCAF11Q99590 1463 aaKnown RBP43.2■■■■■ 4.51
CAPNS1-217ENST00000629983 STRCP1A6NGW2 1772 aa43.18■■■■■ 4.5
CAPNS1-217ENST00000629983 LOC105371045A0A1W2PR82 267 aa43.17■■■■■ 4.5
CAPNS1-217ENST00000629983 TXNDC2Q86VQ3 553 aa43.17■■■■■ 4.5
CAPNS1-217ENST00000629983 KIF15Q9NS87 1388 aa43.16■■■■■ 4.5
CAPNS1-217ENST00000629983 UBR1Q8IWV7 1749 aa43.14■■■■■ 4.5
CAPNS1-217ENST00000629983 GRWD1Q9BQ67 446 aaKnown RBP eCLIP43.13■■■■■ 4.49
CAPNS1-217ENST00000629983 MAP3K1Q13233 1512 aa43.12■■■■■ 4.49
CAPNS1-217ENST00000629983 LTKP29376 864 aa43.12■■■■■ 4.49
CAPNS1-217ENST00000629983 RRP7BPQ9NSQ0 103 aa43.12■■■■■ 4.49
CAPNS1-217ENST00000629983 EID1Q9Y6B2 187 aa43.11■■■■■ 4.49
CAPNS1-217ENST00000629983 CFAP65Q6ZU64 1925 aaKnown RBP43.07■■■■■ 4.49
CAPNS1-217ENST00000629983 STAG3Q9UJ98 1225 aa43.07■■■■■ 4.49
CAPNS1-217ENST00000629983 ARHGAP23Q9P227 1491 aa43.06■■■■■ 4.48
CAPNS1-217ENST00000629983 ARHGAP31Q2M1Z3 1444 aa43.06■■■■■ 4.48
CAPNS1-217ENST00000629983 ERBINQ96RT1 1412 aa43.06■■■■■ 4.48
CAPNS1-217ENST00000629983 SLIT1O75093 1534 aa43.06■■■■■ 4.48
CAPNS1-217ENST00000629983 PRDM15P57071 1507 aaPredicted RBP43.06■■■■■ 4.48
CAPNS1-217ENST00000629983 ABCC5O15440 1437 aa43.02■■■■■ 4.48
CAPNS1-217ENST00000629983 KANK1Q14678 1352 aa43.02■■■■■ 4.48
CAPNS1-217ENST00000629983 APLP2Q06481 763 aa42.97■■■■■ 4.47
CAPNS1-217ENST00000629983 TMEM2Q9UHN6 1383 aa42.95■■■■■ 4.47
CAPNS1-217ENST00000629983 PIK3C2BO00750 1634 aa42.93■■■■■ 4.46
CAPNS1-217ENST00000629983 PTPN23Q9H3S7 1636 aa42.93■■■■■ 4.46
CAPNS1-217ENST00000629983 CROCC2H7BZ55 1655 aa42.92■■■■■ 4.46
CAPNS1-217ENST00000629983 DAPK1P53355 1430 aa42.92■■■■■ 4.46
CAPNS1-217ENST00000629983 CHIC2Q9UKJ5 165 aa42.89■■■■■ 4.46
CAPNS1-217ENST00000629983 EFCAB6Q5THR3 1501 aa42.85■■■■■ 4.45
CAPNS1-217ENST00000629983 TMEM94Q12767 1356 aa42.84■■■■■ 4.45
CAPNS1-217ENST00000629983 IDI1Q13907 227 aa42.84■■■■■ 4.45
CAPNS1-217ENST00000629983 ANKRD30AQ9BXX3 1397 aa42.84■■■■■ 4.45
CAPNS1-217ENST00000629983 SLC26A8Q96RN1 970 aa42.81■■■■■ 4.44
CAPNS1-217ENST00000629983 FGD6Q6ZV73 1430 aa42.8■■■■■ 4.44
CAPNS1-217ENST00000629983 KCNA6P17658 529 aa42.79■■■■■ 4.44
CAPNS1-217ENST00000629983 FAM135BQ49AJ0 1406 aa42.79■■■■■ 4.44
CAPNS1-217ENST00000629983 PROSER2Q86WR7 435 aaPredicted RBP42.78■■■■■ 4.44
CAPNS1-217ENST00000629983 XIRP1Q702N8 1843 aaKnown RBP42.78■■■■■ 4.44
CAPNS1-217ENST00000629983 BCANQ96GW7 911 aa42.77■■■■■ 4.44
CAPNS1-217ENST00000629983 LMTK2Q8IWU2 1503 aa42.76■■■■■ 4.44
CAPNS1-217ENST00000629983 RGS17Q9UGC6 210 aaPredicted RBP42.76■■■■■ 4.44
CAPNS1-217ENST00000629983 RBM33Q96EV2 1170 aaKnown RBP42.75■■■■■ 4.43
CAPNS1-217ENST00000629983 KDM5AP29375 1690 aaKnown RBP42.69■■■■■ 4.42
CAPNS1-217ENST00000629983 ADGRB3O60242 1522 aa42.67■■■■■ 4.42
CAPNS1-217ENST00000629983 NOS1P29475 1434 aa42.66■■■■■ 4.42
CAPNS1-217ENST00000629983 TET3O43151 1660 aa42.63■■■■■ 4.42
CAPNS1-217ENST00000629983 SLC52A1Q9NWF4 448 aa42.63■■■■■ 4.41
CAPNS1-217ENST00000629983 NKTRP30414 1462 aaKnown RBP42.6■■■■■ 4.41
CAPNS1-217ENST00000629983 ROBO1Q9Y6N7 1651 aa42.6■■■■■ 4.41
CAPNS1-217ENST00000629983 MSH6P52701 1360 aa42.59■■■■■ 4.41
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 12.3 ms