RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000629983.2

CAPNS1-217, Transcript of calpain small subunit 1, humanhuman

TSL 5 BASIC

Gene CAPNS1, Length 799 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytosol, Ribosome .

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CAPNS1-217ENST00000629983 PUM2Q8TB72 1066 aaKnown RBP eCLIP24.24■■□□□ 1.478e-53■■■□□ 14.8
CAPNS1-217ENST00000629983 GEMIN5Q8TEQ6 1508 aaKnown RBP eCLIP45.79■■■■■ 4.926e-24■■□□□ 13
CAPNS1-217ENST00000629983 UTP3Q9NQZ2 479 aaKnown RBP eCLIP28.92■■■□□ 2.221e-21■■■■■ 79.2
CAPNS1-217ENST00000629983 DDX55Q8NHQ9 600 aaKnown RBP eCLIP34.58■■■■□ 3.138e-20■■□□□ 14.3
CAPNS1-217ENST00000629983 IGF2BP2Q9Y6M1 599 aaKnown RBP eCLIP23.93■■□□□ 1.428e-17■□□□□ 10.3
CAPNS1-217ENST00000629983 HNRNPKP61978 463 aaKnown RBP eCLIP28.04■■■□□ 2.082e-14■■□□□ 13.1
CAPNS1-217ENST00000629983 GTF2F1P35269 517 aaKnown RBP eCLIP31.52■■■□□ 2.642e-11■■■□□ 17.4
CAPNS1-217ENST00000629983 METAP2P50579 478 aaKnown RBP eCLIP30.98■■■□□ 2.554e-11■□□□□ 10.1
CAPNS1-217ENST00000629983 IGF2BP1Q9NZI8 577 aaKnown RBP eCLIP26.62■■□□□ 1.854e-11■□□□□ 10.6
CAPNS1-217ENST00000629983 DDX3XO00571 662 aaKnown RBP eCLIP26.92■■□□□ 1.91e-10■■■■■ 31
CAPNS1-217ENST00000629983 SF3B4Q15427 424 aaKnown RBP eCLIP25.12■■□□□ 1.612e-10■■■■■ 40.3
CAPNS1-217ENST00000629983 UPF1Q92900 1129 aaKnown RBP eCLIP41.88■■■■■ 4.294e-10■■■■□ 22.9
CAPNS1-217ENST00000629983 SF3B1O75533 1304 aaKnown RBP eCLIP30.4■■■□□ 2.469e-10■■■■□ 24.3
CAPNS1-217ENST00000629983 PCBP2Q15366 365 aaKnown RBP eCLIP25.16■■□□□ 1.623e-9■□□□□ 10.3
CAPNS1-217ENST00000629983 PRPF4O43172 522 aaKnown RBP eCLIP26.04■■□□□ 1.765e-9■□□□□ 8.4
CAPNS1-217ENST00000629983 AQRO60306 1485 aaKnown RBP eCLIP50.75■■■■■ 5.718e-9■□□□□ 10.5
CAPNS1-217ENST00000629983 PCBP1Q15365 356 aaKnown RBP eCLIP30.45■■■□□ 2.472e-8■■□□□ 14
CAPNS1-217ENST00000629983 RBM5P52756 815 aaKnown RBP eCLIP34.88■■■■□ 3.172e-8■■■□□ 16.5
CAPNS1-217ENST00000629983 PABPC4Q13310 644 aaKnown RBP eCLIP33.85■■■■□ 3.013e-8■■□□□ 13.7
CAPNS1-217ENST00000629983 EFTUD2Q15029 972 aaKnown RBP eCLIP25.26■■□□□ 1.634e-8■■■■■ 41.9
CAPNS1-217ENST00000629983 G3BP1Q13283 466 aaKnown RBP eCLIP33.66■■■□□ 2.988e-8■■■■□ 23.7
CAPNS1-217ENST00000629983 SF3A3Q12874 501 aaKnown RBP eCLIP22.42■■□□□ 1.189e-8■■■■■ 39.8
CAPNS1-217ENST00000629983 RBM15Q96T37 977 aaKnown RBP eCLIP27.59■■■□□ 2.011e-7■■■□□ 16.1
CAPNS1-217ENST00000629983 FTOQ9C0B1 505 aaKnown RBP eCLIP32.32■■■□□ 2.761e-7■■■□□ 14.8
CAPNS1-217ENST00000629983 PPIGQ13427 754 aaKnown RBP eCLIP32.79■■■□□ 2.842e-7■□□□□ 8.5
CAPNS1-217ENST00000629983 YBX3P16989 372 aaKnown RBP eCLIP38.38■■■■□ 3.734e-7■■■□□ 18.5
CAPNS1-217ENST00000629983 PRPF8Q6P2Q9 2335 aaKnown RBP eCLIP24.09■■□□□ 1.455e-7■■■□□ 17.3
CAPNS1-217ENST00000629983 LARP4Q71RC2 724 aaKnown RBP eCLIP24.68■■□□□ 1.545e-7■■■□□ 15.7
CAPNS1-217ENST00000629983 IGF2BP3O00425 579 aaKnown RBP eCLIP34.88■■■■□ 3.175e-7■■■■□ 22.6
CAPNS1-217ENST00000629983 SND1Q7KZF4 910 aaKnown RBP eCLIP28.37■■■□□ 2.137e-7■■□□□ 11.5
CAPNS1-217ENST00000629983 RPS3P23396 243 aaKnown RBP eCLIP25.86■■□□□ 1.738e-7■■■■□ 23
CAPNS1-217ENST00000629983 DDX24Q9GZR7 859 aaKnown RBP eCLIP32.94■■■□□ 2.862e-6■■□□□ 12.4
CAPNS1-217ENST00000629983 SUB1P53999 127 aaKnown RBP eCLIP19.62■□□□□ 0.732e-6■■■□□ 18.2
CAPNS1-217ENST00000629983 BUD13Q9BRD0 619 aaKnown RBP eCLIP32.8■■■□□ 2.844e-6■□□□□ 9.2
CAPNS1-217ENST00000629983 FXR2P51116 673 aaKnown RBP eCLIP29.85■■■□□ 2.375e-6■■□□□ 12.9
CAPNS1-217ENST00000629983 SERBP1Q8NC51 408 aaKnown RBP eCLIP25.42■■□□□ 1.666e-6■■■■■ 47.7
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