RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000603546.1

GNAS-256, Transcript of GNAS complex locus, human

TSL 5

Gene GNAS, Length 573 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytoplasm, Cytosol, Nucleus, Ribosome .

Download Table

RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	p-Value	Fold Change
GNAS-256	ENST00000603546	FAM135A	Q9P2D6	1515 aa		42.77	■■■■■ 4.44
GNAS-256	ENST00000603546	MAST1	Q9Y2H9	1570 aa		42.76	■■■■■ 4.44
GNAS-256	ENST00000603546	ZNF142	P52746	1687 aa	Predicted RBP	42.76	■■■■■ 4.44
GNAS-256	ENST00000603546	KDM5D	Q9BY66	1539 aa		42.74	■■■■■ 4.43
GNAS-256	ENST00000603546	CEP170B	Q9Y4F5	1589 aa	Predicted RBP	42.73	■■■■■ 4.43
GNAS-256	ENST00000603546	NCKAP5L	Q9HCH0	1330 aa		42.72	■■■■■ 4.43
GNAS-256	ENST00000603546	PKD2	Q13563	968 aa		42.71	■■■■■ 4.43
GNAS-256	ENST00000603546	PLA2R1	Q13018	1463 aa		42.7	■■■■■ 4.43
GNAS-256	ENST00000603546	FBXO31	Q5XUX0	539 aa	Predicted RBP	42.7	■■■■■ 4.43
GNAS-256	ENST00000603546	PZP	P20742	1482 aa		42.68	■■■■■ 4.42
GNAS-256	ENST00000603546	A2ML1	A8K2U0	1454 aa		42.66	■■■■■ 4.42
GNAS-256	ENST00000603546	TNR	Q92752	1358 aa		42.65	■■■■■ 4.42
GNAS-256	ENST00000603546	TCOF1	Q13428	1488 aa	Known RBP	42.62	■■■■■ 4.41
GNAS-256	ENST00000603546	LTBP4	Q8N2S1	1624 aa		42.6	■■■■■ 4.41
GNAS-256	ENST00000603546	DNMT1	P26358	1616 aa	Known RBP	42.57	■■■■■ 4.41
GNAS-256	ENST00000603546	RNF17	Q9BXT8	1623 aa	Known RBP	42.57	■■■■■ 4.41
GNAS-256	ENST00000603546	EIF2AK4	Q9P2K8	1649 aa	Known RBP	42.55	■■■■■ 4.4
GNAS-256	ENST00000603546	PTPN23	Q9H3S7	1636 aa		42.53	■■■■■ 4.4
GNAS-256	ENST00000603546	ABCC5	O15440	1437 aa		42.53	■■■■■ 4.4
GNAS-256	ENST00000603546	DUOX2	Q9NRD8	1548 aa		42.51	■■■■■ 4.4
GNAS-256	ENST00000603546	SHANK2	Q9UPX8	1470 aa		42.49	■■■■■ 4.39
GNAS-256	ENST00000603546	FGD6	Q6ZV73	1430 aa		42.48	■■■■■ 4.39
GNAS-256	ENST00000603546	ABCC3	O15438	1527 aa		42.48	■■■■■ 4.39
GNAS-256	ENST00000603546	IQSEC2	Q5JU85	1478 aa		42.47	■■■■■ 4.39
GNAS-256	ENST00000603546	ZNF335	Q9H4Z2	1342 aa	Predicted RBP	42.46	■■■■■ 4.39
GNAS-256	ENST00000603546	KIF15	Q9NS87	1388 aa		42.46	■■■■■ 4.39
GNAS-256	ENST00000603546	NLRP1	Q9C000	1473 aa		42.46	■■■■■ 4.39
GNAS-256	ENST00000603546	ZC3H13	Q5T200	1668 aa	Known RBP	42.45	■■■■■ 4.39
GNAS-256	ENST00000603546	THEMIS	Q8N1K5	641 aa	Predicted RBP	42.45	■■■■■ 4.39
GNAS-256	ENST00000603546	RRP7BP	Q9NSQ0	103 aa		42.44	■■■■■ 4.38
GNAS-256	ENST00000603546	DAPK1	P53355	1430 aa		42.43	■■■■■ 4.38
GNAS-256	ENST00000603546	MROH1	Q8NDA8	1641 aa		42.42	■■■■■ 4.38
GNAS-256	ENST00000603546	CROCC2	H7BZ55	1655 aa		42.41	■■■■■ 4.38
GNAS-256	ENST00000603546	ANKLE2	Q86XL3	938 aa		42.38	■■■■■ 4.37
GNAS-256	ENST00000603546	ERBIN	Q96RT1	1412 aa		42.37	■■■■■ 4.37
GNAS-256	ENST00000603546	DROSHA	Q9NRR4	1374 aa	Known RBP eCLIP	42.36	■■■■■ 4.37	4e-16	■■■□□ 15.6
GNAS-256	ENST00000603546	SPATA31D1	Q6ZQQ2	1576 aa		42.35	■■■■■ 4.37
GNAS-256	ENST00000603546	UGGT1	Q9NYU2	1555 aa		42.35	■■■■■ 4.37
GNAS-256	ENST00000603546	ERVK-7	P63135	1459 aa		42.31	■■■■■ 4.36
GNAS-256	ENST00000603546	POLR1A	O95602	1720 aa	Predicted RBP	42.31	■■■■■ 4.36
GNAS-256	ENST00000603546	ANKRD30A	Q9BXX3	1397 aa		42.3	■■■■■ 4.36
GNAS-256	ENST00000603546	CHIC2	Q9UKJ5	165 aa		42.3	■■■■■ 4.36
GNAS-256	ENST00000603546	CEP152	O94986	1710 aa		42.29	■■■■■ 4.36
GNAS-256	ENST00000603546	NEURL4	Q96JN8	1562 aa		42.29	■■■■■ 4.36
GNAS-256	ENST00000603546	PRDM15	P57071	1507 aa	Predicted RBP	42.26	■■■■■ 4.36
GNAS-256	ENST00000603546	GRWD1	Q9BQ67	446 aa	Known RBP eCLIP	42.25	■■■■■ 4.35	7e-26	■□□□□ 8.2
GNAS-256	ENST00000603546	CFAP65	Q6ZU64	1925 aa	Known RBP	42.24	■■■■■ 4.35
GNAS-256	ENST00000603546	ARHGAP31	Q2M1Z3	1444 aa		42.24	■■■■■ 4.35
GNAS-256	ENST00000603546	MED14	O60244	1454 aa		42.2	■■■■■ 4.35
GNAS-256	ENST00000603546	KANK1	Q14678	1352 aa		42.2	■■■■■ 4.35
GNAS-256	ENST00000603546	DEPDC5	O75140	1603 aa		42.19	■■■■■ 4.34
GNAS-256	ENST00000603546	FAM50A	Q14320	339 aa	Known RBP	42.18	■■■■■ 4.34
GNAS-256	ENST00000603546	NPHP4	O75161	1426 aa	Predicted RBP	42.17	■■■■■ 4.34
GNAS-256	ENST00000603546	UBAP1L	F5GYI3	381 aa		42.16	■■■■■ 4.34
GNAS-256	ENST00000603546	ADGRL2	O95490	1459 aa		42.12	■■■■■ 4.33
GNAS-256	ENST00000603546	CPS1	P31327	1500 aa		42.1	■■■■■ 4.33
GNAS-256	ENST00000603546	UBR1	Q8IWV7	1749 aa		42.06	■■■■■ 4.32
GNAS-256	ENST00000603546	LMTK2	Q8IWU2	1503 aa		42.06	■■■■■ 4.32
GNAS-256	ENST00000603546	VWDE	Q8N2E2	1590 aa		42.05	■■■■■ 4.32
GNAS-256	ENST00000603546	IQGAP1	P46940	1657 aa		42.03	■■■■■ 4.32
GNAS-256	ENST00000603546	ANKRD50	Q9ULJ7	1429 aa		41.97	■■■■■ 4.31
GNAS-256	ENST00000603546	TXNDC2	Q86VQ3	553 aa		41.97	■■■■■ 4.31
GNAS-256	ENST00000603546	LTK	P29376	864 aa		41.96	■■■■■ 4.31
GNAS-256	ENST00000603546	ARHGAP23	Q9P227	1491 aa		41.96	■■■■■ 4.31
GNAS-256	ENST00000603546	SLIT1	O75093	1534 aa		41.95	■■■■■ 4.31
GNAS-256	ENST00000603546	SCAF11	Q99590	1463 aa	Known RBP	41.95	■■■■■ 4.31
GNAS-256	ENST00000603546	TOM1	O60784	492 aa		41.94	■■■■■ 4.3
GNAS-256	ENST00000603546	IDI1	Q13907	227 aa		41.93	■■■■■ 4.3
GNAS-256	ENST00000603546	STAG3	Q9UJ98	1225 aa		41.93	■■■■■ 4.3
GNAS-256	ENST00000603546	EID1	Q9Y6B2	187 aa		41.92	■■■■■ 4.3
GNAS-256	ENST00000603546	DISP3	Q9P2K9	1392 aa		41.9	■■■■■ 4.3
GNAS-256	ENST00000603546	PIK3C2B	O00750	1634 aa		41.9	■■■■■ 4.3
GNAS-256	ENST00000603546	NOS1	P29475	1434 aa		41.87	■■■■■ 4.29
GNAS-256	ENST00000603546	EFCAB6	Q5THR3	1501 aa		41.87	■■■■■ 4.29
GNAS-256	ENST00000603546	TMEM2	Q9UHN6	1383 aa		41.87	■■■■■ 4.29
GNAS-256	ENST00000603546	SLC52A1	Q9NWF4	448 aa		41.83	■■■■■ 4.29
GNAS-256	ENST00000603546	KDM5A	P29375	1690 aa	Known RBP	41.83	■■■■■ 4.29
GNAS-256	ENST00000603546	SYNM	O15061	1565 aa		41.82	■■■■■ 4.29
GNAS-256	ENST00000603546	ROCK1	Q13464	1354 aa		41.8	■■■■■ 4.28
GNAS-256	ENST00000603546	PIP4K2B	P78356	416 aa		41.8	■■■■■ 4.28
GNAS-256	ENST00000603546	STRCP1	A6NGW2	1772 aa		41.8	■■■■■ 4.28
GNAS-256	ENST00000603546	SCAF1	Q9H7N4	1312 aa	Known RBP	41.79	■■■■■ 4.28
GNAS-256	ENST00000603546	RPRD2	Q5VT52	1461 aa	Known RBP	41.79	■■■■■ 4.28
GNAS-256	ENST00000603546	LRRC7	Q96NW7	1537 aa		41.77	■■■■■ 4.28
GNAS-256	ENST00000603546	PPARGC1B	Q86YN6	1023 aa	Known RBP	41.74	■■■■■ 4.27
GNAS-256	ENST00000603546	TET3	O43151	1660 aa		41.71	■■■■■ 4.27
GNAS-256	ENST00000603546	HSPA1L	P34931	641 aa		41.69	■■■■■ 4.26
GNAS-256	ENST00000603546	UNC13B	O14795	1591 aa		41.68	■■■■■ 4.26
GNAS-256	ENST00000603546	ITGAE	P38570	1179 aa		41.67	■■■■■ 4.26
GNAS-256	ENST00000603546	ADGRB3	O60242	1522 aa		41.66	■■■■■ 4.26
GNAS-256	ENST00000603546	ILDR2	Q71H61	639 aa		41.65	■■■■■ 4.26
GNAS-256	ENST00000603546	ALK	Q9UM73	1620 aa		41.64	■■■■■ 4.26
GNAS-256	ENST00000603546	GCC2	Q8IWJ2	1684 aa		41.61	■■■■■ 4.25
GNAS-256	ENST00000603546	SLC26A8	Q96RN1	970 aa		41.57	■■■■■ 4.25
GNAS-256	ENST00000603546	KCNA6	P17658	529 aa		41.56	■■■■■ 4.24
GNAS-256	ENST00000603546	HDGF	P51858	240 aa	Known RBP	41.55	■■■■■ 4.24
GNAS-256	ENST00000603546	NUP155	O75694	1391 aa		41.54	■■■■■ 4.24
GNAS-256	ENST00000603546	IQGAP3	Q86VI3	1631 aa		41.52	■■■■■ 4.24
GNAS-256	ENST00000603546		E9PCH4	1651 aa		41.51	■■■■■ 4.24
GNAS-256	ENST00000603546	BCAN	Q96GW7	911 aa		41.5	■■■■■ 4.23

Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 24.2 ms