RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000603546.1

GNAS-256, Transcript of GNAS complex locus, human

TSL 5

Gene GNAS, Length 573 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytoplasm, Cytosol, Nucleus, Ribosome .

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RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	p-Value	Fold Change
GNAS-256	ENST00000603546	NISCH	Q9Y2I1	1504 aa		67.71	■■■■■ 8.43
GNAS-256	ENST00000603546	CCDC180	Q9P1Z9	1646 aa		60.58	■■■■■ 7.29
GNAS-256	ENST00000603546	ABCC9	O60706	1549 aa		60.32	■■■■■ 7.25
GNAS-256	ENST00000603546	RB1CC1	Q8TDY2	1594 aa		57.57	■■■■■ 6.81
GNAS-256	ENST00000603546	NACAD	O15069	1562 aa		57.27	■■■■■ 6.76
GNAS-256	ENST00000603546	DCAF8L2	P0C7V8	631 aa		57.1	■■■■■ 6.73
GNAS-256	ENST00000603546	MYO15B	Q96JP2	1530 aa		56.61	■■■■■ 6.65
GNAS-256	ENST00000603546	DNAJC5B	Q9UF47	199 aa		56.41	■■■■■ 6.62
GNAS-256	ENST00000603546	PABPN1	Q86U42	306 aa	Known RBP eCLIP	56.27	■■■■■ 6.6
GNAS-256	ENST00000603546	UNC13A	Q9UPW8	1703 aa		56.19	■■■■■ 6.59
GNAS-256	ENST00000603546	ZCCHC6	Q5VYS8	1495 aa	Known RBP	56.15	■■■■■ 6.58
GNAS-256	ENST00000603546	DCAF1	Q9Y4B6	1507 aa		55.97	■■■■■ 6.55
GNAS-256	ENST00000603546	BICRA	Q9NZM4	1560 aa		55.85	■■■■■ 6.53
GNAS-256	ENST00000603546	SCRIB	Q14160	1630 aa		55.19	■■■■■ 6.43
GNAS-256	ENST00000603546	SHROOM4	Q9ULL8	1493 aa		55.18	■■■■■ 6.42
GNAS-256	ENST00000603546	CC2D2A	Q9P2K1	1620 aa		54.5	■■■■■ 6.31
GNAS-256	ENST00000603546	EIF4G1	Q04637	1599 aa	Known RBP	54.46	■■■■■ 6.31
GNAS-256	ENST00000603546	CECR2	Q9BXF3	1484 aa		54.34	■■■■■ 6.29
GNAS-256	ENST00000603546	NCAPD3	P42695	1498 aa		52.9	■■■■■ 6.06
GNAS-256	ENST00000603546	ATAD2B	Q9ULI0	1458 aa		52.75	■■■■■ 6.03
GNAS-256	ENST00000603546	SMARCA4	P51532	1647 aa		52.72	■■■■■ 6.03
GNAS-256	ENST00000603546	SMARCA2	P51531	1590 aa		52.6	■■■■■ 6.01
GNAS-256	ENST00000603546	BAZ1A	Q9NRL2	1556 aa	Predicted RBP	52.54	■■■■■ 6
GNAS-256	ENST00000603546	HMGXB3	Q12766	1538 aa		52.46	■■■■■ 5.99
GNAS-256	ENST00000603546	PEG3	Q9GZU2	1588 aa		52.24	■■■■■ 5.95
GNAS-256	ENST00000603546	BAZ1B	Q9UIG0	1483 aa	Known RBP	52.23	■■■■■ 5.95
GNAS-256	ENST00000603546	MROH2B	Q7Z745	1585 aa		52.16	■■■■■ 5.94
GNAS-256	ENST00000603546	ERCC6	Q03468	1493 aa		52.07	■■■■■ 5.93
GNAS-256	ENST00000603546	CUX2	O14529	1486 aa		51.9	■■■■■ 5.9
GNAS-256	ENST00000603546	NES	P48681	1621 aa		51.89	■■■■■ 5.9
GNAS-256	ENST00000603546	DNAJC5	Q9H3Z4	198 aa		51.63	■■■■■ 5.86
GNAS-256	ENST00000603546	LAMC3	Q9Y6N6	1575 aa		51.61	■■■■■ 5.85
GNAS-256	ENST00000603546	WIZ	O95785	1651 aa		51.52	■■■■■ 5.84
GNAS-256	ENST00000603546	PDS5B	Q9NTI5	1447 aa		51.36	■■■■■ 5.81
GNAS-256	ENST00000603546	CADPS	Q9ULU8	1353 aa		51.32	■■■■■ 5.81
GNAS-256	ENST00000603546	THOC2	Q8NI27	1593 aa	Known RBP	51.27	■■■■■ 5.8
GNAS-256	ENST00000603546	RSF1	Q96T23	1441 aa	Predicted RBP	51.22	■■■■■ 5.79
GNAS-256	ENST00000603546	KIF21A	Q7Z4S6	1674 aa		51.19	■■■■■ 5.79
GNAS-256	ENST00000603546	TOP2A	P11388	1531 aa	Known RBP	50.91	■■■■■ 5.74
GNAS-256	ENST00000603546	MRC2	Q9UBG0	1479 aa		50.84	■■■■■ 5.73
GNAS-256	ENST00000603546	CFTR	P13569	1480 aa		50.77	■■■■■ 5.72
GNAS-256	ENST00000603546	CEP164	Q9UPV0	1460 aa		50.69	■■■■■ 5.7
GNAS-256	ENST00000603546	WDR62	O43379	1518 aa		50.68	■■■■■ 5.7
GNAS-256	ENST00000603546	FANCD2	Q9BXW9	1451 aa		50.68	■■■■■ 5.7
GNAS-256	ENST00000603546	CCDC88B	A6NC98	1476 aa		50.38	■■■■■ 5.66
GNAS-256	ENST00000603546	URB2	Q14146	1524 aa	Known RBP	50.22	■■■■■ 5.63
GNAS-256	ENST00000603546	PRDM2	Q13029	1718 aa		50.17	■■■■■ 5.62
GNAS-256	ENST00000603546	TOPBP1	Q92547	1522 aa		49.75	■■■■■ 5.55
GNAS-256	ENST00000603546	ABCC8	Q09428	1581 aa		49.73	■■■■■ 5.55
GNAS-256	ENST00000603546	IFT140	Q96RY7	1462 aa		49.7	■■■■■ 5.55
GNAS-256	ENST00000603546	OSCAR	Q8IYS5	282 aa		49.68	■■■■■ 5.54
GNAS-256	ENST00000603546	DNMBP	Q6XZF7	1577 aa		49.57	■■■■■ 5.53
GNAS-256	ENST00000603546	ZNF608	Q9ULD9	1512 aa	Predicted RBP	49.55	■■■■■ 5.52
GNAS-256	ENST00000603546	TRIM41	Q8WV44	630 aa		49.41	■■■■■ 5.5
GNAS-256	ENST00000603546	TARBP1	Q13395	1621 aa	Known RBP	49.26	■■■■■ 5.48
GNAS-256	ENST00000603546	POLA1	P09884	1462 aa	Predicted RBP	49.25	■■■■■ 5.48
GNAS-256	ENST00000603546	EIF4G3	O43432	1585 aa	Known RBP	49.24	■■■■■ 5.47
GNAS-256	ENST00000603546	SUPT5H	O00267	1087 aa	Known RBP	49.2	■■■■■ 5.47
GNAS-256	ENST00000603546	AQR	O60306	1485 aa	Known RBP eCLIP	49.18	■■■■■ 5.46	1e-9	■■■□□ 16.6
GNAS-256	ENST00000603546	SOGA1	O94964	1423 aa		49.09	■■■■■ 5.45
GNAS-256	ENST00000603546	RAD54L2	Q9Y4B4	1467 aa		49.07	■■■■■ 5.45
GNAS-256	ENST00000603546	FGD5	Q6ZNL6	1462 aa		48.98	■■■■■ 5.43
GNAS-256	ENST00000603546	CUX1	P39880	1505 aa		48.98	■■■■■ 5.43
GNAS-256	ENST00000603546	TDRD9	Q8NDG6	1382 aa	Known RBP	48.94	■■■■■ 5.43
GNAS-256	ENST00000603546	RIMBP3C	A6NJZ7	1639 aa		48.86	■■■■■ 5.41
GNAS-256	ENST00000603546	RIMBP3B	A6NNM3	1639 aa		48.86	■■■■■ 5.41
GNAS-256	ENST00000603546	RIMBP3	Q9UFD9	1639 aa		48.86	■■■■■ 5.41
GNAS-256	ENST00000603546	FBLN2	P98095	1184 aa		48.83	■■■■■ 5.41
GNAS-256	ENST00000603546	CHD1	O14646	1710 aa		48.82	■■■■■ 5.41
GNAS-256	ENST00000603546	WDR97	A6NE52	1622 aa		48.81	■■■■■ 5.4
GNAS-256	ENST00000603546	ARHGEF11	O15085	1522 aa		48.75	■■■■■ 5.39
GNAS-256	ENST00000603546	SNAPC4	Q5SXM2	1469 aa		48.64	■■■■■ 5.38
GNAS-256	ENST00000603546	GRIN2B	Q13224	1484 aa		48.61	■■■■■ 5.37
GNAS-256	ENST00000603546	MAGI1	Q96QZ7	1491 aa	Predicted RBP	48.57	■■■■■ 5.37
GNAS-256	ENST00000603546	CHMP7	Q8WUX9	453 aa	Predicted RBP	48.55	■■■■■ 5.36
GNAS-256	ENST00000603546	CYB5RL	Q6IPT4	315 aa		48.47	■■■■■ 5.35
GNAS-256	ENST00000603546	GAPVD1	Q14C86	1478 aa		48.47	■■■■■ 5.35
GNAS-256	ENST00000603546	ABCA10	Q8WWZ4	1543 aa		48.47	■■■■■ 5.35
GNAS-256	ENST00000603546	SYNJ2	O15056	1496 aa		48.4	■■■■■ 5.34
GNAS-256	ENST00000603546	WRN	Q14191	1432 aa	Predicted RBP eCLIP	48.36	■■■■■ 5.33	3e-6	■□□□□ 10.3
GNAS-256	ENST00000603546	PBRM1	Q86U86	1689 aa		48.34	■■■■■ 5.33
GNAS-256	ENST00000603546	SYNJ1	O43426	1573 aa		48.33	■■■■■ 5.33
GNAS-256	ENST00000603546	ABCA5	Q8WWZ7	1642 aa		48.31	■■■■■ 5.32
GNAS-256	ENST00000603546	CLASP1	Q7Z460	1538 aa		48.31	■■■■■ 5.32
GNAS-256	ENST00000603546	ARAP1	Q96P48	1450 aa		48.29	■■■■■ 5.32
GNAS-256	ENST00000603546	TOP2B	Q02880	1626 aa		48.28	■■■■■ 5.32
GNAS-256	ENST00000603546	BIVM-ERCC5	R4GMW8	1640 aa		48.25	■■■■■ 5.32
GNAS-256	ENST00000603546	GRIN2A	Q12879	1464 aa		47.96	■■■■■ 5.27
GNAS-256	ENST00000603546	ADAMTS12	P58397	1594 aa		47.92	■■■■■ 5.26
GNAS-256	ENST00000603546	FHAD1	B1AJZ9	1412 aa		47.89	■■■■■ 5.26
GNAS-256	ENST00000603546	ERICH3	Q5RHP9	1530 aa		47.86	■■■■■ 5.25
GNAS-256	ENST00000603546	TRH	P20396	242 aa	Predicted RBP	47.82	■■■■■ 5.25
GNAS-256	ENST00000603546	NUP160	Q12769	1436 aa		47.81	■■■■■ 5.24
GNAS-256	ENST00000603546	CEP170	Q5SW79	1584 aa		47.73	■■■■■ 5.23
GNAS-256	ENST00000603546	ERCC6L2	Q5T890	1561 aa		47.56	■■■■■ 5.2
GNAS-256	ENST00000603546	SHROOM2	Q13796	1616 aa		47.52	■■■■■ 5.2
GNAS-256	ENST00000603546	JPH4	Q96JJ6	628 aa		47.41	■■■■■ 5.18
GNAS-256	ENST00000603546	KIF27	Q86VH2	1401 aa		47.4	■■■■■ 5.18
GNAS-256	ENST00000603546	IGF1R	P08069	1367 aa		47.38	■■■■■ 5.18
GNAS-256	ENST00000603546	PRG4	Q92954	1404 aa	Predicted RBP	47.33	■■■■■ 5.17

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