RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000603546.1

GNAS-256, Transcript of GNAS complex locus, humanhuman

TSL 5

Gene GNAS, Length 573 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytoplasm, Cytosol, Nucleus, Ribosome .

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GNAS-256ENST00000603546 NISCHQ9Y2I1 1504 aa67.71■■■■■ 8.43
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GNAS-256ENST00000603546 RB1CC1Q8TDY2 1594 aa57.57■■■■■ 6.81
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GNAS-256ENST00000603546 DCAF8L2P0C7V8 631 aa57.1■■■■■ 6.73
GNAS-256ENST00000603546 MYO15BQ96JP2 1530 aa56.61■■■■■ 6.65
GNAS-256ENST00000603546 DNAJC5BQ9UF47 199 aa56.41■■■■■ 6.62
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GNAS-256ENST00000603546 ZCCHC6Q5VYS8 1495 aaKnown RBP56.15■■■■■ 6.58
GNAS-256ENST00000603546 DCAF1Q9Y4B6 1507 aa55.97■■■■■ 6.55
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GNAS-256ENST00000603546 SHROOM4Q9ULL8 1493 aa55.18■■■■■ 6.42
GNAS-256ENST00000603546 CC2D2AQ9P2K1 1620 aa54.5■■■■■ 6.31
GNAS-256ENST00000603546 EIF4G1Q04637 1599 aaKnown RBP54.46■■■■■ 6.31
GNAS-256ENST00000603546 CECR2Q9BXF3 1484 aa54.34■■■■■ 6.29
GNAS-256ENST00000603546 NCAPD3P42695 1498 aa52.9■■■■■ 6.06
GNAS-256ENST00000603546 ATAD2BQ9ULI0 1458 aa52.75■■■■■ 6.03
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GNAS-256ENST00000603546 SMARCA2P51531 1590 aa52.6■■■■■ 6.01
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GNAS-256ENST00000603546 MROH2BQ7Z745 1585 aa52.16■■■■■ 5.94
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GNAS-256ENST00000603546 NESP48681 1621 aa51.89■■■■■ 5.9
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GNAS-256ENST00000603546 PDS5BQ9NTI5 1447 aa51.36■■■■■ 5.81
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GNAS-256ENST00000603546 CEP164Q9UPV0 1460 aa50.69■■■■■ 5.7
GNAS-256ENST00000603546 WDR62O43379 1518 aa50.68■■■■■ 5.7
GNAS-256ENST00000603546 FANCD2Q9BXW9 1451 aa50.68■■■■■ 5.7
GNAS-256ENST00000603546 CCDC88BA6NC98 1476 aa50.38■■■■■ 5.66
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GNAS-256ENST00000603546 TOPBP1Q92547 1522 aa49.75■■■■■ 5.55
GNAS-256ENST00000603546 ABCC8Q09428 1581 aa49.73■■■■■ 5.55
GNAS-256ENST00000603546 IFT140Q96RY7 1462 aa49.7■■■■■ 5.55
GNAS-256ENST00000603546 OSCARQ8IYS5 282 aa49.68■■■■■ 5.54
GNAS-256ENST00000603546 DNMBPQ6XZF7 1577 aa49.57■■■■■ 5.53
GNAS-256ENST00000603546 ZNF608Q9ULD9 1512 aaPredicted RBP49.55■■■■■ 5.52
GNAS-256ENST00000603546 TRIM41Q8WV44 630 aa49.41■■■■■ 5.5
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GNAS-256ENST00000603546 POLA1P09884 1462 aaPredicted RBP49.25■■■■■ 5.48
GNAS-256ENST00000603546 EIF4G3O43432 1585 aaKnown RBP49.24■■■■■ 5.47
GNAS-256ENST00000603546 SUPT5HO00267 1087 aaKnown RBP49.2■■■■■ 5.47
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GNAS-256ENST00000603546 RAD54L2Q9Y4B4 1467 aa49.07■■■■■ 5.45
GNAS-256ENST00000603546 FGD5Q6ZNL6 1462 aa48.98■■■■■ 5.43
GNAS-256ENST00000603546 CUX1P39880 1505 aa48.98■■■■■ 5.43
GNAS-256ENST00000603546 TDRD9Q8NDG6 1382 aaKnown RBP48.94■■■■■ 5.43
GNAS-256ENST00000603546 RIMBP3CA6NJZ7 1639 aa48.86■■■■■ 5.41
GNAS-256ENST00000603546 RIMBP3BA6NNM3 1639 aa48.86■■■■■ 5.41
GNAS-256ENST00000603546 RIMBP3Q9UFD9 1639 aa48.86■■■■■ 5.41
GNAS-256ENST00000603546 FBLN2P98095 1184 aa48.83■■■■■ 5.41
GNAS-256ENST00000603546 CHD1O14646 1710 aa48.82■■■■■ 5.41
GNAS-256ENST00000603546 WDR97A6NE52 1622 aa48.81■■■■■ 5.4
GNAS-256ENST00000603546 ARHGEF11O15085 1522 aa48.75■■■■■ 5.39
GNAS-256ENST00000603546 SNAPC4Q5SXM2 1469 aa48.64■■■■■ 5.38
GNAS-256ENST00000603546 GRIN2BQ13224 1484 aa48.61■■■■■ 5.37
GNAS-256ENST00000603546 MAGI1Q96QZ7 1491 aaPredicted RBP48.57■■■■■ 5.37
GNAS-256ENST00000603546 CHMP7Q8WUX9 453 aaPredicted RBP48.55■■■■■ 5.36
GNAS-256ENST00000603546 CYB5RLQ6IPT4 315 aa48.47■■■■■ 5.35
GNAS-256ENST00000603546 GAPVD1Q14C86 1478 aa48.47■■■■■ 5.35
GNAS-256ENST00000603546 ABCA10Q8WWZ4 1543 aa48.47■■■■■ 5.35
GNAS-256ENST00000603546 SYNJ2O15056 1496 aa48.4■■■■■ 5.34
GNAS-256ENST00000603546 WRNQ14191 1432 aaPredicted RBP eCLIP48.36■■■■■ 5.333e-6■□□□□ 10.3
GNAS-256ENST00000603546 PBRM1Q86U86 1689 aa48.34■■■■■ 5.33
GNAS-256ENST00000603546 SYNJ1O43426 1573 aa48.33■■■■■ 5.33
GNAS-256ENST00000603546 ABCA5Q8WWZ7 1642 aa48.31■■■■■ 5.32
GNAS-256ENST00000603546 CLASP1Q7Z460 1538 aa48.31■■■■■ 5.32
GNAS-256ENST00000603546 ARAP1Q96P48 1450 aa48.29■■■■■ 5.32
GNAS-256ENST00000603546 TOP2BQ02880 1626 aa48.28■■■■■ 5.32
GNAS-256ENST00000603546 BIVM-ERCC5R4GMW8 1640 aa48.25■■■■■ 5.32
GNAS-256ENST00000603546 GRIN2AQ12879 1464 aa47.96■■■■■ 5.27
GNAS-256ENST00000603546 ADAMTS12P58397 1594 aa47.92■■■■■ 5.26
GNAS-256ENST00000603546 FHAD1B1AJZ9 1412 aa47.89■■■■■ 5.26
GNAS-256ENST00000603546 ERICH3Q5RHP9 1530 aa47.86■■■■■ 5.25
GNAS-256ENST00000603546 TRHP20396 242 aaPredicted RBP47.82■■■■■ 5.25
GNAS-256ENST00000603546 NUP160Q12769 1436 aa47.81■■■■■ 5.24
GNAS-256ENST00000603546 CEP170Q5SW79 1584 aa47.73■■■■■ 5.23
GNAS-256ENST00000603546 ERCC6L2Q5T890 1561 aa47.56■■■■■ 5.2
GNAS-256ENST00000603546 SHROOM2Q13796 1616 aa47.52■■■■■ 5.2
GNAS-256ENST00000603546 JPH4Q96JJ6 628 aa47.41■■■■■ 5.18
GNAS-256ENST00000603546 KIF27Q86VH2 1401 aa47.4■■■■■ 5.18
GNAS-256ENST00000603546 IGF1RP08069 1367 aa47.38■■■■■ 5.18
GNAS-256ENST00000603546 PRG4Q92954 1404 aaPredicted RBP47.33■■■■■ 5.17
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