RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000592965.2

MBD3-211, Transcript of methyl-CpG binding domain protein 3, humanhuman

TSL 4

Gene MBD3, Length 568 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Ribosome .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
MBD3-211ENST00000592965 PTPRTO14522 1441 aa36.57■■■■□ 3.44
MBD3-211ENST00000592965 CEP170BQ9Y4F5 1589 aaPredicted RBP36.54■■■■□ 3.44
MBD3-211ENST00000592965 CAMSAP1Q5T5Y3 1602 aa36.54■■■■□ 3.44
MBD3-211ENST00000592965 RNF17Q9BXT8 1623 aaKnown RBP36.53■■■■□ 3.44
MBD3-211ENST00000592965 PTPN23Q9H3S7 1636 aa36.52■■■■□ 3.44
MBD3-211ENST00000592965 EIF2AK4Q9P2K8 1649 aaKnown RBP36.52■■■■□ 3.44
MBD3-211ENST00000592965 CROCC2H7BZ55 1655 aa36.5■■■■□ 3.43
MBD3-211ENST00000592965 CERKQ8TCT0 537 aa36.49■■■■□ 3.43
MBD3-211ENST00000592965 PZPP20742 1482 aa36.49■■■■□ 3.43
MBD3-211ENST00000592965 SHANK2Q9UPX8 1470 aa36.47■■■■□ 3.43
MBD3-211ENST00000592965 PLA2R1Q13018 1463 aa36.45■■■■□ 3.43
MBD3-211ENST00000592965 FGD6Q6ZV73 1430 aa36.44■■■■□ 3.42
MBD3-211ENST00000592965 WASHC2CQ9Y4E1 1318 aa36.44■■■■□ 3.42
MBD3-211ENST00000592965 ZC3H13Q5T200 1668 aaKnown RBP36.43■■■■□ 3.42
MBD3-211ENST00000592965 A2ML1A8K2U0 1454 aa36.43■■■■□ 3.42
MBD3-211ENST00000592965 TCOF1Q13428 1488 aaKnown RBP36.43■■■■□ 3.42
MBD3-211ENST00000592965 DUOX2Q9NRD8 1548 aa36.42■■■■□ 3.42
MBD3-211ENST00000592965 ABCC5O15440 1437 aa36.42■■■■□ 3.42
MBD3-211ENST00000592965 DNMT1P26358 1616 aaKnown RBP36.41■■■■□ 3.42
MBD3-211ENST00000592965 TNRQ92752 1358 aa36.39■■■■□ 3.42
MBD3-211ENST00000592965 ABCC3O15438 1527 aa36.39■■■■□ 3.42
MBD3-211ENST00000592965 MROH1Q8NDA8 1641 aa36.38■■■■□ 3.41
MBD3-211ENST00000592965 DAPK1P53355 1430 aa36.35■■■■□ 3.41
MBD3-211ENST00000592965 FBXO31Q5XUX0 539 aaPredicted RBP36.35■■■■□ 3.41
MBD3-211ENST00000592965 KIF15Q9NS87 1388 aa36.33■■■■□ 3.41
MBD3-211ENST00000592965 PKD2Q13563 968 aa36.32■■■■□ 3.4
MBD3-211ENST00000592965 LTBP4Q8N2S1 1624 aa36.31■■■■□ 3.4
MBD3-211ENST00000592965 NCKAP5LQ9HCH0 1330 aa36.31■■■■□ 3.4
MBD3-211ENST00000592965 ERBINQ96RT1 1412 aa36.3■■■■□ 3.4
MBD3-211ENST00000592965 NLRP1Q9C000 1473 aa36.28■■■■□ 3.4
MBD3-211ENST00000592965 CEP152O94986 1710 aa36.28■■■■□ 3.4
MBD3-211ENST00000592965 PRDM15P57071 1507 aaPredicted RBP36.27■■■■□ 3.4
MBD3-211ENST00000592965 SPATA31D1Q6ZQQ2 1576 aa36.24■■■■□ 3.39
MBD3-211ENST00000592965 POLR1AO95602 1720 aaPredicted RBP36.23■■■■□ 3.39
MBD3-211ENST00000592965 DEPDC5O75140 1603 aa36.22■■■■□ 3.39
MBD3-211ENST00000592965 RRP7BPQ9NSQ0 103 aa36.21■■■■□ 3.39
MBD3-211ENST00000592965 ERVK-7P63135 1459 aa36.19■■■■□ 3.38
MBD3-211ENST00000592965 IQSEC2Q5JU85 1478 aa36.18■■■■□ 3.38
MBD3-211ENST00000592965 ANKRD30AQ9BXX3 1397 aa36.18■■■■□ 3.38
MBD3-211ENST00000592965 UGGT1Q9NYU2 1555 aa36.16■■■■□ 3.38
MBD3-211ENST00000592965 NEURL4Q96JN8 1562 aa36.15■■■■□ 3.38
MBD3-211ENST00000592965 ADGRL2O95490 1459 aa36.14■■■■□ 3.38
MBD3-211ENST00000592965 CFAP65Q6ZU64 1925 aaKnown RBP36.13■■■■□ 3.37
MBD3-211ENST00000592965 ARHGAP31Q2M1Z3 1444 aa36.12■■■■□ 3.37
MBD3-211ENST00000592965 THEMISQ8N1K5 641 aaPredicted RBP36.1■■■■□ 3.37
MBD3-211ENST00000592965 CHIC2Q9UKJ5 165 aa36.1■■■■□ 3.37
MBD3-211ENST00000592965 ZNF335Q9H4Z2 1342 aaPredicted RBP36.09■■■■□ 3.37
MBD3-211ENST00000592965 DROSHAQ9NRR4 1374 aaKnown RBP eCLIP36.08■■■■□ 3.373e-7■□□□□ 9.3
MBD3-211ENST00000592965 VWDEQ8N2E2 1590 aa36.06■■■■□ 3.36
MBD3-211ENST00000592965 FAM50AQ14320 339 aaKnown RBP36.05■■■■□ 3.36
MBD3-211ENST00000592965 KANK1Q14678 1352 aa36.04■■■■□ 3.36
MBD3-211ENST00000592965 LMTK2Q8IWU2 1503 aa36.03■■■■□ 3.36
MBD3-211ENST00000592965 ANKLE2Q86XL3 938 aa36.03■■■■□ 3.36
MBD3-211ENST00000592965 MED14O60244 1454 aa36.02■■■■□ 3.36
MBD3-211ENST00000592965 UBR1Q8IWV7 1749 aa36.02■■■■□ 3.36
MBD3-211ENST00000592965 GRWD1Q9BQ67 446 aaKnown RBP eCLIP36.01■■■■□ 3.36
MBD3-211ENST00000592965 IQGAP1P46940 1657 aa35.95■■■■□ 3.35
MBD3-211ENST00000592965 NPHP4O75161 1426 aaPredicted RBP35.95■■■■□ 3.35
MBD3-211ENST00000592965 ANKRD50Q9ULJ7 1429 aa35.93■■■■□ 3.34
MBD3-211ENST00000592965 EFCAB6Q5THR3 1501 aa35.93■■■■□ 3.34
MBD3-211ENST00000592965 CPS1P31327 1500 aa35.91■■■■□ 3.34
MBD3-211ENST00000592965 PIK3C2BO00750 1634 aa35.88■■■■□ 3.33
MBD3-211ENST00000592965 SLIT1O75093 1534 aa35.88■■■■□ 3.33
MBD3-211ENST00000592965 ARHGAP23Q9P227 1491 aa35.87■■■■□ 3.33
MBD3-211ENST00000592965 KDM5AP29375 1690 aaKnown RBP35.86■■■■□ 3.33
MBD3-211ENST00000592965 SCAF11Q99590 1463 aaKnown RBP35.84■■■■□ 3.33
MBD3-211ENST00000592965 ROCK1Q13464 1354 aa35.83■■■■□ 3.33
MBD3-211ENST00000592965 SYNMO15061 1565 aa35.83■■■■□ 3.33
MBD3-211ENST00000592965 NOS1P29475 1434 aa35.82■■■■□ 3.32
MBD3-211ENST00000592965 UNC13BO14795 1591 aa35.81■■■■□ 3.32
MBD3-211ENST00000592965 TET3O43151 1660 aa35.79■■■■□ 3.32
MBD3-211ENST00000592965 RPRD2Q5VT52 1461 aaKnown RBP35.79■■■■□ 3.32
MBD3-211ENST00000592965 UBAP1LF5GYI3 381 aa35.77■■■■□ 3.32
MBD3-211ENST00000592965 GCC2Q8IWJ2 1684 aa35.75■■■■□ 3.31
MBD3-211ENST00000592965 TMEM2Q9UHN6 1383 aa35.74■■■■□ 3.31
MBD3-211ENST00000592965 STRCP1A6NGW2 1772 aa35.73■■■■□ 3.31
MBD3-211ENST00000592965 LTKP29376 864 aa35.72■■■■□ 3.31
MBD3-211ENST00000592965 IDI1Q13907 227 aa35.71■■■■□ 3.31
MBD3-211ENST00000592965 TXNDC2Q86VQ3 553 aa35.71■■■■□ 3.31
MBD3-211ENST00000592965 ADGRB3O60242 1522 aa35.71■■■■□ 3.31
MBD3-211ENST00000592965 PPARGC1BQ86YN6 1023 aaKnown RBP35.7■■■■□ 3.31
MBD3-211ENST00000592965 STAG3Q9UJ98 1225 aa35.68■■■■□ 3.3
MBD3-211ENST00000592965 EID1Q9Y6B2 187 aa35.68■■■■□ 3.3
MBD3-211ENST00000592965 SLC52A1Q9NWF4 448 aa35.67■■■■□ 3.3
MBD3-211ENST00000592965 IQGAP3Q86VI3 1631 aa35.66■■■■□ 3.3
MBD3-211ENST00000592965 E9PCH4 1651 aa35.62■■■■□ 3.29
MBD3-211ENST00000592965 LRRC7Q96NW7 1537 aa35.61■■■■□ 3.29
MBD3-211ENST00000592965 ITGAEP38570 1179 aa35.6■■■■□ 3.29
MBD3-211ENST00000592965 RRBP1Q9P2E9 1410 aaKnown RBP35.59■■■■□ 3.29
MBD3-211ENST00000592965 TOM1O60784 492 aa35.57■■■■□ 3.28
MBD3-211ENST00000592965 MYO5BQ9ULV0 1848 aa35.57■■■■□ 3.28
MBD3-211ENST00000592965 ALKQ9UM73 1620 aa35.54■■■■□ 3.28
MBD3-211ENST00000592965 TMEM131LA2VDJ0 1609 aa35.53■■■■□ 3.28
MBD3-211ENST00000592965 NUP155O75694 1391 aa35.51■■■■□ 3.28
MBD3-211ENST00000592965 ZFYVE9O95405 1425 aa35.49■■■■□ 3.27
MBD3-211ENST00000592965 DISP3Q9P2K9 1392 aa35.47■■■■□ 3.27
MBD3-211ENST00000592965 XIRP1Q702N8 1843 aaKnown RBP35.46■■■■□ 3.27
MBD3-211ENST00000592965 PIP4K2BP78356 416 aa35.46■■■■□ 3.27
MBD3-211ENST00000592965 SCAF1Q9H7N4 1312 aaKnown RBP35.46■■■■□ 3.27
MBD3-211ENST00000592965 RIMS2Q9UQ26 1411 aa35.41■■■■□ 3.26
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