RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000592863.2

POLRMT-208, Transcript of RNA polymerase mitochondrial, humanhuman

TSL 5

Gene POLRMT, Length 966 nt, Biotype nonsense mediated decay, Subcellular localisation Endoplasmic reticulum, Nucleus .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
POLRMT-208ENST00000592863 VPS8Q8N3P4 1428 aa31.66■■■□□ 2.66
POLRMT-208ENST00000592863 RSPH4AQ5TD94 716 aa31.65■■■□□ 2.66
POLRMT-208ENST00000592863 ZNF335Q9H4Z2 1342 aaPredicted RBP31.65■■■□□ 2.66
POLRMT-208ENST00000592863 PZPP20742 1482 aa31.63■■■□□ 2.65
POLRMT-208ENST00000592863 LRRC9Q6ZRR7 1453 aa31.63■■■□□ 2.65
POLRMT-208ENST00000592863 POLR1AO95602 1720 aaPredicted RBP31.63■■■□□ 2.65
POLRMT-208ENST00000592863 DISP3Q9P2K9 1392 aa31.62■■■□□ 2.65
POLRMT-208ENST00000592863 TNRQ92752 1358 aa31.61■■■□□ 2.65
POLRMT-208ENST00000592863 SPATA31D1Q6ZQQ2 1576 aa31.58■■■□□ 2.65
POLRMT-208ENST00000592863 WASHC2CQ9Y4E1 1318 aa31.57■■■□□ 2.64
POLRMT-208ENST00000592863 TSPY4P0CV99 314 aa31.56■■■□□ 2.64
POLRMT-208ENST00000592863 TSPY10P0CW01 314 aa31.56■■■□□ 2.64
POLRMT-208ENST00000592863 FBXO31Q5XUX0 539 aaPredicted RBP31.55■■■□□ 2.64
POLRMT-208ENST00000592863 MAST1Q9Y2H9 1570 aa31.54■■■□□ 2.64
POLRMT-208ENST00000592863 RNF17Q9BXT8 1623 aaKnown RBP31.53■■■□□ 2.64
POLRMT-208ENST00000592863 NEURL4Q96JN8 1562 aa31.52■■■□□ 2.64
POLRMT-208ENST00000592863 ZC3H13Q5T200 1668 aaKnown RBP31.51■■■□□ 2.63
POLRMT-208ENST00000592863 LOC105371045A0A1W2PR82 267 aa31.5■■■□□ 2.63
POLRMT-208ENST00000592863 UBAP1LF5GYI3 381 aa31.49■■■□□ 2.63
POLRMT-208ENST00000592863 EIF2AK4Q9P2K8 1649 aaKnown RBP31.49■■■□□ 2.63
POLRMT-208ENST00000592863 MAP3K1Q13233 1512 aa31.49■■■□□ 2.63
POLRMT-208ENST00000592863 NLRP1Q9C000 1473 aa31.47■■■□□ 2.63
POLRMT-208ENST00000592863 MYOM3Q5VTT5 1437 aa31.46■■■□□ 2.63
POLRMT-208ENST00000592863 ABCC3O15438 1527 aa31.45■■■□□ 2.63
POLRMT-208ENST00000592863 MIA2Q96PC5 1412 aa31.45■■■□□ 2.63
POLRMT-208ENST00000592863 UGGT1Q9NYU2 1555 aa31.45■■■□□ 2.63
POLRMT-208ENST00000592863 KANK4Q5T7N3 995 aaPredicted RBP31.43■■■□□ 2.62
POLRMT-208ENST00000592863 DROSHAQ9NRR4 1374 aaKnown RBP eCLIP31.42■■■□□ 2.62
POLRMT-208ENST00000592863 CPS1P31327 1500 aa31.4■■■□□ 2.62
POLRMT-208ENST00000592863 CEP152O94986 1710 aa31.4■■■□□ 2.62
POLRMT-208ENST00000592863 MROH1Q8NDA8 1641 aa31.39■■■□□ 2.62
POLRMT-208ENST00000592863 ILDR2Q71H61 639 aa31.39■■■□□ 2.62
POLRMT-208ENST00000592863 THEMISQ8N1K5 641 aaPredicted RBP31.38■■■□□ 2.61
POLRMT-208ENST00000592863 DEPDC5O75140 1603 aa31.38■■■□□ 2.61
POLRMT-208ENST00000592863 ANKLE2Q86XL3 938 aa31.37■■■□□ 2.61
POLRMT-208ENST00000592863 CROCC2H7BZ55 1655 aa31.37■■■□□ 2.61
POLRMT-208ENST00000592863 SHANK2Q9UPX8 1470 aa31.36■■■□□ 2.61
POLRMT-208ENST00000592863 DUOX2Q9NRD8 1548 aa31.35■■■□□ 2.61
POLRMT-208ENST00000592863 ERVK-7P63135 1459 aa31.34■■■□□ 2.61
POLRMT-208ENST00000592863 IQGAP1P46940 1657 aa31.34■■■□□ 2.61
POLRMT-208ENST00000592863 NPHP4O75161 1426 aaPredicted RBP31.33■■■□□ 2.61
POLRMT-208ENST00000592863 VWDEQ8N2E2 1590 aa31.32■■■□□ 2.6
POLRMT-208ENST00000592863 CFAP65Q6ZU64 1925 aaKnown RBP31.31■■■□□ 2.6
POLRMT-208ENST00000592863 MED14O60244 1454 aa31.3■■■□□ 2.6
POLRMT-208ENST00000592863 PTPN23Q9H3S7 1636 aa31.3■■■□□ 2.6
POLRMT-208ENST00000592863 SCAF1Q9H7N4 1312 aaKnown RBP31.29■■■□□ 2.6
POLRMT-208ENST00000592863 PRDM15P57071 1507 aaPredicted RBP31.27■■■□□ 2.6
POLRMT-208ENST00000592863 KIF15Q9NS87 1388 aa31.27■■■□□ 2.6
POLRMT-208ENST00000592863 UBR1Q8IWV7 1749 aa31.25■■■□□ 2.59
POLRMT-208ENST00000592863 SOCS7O14512 581 aa31.24■■■□□ 2.59
POLRMT-208ENST00000592863 APLP2Q06481 763 aa31.24■■■□□ 2.59
POLRMT-208ENST00000592863 ERBINQ96RT1 1412 aa31.24■■■□□ 2.59
POLRMT-208ENST00000592863 PIP4K2BP78356 416 aa31.23■■■□□ 2.59
POLRMT-208ENST00000592863 TOM1O60784 492 aa31.22■■■□□ 2.59
POLRMT-208ENST00000592863 ABCC5O15440 1437 aa31.22■■■□□ 2.59
POLRMT-208ENST00000592863 DAPK1P53355 1430 aa31.18■■■□□ 2.58
POLRMT-208ENST00000592863 SYNMO15061 1565 aa31.17■■■□□ 2.58
POLRMT-208ENST00000592863 STRCP1A6NGW2 1772 aa31.17■■■□□ 2.58
POLRMT-208ENST00000592863 RRP7BPQ9NSQ0 103 aa31.16■■■□□ 2.58
POLRMT-208ENST00000592863 FGD6Q6ZV73 1430 aa31.15■■■□□ 2.58
POLRMT-208ENST00000592863 ARHGAP31Q2M1Z3 1444 aa31.15■■■□□ 2.58
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POLRMT-208ENST00000592863 HSPA1LP34931 641 aa31.14■■■□□ 2.58
POLRMT-208ENST00000592863 GRWD1Q9BQ67 446 aaKnown RBP eCLIP31.11■■■□□ 2.57
POLRMT-208ENST00000592863 KANK1Q14678 1352 aa31.1■■■□□ 2.57
POLRMT-208ENST00000592863 PIK3C2BO00750 1634 aa31.09■■■□□ 2.57
POLRMT-208ENST00000592863 ALKQ9UM73 1620 aa31.09■■■□□ 2.57
POLRMT-208ENST00000592863 MED1Q15648 1581 aaPredicted RBP31.09■■■□□ 2.57
POLRMT-208ENST00000592863 SLIT1O75093 1534 aa31.09■■■□□ 2.57
POLRMT-208ENST00000592863 LRRC7Q96NW7 1537 aa31.08■■■□□ 2.57
POLRMT-208ENST00000592863 ARHGAP23Q9P227 1491 aa31.08■■■□□ 2.57
POLRMT-208ENST00000592863 ANKRD30AQ9BXX3 1397 aa31.06■■■□□ 2.56
POLRMT-208ENST00000592863 CHIC2Q9UKJ5 165 aa31.03■■■□□ 2.56
POLRMT-208ENST00000592863 TXNDC2Q86VQ3 553 aa31.01■■■□□ 2.55
POLRMT-208ENST00000592863 LMTK2Q8IWU2 1503 aa31.01■■■□□ 2.55
POLRMT-208ENST00000592863 LTKP29376 864 aa31■■■□□ 2.55
POLRMT-208ENST00000592863 KDM5AP29375 1690 aaKnown RBP31■■■□□ 2.55
POLRMT-208ENST00000592863 EID1Q9Y6B2 187 aa30.99■■■□□ 2.55
POLRMT-208ENST00000592863 STAG3Q9UJ98 1225 aa30.98■■■□□ 2.55
POLRMT-208ENST00000592863 EFCAB6Q5THR3 1501 aa30.98■■■□□ 2.55
POLRMT-208ENST00000592863 TMEM2Q9UHN6 1383 aa30.95■■■□□ 2.55
POLRMT-208ENST00000592863 ADGRL2O95490 1459 aa30.94■■■□□ 2.54
POLRMT-208ENST00000592863 XIRP1Q702N8 1843 aaKnown RBP30.94■■■□□ 2.54
POLRMT-208ENST00000592863 SENP3Q9H4L4 574 aaPredicted RBP30.93■■■□□ 2.54
POLRMT-208ENST00000592863 ADGRB3O60242 1522 aa30.9■■■□□ 2.54
POLRMT-208ENST00000592863 FAM50AQ14320 339 aaKnown RBP30.89■■■□□ 2.54
POLRMT-208ENST00000592863 IDI1Q13907 227 aa30.86■■■□□ 2.53
POLRMT-208ENST00000592863 NOS1P29475 1434 aa30.86■■■□□ 2.53
POLRMT-208ENST00000592863 PHF23Q9BUL5 403 aaPredicted RBP30.85■■■□□ 2.53
POLRMT-208ENST00000592863 ANKRD50Q9ULJ7 1429 aa30.83■■■□□ 2.53
POLRMT-208ENST00000592863 TET3O43151 1660 aa30.81■■■□□ 2.52
POLRMT-208ENST00000592863 RPRD2Q5VT52 1461 aaKnown RBP30.81■■■□□ 2.52
POLRMT-208ENST00000592863 GCC2Q8IWJ2 1684 aa30.78■■■□□ 2.52
POLRMT-208ENST00000592863 MYO5BQ9ULV0 1848 aa30.77■■■□□ 2.52
POLRMT-208ENST00000592863 SLC26A8Q96RN1 970 aa30.76■■■□□ 2.51
POLRMT-208ENST00000592863 SLC52A1Q9NWF4 448 aa30.76■■■□□ 2.51
POLRMT-208ENST00000592863 TMEM94Q12767 1356 aa30.76■■■□□ 2.51
POLRMT-208ENST00000592863 UNC13BO14795 1591 aa30.75■■■□□ 2.51
POLRMT-208ENST00000592863 NWD1Q149M9 1564 aa30.74■■■□□ 2.51
POLRMT-208ENST00000592863 NKTRP30414 1462 aaKnown RBP30.72■■■□□ 2.51
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