RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000587429.1

PKN1-210, Transcript of protein kinase N1, human

TSL 4

Gene PKN1, Length 562 nt, Biotype processed transcript, Subcellular localisation Ribosome .

RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	p-Value	Fold Change
PKN1-210	ENST00000587429	FBXO41	Q8TF61	875 aa		33.69	■■■□□ 2.98
PKN1-210	ENST00000587429	MYO3A	Q8NEV4	1616 aa		33.68	■■■□□ 2.98
PKN1-210	ENST00000587429	TCOF1	Q13428	1488 aa	Known RBP	33.67	■■■□□ 2.98
PKN1-210	ENST00000587429	CROCC2	H7BZ55	1655 aa		33.66	■■■□□ 2.98
PKN1-210	ENST00000587429	NCOA1	Q15788	1441 aa		33.66	■■■□□ 2.98
PKN1-210	ENST00000587429	CAMSAP1	Q5T5Y3	1602 aa		33.65	■■■□□ 2.98
PKN1-210	ENST00000587429	DAPK1	P53355	1430 aa		33.64	■■■□□ 2.98
PKN1-210	ENST00000587429	RNF17	Q9BXT8	1623 aa	Known RBP	33.64	■■■□□ 2.98
PKN1-210	ENST00000587429	RRP7BP	Q9NSQ0	103 aa		33.63	■■■□□ 2.97
PKN1-210	ENST00000587429	ZNF142	P52746	1687 aa	Predicted RBP	33.63	■■■□□ 2.97
PKN1-210	ENST00000587429	FAM135A	Q9P2D6	1515 aa		33.63	■■■□□ 2.97
PKN1-210	ENST00000587429	DNMT1	P26358	1616 aa	Known RBP	33.62	■■■□□ 2.97
PKN1-210	ENST00000587429	CEP170B	Q9Y4F5	1589 aa	Predicted RBP	33.62	■■■□□ 2.97
PKN1-210	ENST00000587429	SHANK2	Q9UPX8	1470 aa		33.62	■■■□□ 2.97
PKN1-210	ENST00000587429	CERK	Q8TCT0	537 aa		33.61	■■■□□ 2.97
PKN1-210	ENST00000587429	DUOX2	Q9NRD8	1548 aa		33.61	■■■□□ 2.97
PKN1-210	ENST00000587429	PZP	P20742	1482 aa		33.61	■■■□□ 2.97
PKN1-210	ENST00000587429	PTPRT	O14522	1441 aa		33.61	■■■□□ 2.97
PKN1-210	ENST00000587429	EIF2AK4	Q9P2K8	1649 aa	Known RBP	33.61	■■■□□ 2.97
PKN1-210	ENST00000587429	KIF15	Q9NS87	1388 aa		33.6	■■■□□ 2.97
PKN1-210	ENST00000587429	NCKAP5L	Q9HCH0	1330 aa		33.59	■■■□□ 2.97
PKN1-210	ENST00000587429	CHIC2	Q9UKJ5	165 aa		33.59	■■■□□ 2.97
PKN1-210	ENST00000587429	TNR	Q92752	1358 aa		33.58	■■■□□ 2.97
PKN1-210	ENST00000587429	MROH1	Q8NDA8	1641 aa		33.57	■■■□□ 2.96
PKN1-210	ENST00000587429	ABCC3	O15438	1527 aa		33.55	■■■□□ 2.96
PKN1-210	ENST00000587429	A2ML1	A8K2U0	1454 aa		33.54	■■■□□ 2.96
PKN1-210	ENST00000587429	FAM50A	Q14320	339 aa	Known RBP	33.53	■■■□□ 2.96
PKN1-210	ENST00000587429	CFAP65	Q6ZU64	1925 aa	Known RBP	33.51	■■■□□ 2.96
PKN1-210	ENST00000587429	CEP152	O94986	1710 aa		33.5	■■■□□ 2.95
PKN1-210	ENST00000587429	PLA2R1	Q13018	1463 aa		33.49	■■■□□ 2.95
PKN1-210	ENST00000587429	ZC3H13	Q5T200	1668 aa	Known RBP	33.48	■■■□□ 2.95
PKN1-210	ENST00000587429	ERBIN	Q96RT1	1412 aa		33.48	■■■□□ 2.95
PKN1-210	ENST00000587429	ANKRD30A	Q9BXX3	1397 aa		33.47	■■■□□ 2.95
PKN1-210	ENST00000587429	PKD2	Q13563	968 aa		33.45	■■■□□ 2.95
PKN1-210	ENST00000587429	PPARGC1B	Q86YN6	1023 aa	Known RBP	33.45	■■■□□ 2.95
PKN1-210	ENST00000587429	GRWD1	Q9BQ67	446 aa	Known RBP eCLIP	33.45	■■■□□ 2.95
PKN1-210	ENST00000587429	PRDM15	P57071	1507 aa	Predicted RBP	33.4	■■■□□ 2.94
PKN1-210	ENST00000587429	NLRP1	Q9C000	1473 aa		33.39	■■■□□ 2.94
PKN1-210	ENST00000587429	LTBP4	Q8N2S1	1624 aa		33.39	■■■□□ 2.93
PKN1-210	ENST00000587429	ERVK-7	P63135	1459 aa		33.38	■■■□□ 2.93
PKN1-210	ENST00000587429	SPATA31D1	Q6ZQQ2	1576 aa		33.38	■■■□□ 2.93
PKN1-210	ENST00000587429	DEPDC5	O75140	1603 aa		33.37	■■■□□ 2.93
PKN1-210	ENST00000587429	ADGRL2	O95490	1459 aa		33.37	■■■□□ 2.93
PKN1-210	ENST00000587429	DROSHA	Q9NRR4	1374 aa	Known RBP eCLIP	33.35	■■■□□ 2.93
PKN1-210	ENST00000587429	THEMIS	Q8N1K5	641 aa	Predicted RBP	33.35	■■■□□ 2.93
PKN1-210	ENST00000587429	UGGT1	Q9NYU2	1555 aa		33.34	■■■□□ 2.93
PKN1-210	ENST00000587429	ZNF335	Q9H4Z2	1342 aa	Predicted RBP	33.33	■■■□□ 2.93
PKN1-210	ENST00000587429	KANK1	Q14678	1352 aa		33.31	■■■□□ 2.92
PKN1-210	ENST00000587429	POLR1A	O95602	1720 aa	Predicted RBP	33.3	■■■□□ 2.92
PKN1-210	ENST00000587429	ARHGAP31	Q2M1Z3	1444 aa		33.29	■■■□□ 2.92
PKN1-210	ENST00000587429	ANKLE2	Q86XL3	938 aa		33.28	■■■□□ 2.92
PKN1-210	ENST00000587429	NEURL4	Q96JN8	1562 aa		33.28	■■■□□ 2.92
PKN1-210	ENST00000587429	ANKRD50	Q9ULJ7	1429 aa		33.25	■■■□□ 2.91
PKN1-210	ENST00000587429	VWDE	Q8N2E2	1590 aa		33.25	■■■□□ 2.91
PKN1-210	ENST00000587429	LMTK2	Q8IWU2	1503 aa		33.21	■■■□□ 2.91
PKN1-210	ENST00000587429	ITGAE	P38570	1179 aa		33.19	■■■□□ 2.9
PKN1-210	ENST00000587429	UBR1	Q8IWV7	1749 aa		33.19	■■■□□ 2.9
PKN1-210	ENST00000587429	NPHP4	O75161	1426 aa	Predicted RBP	33.15	■■■□□ 2.9
PKN1-210	ENST00000587429	MED14	O60244	1454 aa		33.14	■■■□□ 2.9
PKN1-210	ENST00000587429	IQSEC2	Q5JU85	1478 aa		33.13	■■■□□ 2.89
PKN1-210	ENST00000587429	ROCK1	Q13464	1354 aa		33.12	■■■□□ 2.89
PKN1-210	ENST00000587429	EFCAB6	Q5THR3	1501 aa		33.12	■■■□□ 2.89
PKN1-210	ENST00000587429	PIK3C2B	O00750	1634 aa		33.1	■■■□□ 2.89
PKN1-210	ENST00000587429	IDI1	Q13907	227 aa		33.1	■■■□□ 2.89
PKN1-210	ENST00000587429	IQGAP1	P46940	1657 aa		33.08	■■■□□ 2.89
PKN1-210	ENST00000587429	LTK	P29376	864 aa		33.08	■■■□□ 2.89
PKN1-210	ENST00000587429	SYNM	O15061	1565 aa		33.08	■■■□□ 2.89
PKN1-210	ENST00000587429	NOS1	P29475	1434 aa		33.06	■■■□□ 2.88
PKN1-210	ENST00000587429	ARHGAP23	Q9P227	1491 aa		33.05	■■■□□ 2.88
PKN1-210	ENST00000587429	TXNDC2	Q86VQ3	553 aa		33.04	■■■□□ 2.88
PKN1-210	ENST00000587429	STAG3	Q9UJ98	1225 aa		33.04	■■■□□ 2.88
PKN1-210	ENST00000587429	SLIT1	O75093	1534 aa		33.03	■■■□□ 2.88
PKN1-210	ENST00000587429	UNC13B	O14795	1591 aa		33.03	■■■□□ 2.88
PKN1-210	ENST00000587429	SCAF11	Q99590	1463 aa	Known RBP	33.02	■■■□□ 2.88
PKN1-210	ENST00000587429	TET3	O43151	1660 aa		33.01	■■■□□ 2.88
PKN1-210	ENST00000587429	UBAP1L	F5GYI3	381 aa		33	■■■□□ 2.87
PKN1-210	ENST00000587429	TMEM2	Q9UHN6	1383 aa		32.98	■■■□□ 2.87
PKN1-210	ENST00000587429	RRBP1	Q9P2E9	1410 aa	Known RBP	32.98	■■■□□ 2.87
PKN1-210	ENST00000587429	CPS1	P31327	1500 aa		32.97	■■■□□ 2.87
PKN1-210	ENST00000587429	EID1	Q9Y6B2	187 aa		32.97	■■■□□ 2.87
PKN1-210	ENST00000587429	RPRD2	Q5VT52	1461 aa	Known RBP	32.97	■■■□□ 2.87
PKN1-210	ENST00000587429	SLC52A1	Q9NWF4	448 aa		32.96	■■■□□ 2.87
PKN1-210	ENST00000587429	GCC2	Q8IWJ2	1684 aa		32.96	■■■□□ 2.87
PKN1-210	ENST00000587429	STRCP1	A6NGW2	1772 aa		32.95	■■■□□ 2.87
PKN1-210	ENST00000587429	KDM5A	P29375	1690 aa	Known RBP	32.94	■■■□□ 2.86
PKN1-210	ENST00000587429	NUP155	O75694	1391 aa		32.92	■■■□□ 2.86
PKN1-210	ENST00000587429	IQGAP3	Q86VI3	1631 aa		32.91	■■■□□ 2.86
PKN1-210	ENST00000587429		E9PCH4	1651 aa		32.91	■■■□□ 2.86
PKN1-210	ENST00000587429	ADGRB3	O60242	1522 aa		32.89	■■■□□ 2.86
PKN1-210	ENST00000587429	MYO5B	Q9ULV0	1848 aa		32.87	■■■□□ 2.85
PKN1-210	ENST00000587429	LRRC7	Q96NW7	1537 aa		32.82	■■■□□ 2.84
PKN1-210	ENST00000587429	PIP4K2B	P78356	416 aa		32.79	■■■□□ 2.84
PKN1-210	ENST00000587429	SLC26A8	Q96RN1	970 aa		32.79	■■■□□ 2.84
PKN1-210	ENST00000587429	SENP3	Q9H4L4	574 aa	Predicted RBP	32.79	■■■□□ 2.84
PKN1-210	ENST00000587429	TMEM131L	A2VDJ0	1609 aa		32.79	■■■□□ 2.84
PKN1-210	ENST00000587429	NAIP	Q13075	1403 aa		32.78	■■■□□ 2.84
PKN1-210	ENST00000587429	TOM1	O60784	492 aa		32.78	■■■□□ 2.84
PKN1-210	ENST00000587429	CHGA	P10645	457 aa	Known RBP	32.78	■■■□□ 2.84
PKN1-210	ENST00000587429	SCAF1	Q9H7N4	1312 aa	Known RBP	32.77	■■■□□ 2.84
PKN1-210	ENST00000587429	ZFYVE9	O95405	1425 aa		32.74	■■■□□ 2.83

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