RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000572010.5

SLC12A4-208, Transcript of solute carrier family 12 member 4, human

TSL 1 (best)

Gene SLC12A4, Length 1,016 nt, Biotype processed transcript, Subcellular localisation Endoplasmic reticulum .

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RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	p-Value	Fold Change
SLC12A4-208	ENST00000572010	DISP3	Q9P2K9	1392 aa		33.67	■■■□□ 2.98
SLC12A4-208	ENST00000572010	FBXO31	Q5XUX0	539 aa	Predicted RBP	33.66	■■■□□ 2.98
SLC12A4-208	ENST00000572010	A2ML1	A8K2U0	1454 aa		33.65	■■■□□ 2.98
SLC12A4-208	ENST00000572010	TCOF1	Q13428	1488 aa	Known RBP	33.64	■■■□□ 2.98
SLC12A4-208	ENST00000572010	TNR	Q92752	1358 aa		33.62	■■■□□ 2.97
SLC12A4-208	ENST00000572010	VPS8	Q8N3P4	1428 aa		33.61	■■■□□ 2.97
SLC12A4-208	ENST00000572010	UBAP1L	F5GYI3	381 aa		33.59	■■■□□ 2.97
SLC12A4-208	ENST00000572010	KDM5D	Q9BY66	1539 aa		33.58	■■■□□ 2.97
SLC12A4-208	ENST00000572010	LRRC9	Q6ZRR7	1453 aa		33.58	■■■□□ 2.97
SLC12A4-208	ENST00000572010	ARHGEF5	Q12774	1597 aa		33.57	■■■□□ 2.96
SLC12A4-208	ENST00000572010	FAM135A	Q9P2D6	1515 aa		33.57	■■■□□ 2.96
SLC12A4-208	ENST00000572010	PZP	P20742	1482 aa		33.56	■■■□□ 2.96
SLC12A4-208	ENST00000572010	DNMT1	P26358	1616 aa	Known RBP	33.56	■■■□□ 2.96
SLC12A4-208	ENST00000572010	THEMIS	Q8N1K5	641 aa	Predicted RBP	33.54	■■■□□ 2.96
SLC12A4-208	ENST00000572010	KANK4	Q5T7N3	995 aa	Predicted RBP	33.52	■■■□□ 2.96
SLC12A4-208	ENST00000572010	ANKLE2	Q86XL3	938 aa		33.52	■■■□□ 2.96
SLC12A4-208	ENST00000572010	MIA2	Q96PC5	1412 aa		33.51	■■■□□ 2.95
SLC12A4-208	ENST00000572010	ILDR2	Q71H61	639 aa		33.46	■■■□□ 2.95
SLC12A4-208	ENST00000572010	DROSHA	Q9NRR4	1374 aa	Known RBP eCLIP	33.45	■■■□□ 2.94
SLC12A4-208	ENST00000572010	MAP3K1	Q13233	1512 aa		33.44	■■■□□ 2.94
SLC12A4-208	ENST00000572010	NLRP1	Q9C000	1473 aa		33.44	■■■□□ 2.94
SLC12A4-208	ENST00000572010	APLP2	Q06481	763 aa		33.42	■■■□□ 2.94
SLC12A4-208	ENST00000572010	MYOM3	Q5VTT5	1437 aa		33.42	■■■□□ 2.94
SLC12A4-208	ENST00000572010	MAST1	Q9Y2H9	1570 aa		33.39	■■■□□ 2.94
SLC12A4-208	ENST00000572010	UGGT1	Q9NYU2	1555 aa		33.38	■■■□□ 2.93
SLC12A4-208	ENST00000572010	POLR1A	O95602	1720 aa	Predicted RBP	33.36	■■■□□ 2.93
SLC12A4-208	ENST00000572010	SPATA31D1	Q6ZQQ2	1576 aa		33.35	■■■□□ 2.93
SLC12A4-208	ENST00000572010	TOM1	O60784	492 aa		33.35	■■■□□ 2.93
SLC12A4-208	ENST00000572010	SHANK2	Q9UPX8	1470 aa		33.35	■■■□□ 2.93
SLC12A4-208	ENST00000572010	SCAF1	Q9H7N4	1312 aa	Known RBP	33.34	■■■□□ 2.93
SLC12A4-208	ENST00000572010	RNF17	Q9BXT8	1623 aa	Known RBP	33.33	■■■□□ 2.93
SLC12A4-208	ENST00000572010	SOCS7	O14512	581 aa		33.33	■■■□□ 2.93
SLC12A4-208	ENST00000572010	NEURL4	Q96JN8	1562 aa		33.33	■■■□□ 2.93
SLC12A4-208	ENST00000572010	ABCC3	O15438	1527 aa		33.33	■■■□□ 2.93
SLC12A4-208	ENST00000572010	CPS1	P31327	1500 aa		33.33	■■■□□ 2.93
SLC12A4-208	ENST00000572010	NPHP4	O75161	1426 aa	Predicted RBP	33.31	■■■□□ 2.92
SLC12A4-208	ENST00000572010	PIP4K2B	P78356	416 aa		33.3	■■■□□ 2.92
SLC12A4-208	ENST00000572010	EIF2AK4	Q9P2K8	1649 aa	Known RBP	33.3	■■■□□ 2.92
SLC12A4-208	ENST00000572010	ZC3H13	Q5T200	1668 aa	Known RBP	33.29	■■■□□ 2.92
SLC12A4-208	ENST00000572010	DUOX2	Q9NRD8	1548 aa		33.28	■■■□□ 2.92
SLC12A4-208	ENST00000572010	MED14	O60244	1454 aa		33.27	■■■□□ 2.92
SLC12A4-208	ENST00000572010	RRP7BP	Q9NSQ0	103 aa		33.27	■■■□□ 2.92
SLC12A4-208	ENST00000572010	ERVK-7	P63135	1459 aa		33.24	■■■□□ 2.91
SLC12A4-208	ENST00000572010	DEPDC5	O75140	1603 aa		33.24	■■■□□ 2.91
SLC12A4-208	ENST00000572010	KIF15	Q9NS87	1388 aa		33.23	■■■□□ 2.91
SLC12A4-208	ENST00000572010	GRWD1	Q9BQ67	446 aa	Known RBP eCLIP	33.21	■■■□□ 2.91
SLC12A4-208	ENST00000572010	HSPA1L	P34931	641 aa		33.2	■■■□□ 2.91
SLC12A4-208	ENST00000572010	ABCC5	O15440	1437 aa		33.19	■■■□□ 2.9
SLC12A4-208	ENST00000572010	VWDE	Q8N2E2	1590 aa		33.19	■■■□□ 2.9
SLC12A4-208	ENST00000572010	MROH1	Q8NDA8	1641 aa		33.18	■■■□□ 2.9
SLC12A4-208	ENST00000572010	ERBIN	Q96RT1	1412 aa		33.16	■■■□□ 2.9
SLC12A4-208	ENST00000572010	CEP152	O94986	1710 aa		33.14	■■■□□ 2.9
SLC12A4-208	ENST00000572010	IQGAP1	P46940	1657 aa		33.14	■■■□□ 2.9
SLC12A4-208	ENST00000572010	PTPN23	Q9H3S7	1636 aa		33.14	■■■□□ 2.9
SLC12A4-208	ENST00000572010	KANK1	Q14678	1352 aa		33.14	■■■□□ 2.9
SLC12A4-208	ENST00000572010	TXNDC2	Q86VQ3	553 aa		33.13	■■■□□ 2.89
SLC12A4-208	ENST00000572010	ARHGAP31	Q2M1Z3	1444 aa		33.12	■■■□□ 2.89
SLC12A4-208	ENST00000572010	CFAP65	Q6ZU64	1925 aa	Known RBP	33.12	■■■□□ 2.89
SLC12A4-208	ENST00000572010	DAPK1	P53355	1430 aa		33.11	■■■□□ 2.89
SLC12A4-208	ENST00000572010	CHIC2	Q9UKJ5	165 aa		33.11	■■■□□ 2.89
SLC12A4-208	ENST00000572010	EID1	Q9Y6B2	187 aa		33.11	■■■□□ 2.89
SLC12A4-208	ENST00000572010	STAG3	Q9UJ98	1225 aa		33.1	■■■□□ 2.89
SLC12A4-208	ENST00000572010	FGD6	Q6ZV73	1430 aa		33.09	■■■□□ 2.89
SLC12A4-208	ENST00000572010	ANKRD30A	Q9BXX3	1397 aa		33.08	■■■□□ 2.89
SLC12A4-208	ENST00000572010	LTK	P29376	864 aa		33.07	■■■□□ 2.88
SLC12A4-208	ENST00000572010	PRDM15	P57071	1507 aa	Predicted RBP	33.07	■■■□□ 2.88
SLC12A4-208	ENST00000572010	SCAF11	Q99590	1463 aa	Known RBP	33.06	■■■□□ 2.88
SLC12A4-208	ENST00000572010	UBR1	Q8IWV7	1749 aa		33.05	■■■□□ 2.88
SLC12A4-208	ENST00000572010	CROCC2	H7BZ55	1655 aa		33.05	■■■□□ 2.88
SLC12A4-208	ENST00000572010	LRRC7	Q96NW7	1537 aa		33.02	■■■□□ 2.88
SLC12A4-208	ENST00000572010	ARHGAP23	Q9P227	1491 aa		32.99	■■■□□ 2.87
SLC12A4-208	ENST00000572010	SLIT1	O75093	1534 aa		32.99	■■■□□ 2.87
SLC12A4-208	ENST00000572010	IDI1	Q13907	227 aa		32.96	■■■□□ 2.87
SLC12A4-208	ENST00000572010	TMEM2	Q9UHN6	1383 aa		32.96	■■■□□ 2.87
SLC12A4-208	ENST00000572010	FAM50A	Q14320	339 aa	Known RBP	32.95	■■■□□ 2.87
SLC12A4-208	ENST00000572010	SENP3	Q9H4L4	574 aa	Predicted RBP	32.95	■■■□□ 2.87
SLC12A4-208	ENST00000572010	STRCP1	A6NGW2	1772 aa		32.94	■■■□□ 2.86
SLC12A4-208	ENST00000572010	SYNM	O15061	1565 aa		32.92	■■■□□ 2.86
SLC12A4-208	ENST00000572010	ALK	Q9UM73	1620 aa		32.91	■■■□□ 2.86
SLC12A4-208	ENST00000572010	LMTK2	Q8IWU2	1503 aa		32.9	■■■□□ 2.86
SLC12A4-208	ENST00000572010	MED1	Q15648	1581 aa	Predicted RBP	32.9	■■■□□ 2.86
SLC12A4-208	ENST00000572010	PIK3C2B	O00750	1634 aa		32.9	■■■□□ 2.86
SLC12A4-208	ENST00000572010	PHF23	Q9BUL5	403 aa	Predicted RBP	32.89	■■■□□ 2.86
SLC12A4-208	ENST00000572010	SLC52A1	Q9NWF4	448 aa		32.87	■■■□□ 2.85
SLC12A4-208	ENST00000572010	EFCAB6	Q5THR3	1501 aa		32.86	■■■□□ 2.85
SLC12A4-208	ENST00000572010	BCAN	Q96GW7	911 aa		32.83	■■■□□ 2.85
SLC12A4-208	ENST00000572010	ADGRL2	O95490	1459 aa		32.82	■■■□□ 2.84
SLC12A4-208	ENST00000572010	KCNA6	P17658	529 aa		32.81	■■■□□ 2.84
SLC12A4-208	ENST00000572010	SLC26A8	Q96RN1	970 aa		32.81	■■■□□ 2.84
SLC12A4-208	ENST00000572010	NOS1	P29475	1434 aa		32.8	■■■□□ 2.84
SLC12A4-208	ENST00000572010	ANKRD50	Q9ULJ7	1429 aa		32.8	■■■□□ 2.84
SLC12A4-208	ENST00000572010	KDM5A	P29375	1690 aa	Known RBP	32.79	■■■□□ 2.84
SLC12A4-208	ENST00000572010	PROSER2	Q86WR7	435 aa	Predicted RBP	32.77	■■■□□ 2.84
SLC12A4-208	ENST00000572010	HDGF	P51858	240 aa	Known RBP	32.75	■■■□□ 2.83
SLC12A4-208	ENST00000572010	TMEM94	Q12767	1356 aa		32.73	■■■□□ 2.83
SLC12A4-208	ENST00000572010	RPRD2	Q5VT52	1461 aa	Known RBP	32.72	■■■□□ 2.83
SLC12A4-208	ENST00000572010	ADGRB3	O60242	1522 aa		32.7	■■■□□ 2.83
SLC12A4-208	ENST00000572010	TET3	O43151	1660 aa		32.69	■■■□□ 2.82
SLC12A4-208	ENST00000572010	PPP1R15A	O75807	674 aa	Predicted RBP	32.68	■■■□□ 2.82
SLC12A4-208	ENST00000572010	FAM135B	Q49AJ0	1406 aa		32.68	■■■□□ 2.82

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