RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000572010.5

SLC12A4-208, Transcript of solute carrier family 12 member 4, humanhuman

TSL 1 (best)

Gene SLC12A4, Length 1,016 nt, Biotype processed transcript, Subcellular localisation Endoplasmic reticulum .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SLC12A4-208ENST00000572010 NISCHQ9Y2I1 1504 aa53.07■■■■■ 6.09
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SLC12A4-208ENST00000572010 DNAJC5BQ9UF47 199 aa44.96■■■■■ 4.79
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SLC12A4-208ENST00000572010 SCRIBQ14160 1630 aa43.39■■■■■ 4.54
SLC12A4-208ENST00000572010 CC2D2AQ9P2K1 1620 aa43.12■■■■■ 4.49
SLC12A4-208ENST00000572010 CECR2Q9BXF3 1484 aa43.08■■■■■ 4.49
SLC12A4-208ENST00000572010 EIF4G1Q04637 1599 aaKnown RBP43■■■■■ 4.47
SLC12A4-208ENST00000572010 NCAPD3P42695 1498 aa41.66■■■■■ 4.26
SLC12A4-208ENST00000572010 ATAD2BQ9ULI0 1458 aa41.5■■■■■ 4.23
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SLC12A4-208ENST00000572010 SMARCA2P51531 1590 aa41.38■■■■■ 4.22
SLC12A4-208ENST00000572010 SMARCA4P51532 1647 aa41.36■■■■■ 4.21
SLC12A4-208ENST00000572010 ERCC6Q03468 1493 aa41.34■■■■■ 4.21
SLC12A4-208ENST00000572010 HMGXB3Q12766 1538 aa41.27■■■■■ 4.2
SLC12A4-208ENST00000572010 CUX2O14529 1486 aa41.23■■■■■ 4.19
SLC12A4-208ENST00000572010 BAZ1AQ9NRL2 1556 aaPredicted RBP41.2■■■■■ 4.19
SLC12A4-208ENST00000572010 BAZ1BQ9UIG0 1483 aaKnown RBP41.12■■■■■ 4.17
SLC12A4-208ENST00000572010 NESP48681 1621 aa41■■■■■ 4.15
SLC12A4-208ENST00000572010 PEG3Q9GZU2 1588 aa40.95■■■■■ 4.15
SLC12A4-208ENST00000572010 MROH2BQ7Z745 1585 aa40.86■■■■■ 4.13
SLC12A4-208ENST00000572010 LAMC3Q9Y6N6 1575 aa40.69■■■■■ 4.11
SLC12A4-208ENST00000572010 PDS5BQ9NTI5 1447 aa40.58■■■■■ 4.09
SLC12A4-208ENST00000572010 THOC2Q8NI27 1593 aaKnown RBP40.51■■■■■ 4.08
SLC12A4-208ENST00000572010 CADPSQ9ULU8 1353 aa40.44■■■■■ 4.06
SLC12A4-208ENST00000572010 KIF21AQ7Z4S6 1674 aa40.38■■■■■ 4.05
SLC12A4-208ENST00000572010 WIZO95785 1651 aa40.34■■■■■ 4.05
SLC12A4-208ENST00000572010 MRC2Q9UBG0 1479 aa40.15■■■■■ 4.02
SLC12A4-208ENST00000572010 RSF1Q96T23 1441 aaPredicted RBP40.03■■■■■ 4
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SLC12A4-208ENST00000572010 FANCD2Q9BXW9 1451 aa39.94■■■■□ 3.98
SLC12A4-208ENST00000572010 CFTRP13569 1480 aa39.89■■■■□ 3.98
SLC12A4-208ENST00000572010 TOP2AP11388 1531 aaKnown RBP39.85■■■■□ 3.97
SLC12A4-208ENST00000572010 TRIM41Q8WV44 630 aa39.63■■■■□ 3.93
SLC12A4-208ENST00000572010 URB2Q14146 1524 aaKnown RBP39.55■■■■□ 3.92
SLC12A4-208ENST00000572010 OSCARQ8IYS5 282 aa39.5■■■■□ 3.91
SLC12A4-208ENST00000572010 CCDC88BA6NC98 1476 aa39.46■■■■□ 3.91
SLC12A4-208ENST00000572010 PRDM2Q13029 1718 aa39.33■■■■□ 3.89
SLC12A4-208ENST00000572010 IFT140Q96RY7 1462 aa39.2■■■■□ 3.87
SLC12A4-208ENST00000572010 TOPBP1Q92547 1522 aa39.14■■■■□ 3.86
SLC12A4-208ENST00000572010 ABCC8Q09428 1581 aa39.13■■■■□ 3.85
SLC12A4-208ENST00000572010 ZNF608Q9ULD9 1512 aaPredicted RBP39.1■■■■□ 3.85
SLC12A4-208ENST00000572010 DNMBPQ6XZF7 1577 aa38.96■■■■□ 3.83
SLC12A4-208ENST00000572010 EIF4G3O43432 1585 aaKnown RBP38.82■■■■□ 3.81
SLC12A4-208ENST00000572010 AQRO60306 1485 aaKnown RBP eCLIP38.8■■■■□ 3.86e-7■■■■□ 22.4
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SLC12A4-208ENST00000572010 RIMBP3BA6NNM3 1639 aa38.78■■■■□ 3.8
SLC12A4-208ENST00000572010 RIMBP3Q9UFD9 1639 aa38.78■■■■□ 3.8
SLC12A4-208ENST00000572010 TARBP1Q13395 1621 aaKnown RBP38.74■■■■□ 3.79
SLC12A4-208ENST00000572010 POLA1P09884 1462 aaPredicted RBP38.73■■■■□ 3.79
SLC12A4-208ENST00000572010 FBLN2P98095 1184 aa38.71■■■■□ 3.79
SLC12A4-208ENST00000572010 ARHGEF11O15085 1522 aa38.68■■■■□ 3.78
SLC12A4-208ENST00000572010 SOGA1O94964 1423 aa38.65■■■■□ 3.78
SLC12A4-208ENST00000572010 RAD54L2Q9Y4B4 1467 aa38.61■■■■□ 3.77
SLC12A4-208ENST00000572010 CYB5RLQ6IPT4 315 aa38.58■■■■□ 3.77
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SLC12A4-208ENST00000572010 CHD1O14646 1710 aa38.53■■■■□ 3.76
SLC12A4-208ENST00000572010 FGD5Q6ZNL6 1462 aa38.47■■■■□ 3.75
SLC12A4-208ENST00000572010 CHMP7Q8WUX9 453 aaPredicted RBP38.4■■■■□ 3.74
SLC12A4-208ENST00000572010 CUX1P39880 1505 aa38.39■■■■□ 3.74
SLC12A4-208ENST00000572010 WDR97A6NE52 1622 aa38.36■■■■□ 3.73
SLC12A4-208ENST00000572010 SNAPC4Q5SXM2 1469 aa38.35■■■■□ 3.73
SLC12A4-208ENST00000572010 SUPT5HO00267 1087 aaKnown RBP38.35■■■■□ 3.73
SLC12A4-208ENST00000572010 GRIN2BQ13224 1484 aa38.28■■■■□ 3.72
SLC12A4-208ENST00000572010 ARAP1Q96P48 1450 aa38.28■■■■□ 3.72
SLC12A4-208ENST00000572010 MAGI1Q96QZ7 1491 aaPredicted RBP38.27■■■■□ 3.72
SLC12A4-208ENST00000572010 TRHP20396 242 aaPredicted RBP38.23■■■■□ 3.71
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SLC12A4-208ENST00000572010 SYNJ2O15056 1496 aa38.15■■■■□ 3.7
SLC12A4-208ENST00000572010 GAPVD1Q14C86 1478 aa38.14■■■■□ 3.7
SLC12A4-208ENST00000572010 CLASP1Q7Z460 1538 aa38.12■■■■□ 3.69
SLC12A4-208ENST00000572010 ABCA10Q8WWZ4 1543 aa38.04■■■■□ 3.68
SLC12A4-208ENST00000572010 PBRM1Q86U86 1689 aa37.98■■■■□ 3.67
SLC12A4-208ENST00000572010 WRNQ14191 1432 aaPredicted RBP eCLIP37.95■■■■□ 3.67
SLC12A4-208ENST00000572010 ABCA5Q8WWZ7 1642 aa37.9■■■■□ 3.66
SLC12A4-208ENST00000572010 GRIN2AQ12879 1464 aa37.75■■■■□ 3.63
SLC12A4-208ENST00000572010 TOP2BQ02880 1626 aa37.75■■■■□ 3.63
SLC12A4-208ENST00000572010 BIVM-ERCC5R4GMW8 1640 aa37.71■■■■□ 3.63
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SLC12A4-208ENST00000572010 ADAMTS12P58397 1594 aa37.63■■■■□ 3.62
SLC12A4-208ENST00000572010 NUP160Q12769 1436 aa37.61■■■■□ 3.61
SLC12A4-208ENST00000572010 ERICH3Q5RHP9 1530 aa37.56■■■■□ 3.6
SLC12A4-208ENST00000572010 CEP170Q5SW79 1584 aa37.55■■■■□ 3.6
SLC12A4-208ENST00000572010 ERCC6L2Q5T890 1561 aa37.52■■■■□ 3.6
SLC12A4-208ENST00000572010 JPH4Q96JJ6 628 aa37.39■■■■□ 3.58
SLC12A4-208ENST00000572010 SHROOM2Q13796 1616 aa37.39■■■■□ 3.58
SLC12A4-208ENST00000572010 PRG4Q92954 1404 aaPredicted RBP37.34■■■■□ 3.57
SLC12A4-208ENST00000572010 AEBP2Q6ZN18 517 aaPredicted RBP37.23■■■■□ 3.55
SLC12A4-208ENST00000572010 NPM1P06748 294 aaKnown RBP eCLIP37.14■■■■□ 3.54
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