RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000568485.1

E2F4-210, Transcript of E2F transcription factor 4, humanhuman

TSL 2

Gene E2F4, Length 707 nt, Biotype retained intron, Subcellular localisation Cytosol .

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
E2F4-210ENST00000568485 A2ML1A8K2U0 1454 aa35.16■■■■□ 3.22
E2F4-210ENST00000568485 KDM5DQ9BY66 1539 aa35.16■■■■□ 3.22
E2F4-210ENST00000568485 LOC105371045A0A1W2PR82 267 aa35.14■■■■□ 3.22
E2F4-210ENST00000568485 PZPP20742 1482 aa35.12■■■■□ 3.21
E2F4-210ENST00000568485 DNMT1P26358 1616 aaKnown RBP35.12■■■■□ 3.21
E2F4-210ENST00000568485 ZNF335Q9H4Z2 1342 aaPredicted RBP35.11■■■■□ 3.21
E2F4-210ENST00000568485 FBXO31Q5XUX0 539 aaPredicted RBP35.09■■■■□ 3.21
E2F4-210ENST00000568485 TNRQ92752 1358 aa35.09■■■■□ 3.21
E2F4-210ENST00000568485 MAP3K1Q13233 1512 aa35.07■■■■□ 3.21
E2F4-210ENST00000568485 TSPY4P0CV99 314 aa35.06■■■■□ 3.2
E2F4-210ENST00000568485 TSPY10P0CW01 314 aa35.06■■■■□ 3.2
E2F4-210ENST00000568485 WASHC2CQ9Y4E1 1318 aa35.05■■■■□ 3.2
E2F4-210ENST00000568485 MAST1Q9Y2H9 1570 aa35.04■■■■□ 3.2
E2F4-210ENST00000568485 KANK4Q5T7N3 995 aaPredicted RBP35.04■■■■□ 3.2
E2F4-210ENST00000568485 RNF17Q9BXT8 1623 aaKnown RBP34.99■■■■□ 3.19
E2F4-210ENST00000568485 MYOM3Q5VTT5 1437 aa34.98■■■■□ 3.19
E2F4-210ENST00000568485 MIA2Q96PC5 1412 aa34.98■■■■□ 3.19
E2F4-210ENST00000568485 NEURL4Q96JN8 1562 aa34.97■■■■□ 3.19
E2F4-210ENST00000568485 DISP3Q9P2K9 1392 aa34.94■■■■□ 3.18
E2F4-210ENST00000568485 NLRP1Q9C000 1473 aa34.94■■■■□ 3.18
E2F4-210ENST00000568485 POLR1AO95602 1720 aaPredicted RBP34.94■■■■□ 3.18
E2F4-210ENST00000568485 ABCC3O15438 1527 aa34.92■■■■□ 3.18
E2F4-210ENST00000568485 EIF2AK4Q9P2K8 1649 aaKnown RBP34.92■■■■□ 3.18
E2F4-210ENST00000568485 ZC3H13Q5T200 1668 aaKnown RBP34.89■■■■□ 3.18
E2F4-210ENST00000568485 MROH1Q8NDA8 1641 aa34.88■■■■□ 3.17
E2F4-210ENST00000568485 DROSHAQ9NRR4 1374 aaKnown RBP eCLIP34.88■■■■□ 3.17
E2F4-210ENST00000568485 UBAP1LF5GYI3 381 aa34.87■■■■□ 3.17
E2F4-210ENST00000568485 UGGT1Q9NYU2 1555 aa34.87■■■■□ 3.17
E2F4-210ENST00000568485 SPATA31D1Q6ZQQ2 1576 aa34.86■■■■□ 3.17
E2F4-210ENST00000568485 THEMISQ8N1K5 641 aaPredicted RBP34.84■■■■□ 3.17
E2F4-210ENST00000568485 ILDR2Q71H61 639 aa34.82■■■■□ 3.16
E2F4-210ENST00000568485 ANKLE2Q86XL3 938 aa34.82■■■■□ 3.16
E2F4-210ENST00000568485 DUOX2Q9NRD8 1548 aa34.81■■■■□ 3.16
E2F4-210ENST00000568485 CPS1P31327 1500 aa34.81■■■■□ 3.16
E2F4-210ENST00000568485 MED14O60244 1454 aa34.8■■■■□ 3.16
E2F4-210ENST00000568485 ERVK-7P63135 1459 aa34.8■■■■□ 3.16
E2F4-210ENST00000568485 SHANK2Q9UPX8 1470 aa34.8■■■■□ 3.16
E2F4-210ENST00000568485 DEPDC5O75140 1603 aa34.8■■■■□ 3.16
E2F4-210ENST00000568485 VWDEQ8N2E2 1590 aa34.77■■■■□ 3.16
E2F4-210ENST00000568485 ABCC5O15440 1437 aa34.76■■■■□ 3.16
E2F4-210ENST00000568485 NPHP4O75161 1426 aaPredicted RBP34.76■■■■□ 3.16
E2F4-210ENST00000568485 CEP152O94986 1710 aa34.75■■■■□ 3.15
E2F4-210ENST00000568485 CROCC2H7BZ55 1655 aa34.74■■■■□ 3.15
E2F4-210ENST00000568485 KIF15Q9NS87 1388 aa34.74■■■■□ 3.15
E2F4-210ENST00000568485 PTPN23Q9H3S7 1636 aa34.73■■■■□ 3.15
E2F4-210ENST00000568485 PRDM15P57071 1507 aaPredicted RBP34.71■■■■□ 3.15
E2F4-210ENST00000568485 ERBINQ96RT1 1412 aa34.7■■■■□ 3.15
E2F4-210ENST00000568485 IQGAP1P46940 1657 aa34.68■■■■□ 3.14
E2F4-210ENST00000568485 DAPK1P53355 1430 aa34.67■■■■□ 3.14
E2F4-210ENST00000568485 ARHGAP31Q2M1Z3 1444 aa34.66■■■■□ 3.14
E2F4-210ENST00000568485 FGD6Q6ZV73 1430 aa34.65■■■■□ 3.14
E2F4-210ENST00000568485 APLP2Q06481 763 aa34.65■■■■□ 3.14
E2F4-210ENST00000568485 RRP7BPQ9NSQ0 103 aa34.64■■■■□ 3.14
E2F4-210ENST00000568485 UBR1Q8IWV7 1749 aa34.63■■■■□ 3.13
E2F4-210ENST00000568485 SOCS7O14512 581 aa34.6■■■■□ 3.13
E2F4-210ENST00000568485 TOM1O60784 492 aa34.6■■■■□ 3.13
E2F4-210ENST00000568485 PIP4K2BP78356 416 aa34.56■■■■□ 3.12
E2F4-210ENST00000568485 ARHGAP23Q9P227 1491 aa34.56■■■■□ 3.12
E2F4-210ENST00000568485 ALKQ9UM73 1620 aa34.55■■■■□ 3.12
E2F4-210ENST00000568485 CFAP65Q6ZU64 1925 aaKnown RBP34.55■■■■□ 3.12
E2F4-210ENST00000568485 STRCP1A6NGW2 1772 aa34.55■■■■□ 3.12
E2F4-210ENST00000568485 SCAF11Q99590 1463 aaKnown RBP34.55■■■■□ 3.12
E2F4-210ENST00000568485 SLIT1O75093 1534 aa34.55■■■■□ 3.12
E2F4-210ENST00000568485 SCAF1Q9H7N4 1312 aaKnown RBP34.54■■■■□ 3.12
E2F4-210ENST00000568485 HSPA1LP34931 641 aa34.53■■■■□ 3.12
E2F4-210ENST00000568485 LRRC7Q96NW7 1537 aa34.51■■■■□ 3.12
E2F4-210ENST00000568485 GRWD1Q9BQ67 446 aaKnown RBP eCLIP34.51■■■■□ 3.125e-14■■■□□ 18
E2F4-210ENST00000568485 LMTK2Q8IWU2 1503 aa34.5■■■■□ 3.11
E2F4-210ENST00000568485 ANKRD30AQ9BXX3 1397 aa34.5■■■■□ 3.11
E2F4-210ENST00000568485 SYNMO15061 1565 aa34.49■■■■□ 3.11
E2F4-210ENST00000568485 LTKP29376 864 aa34.49■■■■□ 3.11
E2F4-210ENST00000568485 KANK1Q14678 1352 aa34.49■■■■□ 3.11
E2F4-210ENST00000568485 CHIC2Q9UKJ5 165 aa34.48■■■■□ 3.11
E2F4-210ENST00000568485 PIK3C2BO00750 1634 aa34.46■■■■□ 3.11
E2F4-210ENST00000568485 TXNDC2Q86VQ3 553 aa34.44■■■■□ 3.1
E2F4-210ENST00000568485 ADGRL2O95490 1459 aa34.43■■■■□ 3.1
E2F4-210ENST00000568485 TMEM2Q9UHN6 1383 aa34.4■■■■□ 3.1
E2F4-210ENST00000568485 MED1Q15648 1581 aaPredicted RBP34.39■■■■□ 3.1
E2F4-210ENST00000568485 KDM5AP29375 1690 aaKnown RBP34.38■■■■□ 3.09
E2F4-210ENST00000568485 EFCAB6Q5THR3 1501 aa34.37■■■■□ 3.09
E2F4-210ENST00000568485 EID1Q9Y6B2 187 aa34.37■■■■□ 3.09
E2F4-210ENST00000568485 NOS1P29475 1434 aa34.36■■■■□ 3.09
E2F4-210ENST00000568485 IDI1Q13907 227 aa34.35■■■■□ 3.09
E2F4-210ENST00000568485 STAG3Q9UJ98 1225 aa34.31■■■■□ 3.08
E2F4-210ENST00000568485 FAM50AQ14320 339 aaKnown RBP34.29■■■■□ 3.08
E2F4-210ENST00000568485 ANKRD50Q9ULJ7 1429 aa34.28■■■■□ 3.08
E2F4-210ENST00000568485 ADGRB3O60242 1522 aa34.27■■■■□ 3.08
E2F4-210ENST00000568485 XIRP1Q702N8 1843 aaKnown RBP34.25■■■■□ 3.07
E2F4-210ENST00000568485 TET3O43151 1660 aa34.23■■■■□ 3.07
E2F4-210ENST00000568485 RPRD2Q5VT52 1461 aaKnown RBP34.23■■■■□ 3.07
E2F4-210ENST00000568485 SLC52A1Q9NWF4 448 aa34.21■■■■□ 3.07
E2F4-210ENST00000568485 KCNA6P17658 529 aa34.15■■■■□ 3.06
E2F4-210ENST00000568485 SLC26A8Q96RN1 970 aa34.15■■■■□ 3.06
E2F4-210ENST00000568485 SENP3Q9H4L4 574 aaPredicted RBP34.15■■■■□ 3.06
E2F4-210ENST00000568485 TMEM94Q12767 1356 aa34.14■■■■□ 3.06
E2F4-210ENST00000568485 UNC13BO14795 1591 aa34.13■■■■□ 3.05
E2F4-210ENST00000568485 NWD1Q149M9 1564 aa34.11■■■■□ 3.05
E2F4-210ENST00000568485 ZFYVE9O95405 1425 aa34.11■■■■□ 3.05
E2F4-210ENST00000568485 FAM135BQ49AJ0 1406 aa34.08■■■■□ 3.05
E2F4-210ENST00000568485 GCC2Q8IWJ2 1684 aa34.08■■■■□ 3.05
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 49.9 ms