RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000568485.1

E2F4-210, Transcript of E2F transcription factor 4, humanhuman

TSL 2

Gene E2F4, Length 707 nt, Biotype retained intron, Subcellular localisation Cytosol .

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
E2F4-210ENST00000568485 NISCHQ9Y2I1 1504 aa55.62■■■■■ 6.49
E2F4-210ENST00000568485 ABCC9O60706 1549 aa49.95■■■■■ 5.59
E2F4-210ENST00000568485 CCDC180Q9P1Z9 1646 aa49.93■■■■■ 5.58
E2F4-210ENST00000568485 RB1CC1Q8TDY2 1594 aa47.53■■■■■ 5.2
E2F4-210ENST00000568485 NACADO15069 1562 aa47.21■■■■■ 5.15
E2F4-210ENST00000568485 DNAJC5BQ9UF47 199 aa46.94■■■■■ 5.1
E2F4-210ENST00000568485 DCAF8L2P0C7V8 631 aa46.83■■■■■ 5.09
E2F4-210ENST00000568485 MYO15BQ96JP2 1530 aa46.6■■■■■ 5.05
E2F4-210ENST00000568485 PABPN1Q86U42 306 aaKnown RBP eCLIP46.48■■■■■ 5.03
E2F4-210ENST00000568485 UNC13AQ9UPW8 1703 aa46.44■■■■■ 5.02
E2F4-210ENST00000568485 BICRAQ9NZM4 1560 aa46.21■■■■■ 4.99
E2F4-210ENST00000568485 ZCCHC6Q5VYS8 1495 aaKnown RBP46.12■■■■■ 4.97
E2F4-210ENST00000568485 DCAF1Q9Y4B6 1507 aa45.98■■■■■ 4.95
E2F4-210ENST00000568485 SHROOM4Q9ULL8 1493 aa45.58■■■■■ 4.89
E2F4-210ENST00000568485 SCRIBQ14160 1630 aa45.47■■■■■ 4.87
E2F4-210ENST00000568485 CC2D2AQ9P2K1 1620 aa45.14■■■■■ 4.82
E2F4-210ENST00000568485 EIF4G1Q04637 1599 aaKnown RBP45.05■■■■■ 4.8
E2F4-210ENST00000568485 CECR2Q9BXF3 1484 aa45.02■■■■■ 4.8
E2F4-210ENST00000568485 NCAPD3P42695 1498 aa43.62■■■■■ 4.57
E2F4-210ENST00000568485 ATAD2BQ9ULI0 1458 aa43.46■■■■■ 4.55
E2F4-210ENST00000568485 SMARCA4P51532 1647 aa43.4■■■■■ 4.54
E2F4-210ENST00000568485 SMARCA2P51531 1590 aa43.32■■■■■ 4.52
E2F4-210ENST00000568485 HMGXB3Q12766 1538 aa43.28■■■■■ 4.52
E2F4-210ENST00000568485 BAZ1AQ9NRL2 1556 aaPredicted RBP43.16■■■■■ 4.5
E2F4-210ENST00000568485 DNAJC5Q9H3Z4 198 aa43.12■■■■■ 4.49
E2F4-210ENST00000568485 ERCC6Q03468 1493 aa43.11■■■■■ 4.49
E2F4-210ENST00000568485 CUX2O14529 1486 aa43.1■■■■■ 4.49
E2F4-210ENST00000568485 PEG3Q9GZU2 1588 aa43.02■■■■■ 4.48
E2F4-210ENST00000568485 BAZ1BQ9UIG0 1483 aaKnown RBP43.01■■■■■ 4.48
E2F4-210ENST00000568485 NESP48681 1621 aa42.92■■■■■ 4.46
E2F4-210ENST00000568485 MROH2BQ7Z745 1585 aa42.86■■■■■ 4.45
E2F4-210ENST00000568485 LAMC3Q9Y6N6 1575 aa42.61■■■■■ 4.41
E2F4-210ENST00000568485 THOC2Q8NI27 1593 aaKnown RBP42.52■■■■■ 4.4
E2F4-210ENST00000568485 PDS5BQ9NTI5 1447 aa42.35■■■■■ 4.37
E2F4-210ENST00000568485 KIF21AQ7Z4S6 1674 aa42.34■■■■■ 4.37
E2F4-210ENST00000568485 WIZO95785 1651 aa42.31■■■■■ 4.36
E2F4-210ENST00000568485 CADPSQ9ULU8 1353 aa42.27■■■■■ 4.36
E2F4-210ENST00000568485 MRC2Q9UBG0 1479 aa42.01■■■■■ 4.32
E2F4-210ENST00000568485 RSF1Q96T23 1441 aaPredicted RBP41.96■■■■■ 4.31
E2F4-210ENST00000568485 WDR62O43379 1518 aa41.94■■■■■ 4.3
E2F4-210ENST00000568485 CEP164Q9UPV0 1460 aa41.82■■■■■ 4.29
E2F4-210ENST00000568485 TOP2AP11388 1531 aaKnown RBP41.81■■■■■ 4.28
E2F4-210ENST00000568485 CFTRP13569 1480 aa41.79■■■■■ 4.28
E2F4-210ENST00000568485 FANCD2Q9BXW9 1451 aa41.78■■■■■ 4.28
E2F4-210ENST00000568485 URB2Q14146 1524 aaKnown RBP41.46■■■■■ 4.23
E2F4-210ENST00000568485 CCDC88BA6NC98 1476 aa41.33■■■■■ 4.21
E2F4-210ENST00000568485 PRDM2Q13029 1718 aa41.3■■■■■ 4.2
E2F4-210ENST00000568485 TRIM41Q8WV44 630 aa41.14■■■■■ 4.18
E2F4-210ENST00000568485 OSCARQ8IYS5 282 aa41.07■■■■■ 4.17
E2F4-210ENST00000568485 IFT140Q96RY7 1462 aa41■■■■■ 4.15
E2F4-210ENST00000568485 TOPBP1Q92547 1522 aa40.99■■■■■ 4.15
E2F4-210ENST00000568485 ZNF608Q9ULD9 1512 aaPredicted RBP40.95■■■■■ 4.15
E2F4-210ENST00000568485 ABCC8Q09428 1581 aa40.87■■■■■ 4.13
E2F4-210ENST00000568485 DNMBPQ6XZF7 1577 aa40.83■■■■■ 4.13
E2F4-210ENST00000568485 EIF4G3O43432 1585 aaKnown RBP40.71■■■■■ 4.11
E2F4-210ENST00000568485 TARBP1Q13395 1621 aaKnown RBP40.64■■■■■ 4.1
E2F4-210ENST00000568485 RIMBP3CA6NJZ7 1639 aa40.58■■■■■ 4.09
E2F4-210ENST00000568485 RIMBP3BA6NNM3 1639 aa40.58■■■■■ 4.09
E2F4-210ENST00000568485 RIMBP3Q9UFD9 1639 aa40.58■■■■■ 4.09
E2F4-210ENST00000568485 POLA1P09884 1462 aaPredicted RBP40.58■■■■■ 4.09
E2F4-210ENST00000568485 AQRO60306 1485 aaKnown RBP eCLIP40.55■■■■■ 4.085e-7■■■■■ 27
E2F4-210ENST00000568485 ARHGEF11O15085 1522 aa40.47■■■■■ 4.07
E2F4-210ENST00000568485 RAD54L2Q9Y4B4 1467 aa40.41■■■■■ 4.06
E2F4-210ENST00000568485 CHD1O14646 1710 aa40.38■■■■■ 4.05
E2F4-210ENST00000568485 SOGA1O94964 1423 aa40.35■■■■■ 4.05
E2F4-210ENST00000568485 FGD5Q6ZNL6 1462 aa40.31■■■■■ 4.04
E2F4-210ENST00000568485 TDRD9Q8NDG6 1382 aaKnown RBP40.29■■■■■ 4.04
E2F4-210ENST00000568485 CUX1P39880 1505 aa40.27■■■■■ 4.04
E2F4-210ENST00000568485 WDR97A6NE52 1622 aa40.22■■■■■ 4.03
E2F4-210ENST00000568485 FBLN2P98095 1184 aa40.21■■■■■ 4.03
E2F4-210ENST00000568485 SNAPC4Q5SXM2 1469 aa40.15■■■■■ 4.02
E2F4-210ENST00000568485 CYB5RLQ6IPT4 315 aa40.1■■■■■ 4.01
E2F4-210ENST00000568485 ARAP1Q96P48 1450 aa40.08■■■■■ 4.01
E2F4-210ENST00000568485 MAGI1Q96QZ7 1491 aaPredicted RBP40.05■■■■■ 4
E2F4-210ENST00000568485 GRIN2BQ13224 1484 aa40.03■■■■■ 4
E2F4-210ENST00000568485 CLASP1Q7Z460 1538 aa39.99■■■■□ 3.99
E2F4-210ENST00000568485 SUPT5HO00267 1087 aaKnown RBP39.96■■■■□ 3.99
E2F4-210ENST00000568485 CHMP7Q8WUX9 453 aaPredicted RBP39.94■■■■□ 3.98
E2F4-210ENST00000568485 SYNJ2O15056 1496 aa39.91■■■■□ 3.98
E2F4-210ENST00000568485 SYNJ1O43426 1573 aa39.91■■■■□ 3.98
E2F4-210ENST00000568485 GAPVD1Q14C86 1478 aa39.88■■■■□ 3.97
E2F4-210ENST00000568485 ABCA10Q8WWZ4 1543 aa39.86■■■■□ 3.97
E2F4-210ENST00000568485 PBRM1Q86U86 1689 aa39.84■■■■□ 3.97
E2F4-210ENST00000568485 ABCA5Q8WWZ7 1642 aa39.8■■■■□ 3.96
E2F4-210ENST00000568485 WRNQ14191 1432 aaPredicted RBP eCLIP39.65■■■■□ 3.94
E2F4-210ENST00000568485 TRHP20396 242 aaPredicted RBP39.64■■■■□ 3.94
E2F4-210ENST00000568485 BIVM-ERCC5R4GMW8 1640 aa39.61■■■■□ 3.93
E2F4-210ENST00000568485 TOP2BQ02880 1626 aa39.6■■■■□ 3.93
E2F4-210ENST00000568485 GRIN2AQ12879 1464 aa39.53■■■■□ 3.92
E2F4-210ENST00000568485 ADAMTS12P58397 1594 aa39.51■■■■□ 3.92
E2F4-210ENST00000568485 NUP160Q12769 1436 aa39.43■■■■□ 3.9
E2F4-210ENST00000568485 CEP170Q5SW79 1584 aa39.39■■■■□ 3.9
E2F4-210ENST00000568485 FHAD1B1AJZ9 1412 aa39.38■■■■□ 3.89
E2F4-210ENST00000568485 ERCC6L2Q5T890 1561 aa39.35■■■■□ 3.89
E2F4-210ENST00000568485 ERICH3Q5RHP9 1530 aa39.35■■■■□ 3.89
E2F4-210ENST00000568485 SHROOM2Q13796 1616 aa39.25■■■■□ 3.87
E2F4-210ENST00000568485 PRG4Q92954 1404 aaPredicted RBP38.99■■■■□ 3.83
E2F4-210ENST00000568485 RUSC2Q8N2Y8 1516 aa38.96■■■■□ 3.83
E2F4-210ENST00000568485 JPH4Q96JJ6 628 aa38.95■■■■□ 3.83
E2F4-210ENST00000568485 IGF1RP08069 1367 aa38.82■■■■□ 3.81
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 13.7 ms