RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000567828.1

PPP4C-212, Transcript of protein phosphatase 4 catalytic subunit, humanhuman

TSL 3

Gene PPP4C, Length 742 nt, Biotype retained intron, Subcellular localisation Cytosol, Ribosome .

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PPP4C-212ENST00000567828 FAM135AQ9P2D6 1515 aa35.65■■■■□ 3.3
PPP4C-212ENST00000567828 CEP170BQ9Y4F5 1589 aaPredicted RBP35.64■■■■□ 3.3
PPP4C-212ENST00000567828 DMRT2Q9Y5R5 561 aa35.64■■■■□ 3.3
PPP4C-212ENST00000567828 NCOA1Q15788 1441 aa35.64■■■■□ 3.3
PPP4C-212ENST00000567828 RNF17Q9BXT8 1623 aaKnown RBP35.64■■■■□ 3.3
PPP4C-212ENST00000567828 EIF2AK4Q9P2K8 1649 aaKnown RBP35.61■■■■□ 3.29
PPP4C-212ENST00000567828 PTPRTO14522 1441 aa35.58■■■■□ 3.29
PPP4C-212ENST00000567828 CERKQ8TCT0 537 aa35.56■■■■□ 3.28
PPP4C-212ENST00000567828 PZPP20742 1482 aa35.55■■■■□ 3.28
PPP4C-212ENST00000567828 FGD6Q6ZV73 1430 aa35.55■■■■□ 3.28
PPP4C-212ENST00000567828 WASHC2CQ9Y4E1 1318 aa35.55■■■■□ 3.28
PPP4C-212ENST00000567828 DNMT1P26358 1616 aaKnown RBP35.54■■■■□ 3.28
PPP4C-212ENST00000567828 ZC3H13Q5T200 1668 aaKnown RBP35.54■■■■□ 3.28
PPP4C-212ENST00000567828 SHANK2Q9UPX8 1470 aa35.53■■■■□ 3.28
PPP4C-212ENST00000567828 CEP152O94986 1710 aa35.52■■■■□ 3.28
PPP4C-212ENST00000567828 ABCC5O15440 1437 aa35.51■■■■□ 3.28
PPP4C-212ENST00000567828 MROH1Q8NDA8 1641 aa35.51■■■■□ 3.28
PPP4C-212ENST00000567828 TCOF1Q13428 1488 aaKnown RBP35.51■■■■□ 3.28
PPP4C-212ENST00000567828 DUOX2Q9NRD8 1548 aa35.51■■■■□ 3.27
PPP4C-212ENST00000567828 A2ML1A8K2U0 1454 aa35.49■■■■□ 3.27
PPP4C-212ENST00000567828 FBXO31Q5XUX0 539 aaPredicted RBP35.49■■■■□ 3.27
PPP4C-212ENST00000567828 ABCC3O15438 1527 aa35.48■■■■□ 3.27
PPP4C-212ENST00000567828 DAPK1P53355 1430 aa35.48■■■■□ 3.27
PPP4C-212ENST00000567828 PLA2R1Q13018 1463 aa35.48■■■■□ 3.27
PPP4C-212ENST00000567828 TNRQ92752 1358 aa35.47■■■■□ 3.27
PPP4C-212ENST00000567828 CFAP65Q6ZU64 1925 aaKnown RBP35.45■■■■□ 3.27
PPP4C-212ENST00000567828 NCKAP5LQ9HCH0 1330 aa35.45■■■■□ 3.27
PPP4C-212ENST00000567828 KIF15Q9NS87 1388 aa35.44■■■■□ 3.26
PPP4C-212ENST00000567828 POLR1AO95602 1720 aaPredicted RBP35.42■■■■□ 3.26
PPP4C-212ENST00000567828 LTBP4Q8N2S1 1624 aa35.39■■■■□ 3.26
PPP4C-212ENST00000567828 RRP7BPQ9NSQ0 103 aa35.37■■■■□ 3.25
PPP4C-212ENST00000567828 ERBINQ96RT1 1412 aa35.37■■■■□ 3.25
PPP4C-212ENST00000567828 PRDM15P57071 1507 aaPredicted RBP35.36■■■■□ 3.25
PPP4C-212ENST00000567828 PKD2Q13563 968 aa35.35■■■■□ 3.25
PPP4C-212ENST00000567828 DEPDC5O75140 1603 aa35.34■■■■□ 3.25
PPP4C-212ENST00000567828 SPATA31D1Q6ZQQ2 1576 aa35.34■■■■□ 3.25
PPP4C-212ENST00000567828 NLRP1Q9C000 1473 aa35.32■■■■□ 3.24
PPP4C-212ENST00000567828 CHIC2Q9UKJ5 165 aa35.31■■■■□ 3.24
PPP4C-212ENST00000567828 ERVK-7P63135 1459 aa35.29■■■■□ 3.24
PPP4C-212ENST00000567828 NEURL4Q96JN8 1562 aa35.29■■■■□ 3.24
PPP4C-212ENST00000567828 UGGT1Q9NYU2 1555 aa35.29■■■■□ 3.24
PPP4C-212ENST00000567828 ANKRD30AQ9BXX3 1397 aa35.26■■■■□ 3.24
PPP4C-212ENST00000567828 FAM50AQ14320 339 aaKnown RBP35.24■■■■□ 3.23
PPP4C-212ENST00000567828 ZNF335Q9H4Z2 1342 aaPredicted RBP35.23■■■■□ 3.23
PPP4C-212ENST00000567828 DROSHAQ9NRR4 1374 aaKnown RBP eCLIP35.23■■■■□ 3.231e-10■■□□□ 12.5
PPP4C-212ENST00000567828 ADGRL2O95490 1459 aa35.22■■■■□ 3.23
PPP4C-212ENST00000567828 GRWD1Q9BQ67 446 aaKnown RBP eCLIP35.2■■■■□ 3.23
PPP4C-212ENST00000567828 UBR1Q8IWV7 1749 aa35.18■■■■□ 3.22
PPP4C-212ENST00000567828 IQSEC2Q5JU85 1478 aa35.18■■■■□ 3.22
PPP4C-212ENST00000567828 THEMISQ8N1K5 641 aaPredicted RBP35.17■■■■□ 3.22
PPP4C-212ENST00000567828 ARHGAP31Q2M1Z3 1444 aa35.15■■■■□ 3.22
PPP4C-212ENST00000567828 VWDEQ8N2E2 1590 aa35.15■■■■□ 3.22
PPP4C-212ENST00000567828 KANK1Q14678 1352 aa35.13■■■■□ 3.21
PPP4C-212ENST00000567828 ANKLE2Q86XL3 938 aa35.11■■■■□ 3.21
PPP4C-212ENST00000567828 IQGAP1P46940 1657 aa35.11■■■■□ 3.21
PPP4C-212ENST00000567828 LMTK2Q8IWU2 1503 aa35.1■■■■□ 3.21
PPP4C-212ENST00000567828 MED14O60244 1454 aa35.07■■■■□ 3.2
PPP4C-212ENST00000567828 PIK3C2BO00750 1634 aa35.06■■■■□ 3.2
PPP4C-212ENST00000567828 NPHP4O75161 1426 aaPredicted RBP35.06■■■■□ 3.2
PPP4C-212ENST00000567828 EFCAB6Q5THR3 1501 aa35.04■■■■□ 3.2
PPP4C-212ENST00000567828 PPARGC1BQ86YN6 1023 aaKnown RBP35.03■■■■□ 3.2
PPP4C-212ENST00000567828 ANKRD50Q9ULJ7 1429 aa35.03■■■■□ 3.2
PPP4C-212ENST00000567828 SYNMO15061 1565 aa35■■■■□ 3.19
PPP4C-212ENST00000567828 CPS1P31327 1500 aa34.96■■■■□ 3.19
PPP4C-212ENST00000567828 SLIT1O75093 1534 aa34.95■■■■□ 3.19
PPP4C-212ENST00000567828 UNC13BO14795 1591 aa34.95■■■■□ 3.18
PPP4C-212ENST00000567828 KDM5AP29375 1690 aaKnown RBP34.95■■■■□ 3.18
PPP4C-212ENST00000567828 STRCP1A6NGW2 1772 aa34.95■■■■□ 3.18
PPP4C-212ENST00000567828 ARHGAP23Q9P227 1491 aa34.94■■■■□ 3.18
PPP4C-212ENST00000567828 TET3O43151 1660 aa34.94■■■■□ 3.18
PPP4C-212ENST00000567828 GCC2Q8IWJ2 1684 aa34.93■■■■□ 3.18
PPP4C-212ENST00000567828 SCAF11Q99590 1463 aaKnown RBP34.93■■■■□ 3.18
PPP4C-212ENST00000567828 NOS1P29475 1434 aa34.89■■■■□ 3.18
PPP4C-212ENST00000567828 UBAP1LF5GYI3 381 aa34.89■■■■□ 3.18
PPP4C-212ENST00000567828 ROCK1Q13464 1354 aa34.88■■■■□ 3.17
PPP4C-212ENST00000567828 ITGAEP38570 1179 aa34.86■■■■□ 3.17
PPP4C-212ENST00000567828 MYO5BQ9ULV0 1848 aa34.85■■■■□ 3.17
PPP4C-212ENST00000567828 LTKP29376 864 aa34.85■■■■□ 3.17
PPP4C-212ENST00000567828 RPRD2Q5VT52 1461 aaKnown RBP34.84■■■■□ 3.17
PPP4C-212ENST00000567828 ADGRB3O60242 1522 aa34.83■■■■□ 3.17
PPP4C-212ENST00000567828 IDI1Q13907 227 aa34.83■■■■□ 3.17
PPP4C-212ENST00000567828 STAG3Q9UJ98 1225 aa34.83■■■■□ 3.17
PPP4C-212ENST00000567828 TXNDC2Q86VQ3 553 aa34.82■■■■□ 3.16
PPP4C-212ENST00000567828 E9PCH4 1651 aa34.82■■■■□ 3.16
PPP4C-212ENST00000567828 IQGAP3Q86VI3 1631 aa34.81■■■■□ 3.16
PPP4C-212ENST00000567828 TMEM2Q9UHN6 1383 aa34.81■■■■□ 3.16
PPP4C-212ENST00000567828 EID1Q9Y6B2 187 aa34.77■■■■□ 3.16
PPP4C-212ENST00000567828 LRRC7Q96NW7 1537 aa34.72■■■■□ 3.15
PPP4C-212ENST00000567828 SLC52A1Q9NWF4 448 aa34.71■■■■□ 3.15
PPP4C-212ENST00000567828 XIRP1Q702N8 1843 aaKnown RBP34.7■■■■□ 3.15
PPP4C-212ENST00000567828 RRBP1Q9P2E9 1410 aaKnown RBP34.7■■■■□ 3.15
PPP4C-212ENST00000567828 TMEM131LA2VDJ0 1609 aa34.68■■■■□ 3.14
PPP4C-212ENST00000567828 ALKQ9UM73 1620 aa34.68■■■■□ 3.14
PPP4C-212ENST00000567828 SCAF1Q9H7N4 1312 aaKnown RBP34.67■■■■□ 3.14
PPP4C-212ENST00000567828 TOM1O60784 492 aa34.65■■■■□ 3.14
PPP4C-212ENST00000567828 PIP4K2BP78356 416 aa34.65■■■■□ 3.14
PPP4C-212ENST00000567828 NUP155O75694 1391 aa34.64■■■■□ 3.14
PPP4C-212ENST00000567828 DISP3Q9P2K9 1392 aa34.61■■■■□ 3.13
PPP4C-212ENST00000567828 ZFYVE9O95405 1425 aa34.58■■■■□ 3.13
PPP4C-212ENST00000567828 SPHKAPQ2M3C7 1700 aa34.58■■■■□ 3.13
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 121.1 ms