RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000567642.1

PPP4C-211, Transcript of protein phosphatase 4 catalytic subunit, human

TSL 2

Gene PPP4C, Length 658 nt, Biotype retained intron, Subcellular localisation Cytosol, Ribosome .

RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	p-Value	Fold Change
PPP4C-211	ENST00000567642	KDM5D	Q9BY66	1539 aa		32.82	■■■□□ 2.84
PPP4C-211	ENST00000567642	PTPRT	O14522	1441 aa		32.8	■■■□□ 2.84
PPP4C-211	ENST00000567642	WASHC2C	Q9Y4E1	1318 aa		32.79	■■■□□ 2.84
PPP4C-211	ENST00000567642	CEP170B	Q9Y4F5	1589 aa	Predicted RBP	32.79	■■■□□ 2.84
PPP4C-211	ENST00000567642	PTPN23	Q9H3S7	1636 aa		32.78	■■■□□ 2.84
PPP4C-211	ENST00000567642	FAM135A	Q9P2D6	1515 aa		32.77	■■■□□ 2.84
PPP4C-211	ENST00000567642	CROCC2	H7BZ55	1655 aa		32.73	■■■□□ 2.83
PPP4C-211	ENST00000567642	RNF17	Q9BXT8	1623 aa	Known RBP	32.72	■■■□□ 2.83
PPP4C-211	ENST00000567642	EIF2AK4	Q9P2K8	1649 aa	Known RBP	32.72	■■■□□ 2.83
PPP4C-211	ENST00000567642	NCKAP5L	Q9HCH0	1330 aa		32.72	■■■□□ 2.83
PPP4C-211	ENST00000567642	FBXO31	Q5XUX0	539 aa	Predicted RBP	32.71	■■■□□ 2.83
PPP4C-211	ENST00000567642	PZP	P20742	1482 aa		32.71	■■■□□ 2.83
PPP4C-211	ENST00000567642	TNR	Q92752	1358 aa		32.69	■■■□□ 2.82
PPP4C-211	ENST00000567642	A2ML1	A8K2U0	1454 aa		32.68	■■■□□ 2.82
PPP4C-211	ENST00000567642	FGD6	Q6ZV73	1430 aa		32.67	■■■□□ 2.82
PPP4C-211	ENST00000567642	DUOX2	Q9NRD8	1548 aa		32.67	■■■□□ 2.82
PPP4C-211	ENST00000567642	DNMT1	P26358	1616 aa	Known RBP	32.66	■■■□□ 2.82
PPP4C-211	ENST00000567642	ABCC5	O15440	1437 aa		32.66	■■■□□ 2.82
PPP4C-211	ENST00000567642	PLA2R1	Q13018	1463 aa		32.66	■■■□□ 2.82
PPP4C-211	ENST00000567642	ZC3H13	Q5T200	1668 aa	Known RBP	32.66	■■■□□ 2.82
PPP4C-211	ENST00000567642	SHANK2	Q9UPX8	1470 aa		32.63	■■■□□ 2.81
PPP4C-211	ENST00000567642	PKD2	Q13563	968 aa		32.63	■■■□□ 2.81
PPP4C-211	ENST00000567642	CFAP65	Q6ZU64	1925 aa	Known RBP	32.63	■■■□□ 2.81
PPP4C-211	ENST00000567642	CEP152	O94986	1710 aa		32.63	■■■□□ 2.81
PPP4C-211	ENST00000567642	ABCC3	O15438	1527 aa		32.61	■■■□□ 2.81
PPP4C-211	ENST00000567642	TCOF1	Q13428	1488 aa	Known RBP	32.61	■■■□□ 2.81
PPP4C-211	ENST00000567642	DAPK1	P53355	1430 aa		32.61	■■■□□ 2.81
PPP4C-211	ENST00000567642	KIF15	Q9NS87	1388 aa		32.61	■■■□□ 2.81
PPP4C-211	ENST00000567642	RRP7BP	Q9NSQ0	103 aa		32.61	■■■□□ 2.81
PPP4C-211	ENST00000567642	MROH1	Q8NDA8	1641 aa		32.59	■■■□□ 2.81
PPP4C-211	ENST00000567642	LTBP4	Q8N2S1	1624 aa		32.58	■■■□□ 2.81
PPP4C-211	ENST00000567642	POLR1A	O95602	1720 aa	Predicted RBP	32.56	■■■□□ 2.8
PPP4C-211	ENST00000567642	CHIC2	Q9UKJ5	165 aa		32.54	■■■□□ 2.8
PPP4C-211	ENST00000567642	ERBIN	Q96RT1	1412 aa		32.52	■■■□□ 2.8
PPP4C-211	ENST00000567642	NLRP1	Q9C000	1473 aa		32.52	■■■□□ 2.8
PPP4C-211	ENST00000567642	ZNF335	Q9H4Z2	1342 aa	Predicted RBP	32.5	■■■□□ 2.79
PPP4C-211	ENST00000567642	UGGT1	Q9NYU2	1555 aa		32.49	■■■□□ 2.79
PPP4C-211	ENST00000567642	FAM50A	Q14320	339 aa	Known RBP	32.49	■■■□□ 2.79
PPP4C-211	ENST00000567642	SPATA31D1	Q6ZQQ2	1576 aa		32.49	■■■□□ 2.79
PPP4C-211	ENST00000567642	ANKRD30A	Q9BXX3	1397 aa		32.48	■■■□□ 2.79
PPP4C-211	ENST00000567642	GRWD1	Q9BQ67	446 aa	Known RBP eCLIP	32.48	■■■□□ 2.79
PPP4C-211	ENST00000567642	THEMIS	Q8N1K5	641 aa	Predicted RBP	32.47	■■■□□ 2.79
PPP4C-211	ENST00000567642	ERVK-7	P63135	1459 aa		32.47	■■■□□ 2.79
PPP4C-211	ENST00000567642	PRDM15	P57071	1507 aa	Predicted RBP	32.46	■■■□□ 2.79
PPP4C-211	ENST00000567642	DROSHA	Q9NRR4	1374 aa	Known RBP eCLIP	32.46	■■■□□ 2.79	1e-10	■■□□□ 12.5
PPP4C-211	ENST00000567642	DEPDC5	O75140	1603 aa		32.44	■■■□□ 2.78
PPP4C-211	ENST00000567642	NEURL4	Q96JN8	1562 aa		32.43	■■■□□ 2.78
PPP4C-211	ENST00000567642	ANKLE2	Q86XL3	938 aa		32.42	■■■□□ 2.78
PPP4C-211	ENST00000567642	IQSEC2	Q5JU85	1478 aa		32.42	■■■□□ 2.78
PPP4C-211	ENST00000567642	KANK1	Q14678	1352 aa		32.4	■■■□□ 2.78
PPP4C-211	ENST00000567642	ADGRL2	O95490	1459 aa		32.35	■■■□□ 2.77
PPP4C-211	ENST00000567642	ARHGAP31	Q2M1Z3	1444 aa		32.34	■■■□□ 2.77
PPP4C-211	ENST00000567642	UBR1	Q8IWV7	1749 aa		32.34	■■■□□ 2.77
PPP4C-211	ENST00000567642	NPHP4	O75161	1426 aa	Predicted RBP	32.3	■■■□□ 2.76
PPP4C-211	ENST00000567642	IQGAP1	P46940	1657 aa		32.3	■■■□□ 2.76
PPP4C-211	ENST00000567642	PPARGC1B	Q86YN6	1023 aa	Known RBP	32.27	■■■□□ 2.76
PPP4C-211	ENST00000567642	MED14	O60244	1454 aa		32.27	■■■□□ 2.76
PPP4C-211	ENST00000567642	VWDE	Q8N2E2	1590 aa		32.26	■■■□□ 2.75
PPP4C-211	ENST00000567642	UBAP1L	F5GYI3	381 aa		32.25	■■■□□ 2.75
PPP4C-211	ENST00000567642	LMTK2	Q8IWU2	1503 aa		32.25	■■■□□ 2.75
PPP4C-211	ENST00000567642	ANKRD50	Q9ULJ7	1429 aa		32.24	■■■□□ 2.75
PPP4C-211	ENST00000567642	PIK3C2B	O00750	1634 aa		32.23	■■■□□ 2.75
PPP4C-211	ENST00000567642	CPS1	P31327	1500 aa		32.21	■■■□□ 2.75
PPP4C-211	ENST00000567642	STAG3	Q9UJ98	1225 aa		32.19	■■■□□ 2.74
PPP4C-211	ENST00000567642	EFCAB6	Q5THR3	1501 aa		32.19	■■■□□ 2.74
PPP4C-211	ENST00000567642	SCAF11	Q99590	1463 aa	Known RBP	32.16	■■■□□ 2.74
PPP4C-211	ENST00000567642	TXNDC2	Q86VQ3	553 aa		32.15	■■■□□ 2.74
PPP4C-211	ENST00000567642	ITGAE	P38570	1179 aa		32.14	■■■□□ 2.74
PPP4C-211	ENST00000567642	SLIT1	O75093	1534 aa		32.14	■■■□□ 2.74
PPP4C-211	ENST00000567642	SYNM	O15061	1565 aa		32.14	■■■□□ 2.74
PPP4C-211	ENST00000567642	ARHGAP23	Q9P227	1491 aa		32.13	■■■□□ 2.73
PPP4C-211	ENST00000567642	LTK	P29376	864 aa		32.12	■■■□□ 2.73
PPP4C-211	ENST00000567642	IDI1	Q13907	227 aa		32.12	■■■□□ 2.73
PPP4C-211	ENST00000567642	EID1	Q9Y6B2	187 aa		32.12	■■■□□ 2.73
PPP4C-211	ENST00000567642	STRCP1	A6NGW2	1772 aa		32.12	■■■□□ 2.73
PPP4C-211	ENST00000567642	KDM5A	P29375	1690 aa	Known RBP	32.11	■■■□□ 2.73
PPP4C-211	ENST00000567642	TET3	O43151	1660 aa		32.1	■■■□□ 2.73
PPP4C-211	ENST00000567642	NOS1	P29475	1434 aa		32.09	■■■□□ 2.73
PPP4C-211	ENST00000567642	GCC2	Q8IWJ2	1684 aa		32.08	■■■□□ 2.73
PPP4C-211	ENST00000567642	ROCK1	Q13464	1354 aa		32.08	■■■□□ 2.73
PPP4C-211	ENST00000567642	UNC13B	O14795	1591 aa		32.08	■■■□□ 2.73
PPP4C-211	ENST00000567642	SCAF1	Q9H7N4	1312 aa	Known RBP	32.07	■■■□□ 2.72
PPP4C-211	ENST00000567642	TMEM2	Q9UHN6	1383 aa		32.07	■■■□□ 2.72
PPP4C-211	ENST00000567642	RPRD2	Q5VT52	1461 aa	Known RBP	32.04	■■■□□ 2.72
PPP4C-211	ENST00000567642	TOM1	O60784	492 aa		32.04	■■■□□ 2.72
PPP4C-211	ENST00000567642	ADGRB3	O60242	1522 aa		32.02	■■■□□ 2.72
PPP4C-211	ENST00000567642	PIP4K2B	P78356	416 aa		32.02	■■■□□ 2.72
PPP4C-211	ENST00000567642	SLC52A1	Q9NWF4	448 aa		32.02	■■■□□ 2.72
PPP4C-211	ENST00000567642	MYO5B	Q9ULV0	1848 aa		32.02	■■■□□ 2.72
PPP4C-211	ENST00000567642	DISP3	Q9P2K9	1392 aa		32	■■■□□ 2.71
PPP4C-211	ENST00000567642		E9PCH4	1651 aa		31.98	■■■□□ 2.71
PPP4C-211	ENST00000567642	LRRC7	Q96NW7	1537 aa		31.97	■■■□□ 2.71
PPP4C-211	ENST00000567642	IQGAP3	Q86VI3	1631 aa		31.97	■■■□□ 2.71
PPP4C-211	ENST00000567642	NUP155	O75694	1391 aa		31.92	■■■□□ 2.7
PPP4C-211	ENST00000567642	BCAN	Q96GW7	911 aa		31.9	■■■□□ 2.7
PPP4C-211	ENST00000567642	CHGA	P10645	457 aa	Known RBP	31.88	■■■□□ 2.69
PPP4C-211	ENST00000567642	XIRP1	Q702N8	1843 aa	Known RBP	31.88	■■■□□ 2.69
PPP4C-211	ENST00000567642	TMEM131L	A2VDJ0	1609 aa		31.87	■■■□□ 2.69
PPP4C-211	ENST00000567642	SLC26A8	Q96RN1	970 aa		31.87	■■■□□ 2.69
PPP4C-211	ENST00000567642	ALK	Q9UM73	1620 aa		31.86	■■■□□ 2.69

Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 138.7 ms