RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000551441.5

CS-227, Transcript of citrate synthase, humanhuman

TSL 3

Gene CS, Length 636 nt, Biotype retained intron, Subcellular localisation Cytosol .

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CS-227ENST00000551441 A2ML1A8K2U0 1454 aa25.92■■□□□ 1.74
CS-227ENST00000551441 SCAF1Q9H7N4 1312 aaKnown RBP25.92■■□□□ 1.74
CS-227ENST00000551441 CEP162Q5TB80 1403 aa25.89■■□□□ 1.74
CS-227ENST00000551441 RTEL1-TNFRSF6BF6WH68 1400 aa25.88■■□□□ 1.73
CS-227ENST00000551441 TNRQ92752 1358 aa25.88■■□□□ 1.73
CS-227ENST00000551441 PIP4K2BP78356 416 aa25.88■■□□□ 1.73
CS-227ENST00000551441 CAMSAP2Q08AD1 1489 aa25.85■■□□□ 1.73
CS-227ENST00000551441 POLR1AO95602 1720 aaPredicted RBP25.85■■□□□ 1.73
CS-227ENST00000551441 WASHC2CQ9Y4E1 1318 aa25.85■■□□□ 1.73
CS-227ENST00000551441 CCDC141Q6ZP82 1450 aa25.85■■□□□ 1.73
CS-227ENST00000551441 NCOA2Q15596 1464 aa25.84■■□□□ 1.73
CS-227ENST00000551441 NEURL4Q96JN8 1562 aa25.83■■□□□ 1.73
CS-227ENST00000551441 DROSHAQ9NRR4 1374 aaKnown RBP eCLIP25.82■■□□□ 1.72
CS-227ENST00000551441 KDM5DQ9BY66 1539 aa25.82■■□□□ 1.72
CS-227ENST00000551441 HSPA1LP34931 641 aa25.81■■□□□ 1.72
CS-227ENST00000551441 PZPP20742 1482 aa25.8■■□□□ 1.72
CS-227ENST00000551441 SHANK2Q9UPX8 1470 aa25.78■■□□□ 1.72
CS-227ENST00000551441 ANKLE2Q86XL3 938 aa25.76■■□□□ 1.71
CS-227ENST00000551441 MIA2Q96PC5 1412 aa25.74■■□□□ 1.71
CS-227ENST00000551441 TSPY4P0CV99 314 aa25.74■■□□□ 1.71
CS-227ENST00000551441 TSPY10P0CW01 314 aa25.74■■□□□ 1.71
CS-227ENST00000551441 TOM1O60784 492 aa25.73■■□□□ 1.71
CS-227ENST00000551441 THEMISQ8N1K5 641 aaPredicted RBP25.73■■□□□ 1.71
CS-227ENST00000551441 CPS1P31327 1500 aa25.73■■□□□ 1.71
CS-227ENST00000551441 RSPH4AQ5TD94 716 aa25.72■■□□□ 1.71
CS-227ENST00000551441 UGGT1Q9NYU2 1555 aa25.72■■□□□ 1.71
CS-227ENST00000551441 VWDEQ8N2E2 1590 aa25.71■■□□□ 1.71
CS-227ENST00000551441 NPHP4O75161 1426 aaPredicted RBP25.7■■□□□ 1.7
CS-227ENST00000551441 ARHGEF5Q12774 1597 aa25.69■■□□□ 1.7
CS-227ENST00000551441 CFAP65Q6ZU64 1925 aaKnown RBP25.69■■□□□ 1.7
CS-227ENST00000551441 MED1Q15648 1581 aaPredicted RBP25.68■■□□□ 1.7
CS-227ENST00000551441 FAM135AQ9P2D6 1515 aa25.68■■□□□ 1.7
CS-227ENST00000551441 NLRP1Q9C000 1473 aa25.67■■□□□ 1.7
CS-227ENST00000551441 ABCC3O15438 1527 aa25.63■■□□□ 1.69
CS-227ENST00000551441 IQGAP1P46940 1657 aa25.63■■□□□ 1.69
CS-227ENST00000551441 STRCP1A6NGW2 1772 aa25.63■■□□□ 1.69
CS-227ENST00000551441 ALKQ9UM73 1620 aa25.63■■□□□ 1.69
CS-227ENST00000551441 LRRC9Q6ZRR7 1453 aa25.62■■□□□ 1.69
CS-227ENST00000551441 LOC105371045A0A1W2PR82 267 aa25.62■■□□□ 1.69
CS-227ENST00000551441 KANK4Q5T7N3 995 aaPredicted RBP25.62■■□□□ 1.69
CS-227ENST00000551441 DEPDC5O75140 1603 aa25.62■■□□□ 1.69
CS-227ENST00000551441 MED14O60244 1454 aa25.61■■□□□ 1.69
CS-227ENST00000551441 CEP152O94986 1710 aa25.61■■□□□ 1.69
CS-227ENST00000551441 RNF17Q9BXT8 1623 aaKnown RBP25.61■■□□□ 1.69
CS-227ENST00000551441 ERVK-7P63135 1459 aa25.58■■□□□ 1.69
CS-227ENST00000551441 MAST1Q9Y2H9 1570 aa25.57■■□□□ 1.68
CS-227ENST00000551441 MROH1Q8NDA8 1641 aa25.56■■□□□ 1.68
CS-227ENST00000551441 ZC3H13Q5T200 1668 aaKnown RBP25.56■■□□□ 1.68
CS-227ENST00000551441 VPS8Q8N3P4 1428 aa25.55■■□□□ 1.68
CS-227ENST00000551441 LRRC7Q96NW7 1537 aa25.55■■□□□ 1.68
CS-227ENST00000551441 EIF2AK4Q9P2K8 1649 aaKnown RBP25.52■■□□□ 1.68
CS-227ENST00000551441 UBR1Q8IWV7 1749 aa25.52■■□□□ 1.68
CS-227ENST00000551441 LTKP29376 864 aa25.5■■□□□ 1.67
CS-227ENST00000551441 GRWD1Q9BQ67 446 aaKnown RBP eCLIP25.5■■□□□ 1.676e-9■□□□□ 10
CS-227ENST00000551441 MYOM3Q5VTT5 1437 aa25.49■■□□□ 1.67
CS-227ENST00000551441 TXNDC2Q86VQ3 553 aa25.48■■□□□ 1.67
CS-227ENST00000551441 RRP7BPQ9NSQ0 103 aa25.48■■□□□ 1.67
CS-227ENST00000551441 DUOX2Q9NRD8 1548 aa25.46■■□□□ 1.67
CS-227ENST00000551441 SCAF11Q99590 1463 aaKnown RBP25.46■■□□□ 1.67
CS-227ENST00000551441 SYNMO15061 1565 aa25.44■■□□□ 1.66
CS-227ENST00000551441 KIF15Q9NS87 1388 aa25.44■■□□□ 1.66
CS-227ENST00000551441 XIRP1Q702N8 1843 aaKnown RBP25.4■■□□□ 1.66
CS-227ENST00000551441 ABCC5O15440 1437 aa25.39■■□□□ 1.66
CS-227ENST00000551441 PIK3C2BO00750 1634 aa25.39■■□□□ 1.66
CS-227ENST00000551441 STAG3Q9UJ98 1225 aa25.39■■□□□ 1.66
CS-227ENST00000551441 CHIC2Q9UKJ5 165 aa25.38■■□□□ 1.65
CS-227ENST00000551441 ARHGAP23Q9P227 1491 aa25.38■■□□□ 1.65
CS-227ENST00000551441 SLIT1O75093 1534 aa25.37■■□□□ 1.65
CS-227ENST00000551441 CROCC2H7BZ55 1655 aa25.37■■□□□ 1.65
CS-227ENST00000551441 EID1Q9Y6B2 187 aa25.37■■□□□ 1.65
CS-227ENST00000551441 PRDM15P57071 1507 aaPredicted RBP25.37■■□□□ 1.65
CS-227ENST00000551441 MAP3K1Q13233 1512 aa25.37■■□□□ 1.65
CS-227ENST00000551441 RBM33Q96EV2 1170 aaKnown RBP25.36■■□□□ 1.65
CS-227ENST00000551441 PTPN23Q9H3S7 1636 aa25.36■■□□□ 1.65
CS-227ENST00000551441 ARHGAP31Q2M1Z3 1444 aa25.34■■□□□ 1.65
CS-227ENST00000551441 ERBINQ96RT1 1412 aa25.33■■□□□ 1.65
CS-227ENST00000551441 DAPK1P53355 1430 aa25.31■■□□□ 1.64
CS-227ENST00000551441 SLC26A8Q96RN1 970 aa25.31■■□□□ 1.64
CS-227ENST00000551441 RGS17Q9UGC6 210 aaPredicted RBP25.31■■□□□ 1.64
CS-227ENST00000551441 TMEM2Q9UHN6 1383 aa25.31■■□□□ 1.64
CS-227ENST00000551441 IDI1Q13907 227 aa25.3■■□□□ 1.64
CS-227ENST00000551441 KANK1Q14678 1352 aa25.3■■□□□ 1.64
CS-227ENST00000551441 APLP2Q06481 763 aa25.28■■□□□ 1.64
CS-227ENST00000551441 TMEM94Q12767 1356 aa25.27■■□□□ 1.64
CS-227ENST00000551441 EFCAB6Q5THR3 1501 aa25.26■■□□□ 1.63
CS-227ENST00000551441 PROSER2Q86WR7 435 aaPredicted RBP25.24■■□□□ 1.63
CS-227ENST00000551441 BCANQ96GW7 911 aa25.24■■□□□ 1.63
CS-227ENST00000551441 FGD6Q6ZV73 1430 aa25.23■■□□□ 1.63
CS-227ENST00000551441 KCNA6P17658 529 aa25.22■■□□□ 1.63
CS-227ENST00000551441 ANKRD30AQ9BXX3 1397 aa25.21■■□□□ 1.63
CS-227ENST00000551441 FAM135BQ49AJ0 1406 aa25.2■■□□□ 1.62
CS-227ENST00000551441 ROBO1Q9Y6N7 1651 aa25.2■■□□□ 1.62
CS-227ENST00000551441 TET3O43151 1660 aa25.19■■□□□ 1.62
CS-227ENST00000551441 LMTK2Q8IWU2 1503 aa25.18■■□□□ 1.62
CS-227ENST00000551441 POTEAQ6S8J7 498 aa25.18■■□□□ 1.62
CS-227ENST00000551441 NOS1P29475 1434 aa25.15■■□□□ 1.62
CS-227ENST00000551441 KDM5AP29375 1690 aaKnown RBP25.15■■□□□ 1.62
CS-227ENST00000551441 ADGRB3O60242 1522 aa25.15■■□□□ 1.62
CS-227ENST00000551441 FAM50AQ14320 339 aaKnown RBP25.14■■□□□ 1.62
CS-227ENST00000551441 MYO5BQ9ULV0 1848 aa25.14■■□□□ 1.61
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 109.1 ms