RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000538663.5

ARMC6-211, Transcript of armadillo repeat containing 6, humanhuman

TSL 4

Gene ARMC6, Length 552 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Ribosome .

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ARMC6-211ENST00000538663 KDM5DQ9BY66 1539 aa36.91■■■■□ 3.5
ARMC6-211ENST00000538663 PLA2R1Q13018 1463 aa36.91■■■■□ 3.5
ARMC6-211ENST00000538663 FAM135AQ9P2D6 1515 aa36.89■■■■□ 3.5
ARMC6-211ENST00000538663 MYOM3Q5VTT5 1437 aa36.86■■■■□ 3.49
ARMC6-211ENST00000538663 FBXO31Q5XUX0 539 aaPredicted RBP36.86■■■■□ 3.49
ARMC6-211ENST00000538663 A2ML1A8K2U0 1454 aa36.86■■■■□ 3.49
ARMC6-211ENST00000538663 TCOF1Q13428 1488 aaKnown RBP36.86■■■■□ 3.49
ARMC6-211ENST00000538663 WASHC2CQ9Y4E1 1318 aa36.85■■■■□ 3.49
ARMC6-211ENST00000538663 MAST1Q9Y2H9 1570 aa36.85■■■■□ 3.49
ARMC6-211ENST00000538663 PZPP20742 1482 aa36.84■■■■□ 3.49
ARMC6-211ENST00000538663 PKD2Q13563 968 aa36.84■■■■□ 3.49
ARMC6-211ENST00000538663 MIA2Q96PC5 1412 aa36.84■■■■□ 3.49
ARMC6-211ENST00000538663 DNMT1P26358 1616 aaKnown RBP36.82■■■■□ 3.49
ARMC6-211ENST00000538663 TNRQ92752 1358 aa36.82■■■■□ 3.49
ARMC6-211ENST00000538663 ZNF335Q9H4Z2 1342 aaPredicted RBP36.77■■■■□ 3.48
ARMC6-211ENST00000538663 RNF17Q9BXT8 1623 aaKnown RBP36.76■■■■□ 3.48
ARMC6-211ENST00000538663 IQSEC2Q5JU85 1478 aa36.75■■■■□ 3.47
ARMC6-211ENST00000538663 EIF2AK4Q9P2K8 1649 aaKnown RBP36.7■■■■□ 3.47
ARMC6-211ENST00000538663 ABCC3O15438 1527 aa36.69■■■■□ 3.46
ARMC6-211ENST00000538663 APLP2Q06481 763 aa36.68■■■■□ 3.46
ARMC6-211ENST00000538663 ZC3H13Q5T200 1668 aaKnown RBP36.65■■■■□ 3.46
ARMC6-211ENST00000538663 MROH1Q8NDA8 1641 aa36.65■■■■□ 3.46
ARMC6-211ENST00000538663 POLR1AO95602 1720 aaPredicted RBP36.65■■■■□ 3.46
ARMC6-211ENST00000538663 NLRP1Q9C000 1473 aa36.64■■■■□ 3.46
ARMC6-211ENST00000538663 DUOX2Q9NRD8 1548 aa36.63■■■■□ 3.45
ARMC6-211ENST00000538663 PTPN23Q9H3S7 1636 aa36.63■■■■□ 3.45
ARMC6-211ENST00000538663 NEURL4Q96JN8 1562 aa36.62■■■■□ 3.45
ARMC6-211ENST00000538663 CROCC2H7BZ55 1655 aa36.61■■■■□ 3.45
ARMC6-211ENST00000538663 ABCC5O15440 1437 aa36.6■■■■□ 3.45
ARMC6-211ENST00000538663 DROSHAQ9NRR4 1374 aaKnown RBP eCLIP36.6■■■■□ 3.45
ARMC6-211ENST00000538663 UGGT1Q9NYU2 1555 aa36.59■■■■□ 3.45
ARMC6-211ENST00000538663 SHANK2Q9UPX8 1470 aa36.59■■■■□ 3.45
ARMC6-211ENST00000538663 KIF15Q9NS87 1388 aa36.57■■■■□ 3.45
ARMC6-211ENST00000538663 THEMISQ8N1K5 641 aaPredicted RBP36.57■■■■□ 3.44
ARMC6-211ENST00000538663 SPATA31D1Q6ZQQ2 1576 aa36.57■■■■□ 3.44
ARMC6-211ENST00000538663 CEP152O94986 1710 aa36.56■■■■□ 3.44
ARMC6-211ENST00000538663 FGD6Q6ZV73 1430 aa36.54■■■■□ 3.44
ARMC6-211ENST00000538663 ERVK-7P63135 1459 aa36.54■■■■□ 3.44
ARMC6-211ENST00000538663 ANKLE2Q86XL3 938 aa36.53■■■■□ 3.44
ARMC6-211ENST00000538663 RRP7BPQ9NSQ0 103 aa36.53■■■■□ 3.44
ARMC6-211ENST00000538663 DAPK1P53355 1430 aa36.52■■■■□ 3.44
ARMC6-211ENST00000538663 ERBINQ96RT1 1412 aa36.5■■■■□ 3.43
ARMC6-211ENST00000538663 UBAP1LF5GYI3 381 aa36.49■■■■□ 3.43
ARMC6-211ENST00000538663 PRDM15P57071 1507 aaPredicted RBP36.48■■■■□ 3.43
ARMC6-211ENST00000538663 DEPDC5O75140 1603 aa36.47■■■■□ 3.43
ARMC6-211ENST00000538663 CFAP65Q6ZU64 1925 aaKnown RBP36.45■■■■□ 3.43
ARMC6-211ENST00000538663 MED14O60244 1454 aa36.44■■■■□ 3.42
ARMC6-211ENST00000538663 NPHP4O75161 1426 aaPredicted RBP36.44■■■■□ 3.42
ARMC6-211ENST00000538663 DISP3Q9P2K9 1392 aa36.42■■■■□ 3.42
ARMC6-211ENST00000538663 CPS1P31327 1500 aa36.41■■■■□ 3.42
ARMC6-211ENST00000538663 CHIC2Q9UKJ5 165 aa36.4■■■■□ 3.42
ARMC6-211ENST00000538663 VWDEQ8N2E2 1590 aa36.4■■■■□ 3.42
ARMC6-211ENST00000538663 GRWD1Q9BQ67 446 aaKnown RBP eCLIP36.39■■■■□ 3.42
ARMC6-211ENST00000538663 ARHGAP31Q2M1Z3 1444 aa36.39■■■■□ 3.42
ARMC6-211ENST00000538663 IQGAP1P46940 1657 aa36.37■■■■□ 3.41
ARMC6-211ENST00000538663 ANKRD30AQ9BXX3 1397 aa36.37■■■■□ 3.41
ARMC6-211ENST00000538663 UBR1Q8IWV7 1749 aa36.36■■■■□ 3.41
ARMC6-211ENST00000538663 KANK1Q14678 1352 aa36.31■■■■□ 3.4
ARMC6-211ENST00000538663 FAM50AQ14320 339 aaKnown RBP36.25■■■■□ 3.39
ARMC6-211ENST00000538663 ILDR2Q71H61 639 aa36.25■■■■□ 3.39
ARMC6-211ENST00000538663 ADGRL2O95490 1459 aa36.24■■■■□ 3.39
ARMC6-211ENST00000538663 SCAF11Q99590 1463 aaKnown RBP36.24■■■■□ 3.39
ARMC6-211ENST00000538663 LMTK2Q8IWU2 1503 aa36.24■■■■□ 3.39
ARMC6-211ENST00000538663 ARHGAP23Q9P227 1491 aa36.23■■■■□ 3.39
ARMC6-211ENST00000538663 SCAF1Q9H7N4 1312 aaKnown RBP36.22■■■■□ 3.39
ARMC6-211ENST00000538663 SLIT1O75093 1534 aa36.22■■■■□ 3.39
ARMC6-211ENST00000538663 STRCP1A6NGW2 1772 aa36.22■■■■□ 3.39
ARMC6-211ENST00000538663 PIK3C2BO00750 1634 aa36.21■■■■□ 3.39
ARMC6-211ENST00000538663 TOM1O60784 492 aa36.21■■■■□ 3.39
ARMC6-211ENST00000538663 PIP4K2BP78356 416 aa36.21■■■■□ 3.39
ARMC6-211ENST00000538663 LTKP29376 864 aa36.2■■■■□ 3.39
ARMC6-211ENST00000538663 TXNDC2Q86VQ3 553 aa36.18■■■■□ 3.38
ARMC6-211ENST00000538663 EFCAB6Q5THR3 1501 aa36.14■■■■□ 3.38
ARMC6-211ENST00000538663 LRRC7Q96NW7 1537 aa36.13■■■■□ 3.38
ARMC6-211ENST00000538663 SYNMO15061 1565 aa36.13■■■■□ 3.37
ARMC6-211ENST00000538663 ALKQ9UM73 1620 aa36.12■■■■□ 3.37
ARMC6-211ENST00000538663 HSPA1LP34931 641 aa36.12■■■■□ 3.37
ARMC6-211ENST00000538663 IDI1Q13907 227 aa36.11■■■■□ 3.37
ARMC6-211ENST00000538663 STAG3Q9UJ98 1225 aa36.11■■■■□ 3.37
ARMC6-211ENST00000538663 EID1Q9Y6B2 187 aa36.11■■■■□ 3.37
ARMC6-211ENST00000538663 TMEM2Q9UHN6 1383 aa36.11■■■■□ 3.37
ARMC6-211ENST00000538663 ANKRD50Q9ULJ7 1429 aa36.1■■■■□ 3.37
ARMC6-211ENST00000538663 NOS1P29475 1434 aa36.08■■■■□ 3.37
ARMC6-211ENST00000538663 KDM5AP29375 1690 aaKnown RBP36.07■■■■□ 3.37
ARMC6-211ENST00000538663 ADGRB3O60242 1522 aa35.99■■■■□ 3.35
ARMC6-211ENST00000538663 RPRD2Q5VT52 1461 aaKnown RBP35.98■■■■□ 3.35
ARMC6-211ENST00000538663 SOCS7O14512 581 aa35.97■■■■□ 3.35
ARMC6-211ENST00000538663 SLC52A1Q9NWF4 448 aa35.96■■■■□ 3.35
ARMC6-211ENST00000538663 TET3O43151 1660 aa35.95■■■■□ 3.35
ARMC6-211ENST00000538663 UNC13BO14795 1591 aa35.93■■■■□ 3.34
ARMC6-211ENST00000538663 XIRP1Q702N8 1843 aaKnown RBP35.92■■■■□ 3.34
ARMC6-211ENST00000538663 ROCK1Q13464 1354 aa35.9■■■■□ 3.34
ARMC6-211ENST00000538663 MED1Q15648 1581 aaPredicted RBP35.89■■■■□ 3.34
ARMC6-211ENST00000538663 GCC2Q8IWJ2 1684 aa35.88■■■■□ 3.33
ARMC6-211ENST00000538663 SLC26A8Q96RN1 970 aa35.88■■■■□ 3.33
ARMC6-211ENST00000538663 PPARGC1BQ86YN6 1023 aaKnown RBP35.86■■■■□ 3.33
ARMC6-211ENST00000538663 SENP3Q9H4L4 574 aaPredicted RBP35.86■■■■□ 3.33
ARMC6-211ENST00000538663 MYO5BQ9ULV0 1848 aa35.83■■■■□ 3.33
ARMC6-211ENST00000538663 KCNA6P17658 529 aa35.82■■■■□ 3.32
ARMC6-211ENST00000538663 ITGAEP38570 1179 aa35.82■■■■□ 3.32
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 42.7 ms