RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000531995.1

PUF60-218, Transcript of poly(U) binding splicing factor 60, humanhuman

TSL 3

Gene PUF60, Length 631 nt, Biotype retained intron, Subcellular localisation Cytosol, Ribosome .

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PUF60-218ENST00000531995 TCOF1Q13428 1488 aaKnown RBP29.01■■■□□ 2.23
PUF60-218ENST00000531995 POLR1AO95602 1720 aaPredicted RBP29■■■□□ 2.23
PUF60-218ENST00000531995 KIF3BO15066 747 aa29■■■□□ 2.23
PUF60-218ENST00000531995 A2ML1A8K2U0 1454 aa28.99■■■□□ 2.23
PUF60-218ENST00000531995 MAST1Q9Y2H9 1570 aa28.98■■■□□ 2.23
PUF60-218ENST00000531995 PPP6R1Q9UPN7 881 aa28.98■■■□□ 2.23
PUF60-218ENST00000531995 PZPP20742 1482 aa28.97■■■□□ 2.23
PUF60-218ENST00000531995 RNF17Q9BXT8 1623 aaKnown RBP28.97■■■□□ 2.23
PUF60-218ENST00000531995 IQSEC2Q5JU85 1478 aa28.94■■■□□ 2.22
PUF60-218ENST00000531995 ZNF335Q9H4Z2 1342 aaPredicted RBP28.94■■■□□ 2.22
PUF60-218ENST00000531995 TNRQ92752 1358 aa28.93■■■□□ 2.22
PUF60-218ENST00000531995 MYOM3Q5VTT5 1437 aa28.92■■■□□ 2.22
PUF60-218ENST00000531995 ZC3H13Q5T200 1668 aaKnown RBP28.92■■■□□ 2.22
PUF60-218ENST00000531995 EIF2AK4Q9P2K8 1649 aaKnown RBP28.91■■■□□ 2.22
PUF60-218ENST00000531995 RSPH4AQ5TD94 716 aa28.91■■■□□ 2.22
PUF60-218ENST00000531995 FBXO31Q5XUX0 539 aaPredicted RBP28.91■■■□□ 2.22
PUF60-218ENST00000531995 NEURL4Q96JN8 1562 aa28.91■■■□□ 2.22
PUF60-218ENST00000531995 CROCC2H7BZ55 1655 aa28.9■■■□□ 2.22
PUF60-218ENST00000531995 CEP152O94986 1710 aa28.89■■■□□ 2.22
PUF60-218ENST00000531995 PKD2Q13563 968 aa28.89■■■□□ 2.22
PUF60-218ENST00000531995 MROH1Q8NDA8 1641 aa28.88■■■□□ 2.21
PUF60-218ENST00000531995 TSPY4P0CV99 314 aa28.88■■■□□ 2.21
PUF60-218ENST00000531995 TSPY10P0CW01 314 aa28.88■■■□□ 2.21
PUF60-218ENST00000531995 ABCC3O15438 1527 aa28.88■■■□□ 2.21
PUF60-218ENST00000531995 WASHC2CQ9Y4E1 1318 aa28.88■■■□□ 2.21
PUF60-218ENST00000531995 PPARGC1BQ86YN6 1023 aaKnown RBP28.87■■■□□ 2.21
PUF60-218ENST00000531995 MIA2Q96PC5 1412 aa28.85■■■□□ 2.21
PUF60-218ENST00000531995 SPATA31D1Q6ZQQ2 1576 aa28.82■■■□□ 2.2
PUF60-218ENST00000531995 PTPN23Q9H3S7 1636 aa28.81■■■□□ 2.2
PUF60-218ENST00000531995 UGGT1Q9NYU2 1555 aa28.8■■■□□ 2.2
PUF60-218ENST00000531995 NLRP1Q9C000 1473 aa28.79■■■□□ 2.2
PUF60-218ENST00000531995 DUOX2Q9NRD8 1548 aa28.78■■■□□ 2.2
PUF60-218ENST00000531995 DROSHAQ9NRR4 1374 aaKnown RBP eCLIP28.76■■■□□ 2.2
PUF60-218ENST00000531995 DISP3Q9P2K9 1392 aa28.76■■■□□ 2.2
PUF60-218ENST00000531995 CFAP65Q6ZU64 1925 aaKnown RBP28.75■■■□□ 2.19
PUF60-218ENST00000531995 SHANK2Q9UPX8 1470 aa28.75■■■□□ 2.19
PUF60-218ENST00000531995 ERVK-7P63135 1459 aa28.74■■■□□ 2.19
PUF60-218ENST00000531995 PRDM15P57071 1507 aaPredicted RBP28.74■■■□□ 2.19
PUF60-218ENST00000531995 DEPDC5O75140 1603 aa28.73■■■□□ 2.19
PUF60-218ENST00000531995 IQGAP1P46940 1657 aa28.73■■■□□ 2.19
PUF60-218ENST00000531995 UBAP1LF5GYI3 381 aa28.71■■■□□ 2.19
PUF60-218ENST00000531995 FGD6Q6ZV73 1430 aa28.7■■■□□ 2.19
PUF60-218ENST00000531995 KIF15Q9NS87 1388 aa28.7■■■□□ 2.18
PUF60-218ENST00000531995 VWDEQ8N2E2 1590 aa28.7■■■□□ 2.18
PUF60-218ENST00000531995 ABCC5O15440 1437 aa28.69■■■□□ 2.18
PUF60-218ENST00000531995 UBR1Q8IWV7 1749 aa28.69■■■□□ 2.18
PUF60-218ENST00000531995 CPS1P31327 1500 aa28.69■■■□□ 2.18
PUF60-218ENST00000531995 NPHP4O75161 1426 aaPredicted RBP28.67■■■□□ 2.18
PUF60-218ENST00000531995 DAPK1P53355 1430 aa28.67■■■□□ 2.18
PUF60-218ENST00000531995 ERBINQ96RT1 1412 aa28.66■■■□□ 2.18
PUF60-218ENST00000531995 MED14O60244 1454 aa28.64■■■□□ 2.17
PUF60-218ENST00000531995 ANKLE2Q86XL3 938 aa28.63■■■□□ 2.17
PUF60-218ENST00000531995 THEMISQ8N1K5 641 aaPredicted RBP28.63■■■□□ 2.17
PUF60-218ENST00000531995 STRCP1A6NGW2 1772 aa28.62■■■□□ 2.17
PUF60-218ENST00000531995 ILDR2Q71H61 639 aa28.6■■■□□ 2.17
PUF60-218ENST00000531995 RRP7BPQ9NSQ0 103 aa28.6■■■□□ 2.17
PUF60-218ENST00000531995 PIK3C2BO00750 1634 aa28.56■■■□□ 2.16
PUF60-218ENST00000531995 SCAF1Q9H7N4 1312 aaKnown RBP28.56■■■□□ 2.16
PUF60-218ENST00000531995 SYNMO15061 1565 aa28.54■■■□□ 2.16
PUF60-218ENST00000531995 GRWD1Q9BQ67 446 aaKnown RBP eCLIP28.53■■■□□ 2.167e-7■□□□□ 9.1
PUF60-218ENST00000531995 ARHGAP31Q2M1Z3 1444 aa28.52■■■□□ 2.16
PUF60-218ENST00000531995 SCAF11Q99590 1463 aaKnown RBP28.52■■■□□ 2.16
PUF60-218ENST00000531995 PIP4K2BP78356 416 aa28.51■■■□□ 2.15
PUF60-218ENST00000531995 ALKQ9UM73 1620 aa28.51■■■□□ 2.15
PUF60-218ENST00000531995 CHIC2Q9UKJ5 165 aa28.5■■■□□ 2.15
PUF60-218ENST00000531995 FAM50AQ14320 339 aaKnown RBP28.49■■■□□ 2.15
PUF60-218ENST00000531995 ANKRD30AQ9BXX3 1397 aa28.49■■■□□ 2.15
PUF60-218ENST00000531995 SLIT1O75093 1534 aa28.48■■■□□ 2.15
PUF60-218ENST00000531995 RRBP1Q9P2E9 1410 aaKnown RBP28.48■■■□□ 2.15
PUF60-218ENST00000531995 ARHGAP23Q9P227 1491 aa28.47■■■□□ 2.15
PUF60-218ENST00000531995 KANK1Q14678 1352 aa28.47■■■□□ 2.15
PUF60-218ENST00000531995 EFCAB6Q5THR3 1501 aa28.46■■■□□ 2.15
PUF60-218ENST00000531995 LMTK2Q8IWU2 1503 aa28.46■■■□□ 2.15
PUF60-218ENST00000531995 LRRC7Q96NW7 1537 aa28.44■■■□□ 2.14
PUF60-218ENST00000531995 ADGRL2O95490 1459 aa28.44■■■□□ 2.14
PUF60-218ENST00000531995 TOM1O60784 492 aa28.42■■■□□ 2.14
PUF60-218ENST00000531995 HSPA1LP34931 641 aa28.42■■■□□ 2.14
PUF60-218ENST00000531995 KDM5AP29375 1690 aaKnown RBP28.42■■■□□ 2.14
PUF60-218ENST00000531995 MED1Q15648 1581 aaPredicted RBP28.41■■■□□ 2.14
PUF60-218ENST00000531995 XIRP1Q702N8 1843 aaKnown RBP28.39■■■□□ 2.14
PUF60-218ENST00000531995 LTKP29376 864 aa28.38■■■□□ 2.13
PUF60-218ENST00000531995 ADGRB3O60242 1522 aa28.38■■■□□ 2.13
PUF60-218ENST00000531995 SOCS7O14512 581 aa28.35■■■□□ 2.13
PUF60-218ENST00000531995 TXNDC2Q86VQ3 553 aa28.35■■■□□ 2.13
PUF60-218ENST00000531995 TMEM2Q9UHN6 1383 aa28.34■■■□□ 2.13
PUF60-218ENST00000531995 MYO5BQ9ULV0 1848 aa28.32■■■□□ 2.12
PUF60-218ENST00000531995 STAG3Q9UJ98 1225 aa28.32■■■□□ 2.12
PUF60-218ENST00000531995 TET3O43151 1660 aa28.32■■■□□ 2.12
PUF60-218ENST00000531995 SENP3Q9H4L4 574 aaPredicted RBP28.31■■■□□ 2.12
PUF60-218ENST00000531995 NOS1P29475 1434 aa28.31■■■□□ 2.12
PUF60-218ENST00000531995 GCC2Q8IWJ2 1684 aa28.3■■■□□ 2.12
PUF60-218ENST00000531995 ANKRD50Q9ULJ7 1429 aa28.3■■■□□ 2.12
PUF60-218ENST00000531995 EID1Q9Y6B2 187 aa28.3■■■□□ 2.12
PUF60-218ENST00000531995 UNC13BO14795 1591 aa28.29■■■□□ 2.12
PUF60-218ENST00000531995 ITGAEP38570 1179 aa28.27■■■□□ 2.12
PUF60-218ENST00000531995 IDI1Q13907 227 aa28.26■■■□□ 2.11
PUF60-218ENST00000531995 RPRD2Q5VT52 1461 aaKnown RBP28.24■■■□□ 2.11
PUF60-218ENST00000531995 E9PCH4 1651 aa28.2■■■□□ 2.11
PUF60-218ENST00000531995 ROCK1Q13464 1354 aa28.2■■■□□ 2.1
PUF60-218ENST00000531995 NWD1Q149M9 1564 aa28.2■■■□□ 2.1
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 45.2 ms