RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000531461.5

ACER3-211, Transcript of alkaline ceramidase 3, humanhuman

TSL 2

Gene ACER3, Length 1,292 nt, Biotype nonsense mediated decay, Subcellular localisation Endoplasmic reticulum .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ACER3-211ENST00000531461 KDM5DQ9BY66 1539 aa38.07■■■■□ 3.69
ACER3-211ENST00000531461 TCOF1Q13428 1488 aaKnown RBP38.07■■■■□ 3.68
ACER3-211ENST00000531461 IQSEC2Q5JU85 1478 aa38.07■■■■□ 3.68
ACER3-211ENST00000531461 PKD2Q13563 968 aa38.06■■■■□ 3.68
ACER3-211ENST00000531461 MAST1Q9Y2H9 1570 aa38.05■■■■□ 3.68
ACER3-211ENST00000531461 A2ML1A8K2U0 1454 aa38.03■■■■□ 3.68
ACER3-211ENST00000531461 MIA2Q96PC5 1412 aa38.03■■■■□ 3.68
ACER3-211ENST00000531461 PZPP20742 1482 aa38.03■■■■□ 3.68
ACER3-211ENST00000531461 NCKAP5LQ9HCH0 1330 aa38.02■■■■□ 3.68
ACER3-211ENST00000531461 KANK4Q5T7N3 995 aaPredicted RBP38.01■■■■□ 3.68
ACER3-211ENST00000531461 DNMT1P26358 1616 aaKnown RBP38■■■■□ 3.67
ACER3-211ENST00000531461 MYOM3Q5VTT5 1437 aa37.98■■■■□ 3.67
ACER3-211ENST00000531461 WASHC2CQ9Y4E1 1318 aa37.97■■■■□ 3.67
ACER3-211ENST00000531461 TNRQ92752 1358 aa37.94■■■■□ 3.66
ACER3-211ENST00000531461 RNF17Q9BXT8 1623 aaKnown RBP37.94■■■■□ 3.66
ACER3-211ENST00000531461 EIF2AK4Q9P2K8 1649 aaKnown RBP37.91■■■■□ 3.66
ACER3-211ENST00000531461 FBXO31Q5XUX0 539 aaPredicted RBP37.91■■■■□ 3.66
ACER3-211ENST00000531461 ZC3H13Q5T200 1668 aaKnown RBP37.88■■■■□ 3.65
ACER3-211ENST00000531461 ZNF335Q9H4Z2 1342 aaPredicted RBP37.86■■■■□ 3.65
ACER3-211ENST00000531461 NLRP1Q9C000 1473 aa37.84■■■■□ 3.65
ACER3-211ENST00000531461 POLR1AO95602 1720 aaPredicted RBP37.84■■■■□ 3.65
ACER3-211ENST00000531461 ABCC3O15438 1527 aa37.82■■■■□ 3.64
ACER3-211ENST00000531461 DUOX2Q9NRD8 1548 aa37.78■■■■□ 3.64
ACER3-211ENST00000531461 NEURL4Q96JN8 1562 aa37.78■■■■□ 3.64
ACER3-211ENST00000531461 MROH1Q8NDA8 1641 aa37.78■■■■□ 3.64
ACER3-211ENST00000531461 SHANK2Q9UPX8 1470 aa37.77■■■■□ 3.64
ACER3-211ENST00000531461 SPATA31D1Q6ZQQ2 1576 aa37.76■■■■□ 3.63
ACER3-211ENST00000531461 UGGT1Q9NYU2 1555 aa37.75■■■■□ 3.63
ACER3-211ENST00000531461 CROCC2H7BZ55 1655 aa37.75■■■■□ 3.63
ACER3-211ENST00000531461 APLP2Q06481 763 aa37.74■■■■□ 3.63
ACER3-211ENST00000531461 THEMISQ8N1K5 641 aaPredicted RBP37.74■■■■□ 3.63
ACER3-211ENST00000531461 PTPN23Q9H3S7 1636 aa37.73■■■■□ 3.63
ACER3-211ENST00000531461 ABCC5O15440 1437 aa37.7■■■■□ 3.62
ACER3-211ENST00000531461 DEPDC5O75140 1603 aa37.69■■■■□ 3.62
ACER3-211ENST00000531461 ANKLE2Q86XL3 938 aa37.69■■■■□ 3.62
ACER3-211ENST00000531461 DROSHAQ9NRR4 1374 aaKnown RBP eCLIP37.68■■■■□ 3.626e-7■■■□□ 19.2
ACER3-211ENST00000531461 MED14O60244 1454 aa37.67■■■■□ 3.62
ACER3-211ENST00000531461 ERVK-7P63135 1459 aa37.67■■■■□ 3.62
ACER3-211ENST00000531461 CEP152O94986 1710 aa37.67■■■■□ 3.62
ACER3-211ENST00000531461 ERBINQ96RT1 1412 aa37.66■■■■□ 3.62
ACER3-211ENST00000531461 KIF15Q9NS87 1388 aa37.66■■■■□ 3.62
ACER3-211ENST00000531461 PRDM15P57071 1507 aaPredicted RBP37.64■■■■□ 3.62
ACER3-211ENST00000531461 FGD6Q6ZV73 1430 aa37.63■■■■□ 3.61
ACER3-211ENST00000531461 CPS1P31327 1500 aa37.63■■■■□ 3.61
ACER3-211ENST00000531461 DAPK1P53355 1430 aa37.61■■■■□ 3.61
ACER3-211ENST00000531461 ARHGAP31Q2M1Z3 1444 aa37.59■■■■□ 3.61
ACER3-211ENST00000531461 UBAP1LF5GYI3 381 aa37.58■■■■□ 3.61
ACER3-211ENST00000531461 CFAP65Q6ZU64 1925 aaKnown RBP37.57■■■■□ 3.61
ACER3-211ENST00000531461 NPHP4O75161 1426 aaPredicted RBP37.57■■■■□ 3.6
ACER3-211ENST00000531461 VWDEQ8N2E2 1590 aa37.55■■■■□ 3.6
ACER3-211ENST00000531461 IQGAP1P46940 1657 aa37.54■■■■□ 3.6
ACER3-211ENST00000531461 RRP7BPQ9NSQ0 103 aa37.54■■■■□ 3.6
ACER3-211ENST00000531461 DISP3Q9P2K9 1392 aa37.54■■■■□ 3.6
ACER3-211ENST00000531461 UBR1Q8IWV7 1749 aa37.53■■■■□ 3.6
ACER3-211ENST00000531461 ANKRD30AQ9BXX3 1397 aa37.48■■■■□ 3.59
ACER3-211ENST00000531461 KANK1Q14678 1352 aa37.42■■■■□ 3.58
ACER3-211ENST00000531461 LMTK2Q8IWU2 1503 aa37.42■■■■□ 3.58
ACER3-211ENST00000531461 SLIT1O75093 1534 aa37.41■■■■□ 3.58
ACER3-211ENST00000531461 ARHGAP23Q9P227 1491 aa37.41■■■■□ 3.58
ACER3-211ENST00000531461 ADGRL2O95490 1459 aa37.39■■■■□ 3.58
ACER3-211ENST00000531461 TOM1O60784 492 aa37.39■■■■□ 3.58
ACER3-211ENST00000531461 SCAF11Q99590 1463 aaKnown RBP37.38■■■■□ 3.57
ACER3-211ENST00000531461 GRWD1Q9BQ67 446 aaKnown RBP eCLIP37.37■■■■□ 3.57
ACER3-211ENST00000531461 CHIC2Q9UKJ5 165 aa37.36■■■■□ 3.57
ACER3-211ENST00000531461 STRCP1A6NGW2 1772 aa37.35■■■■□ 3.57
ACER3-211ENST00000531461 KDM5AP29375 1690 aaKnown RBP37.35■■■■□ 3.57
ACER3-211ENST00000531461 ILDR2Q71H61 639 aa37.34■■■■□ 3.57
ACER3-211ENST00000531461 PIK3C2BO00750 1634 aa37.32■■■■□ 3.57
ACER3-211ENST00000531461 SYNMO15061 1565 aa37.32■■■■□ 3.56
ACER3-211ENST00000531461 LTKP29376 864 aa37.28■■■■□ 3.56
ACER3-211ENST00000531461 LRRC7Q96NW7 1537 aa37.27■■■■□ 3.56
ACER3-211ENST00000531461 TXNDC2Q86VQ3 553 aa37.27■■■■□ 3.56
ACER3-211ENST00000531461 EFCAB6Q5THR3 1501 aa37.26■■■■□ 3.56
ACER3-211ENST00000531461 ALKQ9UM73 1620 aa37.26■■■■□ 3.56
ACER3-211ENST00000531461 TMEM2Q9UHN6 1383 aa37.24■■■■□ 3.55
ACER3-211ENST00000531461 NOS1P29475 1434 aa37.24■■■■□ 3.55
ACER3-211ENST00000531461 PIP4K2BP78356 416 aa37.23■■■■□ 3.55
ACER3-211ENST00000531461 EID1Q9Y6B2 187 aa37.23■■■■□ 3.55
ACER3-211ENST00000531461 FAM50AQ14320 339 aaKnown RBP37.22■■■■□ 3.55
ACER3-211ENST00000531461 ANKRD50Q9ULJ7 1429 aa37.21■■■■□ 3.55
ACER3-211ENST00000531461 SCAF1Q9H7N4 1312 aaKnown RBP37.21■■■■□ 3.55
ACER3-211ENST00000531461 HSPA1LP34931 641 aa37.2■■■■□ 3.55
ACER3-211ENST00000531461 IDI1Q13907 227 aa37.19■■■■□ 3.54
ACER3-211ENST00000531461 RPRD2Q5VT52 1461 aaKnown RBP37.18■■■■□ 3.54
ACER3-211ENST00000531461 SOCS7O14512 581 aa37.17■■■■□ 3.54
ACER3-211ENST00000531461 STAG3Q9UJ98 1225 aa37.16■■■■□ 3.54
ACER3-211ENST00000531461 SLC52A1Q9NWF4 448 aa37.13■■■■□ 3.53
ACER3-211ENST00000531461 ADGRB3O60242 1522 aa37.11■■■■□ 3.53
ACER3-211ENST00000531461 TET3O43151 1660 aa37.1■■■■□ 3.53
ACER3-211ENST00000531461 XIRP1Q702N8 1843 aaKnown RBP37.08■■■■□ 3.53
ACER3-211ENST00000531461 UNC13BO14795 1591 aa37.06■■■■□ 3.52
ACER3-211ENST00000531461 ROCK1Q13464 1354 aa37.04■■■■□ 3.52
ACER3-211ENST00000531461 GCC2Q8IWJ2 1684 aa37.04■■■■□ 3.52
ACER3-211ENST00000531461 MED1Q15648 1581 aaPredicted RBP37.03■■■■□ 3.52
ACER3-211ENST00000531461 KCNA6P17658 529 aa36.96■■■■□ 3.51
ACER3-211ENST00000531461 MYO5BQ9ULV0 1848 aa36.94■■■■□ 3.5
ACER3-211ENST00000531461 ZFYVE9O95405 1425 aa36.93■■■■□ 3.5
ACER3-211ENST00000531461 TMEM131LA2VDJ0 1609 aa36.92■■■■□ 3.5
ACER3-211ENST00000531461 IQGAP3Q86VI3 1631 aa36.92■■■■□ 3.5
ACER3-211ENST00000531461 NWD1Q149M9 1564 aa36.91■■■■□ 3.5
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