RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000531461.5

ACER3-211, Transcript of alkaline ceramidase 3, humanhuman

TSL 2

Gene ACER3, Length 1,292 nt, Biotype nonsense mediated decay, Subcellular localisation Endoplasmic reticulum .

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ACER3-211ENST00000531461 NISCHQ9Y2I1 1504 aa60.27■■■■■ 7.24
ACER3-211ENST00000531461 CCDC180Q9P1Z9 1646 aa54.12■■■■■ 6.25
ACER3-211ENST00000531461 ABCC9O60706 1549 aa53.86■■■■■ 6.21
ACER3-211ENST00000531461 RB1CC1Q8TDY2 1594 aa51.43■■■■■ 5.82
ACER3-211ENST00000531461 NACADO15069 1562 aa51.13■■■■■ 5.78
ACER3-211ENST00000531461 DCAF8L2P0C7V8 631 aa50.62■■■■■ 5.69
ACER3-211ENST00000531461 MYO15BQ96JP2 1530 aa50.55■■■■■ 5.68
ACER3-211ENST00000531461 DNAJC5BQ9UF47 199 aa50.45■■■■■ 5.67
ACER3-211ENST00000531461 UNC13AQ9UPW8 1703 aa50.28■■■■■ 5.64
ACER3-211ENST00000531461 PABPN1Q86U42 306 aaKnown RBP eCLIP50.1■■■■■ 5.61
ACER3-211ENST00000531461 ZCCHC6Q5VYS8 1495 aaKnown RBP49.98■■■■■ 5.59
ACER3-211ENST00000531461 BICRAQ9NZM4 1560 aa49.92■■■■■ 5.58
ACER3-211ENST00000531461 DCAF1Q9Y4B6 1507 aa49.9■■■■■ 5.58
ACER3-211ENST00000531461 SHROOM4Q9ULL8 1493 aa49.38■■■■■ 5.5
ACER3-211ENST00000531461 SCRIBQ14160 1630 aa49.16■■■■■ 5.46
ACER3-211ENST00000531461 CC2D2AQ9P2K1 1620 aa48.74■■■■■ 5.39
ACER3-211ENST00000531461 EIF4G1Q04637 1599 aaKnown RBP48.68■■■■■ 5.38
ACER3-211ENST00000531461 CECR2Q9BXF3 1484 aa48.56■■■■■ 5.36
ACER3-211ENST00000531461 NCAPD3P42695 1498 aa47.2■■■■■ 5.15
ACER3-211ENST00000531461 ATAD2BQ9ULI0 1458 aa47.02■■■■■ 5.12
ACER3-211ENST00000531461 SMARCA4P51532 1647 aa47■■■■■ 5.11
ACER3-211ENST00000531461 SMARCA2P51531 1590 aa46.93■■■■■ 5.1
ACER3-211ENST00000531461 HMGXB3Q12766 1538 aa46.86■■■■■ 5.09
ACER3-211ENST00000531461 BAZ1AQ9NRL2 1556 aaPredicted RBP46.8■■■■■ 5.08
ACER3-211ENST00000531461 PEG3Q9GZU2 1588 aa46.63■■■■■ 5.06
ACER3-211ENST00000531461 BAZ1BQ9UIG0 1483 aaKnown RBP46.54■■■■■ 5.04
ACER3-211ENST00000531461 CUX2O14529 1486 aa46.51■■■■■ 5.04
ACER3-211ENST00000531461 ERCC6Q03468 1493 aa46.51■■■■■ 5.04
ACER3-211ENST00000531461 MROH2BQ7Z745 1585 aa46.39■■■■■ 5.02
ACER3-211ENST00000531461 DNAJC5Q9H3Z4 198 aa46.34■■■■■ 5.01
ACER3-211ENST00000531461 NESP48681 1621 aa46.3■■■■■ 5
ACER3-211ENST00000531461 LAMC3Q9Y6N6 1575 aa46.12■■■■■ 4.97
ACER3-211ENST00000531461 THOC2Q8NI27 1593 aaKnown RBP45.91■■■■■ 4.94
ACER3-211ENST00000531461 WIZO95785 1651 aa45.83■■■■■ 4.93
ACER3-211ENST00000531461 PDS5BQ9NTI5 1447 aa45.81■■■■■ 4.92
ACER3-211ENST00000531461 KIF21AQ7Z4S6 1674 aa45.76■■■■■ 4.92
ACER3-211ENST00000531461 CADPSQ9ULU8 1353 aa45.72■■■■■ 4.91
ACER3-211ENST00000531461 RSF1Q96T23 1441 aaPredicted RBP45.48■■■■■ 4.87
ACER3-211ENST00000531461 MRC2Q9UBG0 1479 aa45.39■■■■■ 4.86
ACER3-211ENST00000531461 WDR62O43379 1518 aa45.31■■■■■ 4.84
ACER3-211ENST00000531461 TOP2AP11388 1531 aaKnown RBP45.31■■■■■ 4.84
ACER3-211ENST00000531461 CFTRP13569 1480 aa45.24■■■■■ 4.83
ACER3-211ENST00000531461 CEP164Q9UPV0 1460 aa45.23■■■■■ 4.83
ACER3-211ENST00000531461 FANCD2Q9BXW9 1451 aa45.17■■■■■ 4.82
ACER3-211ENST00000531461 PRDM2Q13029 1718 aa44.85■■■■■ 4.77
ACER3-211ENST00000531461 URB2Q14146 1524 aaKnown RBP44.8■■■■■ 4.76
ACER3-211ENST00000531461 CCDC88BA6NC98 1476 aa44.76■■■■■ 4.76
ACER3-211ENST00000531461 IFT140Q96RY7 1462 aa44.34■■■■■ 4.69
ACER3-211ENST00000531461 OSCARQ8IYS5 282 aa44.34■■■■■ 4.69
ACER3-211ENST00000531461 TOPBP1Q92547 1522 aa44.34■■■■■ 4.69
ACER3-211ENST00000531461 ABCC8Q09428 1581 aa44.33■■■■■ 4.69
ACER3-211ENST00000531461 DNMBPQ6XZF7 1577 aa44.21■■■■■ 4.67
ACER3-211ENST00000531461 ZNF608Q9ULD9 1512 aaPredicted RBP44.19■■■■■ 4.67
ACER3-211ENST00000531461 TRIM41Q8WV44 630 aa44.18■■■■■ 4.66
ACER3-211ENST00000531461 EIF4G3O43432 1585 aaKnown RBP44■■■■■ 4.63
ACER3-211ENST00000531461 TARBP1Q13395 1621 aaKnown RBP43.97■■■■■ 4.63
ACER3-211ENST00000531461 POLA1P09884 1462 aaPredicted RBP43.89■■■■■ 4.62
ACER3-211ENST00000531461 AQRO60306 1485 aaKnown RBP eCLIP43.8■■■■■ 4.62e-12■■■■■ 32.2
ACER3-211ENST00000531461 RIMBP3CA6NJZ7 1639 aa43.76■■■■■ 4.6
ACER3-211ENST00000531461 RIMBP3BA6NNM3 1639 aa43.76■■■■■ 4.6
ACER3-211ENST00000531461 RIMBP3Q9UFD9 1639 aa43.76■■■■■ 4.6
ACER3-211ENST00000531461 SOGA1O94964 1423 aa43.66■■■■■ 4.58
ACER3-211ENST00000531461 RAD54L2Q9Y4B4 1467 aa43.66■■■■■ 4.58
ACER3-211ENST00000531461 CHD1O14646 1710 aa43.65■■■■■ 4.58
ACER3-211ENST00000531461 ARHGEF11O15085 1522 aa43.63■■■■■ 4.58
ACER3-211ENST00000531461 WDR97A6NE52 1622 aa43.62■■■■■ 4.57
ACER3-211ENST00000531461 FGD5Q6ZNL6 1462 aa43.61■■■■■ 4.57
ACER3-211ENST00000531461 CUX1P39880 1505 aa43.59■■■■■ 4.57
ACER3-211ENST00000531461 TDRD9Q8NDG6 1382 aaKnown RBP43.53■■■■■ 4.56
ACER3-211ENST00000531461 FBLN2P98095 1184 aa43.41■■■■■ 4.54
ACER3-211ENST00000531461 SNAPC4Q5SXM2 1469 aa43.37■■■■■ 4.53
ACER3-211ENST00000531461 SUPT5HO00267 1087 aaKnown RBP43.36■■■■■ 4.53
ACER3-211ENST00000531461 MAGI1Q96QZ7 1491 aaPredicted RBP43.34■■■■■ 4.53
ACER3-211ENST00000531461 GRIN2BQ13224 1484 aa43.32■■■■■ 4.52
ACER3-211ENST00000531461 CYB5RLQ6IPT4 315 aa43.22■■■■■ 4.51
ACER3-211ENST00000531461 ARAP1Q96P48 1450 aa43.2■■■■■ 4.51
ACER3-211ENST00000531461 CLASP1Q7Z460 1538 aa43.2■■■■■ 4.51
ACER3-211ENST00000531461 CHMP7Q8WUX9 453 aaPredicted RBP43.19■■■■■ 4.5
ACER3-211ENST00000531461 ABCA10Q8WWZ4 1543 aa43.18■■■■■ 4.5
ACER3-211ENST00000531461 SYNJ2O15056 1496 aa43.18■■■■■ 4.5
ACER3-211ENST00000531461 SYNJ1O43426 1573 aa43.16■■■■■ 4.5
ACER3-211ENST00000531461 GAPVD1Q14C86 1478 aa43.16■■■■■ 4.5
ACER3-211ENST00000531461 PBRM1Q86U86 1689 aa43.15■■■■■ 4.5
ACER3-211ENST00000531461 ABCA5Q8WWZ7 1642 aa43.1■■■■■ 4.49
ACER3-211ENST00000531461 WRNQ14191 1432 aaPredicted RBP eCLIP42.98■■■■■ 4.47
ACER3-211ENST00000531461 BIVM-ERCC5R4GMW8 1640 aa42.98■■■■■ 4.47
ACER3-211ENST00000531461 TOP2BQ02880 1626 aa42.97■■■■■ 4.47
ACER3-211ENST00000531461 GRIN2AQ12879 1464 aa42.75■■■■■ 4.43
ACER3-211ENST00000531461 ADAMTS12P58397 1594 aa42.75■■■■■ 4.43
ACER3-211ENST00000531461 TRHP20396 242 aaPredicted RBP42.68■■■■■ 4.42
ACER3-211ENST00000531461 ERICH3Q5RHP9 1530 aa42.66■■■■■ 4.42
ACER3-211ENST00000531461 NUP160Q12769 1436 aa42.64■■■■■ 4.42
ACER3-211ENST00000531461 FHAD1B1AJZ9 1412 aa42.63■■■■■ 4.42
ACER3-211ENST00000531461 CEP170Q5SW79 1584 aa42.58■■■■■ 4.41
ACER3-211ENST00000531461 SHROOM2Q13796 1616 aa42.46■■■■■ 4.39
ACER3-211ENST00000531461 ERCC6L2Q5T890 1561 aa42.44■■■■■ 4.39
ACER3-211ENST00000531461 PRG4Q92954 1404 aaPredicted RBP42.15■■■■■ 4.34
ACER3-211ENST00000531461 JPH4Q96JJ6 628 aa42.15■■■■■ 4.34
ACER3-211ENST00000531461 RUSC2Q8N2Y8 1516 aa42.15■■■■■ 4.34
ACER3-211ENST00000531461 KIF27Q86VH2 1401 aa42.1■■■■■ 4.33
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 15.5 ms