RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000515760.1

PEX10-208, Transcript of peroxisomal biogenesis factor 10, human

TSL 4

Gene PEX10, Length 603 nt, Biotype processed transcript, Subcellular localisation Ribosome .

RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	p-Value	Fold Change
PEX10-208	ENST00000515760	KIF3B	O15066	747 aa		33.4	■■■□□ 2.94
PEX10-208	ENST00000515760	PZP	P20742	1482 aa		33.37	■■■□□ 2.93
PEX10-208	ENST00000515760	VPS8	Q8N3P4	1428 aa		33.37	■■■□□ 2.93
PEX10-208	ENST00000515760	DISP3	Q9P2K9	1392 aa		33.37	■■■□□ 2.93
PEX10-208	ENST00000515760	POLR1A	O95602	1720 aa	Predicted RBP	33.37	■■■□□ 2.93
PEX10-208	ENST00000515760	RSPH4A	Q5TD94	716 aa		33.36	■■■□□ 2.93
PEX10-208	ENST00000515760	LRRC9	Q6ZRR7	1453 aa		33.36	■■■□□ 2.93
PEX10-208	ENST00000515760	TNR	Q92752	1358 aa		33.34	■■■□□ 2.93
PEX10-208	ENST00000515760	SPATA31D1	Q6ZQQ2	1576 aa		33.34	■■■□□ 2.93
PEX10-208	ENST00000515760	FBXO31	Q5XUX0	539 aa	Predicted RBP	33.3	■■■□□ 2.92
PEX10-208	ENST00000515760	NEURL4	Q96JN8	1562 aa		33.29	■■■□□ 2.92
PEX10-208	ENST00000515760	MAST1	Q9Y2H9	1570 aa		33.29	■■■□□ 2.92
PEX10-208	ENST00000515760	WASHC2C	Q9Y4E1	1318 aa		33.28	■■■□□ 2.92
PEX10-208	ENST00000515760	RNF17	Q9BXT8	1623 aa	Known RBP	33.28	■■■□□ 2.92
PEX10-208	ENST00000515760	TSPY4	P0CV99	314 aa		33.26	■■■□□ 2.91
PEX10-208	ENST00000515760	TSPY10	P0CW01	314 aa		33.26	■■■□□ 2.91
PEX10-208	ENST00000515760	ZC3H13	Q5T200	1668 aa	Known RBP	33.23	■■■□□ 2.91
PEX10-208	ENST00000515760	EIF2AK4	Q9P2K8	1649 aa	Known RBP	33.22	■■■□□ 2.91
PEX10-208	ENST00000515760	MAP3K1	Q13233	1512 aa		33.22	■■■□□ 2.91
PEX10-208	ENST00000515760	NLRP1	Q9C000	1473 aa		33.21	■■■□□ 2.91
PEX10-208	ENST00000515760	LOC105371045	A0A1W2PR82	267 aa		33.21	■■■□□ 2.91
PEX10-208	ENST00000515760	UBAP1L	F5GYI3	381 aa		33.21	■■■□□ 2.91
PEX10-208	ENST00000515760	ABCC3	O15438	1527 aa		33.19	■■■□□ 2.9
PEX10-208	ENST00000515760	ILDR2	Q71H61	639 aa		33.19	■■■□□ 2.9
PEX10-208	ENST00000515760	MIA2	Q96PC5	1412 aa		33.19	■■■□□ 2.9
PEX10-208	ENST00000515760	UGGT1	Q9NYU2	1555 aa		33.18	■■■□□ 2.9
PEX10-208	ENST00000515760	MYOM3	Q5VTT5	1437 aa		33.18	■■■□□ 2.9
PEX10-208	ENST00000515760	KANK4	Q5T7N3	995 aa	Predicted RBP	33.16	■■■□□ 2.9
PEX10-208	ENST00000515760	MROH1	Q8NDA8	1641 aa		33.15	■■■□□ 2.9
PEX10-208	ENST00000515760	DROSHA	Q9NRR4	1374 aa	Known RBP eCLIP	33.15	■■■□□ 2.9
PEX10-208	ENST00000515760	CPS1	P31327	1500 aa		33.13	■■■□□ 2.89
PEX10-208	ENST00000515760	CEP152	O94986	1710 aa		33.13	■■■□□ 2.89
PEX10-208	ENST00000515760	DEPDC5	O75140	1603 aa		33.12	■■■□□ 2.89
PEX10-208	ENST00000515760	SHANK2	Q9UPX8	1470 aa		33.11	■■■□□ 2.89
PEX10-208	ENST00000515760	ANKLE2	Q86XL3	938 aa		33.09	■■■□□ 2.89
PEX10-208	ENST00000515760	THEMIS	Q8N1K5	641 aa	Predicted RBP	33.09	■■■□□ 2.89
PEX10-208	ENST00000515760	VWDE	Q8N2E2	1590 aa		33.09	■■■□□ 2.89
PEX10-208	ENST00000515760	CROCC2	H7BZ55	1655 aa		33.08	■■■□□ 2.89
PEX10-208	ENST00000515760	ERVK-7	P63135	1459 aa		33.08	■■■□□ 2.89
PEX10-208	ENST00000515760	DUOX2	Q9NRD8	1548 aa		33.07	■■■□□ 2.88
PEX10-208	ENST00000515760	IQGAP1	P46940	1657 aa		33.07	■■■□□ 2.88
PEX10-208	ENST00000515760	MED14	O60244	1454 aa		33.06	■■■□□ 2.88
PEX10-208	ENST00000515760	NPHP4	O75161	1426 aa	Predicted RBP	33.06	■■■□□ 2.88
PEX10-208	ENST00000515760	CFAP65	Q6ZU64	1925 aa	Known RBP	33.01	■■■□□ 2.88
PEX10-208	ENST00000515760	PTPN23	Q9H3S7	1636 aa		33.01	■■■□□ 2.87
PEX10-208	ENST00000515760	SOCS7	O14512	581 aa		33	■■■□□ 2.87
PEX10-208	ENST00000515760	PRDM15	P57071	1507 aa	Predicted RBP	33	■■■□□ 2.87
PEX10-208	ENST00000515760	UBR1	Q8IWV7	1749 aa		32.99	■■■□□ 2.87
PEX10-208	ENST00000515760	SCAF1	Q9H7N4	1312 aa	Known RBP	32.98	■■■□□ 2.87
PEX10-208	ENST00000515760	KIF15	Q9NS87	1388 aa		32.96	■■■□□ 2.87
PEX10-208	ENST00000515760	ABCC5	O15440	1437 aa		32.94	■■■□□ 2.86
PEX10-208	ENST00000515760	ERBIN	Q96RT1	1412 aa		32.94	■■■□□ 2.86
PEX10-208	ENST00000515760	STRCP1	A6NGW2	1772 aa		32.93	■■■□□ 2.86
PEX10-208	ENST00000515760	PIP4K2B	P78356	416 aa		32.93	■■■□□ 2.86
PEX10-208	ENST00000515760	TOM1	O60784	492 aa		32.92	■■■□□ 2.86
PEX10-208	ENST00000515760	SYNM	O15061	1565 aa		32.89	■■■□□ 2.86
PEX10-208	ENST00000515760	DAPK1	P53355	1430 aa		32.89	■■■□□ 2.86
PEX10-208	ENST00000515760	HSPA1L	P34931	641 aa		32.88	■■■□□ 2.85
PEX10-208	ENST00000515760	ALK	Q9UM73	1620 aa		32.88	■■■□□ 2.85
PEX10-208	ENST00000515760	ARHGAP31	Q2M1Z3	1444 aa		32.87	■■■□□ 2.85
PEX10-208	ENST00000515760	APLP2	Q06481	763 aa		32.87	■■■□□ 2.85
PEX10-208	ENST00000515760	FGD6	Q6ZV73	1430 aa		32.86	■■■□□ 2.85
PEX10-208	ENST00000515760	RRP7BP	Q9NSQ0	103 aa		32.86	■■■□□ 2.85
PEX10-208	ENST00000515760	SCAF11	Q99590	1463 aa	Known RBP	32.86	■■■□□ 2.85
PEX10-208	ENST00000515760	MED1	Q15648	1581 aa	Predicted RBP	32.83	■■■□□ 2.85
PEX10-208	ENST00000515760	SLIT1	O75093	1534 aa		32.82	■■■□□ 2.85
PEX10-208	ENST00000515760	LRRC7	Q96NW7	1537 aa		32.82	■■■□□ 2.85
PEX10-208	ENST00000515760	ARHGAP23	Q9P227	1491 aa		32.81	■■■□□ 2.84
PEX10-208	ENST00000515760	PIK3C2B	O00750	1634 aa		32.81	■■■□□ 2.84
PEX10-208	ENST00000515760	GRWD1	Q9BQ67	446 aa	Known RBP eCLIP	32.79	■■■□□ 2.84
PEX10-208	ENST00000515760	KANK1	Q14678	1352 aa		32.77	■■■□□ 2.84
PEX10-208	ENST00000515760	ANKRD30A	Q9BXX3	1397 aa		32.74	■■■□□ 2.83
PEX10-208	ENST00000515760	LMTK2	Q8IWU2	1503 aa		32.73	■■■□□ 2.83
PEX10-208	ENST00000515760	LTK	P29376	864 aa		32.73	■■■□□ 2.83
PEX10-208	ENST00000515760	TXNDC2	Q86VQ3	553 aa		32.71	■■■□□ 2.83
PEX10-208	ENST00000515760	CHIC2	Q9UKJ5	165 aa		32.71	■■■□□ 2.83
PEX10-208	ENST00000515760	KDM5A	P29375	1690 aa	Known RBP	32.71	■■■□□ 2.83
PEX10-208	ENST00000515760	EFCAB6	Q5THR3	1501 aa		32.68	■■■□□ 2.82
PEX10-208	ENST00000515760	XIRP1	Q702N8	1843 aa	Known RBP	32.67	■■■□□ 2.82
PEX10-208	ENST00000515760	TMEM2	Q9UHN6	1383 aa		32.67	■■■□□ 2.82
PEX10-208	ENST00000515760	EID1	Q9Y6B2	187 aa		32.66	■■■□□ 2.82
PEX10-208	ENST00000515760	ADGRL2	O95490	1459 aa		32.65	■■■□□ 2.82
PEX10-208	ENST00000515760	STAG3	Q9UJ98	1225 aa		32.63	■■■□□ 2.81
PEX10-208	ENST00000515760	SENP3	Q9H4L4	574 aa	Predicted RBP	32.61	■■■□□ 2.81
PEX10-208	ENST00000515760	ADGRB3	O60242	1522 aa		32.61	■■■□□ 2.81
PEX10-208	ENST00000515760	NOS1	P29475	1434 aa		32.59	■■■□□ 2.81
PEX10-208	ENST00000515760	IDI1	Q13907	227 aa		32.57	■■■□□ 2.8
PEX10-208	ENST00000515760	FAM50A	Q14320	339 aa	Known RBP	32.54	■■■□□ 2.8
PEX10-208	ENST00000515760	PHF23	Q9BUL5	403 aa	Predicted RBP	32.52	■■■□□ 2.8
PEX10-208	ENST00000515760	ANKRD50	Q9ULJ7	1429 aa		32.51	■■■□□ 2.8
PEX10-208	ENST00000515760	TET3	O43151	1660 aa		32.51	■■■□□ 2.79
PEX10-208	ENST00000515760	RPRD2	Q5VT52	1461 aa	Known RBP	32.49	■■■□□ 2.79
PEX10-208	ENST00000515760	MYO5B	Q9ULV0	1848 aa		32.47	■■■□□ 2.79
PEX10-208	ENST00000515760	GCC2	Q8IWJ2	1684 aa		32.46	■■■□□ 2.79
PEX10-208	ENST00000515760	NWD1	Q149M9	1564 aa		32.46	■■■□□ 2.79
PEX10-208	ENST00000515760	TMEM94	Q12767	1356 aa		32.45	■■■□□ 2.79
PEX10-208	ENST00000515760	UNC13B	O14795	1591 aa		32.45	■■■□□ 2.78
PEX10-208	ENST00000515760	SLC26A8	Q96RN1	970 aa		32.44	■■■□□ 2.78
PEX10-208	ENST00000515760	SLC52A1	Q9NWF4	448 aa		32.44	■■■□□ 2.78
PEX10-208	ENST00000515760	NKTR	P30414	1462 aa	Known RBP	32.42	■■■□□ 2.78

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