RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000514472.1

FGFR4-216, Transcript of fibroblast growth factor receptor 4, humanhuman

TSL 4

Gene FGFR4, Length 552 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Endoplasmic reticulum .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
FGFR4-216ENST00000514472 TSPY4P0CV99 314 aa35.33■■■■□ 3.25
FGFR4-216ENST00000514472 TSPY10P0CW01 314 aa35.33■■■■□ 3.25
FGFR4-216ENST00000514472 KDM5DQ9BY66 1539 aa35.32■■■■□ 3.25
FGFR4-216ENST00000514472 TCOF1Q13428 1488 aaKnown RBP35.31■■■■□ 3.24
FGFR4-216ENST00000514472 PKD2Q13563 968 aa35.3■■■■□ 3.24
FGFR4-216ENST00000514472 MAST1Q9Y2H9 1570 aa35.3■■■■□ 3.24
FGFR4-216ENST00000514472 A2ML1A8K2U0 1454 aa35.29■■■■□ 3.24
FGFR4-216ENST00000514472 DNMT1P26358 1616 aaKnown RBP35.29■■■■□ 3.24
FGFR4-216ENST00000514472 PZPP20742 1482 aa35.27■■■■□ 3.24
FGFR4-216ENST00000514472 FBXO31Q5XUX0 539 aaPredicted RBP35.26■■■■□ 3.24
FGFR4-216ENST00000514472 IQSEC2Q5JU85 1478 aa35.26■■■■□ 3.23
FGFR4-216ENST00000514472 WASHC2CQ9Y4E1 1318 aa35.26■■■■□ 3.23
FGFR4-216ENST00000514472 MYOM3Q5VTT5 1437 aa35.25■■■■□ 3.23
FGFR4-216ENST00000514472 MIA2Q96PC5 1412 aa35.25■■■■□ 3.23
FGFR4-216ENST00000514472 RNF17Q9BXT8 1623 aaKnown RBP35.22■■■■□ 3.23
FGFR4-216ENST00000514472 TNRQ92752 1358 aa35.22■■■■□ 3.23
FGFR4-216ENST00000514472 ZNF335Q9H4Z2 1342 aaPredicted RBP35.18■■■■□ 3.22
FGFR4-216ENST00000514472 EIF2AK4Q9P2K8 1649 aaKnown RBP35.17■■■■□ 3.22
FGFR4-216ENST00000514472 POLR1AO95602 1720 aaPredicted RBP35.16■■■■□ 3.22
FGFR4-216ENST00000514472 ZC3H13Q5T200 1668 aaKnown RBP35.13■■■■□ 3.21
FGFR4-216ENST00000514472 ABCC3O15438 1527 aa35.11■■■■□ 3.21
FGFR4-216ENST00000514472 MROH1Q8NDA8 1641 aa35.1■■■■□ 3.21
FGFR4-216ENST00000514472 NLRP1Q9C000 1473 aa35.09■■■■□ 3.21
FGFR4-216ENST00000514472 NEURL4Q96JN8 1562 aa35.08■■■■□ 3.21
FGFR4-216ENST00000514472 CROCC2H7BZ55 1655 aa35.06■■■■□ 3.2
FGFR4-216ENST00000514472 CFAP65Q6ZU64 1925 aaKnown RBP35.06■■■■□ 3.2
FGFR4-216ENST00000514472 DUOX2Q9NRD8 1548 aa35.06■■■■□ 3.2
FGFR4-216ENST00000514472 PTPN23Q9H3S7 1636 aa35.05■■■■□ 3.2
FGFR4-216ENST00000514472 CEP152O94986 1710 aa35.03■■■■□ 3.2
FGFR4-216ENST00000514472 SPATA31D1Q6ZQQ2 1576 aa35.03■■■■□ 3.2
FGFR4-216ENST00000514472 UGGT1Q9NYU2 1555 aa35.03■■■■□ 3.2
FGFR4-216ENST00000514472 DROSHAQ9NRR4 1374 aaKnown RBP eCLIP35.02■■■■□ 3.23e-6■□□□□ 9
FGFR4-216ENST00000514472 APLP2Q06481 763 aa35.02■■■■□ 3.2
FGFR4-216ENST00000514472 THEMISQ8N1K5 641 aaPredicted RBP35.02■■■■□ 3.2
FGFR4-216ENST00000514472 ABCC5O15440 1437 aa35.01■■■■□ 3.2
FGFR4-216ENST00000514472 SHANK2Q9UPX8 1470 aa35.01■■■■□ 3.19
FGFR4-216ENST00000514472 ANKLE2Q86XL3 938 aa34.98■■■■□ 3.19
FGFR4-216ENST00000514472 ERVK-7P63135 1459 aa34.97■■■■□ 3.19
FGFR4-216ENST00000514472 DEPDC5O75140 1603 aa34.96■■■■□ 3.19
FGFR4-216ENST00000514472 KIF15Q9NS87 1388 aa34.96■■■■□ 3.19
FGFR4-216ENST00000514472 FGD6Q6ZV73 1430 aa34.94■■■■□ 3.18
FGFR4-216ENST00000514472 MED14O60244 1454 aa34.93■■■■□ 3.18
FGFR4-216ENST00000514472 DAPK1P53355 1430 aa34.93■■■■□ 3.18
FGFR4-216ENST00000514472 PRDM15P57071 1507 aaPredicted RBP34.92■■■■□ 3.18
FGFR4-216ENST00000514472 ERBINQ96RT1 1412 aa34.92■■■■□ 3.18
FGFR4-216ENST00000514472 UBAP1LF5GYI3 381 aa34.92■■■■□ 3.18
FGFR4-216ENST00000514472 RRP7BPQ9NSQ0 103 aa34.9■■■■□ 3.18
FGFR4-216ENST00000514472 CPS1P31327 1500 aa34.88■■■■□ 3.17
FGFR4-216ENST00000514472 VWDEQ8N2E2 1590 aa34.87■■■■□ 3.17
FGFR4-216ENST00000514472 NPHP4O75161 1426 aaPredicted RBP34.87■■■■□ 3.17
FGFR4-216ENST00000514472 DISP3Q9P2K9 1392 aa34.87■■■■□ 3.17
FGFR4-216ENST00000514472 UBR1Q8IWV7 1749 aa34.86■■■■□ 3.17
FGFR4-216ENST00000514472 IQGAP1P46940 1657 aa34.86■■■■□ 3.17
FGFR4-216ENST00000514472 ARHGAP31Q2M1Z3 1444 aa34.85■■■■□ 3.17
FGFR4-216ENST00000514472 ANKRD30AQ9BXX3 1397 aa34.77■■■■□ 3.16
FGFR4-216ENST00000514472 CHIC2Q9UKJ5 165 aa34.77■■■■□ 3.16
FGFR4-216ENST00000514472 STRCP1A6NGW2 1772 aa34.76■■■■□ 3.15
FGFR4-216ENST00000514472 GRWD1Q9BQ67 446 aaKnown RBP eCLIP34.75■■■■□ 3.15
FGFR4-216ENST00000514472 ILDR2Q71H61 639 aa34.73■■■■□ 3.15
FGFR4-216ENST00000514472 KANK1Q14678 1352 aa34.72■■■■□ 3.15
FGFR4-216ENST00000514472 ARHGAP23Q9P227 1491 aa34.71■■■■□ 3.15
FGFR4-216ENST00000514472 SLIT1O75093 1534 aa34.71■■■■□ 3.15
FGFR4-216ENST00000514472 LMTK2Q8IWU2 1503 aa34.71■■■■□ 3.15
FGFR4-216ENST00000514472 ADGRL2O95490 1459 aa34.7■■■■□ 3.15
FGFR4-216ENST00000514472 PIK3C2BO00750 1634 aa34.68■■■■□ 3.14
FGFR4-216ENST00000514472 TOM1O60784 492 aa34.68■■■■□ 3.14
FGFR4-216ENST00000514472 SCAF11Q99590 1463 aaKnown RBP34.68■■■■□ 3.14
FGFR4-216ENST00000514472 LTKP29376 864 aa34.66■■■■□ 3.14
FGFR4-216ENST00000514472 ALKQ9UM73 1620 aa34.63■■■■□ 3.13
FGFR4-216ENST00000514472 KDM5AP29375 1690 aaKnown RBP34.63■■■■□ 3.13
FGFR4-216ENST00000514472 PIP4K2BP78356 416 aa34.62■■■■□ 3.13
FGFR4-216ENST00000514472 LRRC7Q96NW7 1537 aa34.61■■■■□ 3.13
FGFR4-216ENST00000514472 TXNDC2Q86VQ3 553 aa34.61■■■■□ 3.13
FGFR4-216ENST00000514472 FAM50AQ14320 339 aaKnown RBP34.6■■■■□ 3.13
FGFR4-216ENST00000514472 SCAF1Q9H7N4 1312 aaKnown RBP34.59■■■■□ 3.13
FGFR4-216ENST00000514472 SYNMO15061 1565 aa34.59■■■■□ 3.13
FGFR4-216ENST00000514472 EFCAB6Q5THR3 1501 aa34.59■■■■□ 3.13
FGFR4-216ENST00000514472 HSPA1LP34931 641 aa34.57■■■■□ 3.12
FGFR4-216ENST00000514472 IDI1Q13907 227 aa34.56■■■■□ 3.12
FGFR4-216ENST00000514472 TMEM2Q9UHN6 1383 aa34.56■■■■□ 3.12
FGFR4-216ENST00000514472 NOS1P29475 1434 aa34.55■■■■□ 3.12
FGFR4-216ENST00000514472 EID1Q9Y6B2 187 aa34.55■■■■□ 3.12
FGFR4-216ENST00000514472 ANKRD50Q9ULJ7 1429 aa34.53■■■■□ 3.12
FGFR4-216ENST00000514472 STAG3Q9UJ98 1225 aa34.51■■■■□ 3.12
FGFR4-216ENST00000514472 XIRP1Q702N8 1843 aaKnown RBP34.51■■■■□ 3.11
FGFR4-216ENST00000514472 SOCS7O14512 581 aa34.49■■■■□ 3.11
FGFR4-216ENST00000514472 RPRD2Q5VT52 1461 aaKnown RBP34.46■■■■□ 3.11
FGFR4-216ENST00000514472 ADGRB3O60242 1522 aa34.45■■■■□ 3.1
FGFR4-216ENST00000514472 TET3O43151 1660 aa34.44■■■■□ 3.1
FGFR4-216ENST00000514472 SLC52A1Q9NWF4 448 aa34.43■■■■□ 3.1
FGFR4-216ENST00000514472 GCC2Q8IWJ2 1684 aa34.41■■■■□ 3.1
FGFR4-216ENST00000514472 MYO5BQ9ULV0 1848 aa34.4■■■■□ 3.1
FGFR4-216ENST00000514472 UNC13BO14795 1591 aa34.4■■■■□ 3.1
FGFR4-216ENST00000514472 MED1Q15648 1581 aaPredicted RBP34.38■■■■□ 3.09
FGFR4-216ENST00000514472 ROCK1Q13464 1354 aa34.36■■■■□ 3.09
FGFR4-216ENST00000514472 SLC26A8Q96RN1 970 aa34.31■■■■□ 3.08
FGFR4-216ENST00000514472 KCNA6P17658 529 aa34.3■■■■□ 3.08
FGFR4-216ENST00000514472 E9PCH4 1651 aa34.3■■■■□ 3.08
FGFR4-216ENST00000514472 TMEM131LA2VDJ0 1609 aa34.3■■■■□ 3.08
FGFR4-216ENST00000514472 ZFYVE9O95405 1425 aa34.29■■■■□ 3.08
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