RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000514128.1

SIMC1-211, Transcript of SUMO interacting motifs containing 1, humanhuman

TSL 2

Gene SIMC1, Length 697 nt, Biotype processed transcript.

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SIMC1-211ENST00000514128 KDM5DQ9BY66 1539 aa38.33■■■■□ 3.73
SIMC1-211ENST00000514128 PTPRTO14522 1441 aa38.32■■■■□ 3.73
SIMC1-211ENST00000514128 CERKQ8TCT0 537 aa38.32■■■■□ 3.72
SIMC1-211ENST00000514128 CEP170BQ9Y4F5 1589 aaPredicted RBP38.31■■■■□ 3.72
SIMC1-211ENST00000514128 WASHC2CQ9Y4E1 1318 aa38.21■■■■□ 3.71
SIMC1-211ENST00000514128 RNF17Q9BXT8 1623 aaKnown RBP38.21■■■■□ 3.71
SIMC1-211ENST00000514128 EIF2AK4Q9P2K8 1649 aaKnown RBP38.21■■■■□ 3.71
SIMC1-211ENST00000514128 PZPP20742 1482 aa38.2■■■■□ 3.71
SIMC1-211ENST00000514128 PTPN23Q9H3S7 1636 aa38.2■■■■□ 3.7
SIMC1-211ENST00000514128 PLA2R1Q13018 1463 aa38.19■■■■□ 3.7
SIMC1-211ENST00000514128 CROCC2H7BZ55 1655 aa38.19■■■■□ 3.7
SIMC1-211ENST00000514128 A2ML1A8K2U0 1454 aa38.16■■■■□ 3.7
SIMC1-211ENST00000514128 ZC3H13Q5T200 1668 aaKnown RBP38.16■■■■□ 3.7
SIMC1-211ENST00000514128 TNRQ92752 1358 aa38.14■■■■□ 3.7
SIMC1-211ENST00000514128 SHANK2Q9UPX8 1470 aa38.12■■■■□ 3.69
SIMC1-211ENST00000514128 DUOX2Q9NRD8 1548 aa38.12■■■■□ 3.69
SIMC1-211ENST00000514128 DNMT1P26358 1616 aaKnown RBP38.1■■■■□ 3.69
SIMC1-211ENST00000514128 NCKAP5LQ9HCH0 1330 aa38.09■■■■□ 3.69
SIMC1-211ENST00000514128 PKD2Q13563 968 aa38.08■■■■□ 3.69
SIMC1-211ENST00000514128 FGD6Q6ZV73 1430 aa38.08■■■■□ 3.69
SIMC1-211ENST00000514128 TCOF1Q13428 1488 aaKnown RBP38.08■■■■□ 3.69
SIMC1-211ENST00000514128 FBXO31Q5XUX0 539 aaPredicted RBP38.07■■■■□ 3.68
SIMC1-211ENST00000514128 ABCC3O15438 1527 aa38.07■■■■□ 3.68
SIMC1-211ENST00000514128 LTBP4Q8N2S1 1624 aa38.04■■■■□ 3.68
SIMC1-211ENST00000514128 ABCC5O15440 1437 aa38.04■■■■□ 3.68
SIMC1-211ENST00000514128 KIF15Q9NS87 1388 aa38.03■■■■□ 3.68
SIMC1-211ENST00000514128 MROH1Q8NDA8 1641 aa38.02■■■■□ 3.68
SIMC1-211ENST00000514128 CEP152O94986 1710 aa38.02■■■■□ 3.68
SIMC1-211ENST00000514128 POLR1AO95602 1720 aaPredicted RBP38.02■■■■□ 3.68
SIMC1-211ENST00000514128 DAPK1P53355 1430 aa38.02■■■■□ 3.68
SIMC1-211ENST00000514128 NLRP1Q9C000 1473 aa38■■■■□ 3.67
SIMC1-211ENST00000514128 ERBINQ96RT1 1412 aa37.98■■■■□ 3.67
SIMC1-211ENST00000514128 IQSEC2Q5JU85 1478 aa37.94■■■■□ 3.66
SIMC1-211ENST00000514128 PRDM15P57071 1507 aaPredicted RBP37.93■■■■□ 3.66
SIMC1-211ENST00000514128 RRP7BPQ9NSQ0 103 aa37.93■■■■□ 3.66
SIMC1-211ENST00000514128 SPATA31D1Q6ZQQ2 1576 aa37.93■■■■□ 3.66
SIMC1-211ENST00000514128 UGGT1Q9NYU2 1555 aa37.92■■■■□ 3.66
SIMC1-211ENST00000514128 ERVK-7P63135 1459 aa37.9■■■■□ 3.66
SIMC1-211ENST00000514128 CFAP65Q6ZU64 1925 aaKnown RBP37.89■■■■□ 3.66
SIMC1-211ENST00000514128 ZNF335Q9H4Z2 1342 aaPredicted RBP37.88■■■■□ 3.66
SIMC1-211ENST00000514128 ANKRD30AQ9BXX3 1397 aa37.88■■■■□ 3.65
SIMC1-211ENST00000514128 NEURL4Q96JN8 1562 aa37.86■■■■□ 3.65
SIMC1-211ENST00000514128 THEMISQ8N1K5 641 aaPredicted RBP37.86■■■■□ 3.65
SIMC1-211ENST00000514128 DEPDC5O75140 1603 aa37.86■■■■□ 3.65
SIMC1-211ENST00000514128 DROSHAQ9NRR4 1374 aaKnown RBP eCLIP37.83■■■■□ 3.65
SIMC1-211ENST00000514128 CHIC2Q9UKJ5 165 aa37.82■■■■□ 3.64
SIMC1-211ENST00000514128 KANK1Q14678 1352 aa37.8■■■■□ 3.64
SIMC1-211ENST00000514128 ANKLE2Q86XL3 938 aa37.8■■■■□ 3.64
SIMC1-211ENST00000514128 FAM50AQ14320 339 aaKnown RBP37.79■■■■□ 3.64
SIMC1-211ENST00000514128 GRWD1Q9BQ67 446 aaKnown RBP eCLIP37.77■■■■□ 3.64
SIMC1-211ENST00000514128 ARHGAP31Q2M1Z3 1444 aa37.75■■■■□ 3.63
SIMC1-211ENST00000514128 ADGRL2O95490 1459 aa37.74■■■■□ 3.63
SIMC1-211ENST00000514128 UBR1Q8IWV7 1749 aa37.72■■■■□ 3.63
SIMC1-211ENST00000514128 IQGAP1P46940 1657 aa37.71■■■■□ 3.63
SIMC1-211ENST00000514128 NPHP4O75161 1426 aaPredicted RBP37.7■■■■□ 3.63
SIMC1-211ENST00000514128 MED14O60244 1454 aa37.69■■■■□ 3.62
SIMC1-211ENST00000514128 CPS1P31327 1500 aa37.67■■■■□ 3.62
SIMC1-211ENST00000514128 LMTK2Q8IWU2 1503 aa37.65■■■■□ 3.62
SIMC1-211ENST00000514128 VWDEQ8N2E2 1590 aa37.64■■■■□ 3.62
SIMC1-211ENST00000514128 UBAP1LF5GYI3 381 aa37.61■■■■□ 3.61
SIMC1-211ENST00000514128 EFCAB6Q5THR3 1501 aa37.59■■■■□ 3.61
SIMC1-211ENST00000514128 ANKRD50Q9ULJ7 1429 aa37.59■■■■□ 3.61
SIMC1-211ENST00000514128 PIK3C2BO00750 1634 aa37.58■■■■□ 3.61
SIMC1-211ENST00000514128 SCAF11Q99590 1463 aaKnown RBP37.57■■■■□ 3.6
SIMC1-211ENST00000514128 SLIT1O75093 1534 aa37.53■■■■□ 3.6
SIMC1-211ENST00000514128 KDM5AP29375 1690 aaKnown RBP37.51■■■■□ 3.6
SIMC1-211ENST00000514128 STAG3Q9UJ98 1225 aa37.51■■■■□ 3.6
SIMC1-211ENST00000514128 ARHGAP23Q9P227 1491 aa37.51■■■■□ 3.59
SIMC1-211ENST00000514128 SYNMO15061 1565 aa37.48■■■■□ 3.59
SIMC1-211ENST00000514128 EID1Q9Y6B2 187 aa37.46■■■■□ 3.59
SIMC1-211ENST00000514128 TET3O43151 1660 aa37.46■■■■□ 3.59
SIMC1-211ENST00000514128 UNC13BO14795 1591 aa37.44■■■■□ 3.58
SIMC1-211ENST00000514128 TXNDC2Q86VQ3 553 aa37.44■■■■□ 3.58
SIMC1-211ENST00000514128 RPRD2Q5VT52 1461 aaKnown RBP37.44■■■■□ 3.58
SIMC1-211ENST00000514128 NOS1P29475 1434 aa37.43■■■■□ 3.58
SIMC1-211ENST00000514128 GCC2Q8IWJ2 1684 aa37.42■■■■□ 3.58
SIMC1-211ENST00000514128 STRCP1A6NGW2 1772 aa37.42■■■■□ 3.58
SIMC1-211ENST00000514128 ROCK1Q13464 1354 aa37.42■■■■□ 3.58
SIMC1-211ENST00000514128 TMEM2Q9UHN6 1383 aa37.41■■■■□ 3.58
SIMC1-211ENST00000514128 ADGRB3O60242 1522 aa37.4■■■■□ 3.58
SIMC1-211ENST00000514128 SCAF1Q9H7N4 1312 aaKnown RBP37.39■■■■□ 3.58
SIMC1-211ENST00000514128 TOM1O60784 492 aa37.39■■■■□ 3.58
SIMC1-211ENST00000514128 LTKP29376 864 aa37.39■■■■□ 3.58
SIMC1-211ENST00000514128 DISP3Q9P2K9 1392 aa37.39■■■■□ 3.58
SIMC1-211ENST00000514128 IDI1Q13907 227 aa37.38■■■■□ 3.57
SIMC1-211ENST00000514128 PPARGC1BQ86YN6 1023 aaKnown RBP37.37■■■■□ 3.57
SIMC1-211ENST00000514128 ITGAEP38570 1179 aa37.33■■■■□ 3.57
SIMC1-211ENST00000514128 SLC52A1Q9NWF4 448 aa37.33■■■■□ 3.57
SIMC1-211ENST00000514128 PIP4K2BP78356 416 aa37.32■■■■□ 3.56
SIMC1-211ENST00000514128 LRRC7Q96NW7 1537 aa37.31■■■■□ 3.56
SIMC1-211ENST00000514128 IQGAP3Q86VI3 1631 aa37.29■■■■□ 3.56
SIMC1-211ENST00000514128 E9PCH4 1651 aa37.25■■■■□ 3.55
SIMC1-211ENST00000514128 MYO5BQ9ULV0 1848 aa37.25■■■■□ 3.55
SIMC1-211ENST00000514128 ALKQ9UM73 1620 aa37.18■■■■□ 3.54
SIMC1-211ENST00000514128 NUP155O75694 1391 aa37.17■■■■□ 3.54
SIMC1-211ENST00000514128 TMEM131LA2VDJ0 1609 aa37.17■■■■□ 3.54
SIMC1-211ENST00000514128 HSPA1LP34931 641 aa37.15■■■■□ 3.54
SIMC1-211ENST00000514128 BCANQ96GW7 911 aa37.14■■■■□ 3.54
SIMC1-211ENST00000514128 XIRP1Q702N8 1843 aaKnown RBP37.14■■■■□ 3.54
SIMC1-211ENST00000514128 RRBP1Q9P2E9 1410 aaKnown RBP37.11■■■■□ 3.53
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