RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000508769.1

SIMC1-210, Transcript of SUMO interacting motifs containing 1, humanhuman

TSL 3

Gene SIMC1, Length 461 nt, Biotype processed transcript.

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SIMC1-210ENST00000508769 PTPRTO14522 1441 aa36.64■■■■□ 3.46
SIMC1-210ENST00000508769 DMRT2Q9Y5R5 561 aa36.63■■■■□ 3.45
SIMC1-210ENST00000508769 RNF17Q9BXT8 1623 aaKnown RBP36.58■■■■□ 3.45
SIMC1-210ENST00000508769 PTPN23Q9H3S7 1636 aa36.58■■■■□ 3.45
SIMC1-210ENST00000508769 FBXO31Q5XUX0 539 aaPredicted RBP36.57■■■■□ 3.44
SIMC1-210ENST00000508769 CROCC2H7BZ55 1655 aa36.57■■■■□ 3.44
SIMC1-210ENST00000508769 NCKAP5LQ9HCH0 1330 aa36.56■■■■□ 3.44
SIMC1-210ENST00000508769 FAM135AQ9P2D6 1515 aa36.55■■■■□ 3.44
SIMC1-210ENST00000508769 PZPP20742 1482 aa36.55■■■■□ 3.44
SIMC1-210ENST00000508769 MROH1Q8NDA8 1641 aa36.53■■■■□ 3.44
SIMC1-210ENST00000508769 DNMT1P26358 1616 aaKnown RBP36.52■■■■□ 3.44
SIMC1-210ENST00000508769 APLP2Q06481 763 aa36.52■■■■□ 3.44
SIMC1-210ENST00000508769 WASHC2CQ9Y4E1 1318 aa36.52■■■■□ 3.44
SIMC1-210ENST00000508769 LTBP4Q8N2S1 1624 aa36.52■■■■□ 3.44
SIMC1-210ENST00000508769 EIF2AK4Q9P2K8 1649 aaKnown RBP36.51■■■■□ 3.43
SIMC1-210ENST00000508769 A2ML1A8K2U0 1454 aa36.5■■■■□ 3.43
SIMC1-210ENST00000508769 ABCC5O15440 1437 aa36.5■■■■□ 3.43
SIMC1-210ENST00000508769 PLA2R1Q13018 1463 aa36.5■■■■□ 3.43
SIMC1-210ENST00000508769 TNRQ92752 1358 aa36.48■■■■□ 3.43
SIMC1-210ENST00000508769 TCOF1Q13428 1488 aaKnown RBP36.48■■■■□ 3.43
SIMC1-210ENST00000508769 ABCC3O15438 1527 aa36.48■■■■□ 3.43
SIMC1-210ENST00000508769 FGD6Q6ZV73 1430 aa36.46■■■■□ 3.43
SIMC1-210ENST00000508769 CEP152O94986 1710 aa36.45■■■■□ 3.43
SIMC1-210ENST00000508769 SHANK2Q9UPX8 1470 aa36.43■■■■□ 3.42
SIMC1-210ENST00000508769 ZC3H13Q5T200 1668 aaKnown RBP36.43■■■■□ 3.42
SIMC1-210ENST00000508769 DUOX2Q9NRD8 1548 aa36.43■■■■□ 3.42
SIMC1-210ENST00000508769 DAPK1P53355 1430 aa36.41■■■■□ 3.42
SIMC1-210ENST00000508769 KIF15Q9NS87 1388 aa36.39■■■■□ 3.42
SIMC1-210ENST00000508769 CFAP65Q6ZU64 1925 aaKnown RBP36.38■■■■□ 3.41
SIMC1-210ENST00000508769 POLR1AO95602 1720 aaPredicted RBP36.37■■■■□ 3.41
SIMC1-210ENST00000508769 ZNF335Q9H4Z2 1342 aaPredicted RBP36.35■■■■□ 3.41
SIMC1-210ENST00000508769 PKD2Q13563 968 aa36.35■■■■□ 3.41
SIMC1-210ENST00000508769 NEURL4Q96JN8 1562 aa36.35■■■■□ 3.41
SIMC1-210ENST00000508769 RRP7BPQ9NSQ0 103 aa36.34■■■■□ 3.41
SIMC1-210ENST00000508769 SPATA31D1Q6ZQQ2 1576 aa36.32■■■■□ 3.41
SIMC1-210ENST00000508769 PRDM15P57071 1507 aaPredicted RBP36.3■■■■□ 3.4
SIMC1-210ENST00000508769 ERVK-7P63135 1459 aa36.3■■■■□ 3.4
SIMC1-210ENST00000508769 NLRP1Q9C000 1473 aa36.29■■■■□ 3.4
SIMC1-210ENST00000508769 ERBINQ96RT1 1412 aa36.28■■■■□ 3.4
SIMC1-210ENST00000508769 CHIC2Q9UKJ5 165 aa36.27■■■■□ 3.4
SIMC1-210ENST00000508769 UGGT1Q9NYU2 1555 aa36.27■■■■□ 3.4
SIMC1-210ENST00000508769 DROSHAQ9NRR4 1374 aaKnown RBP eCLIP36.27■■■■□ 3.4
SIMC1-210ENST00000508769 DEPDC5O75140 1603 aa36.26■■■■□ 3.4
SIMC1-210ENST00000508769 IQSEC2Q5JU85 1478 aa36.2■■■■□ 3.39
SIMC1-210ENST00000508769 GRWD1Q9BQ67 446 aaKnown RBP eCLIP36.17■■■■□ 3.38
SIMC1-210ENST00000508769 ANKRD30AQ9BXX3 1397 aa36.16■■■■□ 3.38
SIMC1-210ENST00000508769 UBR1Q8IWV7 1749 aa36.14■■■■□ 3.38
SIMC1-210ENST00000508769 FAM50AQ14320 339 aaKnown RBP36.14■■■■□ 3.38
SIMC1-210ENST00000508769 THEMISQ8N1K5 641 aaPredicted RBP36.13■■■■□ 3.37
SIMC1-210ENST00000508769 ADGRL2O95490 1459 aa36.12■■■■□ 3.37
SIMC1-210ENST00000508769 ARHGAP31Q2M1Z3 1444 aa36.11■■■■□ 3.37
SIMC1-210ENST00000508769 VWDEQ8N2E2 1590 aa36.1■■■■□ 3.37
SIMC1-210ENST00000508769 ANKLE2Q86XL3 938 aa36.1■■■■□ 3.37
SIMC1-210ENST00000508769 NPHP4O75161 1426 aaPredicted RBP36.08■■■■□ 3.37
SIMC1-210ENST00000508769 IQGAP1P46940 1657 aa36.07■■■■□ 3.37
SIMC1-210ENST00000508769 MED14O60244 1454 aa36.07■■■■□ 3.37
SIMC1-210ENST00000508769 LMTK2Q8IWU2 1503 aa36.03■■■■□ 3.36
SIMC1-210ENST00000508769 PIK3C2BO00750 1634 aa36.02■■■■□ 3.36
SIMC1-210ENST00000508769 KANK1Q14678 1352 aa36.02■■■■□ 3.36
SIMC1-210ENST00000508769 STRCP1A6NGW2 1772 aa35.99■■■■□ 3.35
SIMC1-210ENST00000508769 PPARGC1BQ86YN6 1023 aaKnown RBP35.98■■■■□ 3.35
SIMC1-210ENST00000508769 EFCAB6Q5THR3 1501 aa35.98■■■■□ 3.35
SIMC1-210ENST00000508769 SYNMO15061 1565 aa35.98■■■■□ 3.35
SIMC1-210ENST00000508769 UBAP1LF5GYI3 381 aa35.96■■■■□ 3.35
SIMC1-210ENST00000508769 CPS1P31327 1500 aa35.96■■■■□ 3.35
SIMC1-210ENST00000508769 ANKRD50Q9ULJ7 1429 aa35.95■■■■□ 3.35
SIMC1-210ENST00000508769 ARHGAP23Q9P227 1491 aa35.94■■■■□ 3.34
SIMC1-210ENST00000508769 SLIT1O75093 1534 aa35.93■■■■□ 3.34
SIMC1-210ENST00000508769 SCAF11Q99590 1463 aaKnown RBP35.92■■■■□ 3.34
SIMC1-210ENST00000508769 LTKP29376 864 aa35.91■■■■□ 3.34
SIMC1-210ENST00000508769 NOS1P29475 1434 aa35.87■■■■□ 3.33
SIMC1-210ENST00000508769 UNC13BO14795 1591 aa35.85■■■■□ 3.33
SIMC1-210ENST00000508769 IDI1Q13907 227 aa35.84■■■■□ 3.33
SIMC1-210ENST00000508769 TET3O43151 1660 aa35.83■■■■□ 3.33
SIMC1-210ENST00000508769 KDM5AP29375 1690 aaKnown RBP35.83■■■■□ 3.33
SIMC1-210ENST00000508769 TXNDC2Q86VQ3 553 aa35.82■■■■□ 3.32
SIMC1-210ENST00000508769 ALKQ9UM73 1620 aa35.82■■■■□ 3.32
SIMC1-210ENST00000508769 TMEM2Q9UHN6 1383 aa35.8■■■■□ 3.32
SIMC1-210ENST00000508769 GCC2Q8IWJ2 1684 aa35.78■■■■□ 3.32
SIMC1-210ENST00000508769 MYO5BQ9ULV0 1848 aa35.78■■■■□ 3.32
SIMC1-210ENST00000508769 ADGRB3O60242 1522 aa35.78■■■■□ 3.32
SIMC1-210ENST00000508769 LRRC7Q96NW7 1537 aa35.78■■■■□ 3.32
SIMC1-210ENST00000508769 ROCK1Q13464 1354 aa35.76■■■■□ 3.32
SIMC1-210ENST00000508769 ITGAEP38570 1179 aa35.76■■■■□ 3.32
SIMC1-210ENST00000508769 STAG3Q9UJ98 1225 aa35.75■■■■□ 3.31
SIMC1-210ENST00000508769 DISP3Q9P2K9 1392 aa35.75■■■■□ 3.31
SIMC1-210ENST00000508769 RPRD2Q5VT52 1461 aaKnown RBP35.73■■■■□ 3.31
SIMC1-210ENST00000508769 E9PCH4 1651 aa35.73■■■■□ 3.31
SIMC1-210ENST00000508769 PIP4K2BP78356 416 aa35.73■■■■□ 3.31
SIMC1-210ENST00000508769 SCAF1Q9H7N4 1312 aaKnown RBP35.71■■■■□ 3.31
SIMC1-210ENST00000508769 XIRP1Q702N8 1843 aaKnown RBP35.71■■■■□ 3.31
SIMC1-210ENST00000508769 EID1Q9Y6B2 187 aa35.7■■■■□ 3.31
SIMC1-210ENST00000508769 IQGAP3Q86VI3 1631 aa35.69■■■■□ 3.3
SIMC1-210ENST00000508769 TOM1O60784 492 aa35.66■■■■□ 3.3
SIMC1-210ENST00000508769 HSPA1LP34931 641 aa35.63■■■■□ 3.29
SIMC1-210ENST00000508769 ILDR2Q71H61 639 aa35.63■■■■□ 3.29
SIMC1-210ENST00000508769 SLC52A1Q9NWF4 448 aa35.63■■■■□ 3.29
SIMC1-210ENST00000508769 TMEM131LA2VDJ0 1609 aa35.63■■■■□ 3.29
SIMC1-210ENST00000508769 SENP3Q9H4L4 574 aaPredicted RBP35.59■■■■□ 3.29
SIMC1-210ENST00000508769 SLC26A8Q96RN1 970 aa35.58■■■■□ 3.29
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 28.4 ms