RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000496465.1

TM2D1-211, Transcript of TM2 domain containing 1, humanhuman

TSL 2

Gene TM2D1, Length 577 nt, Biotype nonsense mediated decay, Subcellular localisation Endoplasmic reticulum, Ribosome .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TM2D1-211ENST00000496465 PTPN23Q9H3S7 1636 aa28.55■■■□□ 2.16
TM2D1-211ENST00000496465 PTPRTO14522 1441 aa28.55■■■□□ 2.16
TM2D1-211ENST00000496465 CAMSAP1Q5T5Y3 1602 aa28.54■■■□□ 2.16
TM2D1-211ENST00000496465 RNF17Q9BXT8 1623 aaKnown RBP28.54■■■□□ 2.16
TM2D1-211ENST00000496465 CROCC2H7BZ55 1655 aa28.53■■■□□ 2.16
TM2D1-211ENST00000496465 EIF2AK4Q9P2K8 1649 aaKnown RBP28.53■■■□□ 2.16
TM2D1-211ENST00000496465 CEP170BQ9Y4F5 1589 aaPredicted RBP28.52■■■□□ 2.16
TM2D1-211ENST00000496465 CERKQ8TCT0 537 aa28.5■■■□□ 2.15
TM2D1-211ENST00000496465 WASHC2CQ9Y4E1 1318 aa28.49■■■□□ 2.15
TM2D1-211ENST00000496465 PZPP20742 1482 aa28.49■■■□□ 2.15
TM2D1-211ENST00000496465 SHANK2Q9UPX8 1470 aa28.48■■■□□ 2.15
TM2D1-211ENST00000496465 FGD6Q6ZV73 1430 aa28.48■■■□□ 2.15
TM2D1-211ENST00000496465 TCOF1Q13428 1488 aaKnown RBP28.47■■■□□ 2.15
TM2D1-211ENST00000496465 ABCC5O15440 1437 aa28.47■■■□□ 2.15
TM2D1-211ENST00000496465 ZC3H13Q5T200 1668 aaKnown RBP28.46■■■□□ 2.15
TM2D1-211ENST00000496465 DUOX2Q9NRD8 1548 aa28.46■■■□□ 2.15
TM2D1-211ENST00000496465 DNMT1P26358 1616 aaKnown RBP28.46■■■□□ 2.15
TM2D1-211ENST00000496465 PLA2R1Q13018 1463 aa28.45■■■□□ 2.14
TM2D1-211ENST00000496465 A2ML1A8K2U0 1454 aa28.44■■■□□ 2.14
TM2D1-211ENST00000496465 MROH1Q8NDA8 1641 aa28.43■■■□□ 2.14
TM2D1-211ENST00000496465 FBXO31Q5XUX0 539 aaPredicted RBP28.42■■■□□ 2.14
TM2D1-211ENST00000496465 DAPK1P53355 1430 aa28.42■■■□□ 2.14
TM2D1-211ENST00000496465 TNRQ92752 1358 aa28.41■■■□□ 2.14
TM2D1-211ENST00000496465 ABCC3O15438 1527 aa28.41■■■□□ 2.14
TM2D1-211ENST00000496465 KIF15Q9NS87 1388 aa28.38■■■□□ 2.13
TM2D1-211ENST00000496465 PKD2Q13563 968 aa28.38■■■□□ 2.13
TM2D1-211ENST00000496465 NCKAP5LQ9HCH0 1330 aa28.38■■■□□ 2.13
TM2D1-211ENST00000496465 ERBINQ96RT1 1412 aa28.36■■■□□ 2.13
TM2D1-211ENST00000496465 CEP152O94986 1710 aa28.36■■■□□ 2.13
TM2D1-211ENST00000496465 LTBP4Q8N2S1 1624 aa28.35■■■□□ 2.13
TM2D1-211ENST00000496465 RRP7BPQ9NSQ0 103 aa28.33■■■□□ 2.13
TM2D1-211ENST00000496465 NLRP1Q9C000 1473 aa28.33■■■□□ 2.13
TM2D1-211ENST00000496465 PRDM15P57071 1507 aaPredicted RBP28.32■■■□□ 2.12
TM2D1-211ENST00000496465 SPATA31D1Q6ZQQ2 1576 aa28.32■■■□□ 2.12
TM2D1-211ENST00000496465 DEPDC5O75140 1603 aa28.31■■■□□ 2.12
TM2D1-211ENST00000496465 POLR1AO95602 1720 aaPredicted RBP28.31■■■□□ 2.12
TM2D1-211ENST00000496465 CFAP65Q6ZU64 1925 aaKnown RBP28.3■■■□□ 2.12
TM2D1-211ENST00000496465 ANKRD30AQ9BXX3 1397 aa28.28■■■□□ 2.12
TM2D1-211ENST00000496465 ERVK-7P63135 1459 aa28.26■■■□□ 2.11
TM2D1-211ENST00000496465 UGGT1Q9NYU2 1555 aa28.25■■■□□ 2.11
TM2D1-211ENST00000496465 ADGRL2O95490 1459 aa28.24■■■□□ 2.11
TM2D1-211ENST00000496465 IQSEC2Q5JU85 1478 aa28.24■■■□□ 2.11
TM2D1-211ENST00000496465 CHIC2Q9UKJ5 165 aa28.24■■■□□ 2.11
TM2D1-211ENST00000496465 THEMISQ8N1K5 641 aaPredicted RBP28.23■■■□□ 2.11
TM2D1-211ENST00000496465 ARHGAP31Q2M1Z3 1444 aa28.23■■■□□ 2.11
TM2D1-211ENST00000496465 NEURL4Q96JN8 1562 aa28.23■■■□□ 2.11
TM2D1-211ENST00000496465 FAM50AQ14320 339 aaKnown RBP28.2■■■□□ 2.1
TM2D1-211ENST00000496465 ZNF335Q9H4Z2 1342 aaPredicted RBP28.19■■■□□ 2.1
TM2D1-211ENST00000496465 DROSHAQ9NRR4 1374 aaKnown RBP eCLIP28.19■■■□□ 2.1
TM2D1-211ENST00000496465 VWDEQ8N2E2 1590 aa28.18■■■□□ 2.1
TM2D1-211ENST00000496465 KANK1Q14678 1352 aa28.17■■■□□ 2.1
TM2D1-211ENST00000496465 ANKLE2Q86XL3 938 aa28.16■■■□□ 2.1
TM2D1-211ENST00000496465 GRWD1Q9BQ67 446 aaKnown RBP eCLIP28.16■■■□□ 2.1
TM2D1-211ENST00000496465 LMTK2Q8IWU2 1503 aa28.16■■■□□ 2.1
TM2D1-211ENST00000496465 UBR1Q8IWV7 1749 aa28.15■■■□□ 2.1
TM2D1-211ENST00000496465 MED14O60244 1454 aa28.14■■■□□ 2.09
TM2D1-211ENST00000496465 ANKRD50Q9ULJ7 1429 aa28.09■■■□□ 2.09
TM2D1-211ENST00000496465 IQGAP1P46940 1657 aa28.08■■■□□ 2.09
TM2D1-211ENST00000496465 NPHP4O75161 1426 aaPredicted RBP28.08■■■□□ 2.09
TM2D1-211ENST00000496465 EFCAB6Q5THR3 1501 aa28.06■■■□□ 2.08
TM2D1-211ENST00000496465 KDM5AP29375 1690 aaKnown RBP28.03■■■□□ 2.08
TM2D1-211ENST00000496465 PIK3C2BO00750 1634 aa28.03■■■□□ 2.08
TM2D1-211ENST00000496465 SLIT1O75093 1534 aa28.02■■■□□ 2.08
TM2D1-211ENST00000496465 CPS1P31327 1500 aa28.02■■■□□ 2.08
TM2D1-211ENST00000496465 ROCK1Q13464 1354 aa28.02■■■□□ 2.08
TM2D1-211ENST00000496465 ARHGAP23Q9P227 1491 aa28.02■■■□□ 2.08
TM2D1-211ENST00000496465 SYNMO15061 1565 aa27.99■■■□□ 2.07
TM2D1-211ENST00000496465 NOS1P29475 1434 aa27.99■■■□□ 2.07
TM2D1-211ENST00000496465 SCAF11Q99590 1463 aaKnown RBP27.98■■■□□ 2.07
TM2D1-211ENST00000496465 UNC13BO14795 1591 aa27.98■■■□□ 2.07
TM2D1-211ENST00000496465 TET3O43151 1660 aa27.97■■■□□ 2.07
TM2D1-211ENST00000496465 RPRD2Q5VT52 1461 aaKnown RBP27.96■■■□□ 2.07
TM2D1-211ENST00000496465 PPARGC1BQ86YN6 1023 aaKnown RBP27.96■■■□□ 2.07
TM2D1-211ENST00000496465 GCC2Q8IWJ2 1684 aa27.95■■■□□ 2.07
TM2D1-211ENST00000496465 IDI1Q13907 227 aa27.94■■■□□ 2.06
TM2D1-211ENST00000496465 UBAP1LF5GYI3 381 aa27.93■■■□□ 2.06
TM2D1-211ENST00000496465 LTKP29376 864 aa27.93■■■□□ 2.06
TM2D1-211ENST00000496465 STRCP1A6NGW2 1772 aa27.93■■■□□ 2.06
TM2D1-211ENST00000496465 TXNDC2Q86VQ3 553 aa27.92■■■□□ 2.06
TM2D1-211ENST00000496465 TMEM2Q9UHN6 1383 aa27.91■■■□□ 2.06
TM2D1-211ENST00000496465 SLC52A1Q9NWF4 448 aa27.89■■■□□ 2.06
TM2D1-211ENST00000496465 STAG3Q9UJ98 1225 aa27.89■■■□□ 2.06
TM2D1-211ENST00000496465 EID1Q9Y6B2 187 aa27.89■■■□□ 2.06
TM2D1-211ENST00000496465 IQGAP3Q86VI3 1631 aa27.88■■■□□ 2.05
TM2D1-211ENST00000496465 ADGRB3O60242 1522 aa27.87■■■□□ 2.05
TM2D1-211ENST00000496465 E9PCH4 1651 aa27.85■■■□□ 2.05
TM2D1-211ENST00000496465 ITGAEP38570 1179 aa27.85■■■□□ 2.05
TM2D1-211ENST00000496465 RRBP1Q9P2E9 1410 aaKnown RBP27.84■■■□□ 2.05
TM2D1-211ENST00000496465 MYO5BQ9ULV0 1848 aa27.83■■■□□ 2.05
TM2D1-211ENST00000496465 LRRC7Q96NW7 1537 aa27.82■■■□□ 2.04
TM2D1-211ENST00000496465 TOM1O60784 492 aa27.8■■■□□ 2.04
TM2D1-211ENST00000496465 TMEM131LA2VDJ0 1609 aa27.78■■■□□ 2.04
TM2D1-211ENST00000496465 NUP155O75694 1391 aa27.77■■■□□ 2.04
TM2D1-211ENST00000496465 ALKQ9UM73 1620 aa27.76■■■□□ 2.03
TM2D1-211ENST00000496465 XIRP1Q702N8 1843 aaKnown RBP27.74■■■□□ 2.03
TM2D1-211ENST00000496465 ZFYVE9O95405 1425 aa27.72■■■□□ 2.03
TM2D1-211ENST00000496465 PIP4K2BP78356 416 aa27.7■■■□□ 2.02
TM2D1-211ENST00000496465 SCAF1Q9H7N4 1312 aaKnown RBP27.67■■■□□ 2.02
TM2D1-211ENST00000496465 RIMS2Q9UQ26 1411 aa27.67■■■□□ 2.02
TM2D1-211ENST00000496465 DISP3Q9P2K9 1392 aa27.66■■■□□ 2.02
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