RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000490677.1

HOXB3-211, Transcript of homeobox B3, humanhuman

TSL 1 (best) BASIC

Gene HOXB3, Length 1,109 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytoplasm, Nucleus .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HOXB3-211ENST00000490677 CAMSAP1Q5T5Y3 1602 aa43.81■■■■■ 4.6
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HOXB3-211ENST00000490677 PTPRTO14522 1441 aa43.77■■■■■ 4.6
HOXB3-211ENST00000490677 DMRT2Q9Y5R5 561 aa43.75■■■■■ 4.59
HOXB3-211ENST00000490677 MROH1Q8NDA8 1641 aa43.71■■■■■ 4.59
HOXB3-211ENST00000490677 PZPP20742 1482 aa43.7■■■■■ 4.59
HOXB3-211ENST00000490677 APLP2Q06481 763 aa43.7■■■■■ 4.59
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HOXB3-211ENST00000490677 CERKQ8TCT0 537 aa43.68■■■■■ 4.58
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HOXB3-211ENST00000490677 A2ML1A8K2U0 1454 aa43.62■■■■■ 4.57
HOXB3-211ENST00000490677 ABCC3O15438 1527 aa43.62■■■■■ 4.57
HOXB3-211ENST00000490677 WASHC2CQ9Y4E1 1318 aa43.61■■■■■ 4.57
HOXB3-211ENST00000490677 FBXO31Q5XUX0 539 aaPredicted RBP43.6■■■■■ 4.57
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HOXB3-211ENST00000490677 TNRQ92752 1358 aa43.54■■■■■ 4.56
HOXB3-211ENST00000490677 NCKAP5LQ9HCH0 1330 aa43.51■■■■■ 4.56
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HOXB3-211ENST00000490677 NLRP1Q9C000 1473 aa43.41■■■■■ 4.54
HOXB3-211ENST00000490677 NEURL4Q96JN8 1562 aa43.41■■■■■ 4.54
HOXB3-211ENST00000490677 RRP7BPQ9NSQ0 103 aa43.39■■■■■ 4.54
HOXB3-211ENST00000490677 ERVK-7P63135 1459 aa43.38■■■■■ 4.53
HOXB3-211ENST00000490677 UGGT1Q9NYU2 1555 aa43.33■■■■■ 4.53
HOXB3-211ENST00000490677 ADGRL2O95490 1459 aa43.32■■■■■ 4.53
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HOXB3-211ENST00000490677 ANKRD30AQ9BXX3 1397 aa43.29■■■■■ 4.52
HOXB3-211ENST00000490677 VWDEQ8N2E2 1590 aa43.28■■■■■ 4.52
HOXB3-211ENST00000490677 CHIC2Q9UKJ5 165 aa43.27■■■■■ 4.52
HOXB3-211ENST00000490677 ARHGAP31Q2M1Z3 1444 aa43.27■■■■■ 4.52
HOXB3-211ENST00000490677 ZNF335Q9H4Z2 1342 aaPredicted RBP43.26■■■■■ 4.52
HOXB3-211ENST00000490677 UBR1Q8IWV7 1749 aa43.25■■■■■ 4.51
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HOXB3-211ENST00000490677 THEMISQ8N1K5 641 aaPredicted RBP43.18■■■■■ 4.5
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HOXB3-211ENST00000490677 CPS1P31327 1500 aa42.97■■■■■ 4.47
HOXB3-211ENST00000490677 UNC13BO14795 1591 aa42.96■■■■■ 4.47
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HOXB3-211ENST00000490677 ROCK1Q13464 1354 aa42.9■■■■■ 4.46
HOXB3-211ENST00000490677 GCC2Q8IWJ2 1684 aa42.89■■■■■ 4.46
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HOXB3-211ENST00000490677 E9PCH4 1651 aa42.78■■■■■ 4.44
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HOXB3-211ENST00000490677 NUP155O75694 1391 aa42.52■■■■■ 4.4
HOXB3-211ENST00000490677 TOM1O60784 492 aa42.51■■■■■ 4.4
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HOXB3-211ENST00000490677 NAIPQ13075 1403 aa42.42■■■■■ 4.38
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