RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000486587.1

LRSAM1-208, Transcript of leucine rich repeat and sterile alpha motif containing 1, human

TSL 3

Gene LRSAM1, Length 827 nt, Biotype processed transcript.

RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	p-Value	Fold Change
LRSAM1-208	ENST00000486587	NCOA1	Q15788	1441 aa		28.15	■■■□□ 2.1
LRSAM1-208	ENST00000486587	RNF17	Q9BXT8	1623 aa	Known RBP	28.14	■■■□□ 2.1
LRSAM1-208	ENST00000486587	EIF2AK4	Q9P2K8	1649 aa	Known RBP	28.11	■■■□□ 2.09
LRSAM1-208	ENST00000486587	FAM135A	Q9P2D6	1515 aa		28.1	■■■□□ 2.09
LRSAM1-208	ENST00000486587	FGD6	Q6ZV73	1430 aa		28.09	■■■□□ 2.09
LRSAM1-208	ENST00000486587	MROH1	Q8NDA8	1641 aa		28.09	■■■□□ 2.09
LRSAM1-208	ENST00000486587	DNMT1	P26358	1616 aa	Known RBP	28.08	■■■□□ 2.09
LRSAM1-208	ENST00000486587	CEP152	O94986	1710 aa		28.08	■■■□□ 2.09
LRSAM1-208	ENST00000486587	PZP	P20742	1482 aa		28.08	■■■□□ 2.09
LRSAM1-208	ENST00000486587	PPP6R1	Q9UPN7	881 aa		28.07	■■■□□ 2.08
LRSAM1-208	ENST00000486587	PTPRT	O14522	1441 aa		28.05	■■■□□ 2.08
LRSAM1-208	ENST00000486587	ABCC3	O15438	1527 aa		28.05	■■■□□ 2.08
LRSAM1-208	ENST00000486587	ABCC5	O15440	1437 aa		28.05	■■■□□ 2.08
LRSAM1-208	ENST00000486587	ZC3H13	Q5T200	1668 aa	Known RBP	28.05	■■■□□ 2.08
LRSAM1-208	ENST00000486587	SHANK2	Q9UPX8	1470 aa		28.05	■■■□□ 2.08
LRSAM1-208	ENST00000486587	CERK	Q8TCT0	537 aa		28.04	■■■□□ 2.08
LRSAM1-208	ENST00000486587	DUOX2	Q9NRD8	1548 aa		28.03	■■■□□ 2.08
LRSAM1-208	ENST00000486587	TCOF1	Q13428	1488 aa	Known RBP	28.03	■■■□□ 2.08
LRSAM1-208	ENST00000486587	WASHC2C	Q9Y4E1	1318 aa		28.03	■■■□□ 2.08
LRSAM1-208	ENST00000486587	FBXO31	Q5XUX0	539 aa	Predicted RBP	28.03	■■■□□ 2.08
LRSAM1-208	ENST00000486587	DMRT2	Q9Y5R5	561 aa		28.03	■■■□□ 2.08
LRSAM1-208	ENST00000486587	DAPK1	P53355	1430 aa		28.02	■■■□□ 2.08
LRSAM1-208	ENST00000486587	A2ML1	A8K2U0	1454 aa		28.02	■■■□□ 2.08
LRSAM1-208	ENST00000486587	TNR	Q92752	1358 aa		28.01	■■■□□ 2.07
LRSAM1-208	ENST00000486587	KIF15	Q9NS87	1388 aa		28	■■■□□ 2.07
LRSAM1-208	ENST00000486587	NCKAP5L	Q9HCH0	1330 aa		28	■■■□□ 2.07
LRSAM1-208	ENST00000486587	PLA2R1	Q13018	1463 aa		27.99	■■■□□ 2.07
LRSAM1-208	ENST00000486587	POLR1A	O95602	1720 aa	Predicted RBP	27.97	■■■□□ 2.07
LRSAM1-208	ENST00000486587	CFAP65	Q6ZU64	1925 aa	Known RBP	27.95	■■■□□ 2.06
LRSAM1-208	ENST00000486587	LTBP4	Q8N2S1	1624 aa		27.95	■■■□□ 2.06
LRSAM1-208	ENST00000486587	PRDM15	P57071	1507 aa	Predicted RBP	27.94	■■■□□ 2.06
LRSAM1-208	ENST00000486587	RRP7BP	Q9NSQ0	103 aa		27.93	■■■□□ 2.06
LRSAM1-208	ENST00000486587	ERBIN	Q96RT1	1412 aa		27.92	■■■□□ 2.06
LRSAM1-208	ENST00000486587	DEPDC5	O75140	1603 aa		27.91	■■■□□ 2.06
LRSAM1-208	ENST00000486587	SPATA31D1	Q6ZQQ2	1576 aa		27.9	■■■□□ 2.06
LRSAM1-208	ENST00000486587	CHIC2	Q9UKJ5	165 aa		27.9	■■■□□ 2.06
LRSAM1-208	ENST00000486587	NEURL4	Q96JN8	1562 aa		27.9	■■■□□ 2.06
LRSAM1-208	ENST00000486587	ERVK-7	P63135	1459 aa		27.89	■■■□□ 2.06
LRSAM1-208	ENST00000486587	NLRP1	Q9C000	1473 aa		27.87	■■■□□ 2.05
LRSAM1-208	ENST00000486587	UGGT1	Q9NYU2	1555 aa		27.86	■■■□□ 2.05
LRSAM1-208	ENST00000486587	FAM50A	Q14320	339 aa	Known RBP	27.85	■■■□□ 2.05
LRSAM1-208	ENST00000486587	ZNF335	Q9H4Z2	1342 aa	Predicted RBP	27.85	■■■□□ 2.05
LRSAM1-208	ENST00000486587	PKD2	Q13563	968 aa		27.84	■■■□□ 2.05
LRSAM1-208	ENST00000486587	ANKRD30A	Q9BXX3	1397 aa		27.83	■■■□□ 2.05
LRSAM1-208	ENST00000486587	DROSHA	Q9NRR4	1374 aa	Known RBP eCLIP	27.82	■■■□□ 2.04
LRSAM1-208	ENST00000486587	GRWD1	Q9BQ67	446 aa	Known RBP eCLIP	27.81	■■■□□ 2.04
LRSAM1-208	ENST00000486587	ADGRL2	O95490	1459 aa		27.8	■■■□□ 2.04
LRSAM1-208	ENST00000486587	UBR1	Q8IWV7	1749 aa		27.78	■■■□□ 2.04
LRSAM1-208	ENST00000486587	VWDE	Q8N2E2	1590 aa		27.75	■■■□□ 2.03
LRSAM1-208	ENST00000486587	PPARGC1B	Q86YN6	1023 aa	Known RBP	27.74	■■■□□ 2.03
LRSAM1-208	ENST00000486587	IQGAP1	P46940	1657 aa		27.72	■■■□□ 2.03
LRSAM1-208	ENST00000486587	IQSEC2	Q5JU85	1478 aa		27.72	■■■□□ 2.03
LRSAM1-208	ENST00000486587	KANK1	Q14678	1352 aa		27.72	■■■□□ 2.03
LRSAM1-208	ENST00000486587	PIK3C2B	O00750	1634 aa		27.71	■■■□□ 2.03
LRSAM1-208	ENST00000486587	ARHGAP31	Q2M1Z3	1444 aa		27.71	■■■□□ 2.03
LRSAM1-208	ENST00000486587	EFCAB6	Q5THR3	1501 aa		27.7	■■■□□ 2.02
LRSAM1-208	ENST00000486587	LMTK2	Q8IWU2	1503 aa		27.69	■■■□□ 2.02
LRSAM1-208	ENST00000486587	THEMIS	Q8N1K5	641 aa	Predicted RBP	27.69	■■■□□ 2.02
LRSAM1-208	ENST00000486587	NPHP4	O75161	1426 aa	Predicted RBP	27.68	■■■□□ 2.02
LRSAM1-208	ENST00000486587	ANKLE2	Q86XL3	938 aa		27.67	■■■□□ 2.02
LRSAM1-208	ENST00000486587	SYNM	O15061	1565 aa		27.67	■■■□□ 2.02
LRSAM1-208	ENST00000486587	ANKRD50	Q9ULJ7	1429 aa		27.66	■■■□□ 2.02
LRSAM1-208	ENST00000486587	MED14	O60244	1454 aa		27.64	■■■□□ 2.02
LRSAM1-208	ENST00000486587	UNC13B	O14795	1591 aa		27.62	■■■□□ 2.01
LRSAM1-208	ENST00000486587	STRCP1	A6NGW2	1772 aa		27.61	■■■□□ 2.01
LRSAM1-208	ENST00000486587	TET3	O43151	1660 aa		27.59	■■■□□ 2.01
LRSAM1-208	ENST00000486587	SCAF11	Q99590	1463 aa	Known RBP	27.59	■■■□□ 2.01
LRSAM1-208	ENST00000486587	CPS1	P31327	1500 aa		27.58	■■■□□ 2.01
LRSAM1-208	ENST00000486587	ARHGAP23	Q9P227	1491 aa		27.57	■■■□□ 2
LRSAM1-208	ENST00000486587	SLIT1	O75093	1534 aa		27.57	■■■□□ 2
LRSAM1-208	ENST00000486587	GCC2	Q8IWJ2	1684 aa		27.57	■■■□□ 2
LRSAM1-208	ENST00000486587	ITGAE	P38570	1179 aa		27.57	■■■□□ 2
LRSAM1-208	ENST00000486587	UBAP1L	F5GYI3	381 aa		27.55	■■■□□ 2
LRSAM1-208	ENST00000486587	ADGRB3	O60242	1522 aa		27.54	■■■□□ 2
LRSAM1-208	ENST00000486587	NOS1	P29475	1434 aa		27.54	■■■□□ 2
LRSAM1-208	ENST00000486587	MYO5B	Q9ULV0	1848 aa		27.53	■■■□□ 2
LRSAM1-208	ENST00000486587	KDM5A	P29375	1690 aa	Known RBP	27.53	■■■□□ 2
LRSAM1-208	ENST00000486587	LTK	P29376	864 aa		27.51	■■□□□ 1.99
LRSAM1-208	ENST00000486587	ROCK1	Q13464	1354 aa		27.5	■■□□□ 1.99
LRSAM1-208	ENST00000486587		E9PCH4	1651 aa		27.5	■■□□□ 1.99
LRSAM1-208	ENST00000486587	IQGAP3	Q86VI3	1631 aa		27.49	■■□□□ 1.99
LRSAM1-208	ENST00000486587	STAG3	Q9UJ98	1225 aa		27.48	■■□□□ 1.99
LRSAM1-208	ENST00000486587	TMEM2	Q9UHN6	1383 aa		27.48	■■□□□ 1.99
LRSAM1-208	ENST00000486587	RPRD2	Q5VT52	1461 aa	Known RBP	27.47	■■□□□ 1.99
LRSAM1-208	ENST00000486587	IDI1	Q13907	227 aa		27.47	■■□□□ 1.99
LRSAM1-208	ENST00000486587	TXNDC2	Q86VQ3	553 aa		27.46	■■□□□ 1.99
LRSAM1-208	ENST00000486587	SCAF1	Q9H7N4	1312 aa	Known RBP	27.42	■■□□□ 1.98
LRSAM1-208	ENST00000486587	LRRC7	Q96NW7	1537 aa		27.42	■■□□□ 1.98
LRSAM1-208	ENST00000486587	ALK	Q9UM73	1620 aa		27.41	■■□□□ 1.98
LRSAM1-208	ENST00000486587	EID1	Q9Y6B2	187 aa		27.41	■■□□□ 1.98
LRSAM1-208	ENST00000486587	XIRP1	Q702N8	1843 aa	Known RBP	27.39	■■□□□ 1.98
LRSAM1-208	ENST00000486587	PIP4K2B	P78356	416 aa		27.39	■■□□□ 1.98
LRSAM1-208	ENST00000486587	RRBP1	Q9P2E9	1410 aa	Known RBP	27.39	■■□□□ 1.97
LRSAM1-208	ENST00000486587	TMEM131L	A2VDJ0	1609 aa		27.38	■■□□□ 1.97
LRSAM1-208	ENST00000486587	SENP3	Q9H4L4	574 aa	Predicted RBP	27.38	■■□□□ 1.97
LRSAM1-208	ENST00000486587	NUP155	O75694	1391 aa		27.35	■■□□□ 1.97
LRSAM1-208	ENST00000486587	DISP3	Q9P2K9	1392 aa		27.35	■■□□□ 1.97
LRSAM1-208	ENST00000486587	SLC52A1	Q9NWF4	448 aa		27.33	■■□□□ 1.97
LRSAM1-208	ENST00000486587	ZFYVE9	O95405	1425 aa		27.32	■■□□□ 1.96
LRSAM1-208	ENST00000486587	SPHKAP	Q2M3C7	1700 aa		27.31	■■□□□ 1.96

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