RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000462894.1

EIF6-208, Transcript of eukaryotic translation initiation factor 6, human

TSL 3

Gene EIF6, Length 453 nt, Biotype processed transcript, Subcellular localisation Ribosome .

RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	p-Value	Fold Change
EIF6-208	ENST00000462894	VPS8	Q8N3P4	1428 aa		41.46	■■■■■ 4.23
EIF6-208	ENST00000462894	DNMT1	P26358	1616 aa	Known RBP	41.44	■■■■■ 4.22
EIF6-208	ENST00000462894	ZNF335	Q9H4Z2	1342 aa	Predicted RBP	41.44	■■■■■ 4.22
EIF6-208	ENST00000462894	PZP	P20742	1482 aa		41.42	■■■■■ 4.22
EIF6-208	ENST00000462894	LRRC9	Q6ZRR7	1453 aa		41.42	■■■■■ 4.22
EIF6-208	ENST00000462894	TNR	Q92752	1358 aa		41.38	■■■■■ 4.22
EIF6-208	ENST00000462894	TSPY4	P0CV99	314 aa		41.34	■■■■■ 4.21
EIF6-208	ENST00000462894	TSPY10	P0CW01	314 aa		41.34	■■■■■ 4.21
EIF6-208	ENST00000462894	FBXO31	Q5XUX0	539 aa	Predicted RBP	41.34	■■■■■ 4.21
EIF6-208	ENST00000462894	WASHC2C	Q9Y4E1	1318 aa		41.33	■■■■■ 4.21
EIF6-208	ENST00000462894	DISP3	Q9P2K9	1392 aa		41.33	■■■■■ 4.21
EIF6-208	ENST00000462894	MAP3K1	Q13233	1512 aa		41.31	■■■■■ 4.2
EIF6-208	ENST00000462894	MAST1	Q9Y2H9	1570 aa		41.31	■■■■■ 4.2
EIF6-208	ENST00000462894	POLR1A	O95602	1720 aa	Predicted RBP	41.27	■■■■■ 4.2
EIF6-208	ENST00000462894	RNF17	Q9BXT8	1623 aa	Known RBP	41.26	■■■■■ 4.2
EIF6-208	ENST00000462894	NEURL4	Q96JN8	1562 aa		41.26	■■■■■ 4.2
EIF6-208	ENST00000462894	LOC105371045	A0A1W2PR82	267 aa		41.26	■■■■■ 4.2
EIF6-208	ENST00000462894	NLRP1	Q9C000	1473 aa		41.23	■■■■■ 4.19
EIF6-208	ENST00000462894	MIA2	Q96PC5	1412 aa		41.23	■■■■■ 4.19
EIF6-208	ENST00000462894	SPATA31D1	Q6ZQQ2	1576 aa		41.21	■■■■■ 4.19
EIF6-208	ENST00000462894	KANK4	Q5T7N3	995 aa	Predicted RBP	41.2	■■■■■ 4.19
EIF6-208	ENST00000462894	MYOM3	Q5VTT5	1437 aa		41.19	■■■■■ 4.18
EIF6-208	ENST00000462894	EIF2AK4	Q9P2K8	1649 aa	Known RBP	41.19	■■■■■ 4.18
EIF6-208	ENST00000462894	UBAP1L	F5GYI3	381 aa		41.19	■■■■■ 4.18
EIF6-208	ENST00000462894	ZC3H13	Q5T200	1668 aa	Known RBP	41.18	■■■■■ 4.18
EIF6-208	ENST00000462894	ABCC3	O15438	1527 aa		41.18	■■■■■ 4.18
EIF6-208	ENST00000462894	ILDR2	Q71H61	639 aa		41.14	■■■■■ 4.18
EIF6-208	ENST00000462894	UGGT1	Q9NYU2	1555 aa		41.14	■■■■■ 4.18
EIF6-208	ENST00000462894	DROSHA	Q9NRR4	1374 aa	Known RBP eCLIP	41.13	■■■■■ 4.18
EIF6-208	ENST00000462894	THEMIS	Q8N1K5	641 aa	Predicted RBP	41.12	■■■■■ 4.17
EIF6-208	ENST00000462894	CPS1	P31327	1500 aa		41.12	■■■■■ 4.17
EIF6-208	ENST00000462894	MROH1	Q8NDA8	1641 aa		41.11	■■■■■ 4.17
EIF6-208	ENST00000462894	ANKLE2	Q86XL3	938 aa		41.1	■■■■■ 4.17
EIF6-208	ENST00000462894	DEPDC5	O75140	1603 aa		41.08	■■■■■ 4.17
EIF6-208	ENST00000462894	SHANK2	Q9UPX8	1470 aa		41.08	■■■■■ 4.17
EIF6-208	ENST00000462894	MED14	O60244	1454 aa		41.07	■■■■■ 4.16
EIF6-208	ENST00000462894	DUOX2	Q9NRD8	1548 aa		41.04	■■■■■ 4.16
EIF6-208	ENST00000462894	ERVK-7	P63135	1459 aa		41.04	■■■■■ 4.16
EIF6-208	ENST00000462894	VWDE	Q8N2E2	1590 aa		41.03	■■■■■ 4.16
EIF6-208	ENST00000462894	NPHP4	O75161	1426 aa	Predicted RBP	41.02	■■■■■ 4.16
EIF6-208	ENST00000462894	CEP152	O94986	1710 aa		40.98	■■■■■ 4.15
EIF6-208	ENST00000462894	CROCC2	H7BZ55	1655 aa		40.95	■■■■■ 4.15
EIF6-208	ENST00000462894	SOCS7	O14512	581 aa		40.95	■■■■■ 4.15
EIF6-208	ENST00000462894	IQGAP1	P46940	1657 aa		40.94	■■■■■ 4.15
EIF6-208	ENST00000462894	KIF15	Q9NS87	1388 aa		40.93	■■■■■ 4.14
EIF6-208	ENST00000462894	PRDM15	P57071	1507 aa	Predicted RBP	40.93	■■■■■ 4.14
EIF6-208	ENST00000462894	ABCC5	O15440	1437 aa		40.93	■■■■■ 4.14
EIF6-208	ENST00000462894	PTPN23	Q9H3S7	1636 aa		40.91	■■■■■ 4.14
EIF6-208	ENST00000462894	ERBIN	Q96RT1	1412 aa		40.91	■■■■■ 4.14
EIF6-208	ENST00000462894	TOM1	O60784	492 aa		40.87	■■■■■ 4.13
EIF6-208	ENST00000462894	ARHGAP31	Q2M1Z3	1444 aa		40.86	■■■■■ 4.13
EIF6-208	ENST00000462894	UBR1	Q8IWV7	1749 aa		40.86	■■■■■ 4.13
EIF6-208	ENST00000462894	DAPK1	P53355	1430 aa		40.83	■■■■■ 4.13
EIF6-208	ENST00000462894	APLP2	Q06481	763 aa		40.82	■■■■■ 4.13
EIF6-208	ENST00000462894	PIP4K2B	P78356	416 aa		40.8	■■■■■ 4.12
EIF6-208	ENST00000462894	FGD6	Q6ZV73	1430 aa		40.8	■■■■■ 4.12
EIF6-208	ENST00000462894	SCAF1	Q9H7N4	1312 aa	Known RBP	40.8	■■■■■ 4.12
EIF6-208	ENST00000462894	RRP7BP	Q9NSQ0	103 aa		40.79	■■■■■ 4.12
EIF6-208	ENST00000462894	HSPA1L	P34931	641 aa		40.78	■■■■■ 4.12
EIF6-208	ENST00000462894	CFAP65	Q6ZU64	1925 aa	Known RBP	40.77	■■■■■ 4.12
EIF6-208	ENST00000462894	ALK	Q9UM73	1620 aa		40.77	■■■■■ 4.12
EIF6-208	ENST00000462894	STRCP1	A6NGW2	1772 aa		40.76	■■■■■ 4.12
EIF6-208	ENST00000462894	SCAF11	Q99590	1463 aa	Known RBP	40.76	■■■■■ 4.12
EIF6-208	ENST00000462894	ARHGAP23	Q9P227	1491 aa		40.76	■■■■■ 4.12
EIF6-208	ENST00000462894	SYNM	O15061	1565 aa		40.75	■■■■■ 4.11
EIF6-208	ENST00000462894	SLIT1	O75093	1534 aa		40.75	■■■■■ 4.11
EIF6-208	ENST00000462894	LRRC7	Q96NW7	1537 aa		40.72	■■■■■ 4.11
EIF6-208	ENST00000462894	KANK1	Q14678	1352 aa		40.67	■■■■■ 4.1
EIF6-208	ENST00000462894	LMTK2	Q8IWU2	1503 aa		40.67	■■■■■ 4.1
EIF6-208	ENST00000462894	ANKRD30A	Q9BXX3	1397 aa		40.66	■■■■■ 4.1
EIF6-208	ENST00000462894	GRWD1	Q9BQ67	446 aa	Known RBP eCLIP	40.66	■■■■■ 4.1	2e-22	■□□□□ 8.7
EIF6-208	ENST00000462894	LTK	P29376	864 aa		40.65	■■■■■ 4.1
EIF6-208	ENST00000462894	MED1	Q15648	1581 aa	Predicted RBP	40.65	■■■■■ 4.1
EIF6-208	ENST00000462894	PIK3C2B	O00750	1634 aa		40.64	■■■■■ 4.1
EIF6-208	ENST00000462894	TXNDC2	Q86VQ3	553 aa		40.62	■■■■■ 4.09
EIF6-208	ENST00000462894	CHIC2	Q9UKJ5	165 aa		40.58	■■■■■ 4.09
EIF6-208	ENST00000462894	KDM5A	P29375	1690 aa	Known RBP	40.58	■■■■■ 4.09
EIF6-208	ENST00000462894	TMEM2	Q9UHN6	1383 aa		40.57	■■■■■ 4.08
EIF6-208	ENST00000462894	EID1	Q9Y6B2	187 aa		40.56	■■■■■ 4.08
EIF6-208	ENST00000462894	ADGRL2	O95490	1459 aa		40.56	■■■■■ 4.08
EIF6-208	ENST00000462894	EFCAB6	Q5THR3	1501 aa		40.52	■■■■■ 4.08
EIF6-208	ENST00000462894	NOS1	P29475	1434 aa		40.49	■■■■■ 4.07
EIF6-208	ENST00000462894	IDI1	Q13907	227 aa		40.48	■■■■■ 4.07
EIF6-208	ENST00000462894	STAG3	Q9UJ98	1225 aa		40.48	■■■■■ 4.07
EIF6-208	ENST00000462894	XIRP1	Q702N8	1843 aa	Known RBP	40.44	■■■■■ 4.06
EIF6-208	ENST00000462894	ADGRB3	O60242	1522 aa		40.42	■■■■■ 4.06
EIF6-208	ENST00000462894	ANKRD50	Q9ULJ7	1429 aa		40.38	■■■■■ 4.05
EIF6-208	ENST00000462894	RPRD2	Q5VT52	1461 aa	Known RBP	40.37	■■■■■ 4.05
EIF6-208	ENST00000462894	TET3	O43151	1660 aa		40.37	■■■■■ 4.05
EIF6-208	ENST00000462894	FAM50A	Q14320	339 aa	Known RBP	40.36	■■■■■ 4.05
EIF6-208	ENST00000462894	SLC52A1	Q9NWF4	448 aa		40.34	■■■■■ 4.05
EIF6-208	ENST00000462894	SENP3	Q9H4L4	574 aa	Predicted RBP	40.3	■■■■■ 4.04
EIF6-208	ENST00000462894	KCNA6	P17658	529 aa		40.29	■■■■■ 4.04
EIF6-208	ENST00000462894	TMEM94	Q12767	1356 aa		40.27	■■■■■ 4.04
EIF6-208	ENST00000462894	PHF23	Q9BUL5	403 aa	Predicted RBP	40.27	■■■■■ 4.04
EIF6-208	ENST00000462894	SLC26A8	Q96RN1	970 aa		40.25	■■■■■ 4.03
EIF6-208	ENST00000462894	NWD1	Q149M9	1564 aa		40.25	■■■■■ 4.03
EIF6-208	ENST00000462894	FAM135B	Q49AJ0	1406 aa		40.23	■■■■■ 4.03
EIF6-208	ENST00000462894	NKTR	P30414	1462 aa	Known RBP	40.22	■■■■■ 4.03
EIF6-208	ENST00000462894	UNC13B	O14795	1591 aa		40.22	■■■■■ 4.03

Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 13 ms