RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000462894.1

EIF6-208, Transcript of eukaryotic translation initiation factor 6, humanhuman

TSL 3

Gene EIF6, Length 453 nt, Biotype processed transcript, Subcellular localisation Ribosome .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
EIF6-208ENST00000462894 NISCHQ9Y2I1 1504 aa65.56■■■■■ 8.09
EIF6-208ENST00000462894 ABCC9O60706 1549 aa58.96■■■■■ 7.03
EIF6-208ENST00000462894 CCDC180Q9P1Z9 1646 aa58.92■■■■■ 7.02
EIF6-208ENST00000462894 RB1CC1Q8TDY2 1594 aa56.12■■■■■ 6.57
EIF6-208ENST00000462894 NACADO15069 1562 aa55.73■■■■■ 6.51
EIF6-208ENST00000462894 DNAJC5BQ9UF47 199 aa55.39■■■■■ 6.46
EIF6-208ENST00000462894 DCAF8L2P0C7V8 631 aa55.21■■■■■ 6.43
EIF6-208ENST00000462894 MYO15BQ96JP2 1530 aa54.98■■■■■ 6.39
EIF6-208ENST00000462894 PABPN1Q86U42 306 aaKnown RBP eCLIP54.82■■■■■ 6.374e-6■□□□□ 11
EIF6-208ENST00000462894 UNC13AQ9UPW8 1703 aa54.81■■■■■ 6.37
EIF6-208ENST00000462894 BICRAQ9NZM4 1560 aa54.51■■■■■ 6.32
EIF6-208ENST00000462894 ZCCHC6Q5VYS8 1495 aaKnown RBP54.35■■■■■ 6.29
EIF6-208ENST00000462894 DCAF1Q9Y4B6 1507 aa54.21■■■■■ 6.27
EIF6-208ENST00000462894 SHROOM4Q9ULL8 1493 aa53.84■■■■■ 6.21
EIF6-208ENST00000462894 SCRIBQ14160 1630 aa53.61■■■■■ 6.17
EIF6-208ENST00000462894 CC2D2AQ9P2K1 1620 aa53.28■■■■■ 6.12
EIF6-208ENST00000462894 EIF4G1Q04637 1599 aaKnown RBP53.17■■■■■ 6.1
EIF6-208ENST00000462894 CECR2Q9BXF3 1484 aa53.15■■■■■ 6.1
EIF6-208ENST00000462894 NCAPD3P42695 1498 aa51.45■■■■■ 5.83
EIF6-208ENST00000462894 ATAD2BQ9ULI0 1458 aa51.26■■■■■ 5.8
EIF6-208ENST00000462894 SMARCA4P51532 1647 aa51.17■■■■■ 5.78
EIF6-208ENST00000462894 SMARCA2P51531 1590 aa51.11■■■■■ 5.77
EIF6-208ENST00000462894 HMGXB3Q12766 1538 aa51.08■■■■■ 5.77
EIF6-208ENST00000462894 DNAJC5Q9H3Z4 198 aa50.98■■■■■ 5.75
EIF6-208ENST00000462894 CUX2O14529 1486 aa50.94■■■■■ 5.75
EIF6-208ENST00000462894 ERCC6Q03468 1493 aa50.91■■■■■ 5.74
EIF6-208ENST00000462894 BAZ1AQ9NRL2 1556 aaPredicted RBP50.91■■■■■ 5.74
EIF6-208ENST00000462894 BAZ1BQ9UIG0 1483 aaKnown RBP50.74■■■■■ 5.71
EIF6-208ENST00000462894 PEG3Q9GZU2 1588 aa50.73■■■■■ 5.71
EIF6-208ENST00000462894 NESP48681 1621 aa50.62■■■■■ 5.69
EIF6-208ENST00000462894 MROH2BQ7Z745 1585 aa50.5■■■■■ 5.67
EIF6-208ENST00000462894 LAMC3Q9Y6N6 1575 aa50.3■■■■■ 5.64
EIF6-208ENST00000462894 THOC2Q8NI27 1593 aaKnown RBP50.2■■■■■ 5.63
EIF6-208ENST00000462894 PDS5BQ9NTI5 1447 aa49.99■■■■■ 5.59
EIF6-208ENST00000462894 KIF21AQ7Z4S6 1674 aa49.97■■■■■ 5.59
EIF6-208ENST00000462894 WIZO95785 1651 aa49.87■■■■■ 5.57
EIF6-208ENST00000462894 CADPSQ9ULU8 1353 aa49.85■■■■■ 5.57
EIF6-208ENST00000462894 MRC2Q9UBG0 1479 aa49.59■■■■■ 5.53
EIF6-208ENST00000462894 WDR62O43379 1518 aa49.5■■■■■ 5.51
EIF6-208ENST00000462894 RSF1Q96T23 1441 aaPredicted RBP49.42■■■■■ 5.5
EIF6-208ENST00000462894 CEP164Q9UPV0 1460 aa49.35■■■■■ 5.49
EIF6-208ENST00000462894 TOP2AP11388 1531 aaKnown RBP49.29■■■■■ 5.48
EIF6-208ENST00000462894 CFTRP13569 1480 aa49.28■■■■■ 5.48
EIF6-208ENST00000462894 FANCD2Q9BXW9 1451 aa49.28■■■■■ 5.48
EIF6-208ENST00000462894 URB2Q14146 1524 aaKnown RBP48.89■■■■■ 5.42
EIF6-208ENST00000462894 PRDM2Q13029 1718 aa48.76■■■■■ 5.4
EIF6-208ENST00000462894 CCDC88BA6NC98 1476 aa48.68■■■■■ 5.38
EIF6-208ENST00000462894 TRIM41Q8WV44 630 aa48.61■■■■■ 5.37
EIF6-208ENST00000462894 OSCARQ8IYS5 282 aa48.5■■■■■ 5.35
EIF6-208ENST00000462894 IFT140Q96RY7 1462 aa48.38■■■■■ 5.34
EIF6-208ENST00000462894 TOPBP1Q92547 1522 aa48.34■■■■■ 5.33
EIF6-208ENST00000462894 ZNF608Q9ULD9 1512 aaPredicted RBP48.29■■■■■ 5.32
EIF6-208ENST00000462894 ABCC8Q09428 1581 aa48.24■■■■■ 5.31
EIF6-208ENST00000462894 DNMBPQ6XZF7 1577 aa48.17■■■■■ 5.3
EIF6-208ENST00000462894 EIF4G3O43432 1585 aaKnown RBP48.05■■■■■ 5.28
EIF6-208ENST00000462894 RIMBP3CA6NJZ7 1639 aa47.93■■■■■ 5.26
EIF6-208ENST00000462894 RIMBP3BA6NNM3 1639 aa47.93■■■■■ 5.26
EIF6-208ENST00000462894 TARBP1Q13395 1621 aaKnown RBP47.93■■■■■ 5.26
EIF6-208ENST00000462894 RIMBP3Q9UFD9 1639 aa47.93■■■■■ 5.26
EIF6-208ENST00000462894 POLA1P09884 1462 aaPredicted RBP47.84■■■■■ 5.25
EIF6-208ENST00000462894 AQRO60306 1485 aaKnown RBP eCLIP47.81■■■■■ 5.247e-8■■■■□ 24.9
EIF6-208ENST00000462894 ARHGEF11O15085 1522 aa47.79■■■■■ 5.24
EIF6-208ENST00000462894 CHD1O14646 1710 aa47.67■■■■■ 5.22
EIF6-208ENST00000462894 RAD54L2Q9Y4B4 1467 aa47.63■■■■■ 5.22
EIF6-208ENST00000462894 SOGA1O94964 1423 aa47.58■■■■■ 5.21
EIF6-208ENST00000462894 FGD5Q6ZNL6 1462 aa47.52■■■■■ 5.2
EIF6-208ENST00000462894 WDR97A6NE52 1622 aa47.49■■■■■ 5.19
EIF6-208ENST00000462894 TDRD9Q8NDG6 1382 aaKnown RBP47.49■■■■■ 5.19
EIF6-208ENST00000462894 CUX1P39880 1505 aa47.46■■■■■ 5.19
EIF6-208ENST00000462894 FBLN2P98095 1184 aa47.44■■■■■ 5.18
EIF6-208ENST00000462894 SNAPC4Q5SXM2 1469 aa47.36■■■■■ 5.17
EIF6-208ENST00000462894 CYB5RLQ6IPT4 315 aa47.34■■■■■ 5.17
EIF6-208ENST00000462894 ARAP1Q96P48 1450 aa47.32■■■■■ 5.17
EIF6-208ENST00000462894 MAGI1Q96QZ7 1491 aaPredicted RBP47.26■■■■■ 5.16
EIF6-208ENST00000462894 GRIN2BQ13224 1484 aa47.22■■■■■ 5.15
EIF6-208ENST00000462894 CLASP1Q7Z460 1538 aa47.19■■■■■ 5.14
EIF6-208ENST00000462894 SYNJ1O43426 1573 aa47.12■■■■■ 5.13
EIF6-208ENST00000462894 CHMP7Q8WUX9 453 aaPredicted RBP47.12■■■■■ 5.13
EIF6-208ENST00000462894 SYNJ2O15056 1496 aa47.09■■■■■ 5.13
EIF6-208ENST00000462894 GAPVD1Q14C86 1478 aa47.02■■■■■ 5.12
EIF6-208ENST00000462894 PBRM1Q86U86 1689 aa47.02■■■■■ 5.12
EIF6-208ENST00000462894 ABCA10Q8WWZ4 1543 aa47■■■■■ 5.11
EIF6-208ENST00000462894 SUPT5HO00267 1087 aaKnown RBP46.99■■■■■ 5.11
EIF6-208ENST00000462894 ABCA5Q8WWZ7 1642 aa46.95■■■■■ 5.11
EIF6-208ENST00000462894 TRHP20396 242 aaPredicted RBP46.83■■■■■ 5.09
EIF6-208ENST00000462894 WRNQ14191 1432 aaPredicted RBP eCLIP46.75■■■■■ 5.071e-6■■■■■ 58.5
EIF6-208ENST00000462894 BIVM-ERCC5R4GMW8 1640 aa46.69■■■■■ 5.07
EIF6-208ENST00000462894 TOP2BQ02880 1626 aa46.68■■■■■ 5.06
EIF6-208ENST00000462894 GRIN2AQ12879 1464 aa46.63■■■■■ 5.05
EIF6-208ENST00000462894 ADAMTS12P58397 1594 aa46.6■■■■■ 5.05
EIF6-208ENST00000462894 NUP160Q12769 1436 aa46.5■■■■■ 5.03
EIF6-208ENST00000462894 CEP170Q5SW79 1584 aa46.46■■■■■ 5.03
EIF6-208ENST00000462894 FHAD1B1AJZ9 1412 aa46.45■■■■■ 5.03
EIF6-208ENST00000462894 ERICH3Q5RHP9 1530 aa46.41■■■■■ 5.02
EIF6-208ENST00000462894 ERCC6L2Q5T890 1561 aa46.39■■■■■ 5.02
EIF6-208ENST00000462894 SHROOM2Q13796 1616 aa46.31■■■■■ 5
EIF6-208ENST00000462894 PRG4Q92954 1404 aaPredicted RBP46■■■■■ 4.95
EIF6-208ENST00000462894 RUSC2Q8N2Y8 1516 aa45.96■■■■■ 4.95
EIF6-208ENST00000462894 JPH4Q96JJ6 628 aa45.93■■■■■ 4.94
EIF6-208ENST00000462894 KIF27Q86VH2 1401 aa45.75■■■■■ 4.91
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